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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Uva e Vinho. |
Data corrente: |
28/08/2014 |
Data da última atualização: |
02/04/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
PERINI, P.; PASQUALI, G.; MARGIS-PINHEIRO, M.; OLIVEIRA, P. R. D. de; REVERS, L. F. |
Afiliação: |
Pâmela Perini; Giancarlo Pasquali; Márcia Margis-Pinheiro; PAULO RICARDO DIAS DE OLIVEIRA, CNPUV; LUIS FERNANDO REVERS, CNPUV. |
Título: |
Reference genes for transcriptional analysis of flowering and fruit ripening stages in apple (Malus 3 domestica Borkh.). |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
Molecular Breeding, mar. 2014. |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
DOI 10.1007/s11032-014-0078-3 |
Conteúdo: |
Apple (Malus 9 domestica Borkh.) is the most important deciduous tree fruit crop grown around the world. Comparisons of gene expression profiles from different tissues, conditions or cultivars are valuable scientific tools to better understand the gene expression changes behind important silvicultural and nutritional traits. However, the accuracy of techniques employed to access gene expression is dependent on the evaluation of stable reference genes for data normalization to avoid statistical significance undue or incorrect conclusions. The objective of this work was to select the best genes to be used as references for gene expression studies in apple trees by reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR). Vegetative and reproductive tissues of the apple ??Gala?? cultivar were evaluated during their seasonal cycle of growth and dormancy. The expression of 23 traditional housekeeping genes or genes suggested as constitutive by microarray data was investigated. Tested combinations of primers allowed the specific amplification and the generation of suitable efficiency curves for gene expression studies by RT-qPCR. Gene stability was determined by two different statistical descriptors, geNorm and Norm-Finder. The known variable PAL gene expression was used to validate selected normalizers. Results obtained allowed us to conclude that MDH, SAND, THFS, TMp1 and WD40 are the best reference genes to accurately normalize the relative transcript abundances using RT-qPCR in various tissues of apple. MenosApple (Malus 9 domestica Borkh.) is the most important deciduous tree fruit crop grown around the world. Comparisons of gene expression profiles from different tissues, conditions or cultivars are valuable scientific tools to better understand the gene expression changes behind important silvicultural and nutritional traits. However, the accuracy of techniques employed to access gene expression is dependent on the evaluation of stable reference genes for data normalization to avoid statistical significance undue or incorrect conclusions. The objective of this work was to select the best genes to be used as references for gene expression studies in apple trees by reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR). Vegetative and reproductive tissues of the apple ??Gala?? cultivar were evaluated during their seasonal cycle of growth and dormancy. The expression of 23 traditional housekeeping genes or genes suggested as constitutive by microarray data was investigated. Tested combinations of primers allowed the specific amplification and the generation of suitable efficiency curves for gene expression studies by RT-qPCR. Gene stability was determined by two different statistical descriptors, geNorm and Norm-Finder. The known variable PAL gene expression was used to validate selected normalizers. Results obtained allowed us to conclude that MDH, SAND, THFS, TMp1 and WD40 are the best reference genes to accurately normalize the relative transcript abundances u... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Expressão genética; Gala; Genes de referencia; RT-qPCR. |
Thesagro: |
Genetica vegetal; Maçã. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/107436/1/Perini2014-Reference-Genes-Apple.pdf
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Marc: |
LEADER 02287naa a2200253 a 4500 001 1993623 005 2019-04-02 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aPERINI, P. 245 $aReference genes for transcriptional analysis of flowering and fruit ripening stages in apple (Malus 3 domestica Borkh.).$h[electronic resource] 260 $c2014 500 $aDOI 10.1007/s11032-014-0078-3 520 $aApple (Malus 9 domestica Borkh.) is the most important deciduous tree fruit crop grown around the world. Comparisons of gene expression profiles from different tissues, conditions or cultivars are valuable scientific tools to better understand the gene expression changes behind important silvicultural and nutritional traits. However, the accuracy of techniques employed to access gene expression is dependent on the evaluation of stable reference genes for data normalization to avoid statistical significance undue or incorrect conclusions. The objective of this work was to select the best genes to be used as references for gene expression studies in apple trees by reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR). Vegetative and reproductive tissues of the apple ??Gala?? cultivar were evaluated during their seasonal cycle of growth and dormancy. The expression of 23 traditional housekeeping genes or genes suggested as constitutive by microarray data was investigated. Tested combinations of primers allowed the specific amplification and the generation of suitable efficiency curves for gene expression studies by RT-qPCR. Gene stability was determined by two different statistical descriptors, geNorm and Norm-Finder. The known variable PAL gene expression was used to validate selected normalizers. Results obtained allowed us to conclude that MDH, SAND, THFS, TMp1 and WD40 are the best reference genes to accurately normalize the relative transcript abundances using RT-qPCR in various tissues of apple. 650 $aGenetica vegetal 650 $aMaçã 653 $aExpressão genética 653 $aGala 653 $aGenes de referencia 653 $aRT-qPCR 700 1 $aPASQUALI, G. 700 1 $aMARGIS-PINHEIRO, M. 700 1 $aOLIVEIRA, P. R. D. de 700 1 $aREVERS, L. F. 773 $tMolecular Breeding, mar. 2014.
