| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Caprinos e Ovinos. Para informações adicionais entre em contato com cnpc.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos. |
|
Data corrente: |
23/08/2023 |
|
Data da última atualização: |
24/08/2023 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
LEÃO, U. S.; BUENO, L. G.; NEGREIROS, A. B.; SILVA, G. R.; MAGGIONI, R.; BRITTO. F. B.; SARMENTO, J. L. R.; GALVANI, D. B.; DINIZ, F. M. |
|
Afiliação: |
UESLEI S. LEÃO, Northeast Biotechnology Network (RENORBIO); UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ; LUICE GOMES BUENO GALVANI, CNPC; ALINE B. NEGREIROS, Northeast Biotechnology Network (RENORBIO); UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ; GEICE R. SILVA; RODRIGO MAGGIONI, INSTITUTE OF MARINE SCIENCES (LABOMAR), UNIVERSIDADE FEDERAL DO CEARÁ; FABIO B. BRITTO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ; JOSE L. R. SARMENTO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ; DIEGO BARCELOS GALVANI, CNPC; FABIO MENDONCA DINIZ, CNPC. |
|
Título: |
Unveiling the demographic background and genetic diversity of Urochloa mosambicensis (Poaceae) through genome-wide identification of simple sequence repeats and molecular marker development. |
|
Ano de publicação: |
2023 |
|
Fonte/Imprenta: |
Conservation Genetics Resources, v. 15, p. 1-9, Aug. 2023. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s12686-023-01312-8 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Abstract: The first set of simple sequence repeat (SSR) markers for Urochloa mosambicensis (Hack.) Dandy is described in this study. SSRs were isolated from a genomic library with 3491 contigs obtained by high-throughput sequencing. Primers were designed for twenty loci, and all primer pairs were successfully amplified in 39 genotypes, yielding an average of 4.95 alleles per locus. The mean polymorphic information content (PIC) was 0.559, and the mean discriminating power (DP) was 0.520 for all loci considering also all U. mosambicensis genotypes. The non?Bayesian clustering analysis has confirmed clustering consistency of the individuals and provides enough support for the existence of the pattern that also emerged from PCoA and UPGMA. These markers demonstrated potential transferability to U. advena, U. oligotricha, U. brachyura and U. xantholeuca. Our findings showed that the set of molecular markers described here have strong potential for fingerprinting and characterizing genetic diversity in intra-specific plant collections, whose breeding programs could be accelerated by the effective use of these molecular tools, not only in U. mosambicensis, but also within the genus Urochloa. |
|
Palavras-Chave: |
Capim-corrente; Genetic diversity; High-throughput sequencing; Microsatellites; Next-generation sequencing; SSR; Transferability. |
|
Thesagro: |
Capim Urochloa; Genética Molecular; Gramínea Forrageira; Marcador Genético; Marcador Molecular; Urochloa Mosambicensis. |
|
Thesaurus Nal: |
Forage grasses; Genetic markers; Molecular genetics; Plant genetics; Sequence analysis. |
|
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
|
Marc: |
LEADER 02618naa a2200445 a 4500
001 2156061
005 2023-08-24
008 2023 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s12686-023-01312-8$2DOI
100 1 $aLEÃO, U. S.
245 $aUnveiling the demographic background and genetic diversity of Urochloa mosambicensis (Poaceae) through genome-wide identification of simple sequence repeats and molecular marker development.$h[electronic resource]
260 $c2023
520 $aAbstract: The first set of simple sequence repeat (SSR) markers for Urochloa mosambicensis (Hack.) Dandy is described in this study. SSRs were isolated from a genomic library with 3491 contigs obtained by high-throughput sequencing. Primers were designed for twenty loci, and all primer pairs were successfully amplified in 39 genotypes, yielding an average of 4.95 alleles per locus. The mean polymorphic information content (PIC) was 0.559, and the mean discriminating power (DP) was 0.520 for all loci considering also all U. mosambicensis genotypes. The non?Bayesian clustering analysis has confirmed clustering consistency of the individuals and provides enough support for the existence of the pattern that also emerged from PCoA and UPGMA. These markers demonstrated potential transferability to U. advena, U. oligotricha, U. brachyura and U. xantholeuca. Our findings showed that the set of molecular markers described here have strong potential for fingerprinting and characterizing genetic diversity in intra-specific plant collections, whose breeding programs could be accelerated by the effective use of these molecular tools, not only in U. mosambicensis, but also within the genus Urochloa.
