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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
29/12/2014 |
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Data da última atualização: |
07/04/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BENCKE-MALATO, M.; CABREIRA, C.; WIEBKE-STROHM, B.; BÜCKER-NETO, L.; MANCINI, E.; OSORIO, M. B.; HOMRICH, M. S.; TURCHETTO-ZOLET, A. C.; CARVALHO, M. C. C. G. de; STOLF, R.; WEBER, R. L. M.; WESTERGAARD, G.; CASTAGNARO, A. P.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; MARGIS-PINHEIRO, M.; BODANESE-ZANETTINI, M. H. |
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Afiliação: |
MARTA BENCKE-MALATO, UFRGS; CAROLINE CABREIRA, UFRGS; BEATRIZ WIEBKE-STROHM, UFRGS; LAURO BÜCKER-NETO, UFRGS; ESTEFANIA MANCINI, Instituto de Agrobiotecnologia Rosario SA; MARINA B. OSORIO, UFRGS; MILENA S. HOMRICH, UFRGS; ANDREIA CARINA TURCHETTO-ZOLET, UFRGS; MAYRA C. C. G. DE CARVALHO, CNPSO - estagiária; RENATA STOLF, CNPSO - estagiària; RICARDO L. M. WEBER, UFRGS; GASTÓN WESTERGAARD, Instituto de Agrobiotecnologia Rosario SA; ATÍLIO P. CASTAGNARO, Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres (EEAOC); RICARDO VILELA ABDELNOOR, CNPSO; FRANCISMAR CORREA MARCELINO-GUIMARÃES, CNPSO; MÁRCIA MARGIS-PINHEIRO, UFRGS; MARIA HELENA BODANESE-ZANETTINI, UFRGS. |
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Título: |
Genome-wide annotation of the soybean WRKY family and functional characterization of genes involved in response to Phakopsora pachyrhizi infection. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Plant Biology, v. 14, n. 1, article 236, Sept. 2014. |
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Páginas: |
18 p. |
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ISSN: |
1471-2229 |
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DOI: |
10.1186/s12870-014-0236-0 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Background: Many previous studies have shown that soybean WRKY transcription factors are involved in the plant response to biotic and abiotic stresses. Phakopsora pachyrhizi is the causal agent of Asian Soybean Rust, one of the most important soybean diseases. There are evidences that WRKYs are involved in the resistance of some soybean genotypes against that fungus. The number of WRKY genes already annotated in soybean genome was underrepresented. In the present study, a genome-wide annotation of the soybean WRKY family was carried out and members involved in the response to P. pachyrhizi were identified. Results: As a result of a soybean genomic databases search, 182 WRKY-encoding genes were annotated and 33 putative pseudogenes identified. Genes involved in the response to P. pachyrhizi infection were identified using superSAGE, RNA-Seq of microdissected lesions and microarray experiments. Seventy-five genes were differentially expressed during fungal infection. The expression of eight WRKY genes was validated by RT-qPCR. The expression of these genes in a resistant genotype was earlier and/or stronger compared with a susceptible genotype in response to P. pachyrhizi infection. Soybean somatic embryos were transformed in order to overexpress or silence WRKY genes. Embryos overexpressing a WRKY gene were obtained, but they were unable to convert into plants. When infected with P. pachyrhizi, the leaves of the silenced transgenic line showed a higher number of lesions than the wild-type plants. Conclusions: The present study reports a genome-wide annotation of soybean WRKY family. The participation of some members in response to P. pachyrhizi infection was demonstrated. The results contribute to the elucidation of gene function and suggest the manipulation of WRKYs as a strategy to increase fungal resistance in soybean plants. MenosBackground: Many previous studies have shown that soybean WRKY transcription factors are involved in the plant response to biotic and abiotic stresses. Phakopsora pachyrhizi is the causal agent of Asian Soybean Rust, one of the most important soybean diseases. There are evidences that WRKYs are involved in the resistance of some soybean genotypes against that fungus. The number of WRKY genes already annotated in soybean genome was underrepresented. In the present study, a genome-wide annotation of the soybean WRKY family was carried out and members involved in the response to P. pachyrhizi were identified. Results: As a result of a soybean genomic databases search, 182 WRKY-encoding genes were annotated and 33 putative pseudogenes identified. Genes involved in the response to P. pachyrhizi infection were identified using superSAGE, RNA-Seq of microdissected lesions and microarray experiments. Seventy-five genes were differentially expressed during fungal infection. The expression of eight WRKY genes was validated by RT-qPCR. The expression of these genes in a resistant genotype was earlier and/or stronger compared with a susceptible genotype in response to P. pachyrhizi infection. Soybean somatic embryos were transformed in order to overexpress or silence WRKY genes. Embryos overexpressing a WRKY gene were obtained, but they were unable to convert into plants. When infected with P. pachyrhizi, the leaves of the silenced transgenic line showed a higher number of lesions than ... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Soja. |