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Registro original: |
Embrapa Uva e Vinho (CNPUV) |
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Registros recuperados : 254 | |
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Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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162. | | BECK, P.; TEIXEIRA, G. J. G.; MORINI, M. A. L.; AGUSTINI, B. C.; SILVA, G. A. da. Avaliação de leveduras para controle biológico de fungos filamentosos fitopatogênicos . In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 16.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUANDOS DA EMBRAPA UVA E VINHO, 12., 2018, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves, RS: Embrapa Uva e Vinho, 26 a 27 de setembro de 2018. p. 17.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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164. | | LANDAU, E. C.; HIRSCH, A.; SILVA, G. A. da; MOURA, L.; VALADARES, G. M.; MARTINS, J. L. A. Análise integrada da dinâmica da produção agropecuária e da paisagem natural no Brasil nas ultimas décadas. In: LANDAU, E. C.; SILVA, G. A. da; MOURA, L.; HIRSCH, A.; GUIMARAES, D. P. (ed.). Dinâmica da produção agropecuária e da paisagem natural no Brasil nas últimas décadas: sistemas agrícolas, paisagem natural e análise integrada do espaço rural. Brasília, DF: Embrapa, 2020. v. 4, cap. 57, p. 2125-2171.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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165. | | FREITAS, J. G.; ALBUQUERQUE, F. A. de; MOTA, J. R.; SILVA, G. A. da; SILVA, C. F. L. da. Caracterização física das sementes da cultivar BRS ENERGIA em quatro densidade populacional em Irecê-BA. CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 5.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 2.; FÓRUM CAPIXABA DE PINHÃO-MANSO, 1., 2012, Guarapari. Desafios e Oportunidades: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2012. p. 415Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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166. | | SILVA, F. C.; SILVA, G. A. da; SOUZA, F. F. de; BINI, D.; MARRIEL, I. E.; OLIVEIRA-PAIVA, C. A. Capacidade de cepas de Bacillus solubilizadores de fosfato em aumentar a produtividade de milho. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 33., 2022, Sete Lagoas. Brasil: 200 anos de independência: sustentabilidade e desafios para a cadeia produtiva de grãos: resumos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2022. Evento online.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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169. | | SILVA, G. A. da; SILVA, S. de S.; SOUSA, M. V. R. de; GUIMARÃES, L. M.; MESQUITA, E. F. de. Estudo da fitomassa das folhas e caule da mamoneira EBDA MPA 11 submetidos às diferentes dosagens de nitrogênio no campus IV da UEPB Catolé do Rocha-PB. . In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 5.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 2.; FÓRUM CAPIXABA DE PINHÃO-MANSO, 1., 2012, Guarapari. Desafios e Oportunidades: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2012. p. 90Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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172. | | WLODARCZYK, S. R.; SOUZA, R. C. de; BONFIM, T. M. B.; BRAND, D.; SILVA, G. A. da. Evaluation of isolated yeasts from grapes of Pinto Bandeira region, Bento Gonçalves (RS) in relation to production of H2S and fermentation rate. Biochemistry and Biotechnology Reports, Londrina, v. 1, n. 2, p. 26-29, jul./dez. 2012.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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Biblioteca(s): Embrapa Semiárido; Embrapa Uva e Vinho. |
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177. | | PEREIRA, G. E.; PRATES, M. V. M.; SILVA, G. A. da; BIASOTO, A. C. T.; GUERRA, C. C. Boas práticas de elaboração e PPHO. IN: SILVEIRA, S. V. da; GARRIDO, L. da R.; HOFFMANN, A. (Ed.). Produção integrada de uva para processamento: processos de elaboração de sucos e vinhos, BPA e APPCC. Brasília, DF: Embrapa, 2015. v. 5, cap. 3, p. 24-38.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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178. | | SILVA, G. A. da; GUIMARÃES, L. M.; SOUSA, M. V. R. de; SILVA, S. de S.; MESQUITA, E. F. de. Crescimento da mamoneira EBDA MPA 11 sob o efeito da adubação nitrogenada. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 5.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 2.; FÓRUM CAPIXABA DE PINHÃO-MANSO, 1., 2012, Guarapari. Desafios e Oportunidades: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2012. p. 71Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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179. | | SILVA, G. A. da; SANTOS, H. P. dos; SANTOS, H. P. dos; GURAK, P. D.; POLI, J. S.; CROCOLI, C. Cultivo de videira protegido com cobertura plástica e sua relação com a fermentação do mosto. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE BIOPROCESSOS, 16., 2007, Curitiba. Anais... Curitiba: UFPR, 2007. 1 CD-ROM. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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180. | | SILVA, G. A. da; BARBOSA, E. dos S.; POLETTO, C. M.; POLI, J. S.; LOCATELLI, C.; LEITE, S. G. F. Potencialidades de linhagens de levedura Saccharomyces cerevisiae durante a fermentação tumultuosa da cv. Cabernet Sauvignon. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 12., 2008, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho, 2008. p. 160. Resumo.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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