650 $aForage grasses
650 $aGenetic markers
650 $aMolecular genetics
650 $aPlant genetics
650 $aSequence analysis
650 $aCapim Urochloa
650 $aGenética Molecular
650 $aGramínea Forrageira
650 $aMarcador Genético
650 $aMarcador Molecular
650 $aUrochloa Mosambicensis
653 $aCapim-corrente
653 $aGenetic diversity
653 $aHigh-throughput sequencing
653 $aMicrosatellites
653 $aNext-generation sequencing
653 $aSSR
653 $aTransferability
700 1 $aBUENO, L. G.
700 1 $aNEGREIROS, A. B.
700 1 $aSILVA, G. R.
700 1 $aMAGGIONI, R.
700 1 $aBRITTO. F. B.
700 1 $aSARMENTO, J. L. R.
700 1 $aGALVANI, D. B.
700 1 $aDINIZ, F. M.
773 $tConservation Genetics Resources$gv. 15, p. 1-9, Aug. 2023.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 27 | |
| 1. |  | MAGGIONI, R. de A.; TOMASI, J. de C.; ZUFFELLATO-RIBAS, K. C.; WENDLING, I. Ácido indolbutírico e diferentes clones no enraizamento de estacas de Araucaria angustifolia. In: SEMINÁRIO SUL-BRASILEIRO SOBRE A SUSTENTABILIDADE DA ARAUCÁRIA, 3., 2018, Passo Fundo. Uso sustentável, produção, inovação, educação, legislação, conservação: anais. Tapera: Lew, 2018. p. 148-150.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
|    |
| 5. | | LEGAT, A. P.; MAGGIONI, R.; KAMIMURA, M. T.; MENEZES, A. G.; ARAÚJO, A. C. Potencial de Litopenaeus vannamei para o melhoramento genético e a sustentabilidade da carcinicultura no Estado do Piauí-Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE OCEANOGRAFIA, 3.; CONGRESSO IBERO-AMERICANO DE OCEANOGRAFIA, 1., 2008, Fortaleza. Anais... Fortaleza: Associação Brasileira de Oceanografia, 2008. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
| |
| 6. | | STUEPP, C. A.; FRAGOSO, R. O.; MAGGIONI, R. A.; ZUFFELLATO-RIBAS, K. C.; WENDLING, I. Vegetative rescue and ex vitro plants production system for Ginkgo biloba by cuttings and mini-cuttings. Revista Brasileira de Plantas Medicinais, São Paulo, v. 19, n. 2, p. 300-303, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
| 8. | | STUEPP, C. A.; FRAGOSO, R. de O.; MAGGIONI, R. de A.; LATOH, L. P.; WENDLING, I.; ZUFFELLATO-RIBAS, K. C. Ex vitro system for acer palmatum plants propagation by mini-cuttings technique. Cerne, Lavras, v. 22, n. 3, p. 355-364, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
| 12. | | SÁ, F. P. de; GOMES, E. N.; MAGGIONI, R. de A.; WENDLING, I.; HELM, C. V.; SANT'ANNA-SANTOS, B. F.; ZUFELLATO-RIBAS, K. C. Biochemical and anatomical features of adventitious rhizogenesis in apical and basal mini-cuttings of Ilex paraguariensis. New Forests, v. 53, p. 411-430, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
|  |
| 13. | | GABIRA, M. M.; AGUIAR, N. S. de; DUARTE, M. M.; VIEIRA, L. M.; TOMASI, J. de C.; MAGGIONI, R. de A.; WENDLING, I. CEVAD campo: cultivo de erva-mate em alta densidade no campo. Colombo: Embrapa Florestas, 2023. 11 p. (Embrapa Florestas. Comunicado técnico, 486). ODS 2, 8, 12, 15 e 17.| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
