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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Clima Temperado. |
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Data corrente: |
18/03/2021 |
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Data da última atualização: |
18/03/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ROSSATTO, T.; AULER, P. A.; AMARAL, M. N.; MILECH, C.; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; BRAGA, E. J. B. |
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Afiliação: |
T. ROSSATTO, UFPEL; P. A. AULER, UFPEL; M. N. AMARAL, UFPEL; C. MILECH, UFPEL; ARIANO MARTINS DE MAGALHAES JUNIOR, CPACT; E. J. B. BRAGA, UFPEL. |
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Título: |
Selection of Reference Genes for RT-qPCR Studies in Different Organs of Rice Cultivar BRS AG Submitted to Recurrent Saline Stress. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Russian Journal of Plant Physiology, v. 68, n. 2, p. 254-265, 2021. |
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ISSN: |
1021-4437 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Quantitative real-time polymerase chain reactions (RT-qPCR) have become one of the most widely used methods for analyzing gene expression, provided suitable reference genes are available to normalize the data. RNA was isolated from leaves, grain, rachises and sheaths of rice (Oryza sativa L. cv. BRS AG) submitted to different saline stress events for seven days, and expression analysis was carried out by RT-qPCR. Expression levels of ten candidate reference genes were assessed, actin11 (ACT11), ubiquitin conjugating enzyme E2 (UBC-E2), eukaryotic elongation factor1-a (Eef-1a), glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), B-tubulin (B-Tub), eukaryotic initiation factor 4a (Eif-4-a), ubiquitin10 (UBQ10), ubiquitin5 (UBQ5), aquaporin TIP41 (TIP41-like). Gene expression stability was calculated using the common statistical algorithms geNorm, BestKeeper and ?Ct method, NormFinder and RefFinder. The most stably expressed genes were UBC2E and GAPDH for leaves, UBQ5 and UBQ10 for sheaths, TIP41 and UBQ10 for rachises, and TIP41 and cyclophilin for grain. Gene expression of triose phosphate translocator (TPT1), ADP-glucose transporter (BT1-1), choline monooxygenase (CMO) was used to validate the selected reference genes. The results highlighted the importance of using suitable reference gene to normalize gene expression data in rice plants. |
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Thesagro: |
Arroz; Gene; Oryza Sativa. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/221965/1/Artigo-Selection-of-Reference-Genes.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Clima Temperado (CPACT) |
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| Registros recuperados : 295 | |
| 82. |  | FALQUETO, A. R.; CASSOL, D.; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; OLIVEIRA, A. C. de; BACARIN, M. A. Physiological analysis of leaf senescence of two rice cultivars with different yield potential. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 44, n. 7, p. 695-700, jul. 2009. Título em português: Análise fi siológica da senescência foliar de duas cultivares de arroz com diferentes potenciais de produtividade.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 85. | | ROSSATTO, T.; AULER, P. A.; AMARAL, M. N.; MILECH, C.; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; BRAGA, E. J. B. Selection of Reference Genes for RT-qPCR Studies in Different Organs of Rice Cultivar BRS AG Submitted to Recurrent Saline Stress. