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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
26/04/2010 |
Data da última atualização: |
29/09/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
MAIA, L. C. da; SOUZA, V. Q. de; KOPP, M. M.; CARVALHO, F. I. F. de F; OLIVEIRA, A. C. |
Afiliação: |
LUCIANO CARLOS DA MAIA, UFPel; VELCI QUEIRÓZ DE SOUZA, UFSM; MAURICIO MARINI KOPP, CNPGL; ERNANDO IRAJÁ FÉLIX DE CARVALHO, UFPel; ANTÔNIO COSTA OLIVEIRA, UFPel. |
Título: |
Tandem repeat distribution of gene transcripts in three plant families. |
Ano de publicação: |
2009 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 32, n. 4, p. 822-833, 2009. |
DOI: |
https://doi.org/10.1590/S1415-47572009005000091 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Tandem repeats (microsatellites or SSRs) are molecular markers with great potential for plant genetic studies. Modern strategies include the transfer of these markers among widely studied and orphan species. In silico analyses allow for studying distribution patterns of microsatellites and predicting which motifs would be more amenable to interspecies transfer. Transcribed sequences (Unigene) from ten species of three plant families were surveyed for the occurrence of micro and minisatellites. Transcripts from different species displayed different rates of tandem repeat occurrence, ranging from 1.47% to 11.28%. Both similar and different patterns were found within and among plant families. The results also indicate a lack of association between genome size and tandem repeat fractions in expressed regions. The conservation of motifs among species and its implication on genome evolution and dynamics are discussed. |
Palavras-Chave: |
Comparative genomics; EST; SSR. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/711664/1/Tandem-repeat-distribution-of-gene-transcripts-in-three-plant-families.pdf
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Marc: |
LEADER 01601naa a2200217 a 4500 001 1711664 005 2022-09-29 008 2009 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1590/S1415-47572009005000091$2DOI 100 1 $aMAIA, L. C. da 245 $aTandem repeat distribution of gene transcripts in three plant families.$h[electronic resource] 260 $c2009 520 $aTandem repeats (microsatellites or SSRs) are molecular markers with great potential for plant genetic studies. Modern strategies include the transfer of these markers among widely studied and orphan species. In silico analyses allow for studying distribution patterns of microsatellites and predicting which motifs would be more amenable to interspecies transfer. Transcribed sequences (Unigene) from ten species of three plant families were surveyed for the occurrence of micro and minisatellites. Transcripts from different species displayed different rates of tandem repeat occurrence, ranging from 1.47% to 11.28%. Both similar and different patterns were found within and among plant families. The results also indicate a lack of association between genome size and tandem repeat fractions in expressed regions. The conservation of motifs among species and its implication on genome evolution and dynamics are discussed. 653 $aComparative genomics 653 $aEST 653 $aSSR 700 1 $aSOUZA, V. Q. de 700 1 $aKOPP, M. M. 700 1 $aCARVALHO, F. I. F. de F 700 1 $aOLIVEIRA, A. C. 773 $tGenetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto$gv. 32, n. 4, p. 822-833, 2009.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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URL |
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Registros recuperados : 98 | |
61. | | SILVA, F. S. B.; MELO, A. M. Y.; MELO, N. F. de; RESENDE, G. M. de; CAMPOS, M. A. S.; MAIA, L. C. Produção de proteínas do solo relacionadas à glomalina (PSRG) na rizosfera de maracujazeiros-doce em função do uso de vermicomposto e fontes de inóculo micorrízico. In: ENCONTRO NACIONAL DE MICROBIOLOGIA AMBIENTAL, 11.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, DO SOLO, 10; . 2008, Fortaleza. Resumos exandidos... Fortaleza: UFC, 2008. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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62. | | LUCHE, H. de S.; SILVA, J. A. G. da; NORNBERG, R.; ARENHARDT, E. G.; CAETANO, V. da R.; MAIA, L. C. da; OLIVEIRA, A. C. de. Prediction of Parental Combination for Introduction of Stay-green Associated Loci in Wheat¹. Journal of Crop Science and Biotechnology, v. 20, n. 2. p. 73-80, 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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64. | | SILVA, E. M.; MAIA, L. C.; MENEZES, K. M. S.; BRAGA, M. B.; MELO, N. F. de; YANO-MELO, A. M. Water availability and formation of propagules of arbuscular mycorrhizal fungi associated with sorghum. Applied Soil Ecology, Amsterdam, v. 94, p. 15-20, 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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65. | | OLIVEIRA, A. C. de; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; SILVEIRA, C. F.; BRAGA, E. J. B.; FONSECA, G. de M. da; BENITEZ, L. C.; MAIA, L. C. da; LUZ, V. K. da. Ácido abscísico e o estresse abiótico. Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2010. 30 p. (Embrapa Clima Temperado. Documentos, 307).Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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66. | | PEREIRA, C. M. R.; GOTO, B. T.; SILVA, D. K. A. da; FERREIRA, A. C. de A.; SOUZA, F. A. de; SILVA, G. A. da S.; MAIA, L. C.; OEHL, F. Acaulospora reducta sp. nov. and A. excavata: two glomeromycotan fungi with pitted spores from Brazil. Mycotaxon, Ithaca, v. 130, p. 983-995,Oct./Dec. 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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67. | | OLIVEIRA, A. C. de; MAIA, L. C. da; ALMEIDA, A. M.; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; MISTURA, C. C.; BERVALD, C. M. P.; FARIAS, D. R.; AHLERT, R. A.; CRESTANI, M.; VITAL, C.; LOUREIRO, M. E.; BARBIERI, R. L. Assessment of genetic variation in Brazilian rice: Novel traits and novel techniques. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON GENOMICS OF PLANT GENETIC RESOURCES, 2., 2010, Bologna, Itália. Final program & abstracts. Bologna: University of Bologna, 2010. p. 205. P5.08Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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68. | | BRANCO, J. S. C.; BRESOLIN, A. P. S.; MAGALHÃES JUNIOR, A. M.; MARINI, N.; KOPP, M. M.; MAIA, L. C.; MALONE, E.; MISTURA, C.; AHLERT, R. J.; CARVALHO, F. I. de; OLIVEIRA, A. C. de. Análise da coleção ativa de germoplasma de arroz (Oryza sativa L.) da Embrapa Clima Temperado baseada na técnica de marcadores moleculares AFLP. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 5.; REUNIÃO DA CULTURA DO ARROZ IRRIGADO, 27., 2007, Pelotas. Anais... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2007. v. 1, p. 286-288Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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69. | | BENITEZ, L. C. B.; VIGHI, I. L.; AULER, P. A.; AMARAL, M. N. do; MORAES, G. P.; RODRIGUES, G. dos S.; MAIA, L. C. da; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; BRAGA, E. J. B. Correlation of proline content and gene expression involved in the metabolism of this amino acid under abiotic stress. Acta Physiologiae Plantarum, v. 38, n. 11, p. 267-1-12, 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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70. | | SILVA, J. A. G. da; CARVALHO, F. I. F. de; HARTWIG, I.; CAETANO, V. da R.; BERTAN, I.; MAIA, L. C. da; SCHIMIDT, D. A. M.; FINATTO, T.; VALÉRIO, I. P. Distância morfológica entre genótipos de trigo com ausência e presença do caráter "stay-green". Ciência Rural, Santa Maria, v. 37, n. 5, p.1261-1267, set/out, 2007.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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71. | | LUCHE, H. de S.; SILVA, J. A. G. da; NORNBERG, R.; SILVEIRA, S. F. S. da; BARETTA, D.; GROLI, E. L.; MAIA, L. C. da; OLIVEIRA, A. C. de. Desempenho per se e parâmetros genéticos de linhagens de trigo com expressão do caráter "stay-green". Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 48, n. 2, p. 167-173, fev. 2013. Título em inglês: Per se performance and genetic parameters of wheat lines expressing the ?stay?green? character.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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72. | | SANTOS, O. P. dos; CARVALHO, I. R.; NRDINO, M.; OLIVOTO, T.; PELEGRIN, A. J. de; SZARESKI, V. J.; FERRARI, M.; NUNES, A. C. P.; DEMARI, G. H.; LAUTENCHLEGER, F.; SOUZA, V. Q. de; MAIA, L. C. da. Methods of adaptability and stability applied to eucalyptus breeding. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 53, n. 1, p. 53-62, jan. 2018. Título em português: Métodos de adaptabilidade e estabilidade aplicados ao melhoramento de eucalipto.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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73. | | NORNBERG, R.; SILVA, J. A. G. da; LUCHE, H. de S.; TESSMANN, E. W.; KAVALCO, S. A. F.; ZIMMER, C. M.; BARETTA, D.; MAIA, L. C. da; OLIVEIRA, A. C. de. Tolerance to preharvest sprouting and yield of wheat genotypes from different breeding programs. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 50, n. 8, p. 698-706, ago. 2015. Título em português: Tolerância à germinação na pré?colheita e produtividade de genótipos de trigo de diferentes programas de melhoramento.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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74. | | MAIA, L. C. da; CADORE, P. R. B.; BENITEZ, L. C.; DANIELLOWSKI, R.; BRAGA, E. J.; FAGUNDES, P. R. R.; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; OLIVEIRA, A. C. de. Transcriptome profiling of rice seedlings under cold stress. Functional Plant Biology, v. 44, n. 4, p. A-K, 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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75. | | LUZ, V. K. da; FONSECA, G. de M. da; GROLI, E. L.; FIGUEIREDO, R.; BARETTA, D.; SILVEIRA, S.; NEVES, C. G.; KOPP, M. M.; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; MAIA, L. C. da; OLIVEIRA, A. C. de. Variabilidade para caracteres agronômicos em mutantes de arroz. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 8., 2013, Santa Maria. Avaliando cenários para a produção sustentável de arroz: anais. Santa Maria: UFSM; Porto Alegre: Sosbai, 2013.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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76. | | LUCHE, H. de S.; SILVA, J. A. G. da; NORNBERG, R.; HAWERROTH, M. C.; SILVEIRA, S. F. da S.; CAETANO, V. da R.; SANTOS, R. L.; FIGUEIREDO, R. G.; MAIA, L. C. da; OLIVEIRA, A. C. de. Stay-green character and its contribution in Brazilian wheats. Ciência Rural, Santa Maria, v. 47, n. 1, p. 1-7, 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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77. | | LUZ, V. K. da; FONSECA, G. M.; GROLI, E. L.; NEVES, C. G.; FIGUEIREDO, R.; BARETTA, D.; SILVEIRA, S. F. S.; KOPP, M. M.; MAGALHÃES-JÚNIOR, A. M.; MAIA, L. C.; OLIVEIRA, A. C. Variability for agronomically important traits in rice mutant families. In: INTERNATIONAL CROP SCIENCE CONGRESS, 6., 2012, Bento Gonçalves. [Proceedings...] [S.l.]: International Crop Science Society, 2012. 1 pendrive. Resumo 2904.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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78. | | FACCHINELLO, P. H. K.; CARVALHO, I. R.; STRECK, E. A.; AGUIAR, G. A.; GOVEIA, J.; FEIJÓ, M.; PEREIRA, R. R.; FAGUNDES, P. R. R.; LORO, M. V.; MAIA, L. C. DA; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de. Genetic cause and effect interrelationships for grain quality attributes of irrigated rice. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 58, e03252, 2023. Título em português: Inter-relações genéticas de causa e efeito para atributos de qualidade de grãos de arroz irrigado.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Unidades Centrais. |
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79. | | OLIVEIRA, V. F. de; VENSKE, E.; STAFEN, C. F.; PANIZ, F. P.; PEDRON, T.; PEREIRA, R. M.; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; MAIA, L. C. da; OLIVEIRA, A. C. de; BATISTA, B. L.; PEGORARO, C. Genome-wide association of iron content in rice grains grown in Southern Brazil. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 58, e03203, 2023. Título em português: Associação genômica ampla para teor de ferro em grãos de arroz na região Sul do Brasil.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Unidades Centrais. |
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80. | | AGUIAR, G. A.; STRECK, E.; SEVERO, A. C. de M.; OLIVEIRA, A. C. de; MAIA, L. C. da; MORAES, O. P. de; NEVES, P.; FAGUNDES, P. R. R.; MAGALHÃES JUNIOR, A. M. de. Desempenho agronômico de linhagens de arroz irrigado em ensaio de VCU no RS - safra 2011/12. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 8., 2013, Santa Maria. Avaliando cenários para a produção sustentável de arroz: anais. Santa Maria: UFSM; Porto Alegre: Sosbai, 2013. v.1. p. 233-236.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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