| 14. | | MAGGIONI, R.; COIMBRA, M. R. M.; COSTA, R. B. da; DINIZ, F. M.; MOLINA, W. F.; OLIVEIRA, D. M. de; LEGAT, A. P. Genetic variability of marine shrimp in the brazilian industry. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 48, n. 8, p. 968-974, ago. 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| 15. | | PEREIRA, V. A.; FORTE, J. M.; ARRUDA-JÚNIOR, J. P. V.; DINIZ, F. M.; MAGGIONI, R.; SALMITO-VANDERLEY, C. S. B. Identification and characterization of microsatellite loci in West Atlantic sea cucumber Holothuria grisea (Selenka 1867). Journal of Genetics, v. 97, n. 5, p. 1363-1369, Dec. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 16. | | DUARTE, M. M.; TOMASI, J. de C.; GABIRA, M. M.; VIEIRA, L. M.; AGUIAR, N. S. de; MAGGIONI, R. de A.; NOGUEIRA, A. C.; WENDLING, I. Estaquia e enraizamento de genótipos de erva-mate com elevado teor de cafeína. In: EVENTOS ARAUCÁRIA: PESQUISA, INOVAÇÃO E TECNOLOGIAS PARA SISTEMAS DE PRODUÇÃO, ERVA-MATE XXI: INOVAÇÃO E TECNOLOGIAS PARA O SETOR ERVATEIRO, 2020, Colombo. Anais. Colombo: Embrapa Florestas, 2021. p. 42. (Embrapa Florestas. Documentos, 344). Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
| 17. | | GABIRA, M. M.; AGUIAR, N. S. de; MAGGIONI, R. de A.; VIEIRA, L. M.; TOMASI, J. de C.; DUARTE, M. M.; WENDLING, I. Influência de doses de nitrogênio sobre a densidade foliar em erva-mate. In: EVENTOS ARAUCÁRIA: PESQUISA, INOVAÇÃO E TECNOLOGIAS PARA SISTEMAS DE PRODUÇÃO, ERVA-MATE XXI: INOVAÇÃO E TECNOLOGIAS PARA O SETOR ERVATEIRO, 2020, Colombo. Anais. Colombo: Embrapa Florestas, 2021. p. 57. (Embrapa Florestas. Documentos, 344). Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
| 18. | | MAGGIONI, R. de A.; DUARTE, M. M.; VIEIRA, L. M.; FOLADORI-INVERNIZZI, S.; NOGUEIRA, A. C.; CARPANEZZI, A. A.; ZUFFELLATO-RIBAS, K. C. Morphology and germination of Aegiphila brachiata Vell.: potential species for ecological restoration in atlantic forest. DELOS: Desarrollo Local Sostenible, v. 16, n. 42, p. 31-47, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
| 19. | | VIEIRA, L. M.; MAGGIONI, R. de A.; TOMASI, J. de C.; GOMES, E. N.; WENDLING, I.; HELM, C. V.; KOEHLER, H. S.; ZUFFELLATO-RIBAS, K. C. Vegetative propagation, chemical composition and antioxidant activity of yerba mate genotypes. Plant Genetic Resources, v. 19, n. 2, p. 112-121, Apr. 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
| 20. | | LEAO, U. S.; BUENO, L. G.; WILKE, D. V.; MAGGIONI, R.; SILVA, G. R. da; NEGREIROS, A. B.; DINIZ, F. M. Sequenciamento de Nova Geração (NGS) de Urochloa mosambicensis: uma forrageira promissora para o semiárido. In: ENCONTRO DE BIOTECNOLOGIA DO NORDESTE, 2017, Natal. Livro de resumos. [Recife: Rede Nordeste de Biotecnologia, 2017]. Resumo RAS0002. 1 f. RENORBIO 2017.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| Registros recuperados : 27 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
