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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
Data corrente: |
19/05/2017 |
Data da última atualização: |
17/06/2020 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SILVA, R. A. da; SOUZA, G.; LEMOS, L. S. L.; LOPES, U. V.; PATROCÌNIO, N. G. R. B.; ALVES, R. M.; MARCELLINO, L. H.; CLEMENT, D.; MICHELI, F.; GRAMACHO, K. P. |
Afiliação: |
RANGELINE AZEVEDO DA SILVA, UESC; GUSTAVO SOUZA, UFPE; LÍVIA SANTOS LIMA LEMOS, UFSB; UILSON VANDERLEI LOPES, CEPLAC/CEPEC; NARA GEÓRGIA RIBEIRO BRAZ PATROCÌNIO, UESC; RAFAEL MOYSES ALVES, CPATU; LUCILIA HELENA MARCELLINO, Cenargen; DIDIER CLEMENT, CEPLAC/CEPEC; FABIENNE MICHELI, UESC; KARINA PERES GRAMACHO, CEPLAC/CEPEC. |
Título: |
Genome size, cytogenetic data and transferability of EST-SSRs markers in wild and cultivated species of the genus Theobroma L. (Byttnerioideae, Malvaceae). |
Ano de publicação: |
2017 |
Fonte/Imprenta: |
PLoS ONE, v. 12, n. 2, 2017. |
DOI: |
10.1371/journal.pone.0170799 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The genus Theobroma comprises several trees species native to the Amazon. Theobroma cacao L. plays a key economic role mainly in the chocolate industry. Both cultivated and wild forms are described within the genus. Variations in genome size and chromosome number have been used for prediction purposes including the frequency of interspecific hybridization or inference about evolutionary relationships. In this study, the nuclear DNA content, karyotype and genetic diversity using functional microsatellites (EST-SSR) of seven Theobroma species were characterized. The nuclear content of DNA for all analyzed Theobroma species was 1C = ~ 0.46 pg. These species presented 2n = 20 with small chromosomes and only one pair of terminal heterochromatic bands positively stained (CMA+/DAPI− bands). The small size of Theobroma ssp. genomes was equivalent to other Byttnerioideae species, suggesting that the basal lineage of Malvaceae have smaller genomes and that there was an expansion of 2C values in the more specialized family clades. A set of 20 EST-SSR primers were characterized for related species of Theobroma, in which 12 loci were polymorphic. The polymorphism information content (PIC) ranged from 0.23 to 0.65, indicating a high level of information per locus. Combined results of flow cytometry, cytogenetic data and EST-SSRs markers will contribute to better describe the species and infer about the evolutionary relationships among Theobroma species. In addition, the importance of a core collection for conservation purposes is highlighted. MenosThe genus Theobroma comprises several trees species native to the Amazon. Theobroma cacao L. plays a key economic role mainly in the chocolate industry. Both cultivated and wild forms are described within the genus. Variations in genome size and chromosome number have been used for prediction purposes including the frequency of interspecific hybridization or inference about evolutionary relationships. In this study, the nuclear DNA content, karyotype and genetic diversity using functional microsatellites (EST-SSR) of seven Theobroma species were characterized. The nuclear content of DNA for all analyzed Theobroma species was 1C = ~ 0.46 pg. These species presented 2n = 20 with small chromosomes and only one pair of terminal heterochromatic bands positively stained (CMA+/DAPI− bands). The small size of Theobroma ssp. genomes was equivalent to other Byttnerioideae species, suggesting that the basal lineage of Malvaceae have smaller genomes and that there was an expansion of 2C values in the more specialized family clades. A set of 20 EST-SSR primers were characterized for related species of Theobroma, in which 12 loci were polymorphic. The polymorphism information content (PIC) ranged from 0.23 to 0.65, indicating a high level of information per locus. Combined results of flow cytometry, cytogenetic data and EST-SSRs markers will contribute to better describe the species and infer about the evolutionary relationships among Theobroma species. In addition, the importance o... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Theobroma Cacao. |
Thesaurus Nal: |
Theobroma. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/214031/1/journal.pone.0170799.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/180926/1/journal.pone.0170799.pdf
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Marc: |