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Thesaurus Nal: |
Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/114583/1/Genome-wide-annotation-of-the-soybean-WRKY-family-and-functional-characterization-of-genes-involved-in-response-to-Phakopsora-pachyrhizi-infection.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
11/02/2008 |
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Data da última atualização: |
02/05/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
KRAUSE, W.; RAMALHO, M. A. P.; ABREU, A. de F. B. |
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Afiliação: |
WILLIAN KRAUSE, UFLA; MAGNO ANTONIO PATTO RAMALHO, UFLA; ANGELA DE FATIMA BARBOSA ABREU, CNPAF. |
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Título: |
Alternativas para melhorar eficiência dos experimentos de valor de cultivo e uso na cultura do feijoeiro. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista Ceres, v. 54, n. 312, p. 200-206, mar./abr. 2007. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi avaliar a precisão de experimentos de valor de cultivo e uso (VCU), com ênfase na necessidade de bordadura e no emprego de variáveis ambientes como covariáveis da variável dependente produtividade de grãos de 20 linhagens de feijão. Para avaliar a necessidade de bordadura foram realizadas as análises de variância de produtividade de grãos (kg/ha), considerando as áreas útil e total e a bordadura. Nas análises de covariância foram consideradas como covariáveis: o teor de nutrientes do solo; a quantidade de água recebida por parcela; e o estande final. O uso de bordaduras não contribuiu para a melhoria da precisão experimental e não alterou o desempenho médio das linhagens avaliadas neste trabalho. Maior precisão experimental foi obtida quando se considerou a área total da parcela. O emprego dos teores de nutrientes como covariável só foi eficaz quando seu teor no solo foi considerado crítico para a cultura. A utilização da quantidade total de água recebida por parcela e o estande final como covariáveis, não contribuíram na melhoria da eficiência dos experimento |
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Palavras-Chave: |
Avaliação; Cultivar; Genética quantitativa; Precisão experimental. |
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Thesagro: |
Feijão; Phaseolus Vulgaris; Variedade. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/33636/1/RCKrause.pdf
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Marc: |
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520 $aO objetivo deste trabalho foi avaliar a precisão de experimentos de valor de cultivo e uso (VCU), com ênfase na necessidade de bordadura e no emprego de variáveis ambientes como covariáveis da variável dependente produtividade de grãos de 20 linhagens de feijão. Para avaliar a necessidade de bordadura foram realizadas as análises de variância de produtividade de grãos (kg/ha), considerando as áreas útil e total e a bordadura. Nas análises de covariância foram consideradas como covariáveis: o teor de nutrientes do solo; a quantidade de água recebida por parcela; e o estande final. O uso de bordaduras não contribuiu para a melhoria da precisão experimental e não alterou o desempenho médio das linhagens avaliadas neste trabalho. Maior precisão experimental foi obtida quando se considerou a área total da parcela. O emprego dos teores de nutrientes como covariável só foi eficaz quando seu teor no solo foi considerado crítico para a cultura. A utilização da quantidade total de água recebida por parcela e o estande final como covariáveis, não contribuíram na melhoria da eficiência dos experimento
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653 $aCultivar
653 $aGenética quantitativa
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773 $tRevista Ceres$gv. 54, n. 312, p. 200-206, mar./abr. 2007.
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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