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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
Data corrente: |
28/12/2009 |
Data da última atualização: |
26/05/2011 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
BINNECK, E.; IWATA, M.; SANTOS, L. G. A. dos; MARCELINO, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L. |
Afiliação: |
ELISEU BINNECK, CNPSo; MARCELO IWATA, UEL; LUIZ GUSTAVO ANDRADE DOS SANTOS, UEL; FRANCISMAR CORREA MARCELINO, CNPSo; RICARDO VILELA ABDELNOOR, CNPSo; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, CNPSo. |
Título: |
VSQUAL: a visual system to assist DNA sequencing quality control. |
Ano de publicação: |
2009 |
Fonte/Imprenta: |
In: SIMPOSIO NACIONAL DE BIOTECNOLOGIA REDBIO-ARGENTINA, 7.; CONGRESO INTERNACIONAL-REDBIO-ARGENTINA, 2., 2009, Rosario. La biotecnologia y los futuros escenarios mundiales: [resumenes]. Rosario: INTA, 2009. p. 59. |
Idioma: |
Inglês |
Palavras-Chave: |
Bioinformática. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 00679naa a2200181 a 4500 001 1578919 005 2011-05-26 008 2009 bl --- 0-- u #d 100 1 $aBINNECK, E. 245 $aVSQUAL$ba visual system to assist DNA sequencing quality control. 260 $c2009 653 $aBioinformática 700 1 $aIWATA, M. 700 1 $aSANTOS, L. G. A. dos 700 1 $aMARCELINO, F. C. 700 1 $aABDELNOOR, R. V. 700 1 $aNEPOMUCENO, A. L. 773 $tIn: SIMPOSIO NACIONAL DE BIOTECNOLOGIA REDBIO-ARGENTINA, 7.; CONGRESO INTERNACIONAL-REDBIO-ARGENTINA, 2., 2009, Rosario. La biotecnologia y los futuros escenarios mundiales: [resumenes]. Rosario: INTA, 2009. p. 59.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
Data corrente: |
11/03/2010 |
Data da última atualização: |
20/07/2011 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
IBELLI, A. M. G.; GIACHETTO, P. F.; OLIVEIRA, M. C. de S.; YAMAGISHI, M. E. B.; VENERONI, G. B.; TIZIOTO, P. C.; REGITANO, L. C. de A. |
Afiliação: |
ADRIANA MÉRCIA G. IBELLI, UFSCar, SÃO CARLOS, SP; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; MARCIA CRISTINA DE SENA OLIVEIRA, CPPSE; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; GISELE B. VENERONI, UFSCar, SÃO CARLOS, SP; UFSCar/SÃO PAULO, SP; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
Título: |
Vias regulatórias envolvidas na resistência e susceptibilidade de bovinos infestados com carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus. |
Ano de publicação: |
2009 |
Fonte/Imprenta: |
In: WORKSHOP DA REDE GENÔMICA ANIMAL, 1., 2009, Fortaleza. Anais... Fortaleza, Rede Genômica Animal, 2009 |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
A variabilidade genética para resistência de bovinos ao carrapato tem sido verificada em diversos grupos genéticos. A compreensão dos mecanismos envolvidos nessa variação pode auxiliar a identificação de genes ou marcadores para essa característica. O objetivo desse trabalho foi verificar quais vias regulatórias podem estar envolvidas na resistência e suscetibilidade de bovinos submetidos à infestação artificial com carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus. Para isso, amostras de pele (PE) e linfonodo (LN) de animais previamente classificados em resistentes (PER e LNR) e sensíveis (PES e LNS) foram coletadas no nono dia após a infestação artificial com carrapato. Foi realizado o isolamento e purificação em coluna de sílica do RNA total e, posteriormente, as amostras foram submetidas à análise de expressão gênica pela técnica de microarranjos utilizando a plataforma Affymetrix. Os dados foram processados pelo pacote Affy, em programa R, para correção de background e normalização e, submetidos à análise de co-expressão relativa a genes-guia, considerando-se tecido e categoria de resistência. Com base na categorização de genes co-expressos, quanto ao processo biológico, observou-se que a maioria dos genes foram os relacionados à divisão celular, processos metabólicos, regulação positiva da transcrição dependente de RNA polimerase II e quimiotaxia. Quando avaliada por tecidos e por tratamento (resistente ou sensível), verificou-se alguma especificidade como quimiotaxia de macrófago e regulação positiva de transcrição só relatadas no grupo PE, enquanto que modificação de cromatina e oxirredução foram observadas no grupo LN. Quanto à função molecular, as classes ligantes de proteína, íon metálico, atividade de citocina e quimiocina foram as mais abundantes, sendo que os grupos PER e LNR apresentaram maior porcentagem de genes co-expressos para atividade de citocina, e menor porcentagem para atividade de quimiocina quando comparados aos grupos PES e LNS, respectivamente. As funções de ligantes de proteína, de seqüência específica de DNA e atividade de fator de transcrição foram presentes apenas em PE. Para atividade oxirredutase, transferase, hidrolase e ligantes de ATP, os co-expressos só foram detectados em LN e para todas essas funções, a maior abundância foi para LNR. Pode-se concluir até o momento, que várias vias observadas são tecido-específicas e que há diferença na porcentagem de genes co-expressos entre os grupos sugerindo que novos genes candidatos devem ser estudados para verificar o seu papel na resistência ou susceptibilidade a esse parasita. MenosA variabilidade genética para resistência de bovinos ao carrapato tem sido verificada em diversos grupos genéticos. A compreensão dos mecanismos envolvidos nessa variação pode auxiliar a identificação de genes ou marcadores para essa característica. O objetivo desse trabalho foi verificar quais vias regulatórias podem estar envolvidas na resistência e suscetibilidade de bovinos submetidos à infestação artificial com carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus. Para isso, amostras de pele (PE) e linfonodo (LN) de animais previamente classificados em resistentes (PER e LNR) e sensíveis (PES e LNS) foram coletadas no nono dia após a infestação artificial com carrapato. Foi realizado o isolamento e purificação em coluna de sílica do RNA total e, posteriormente, as amostras foram submetidas à análise de expressão gênica pela técnica de microarranjos utilizando a plataforma Affymetrix. Os dados foram processados pelo pacote Affy, em programa R, para correção de background e normalização e, submetidos à análise de co-expressão relativa a genes-guia, considerando-se tecido e categoria de resistência. Com base na categorização de genes co-expressos, quanto ao processo biológico, observou-se que a maioria dos genes foram os relacionados à divisão celular, processos metabólicos, regulação positiva da transcrição dependente de RNA polimerase II e quimiotaxia. Quando avaliada por tecidos e por tratamento (resistente ou sensível), verificou-se alguma especificidade como quimiotaxia de m... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Melhoramento genético; Susceptibilidade. |
Thesagro: |
Boophilus microplus; Carrapato; Resistência. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/38076/1/PROCI-2009.00368.pdf
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Marc: |
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