LEADER 02379naa a2200265 a 4500 001 2123321 005 2020-06-17 008 2017 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1371/journal.pone.0170799$2DOI 100 1 $aSILVA, R. A. da 245 $aGenome size, cytogenetic data and transferability of EST-SSRs markers in wild and cultivated species of the genus Theobroma L. (Byttnerioideae, Malvaceae).$h[electronic resource] 260 $c2017 520 $aThe genus Theobroma comprises several trees species native to the Amazon. Theobroma cacao L. plays a key economic role mainly in the chocolate industry. Both cultivated and wild forms are described within the genus. Variations in genome size and chromosome number have been used for prediction purposes including the frequency of interspecific hybridization or inference about evolutionary relationships. In this study, the nuclear DNA content, karyotype and genetic diversity using functional microsatellites (EST-SSR) of seven Theobroma species were characterized. The nuclear content of DNA for all analyzed Theobroma species was 1C = ~ 0.46 pg. These species presented 2n = 20 with small chromosomes and only one pair of terminal heterochromatic bands positively stained (CMA+/DAPI− bands). The small size of Theobroma ssp. genomes was equivalent to other Byttnerioideae species, suggesting that the basal lineage of Malvaceae have smaller genomes and that there was an expansion of 2C values in the more specialized family clades. A set of 20 EST-SSR primers were characterized for related species of Theobroma, in which 12 loci were polymorphic. The polymorphism information content (PIC) ranged from 0.23 to 0.65, indicating a high level of information per locus. Combined results of flow cytometry, cytogenetic data and EST-SSRs markers will contribute to better describe the species and infer about the evolutionary relationships among Theobroma species. In addition, the importance of a core collection for conservation purposes is highlighted. 650 $aTheobroma 650 $aTheobroma Cacao 700 1 $aSOUZA, G. 700 1 $aLEMOS, L. S. L. 700 1 $aLOPES, U. V. 700 1 $aPATROCÌNIO, N. G. R. B. 700 1 $aALVES, R. M. 700 1 $aMARCELLINO, L. H. 700 1 $aCLEMENT, D. 700 1 $aMICHELI, F. 700 1 $aGRAMACHO, K. P. 773 $tPLoS ONE$gv. 12, n. 2, 2017.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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Registros recuperados : 77 | |
61. | | FALCAO, L. L.; WERNECK, J. O. S.; SANTANA, R. J.; ALVES, R. M.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M.; MARCELLINO, L. H. Análise e caracterização do gene de osmotina em cupuaçuzeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2012, Belém, PA. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2012. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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62. | | PIRES, M. V. V.; FALCÃO, L. L.; CABRAL, G. B.; GOMES, C. S.; PEREIRA, J. M. N.; MEIRELES JÚNIOR, H. J.; GANDER, E. S.; MARCELLINO, L. H. Estudos do promotor do gene "Opaque-2-Like" de milheto (Pennisetum glaucum). In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 10., 2005, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2005. p. 64.Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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63. | | LÜDKE, L.; PIRES, M. V.; CABRAL, G. B.; GOMES, C. S.; PEREIRA, J. M. N.; MEIRELES JUNIOR, H. J.; GANDER, E. S.; MARCELLINO, L. H. Estudos funcionais do promotor do gene "Opaque-2-like" de milheto. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia, SP. A era da genômica: da bioestatística à bioinformática: anais. Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. p. 698.Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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64. | | SANTANA, R. J.; FALCAO, L. L.; WERNECK, J. O. S.; ALVES, R. M.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M.; MARCELLINO, L. H. Identificação e análise de genes expressos em semente e polpa de cupuaçuzeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2012, Belém, PA. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2012. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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66. | | PAULINO, J. L.; WERNECK, J. O. S.; REZENDE, D. R.; LIMA, C. S. P.; RAMOS, A. R.; FALCAO, L. L.; MARCELLINO, L. H. Purificação e avaliação de atividade de osmotina de cacau (Theobroma cacao L.) expressa em Escherichia coli. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 16., 2011, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2011. Resumo: 038 p.73Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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67. | | MOURNET, P.; ALBUQUERQUE, P. S. B. de; ALVES, R. M.; SILVA-WERNECK, J. O.; RIVALLAN, R.; MARCELLINO, L. H.; CLÉMENT, D. A reference high-density genetic map of Theobroma grandiflorum (Willd. ex Spreng) and QTL detection for resistance to witches' broom disease (Moniliophthora perniciosa). Tree Genetics & Genomes, v. 16, article 89, 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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68. | | OLIVEIRA JÚNIOR, G. P.; FALCAO, L. L.; WERNECK, J. O. S.; GESTEIRA, A. da S.; ARGOUT, X.; CASCARDO, J. C. M.; MICHELI, F.; MARCELLINO, L. H. Influência de um endofítico bacteriano na expressão gênica em folhas de cacau (Theobroma cacao). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2010. p. 271.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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69. | | RODRIGUES, M. A.; FALCAO, L. L.; MARCELLINO, L. H.; WERNECK, J. O. S.; MAGALHÃES, B. S.; SILVA, L. P. da; BLOCH JUNIOR, C.; BEMQUERER, M. P. Materiais híbridos orgânico-inorgânicos com propriedades antimicrobianas. In: WORKSHOP DA REDE DE NANOTECNOLOGIA APLICADA AO AGRONEGÓCIO 2012, 6., 2012, Fortaleza. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação; Fortaleza: Embrapa Agroindústria Tropical, 2012. p. 189-191Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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70. | | FALCAO, L. L.; WERNECK, J. O. S.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; ALVES, R. M.; ALBUQUERQUE, P. S. B.; MARCELLINO, L. H. Analyses of cupuassu (Theobroma grandiflorum) transcriptome during interaction with Moniliophthora perniciosa, the causal agent of Witches' Broom disease. In: BRAZILIAN BIOTECHNOLOGY CONGRESS, 7.; BIOTECHNOLOGY IBERO-AMERICAN CONGRESS, 2., 2018, Brasília, DF. Proceedings... Brasília, DF: SBBiotec, 2018.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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71. | | FALCAO, L. L.; WERNECK, J. O. S.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; ALVES, R. M.; ALBUQUERQUE, P. S. B.; MARCELLINO, L. H. Analyses of cupuassu (Theobroma grandiflorum) transcriptome during interaction with Moniliophthora perniciosa, the causal agent of Witches' Broom disease. In: BRAZILIAN BIOTECHNOLOGY CONGRESS, 7.; BIOTECHNOLOGY IBERO-AMERICAN CONGRESS, 2., 2018, Brasília, DF. Proceedings... Brasília, DF: SBBiotec, 2018.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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72. | | SILVA, R. A. da; SOUZA, G.; LEMOS, L. S. L.; LOPES, U. V.; PATROCÌNIO, N. G. R. B.; ALVES, R. M.; MARCELLINO, L. H.; CLEMENT, D.; MICHELI, F.; GRAMACHO, K. P. Genome size, cytogenetic data and transferability of EST-SSRs markers in wild and cultivated species of the genus Theobroma L. (Byttnerioideae, Malvaceae). PLoS ONE, v. 12, n. 2, 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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73. | | FALCAO, L. L.; WERNECK, J. O. S.; ALBUQUERQUE, P. S. B.; ALVES, R. M.; GRYNBERG, P.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; BRIGIDO, M. M.; MARCELLINO, L. H. Comparative transcriptomics of cupuassu (Theobroma grandiflorum) offers insights into the early defense mechanism to Moniliophthora perniciosa, the causal agent of witches' broom disease. Journal of Plant Interactions, v. 17, n. 1, p. 991-1005, 2022. Na publicação; Joseilde Oliveira Silva-Werneck.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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74. | | MEIRA, F. S.; RIBEIRO, D. G.; CAMPOS, S. S. de; FALCAO, L. L.; GOMES, A. C. M. M.; DUSI, D. M. de A.; MARCELLINO, L. H.; REIS, A. M. dos; PEREIRA, J. E. S. Differential expression of genes potentially related to the callogenesis and in situ hybridization of SERK gene in macaw palm (Acrocomia aculeata Jacq.) Lodd. ex Mart. Protoplasma, v. 261, p. 89-101, 2024. Na publicação: Angela Mehta; Jonny Everson Scherwinski-Pereira.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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75. | | SANTOS, L. F. dos; FREGAPANI, R. M.; FALCAO, L. L.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; LOPES, U. V.; GRAMACHO, K. P.; ALVES, R. M.; MICHELI, F.; MARCELLINO, L. H. First microsatellite markers developed from cupuassu ESTs: application in diversity analysis and cross-species transferability to cacao. PLoS ONE, v. 11, n. 3, e0151074, 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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76. | | MOREIRA, J. S.; ALMEIDA, R. G.; SANTOS, M. O.; VASCONCELOS, I. M.; OLIVEIRA, J. T. A.; RIBEIRO, S. da G.; MARCELLINO, L. H.; DIAS, S. C.; FRANCO, O. L. Molecular characterization of two antifungal proteins from flowers of Rosemay pepper (Lippia Sidoides) with activity against botrytis cinerea. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Fortaleza. Programa e resumos. Brasília, DF: SBBiotec, 2010. p. 90.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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77. | | SANTOS, L. F. dos; SILVA, R. J. S.; AMARAL, D. O. J. do; PAULA, M. F. B. de; FALCÃO, L. L.; LEGAVRE, T.; ALVES, R. M.; MARCELLINO, L. H.; MICHELI, F. Selection of reference genes for expression study in pulp and seeds of Theobroma grandiflorum (Willd. ex Spreng.) Schum. Plos One, v. 11, n. 8, e0160646, 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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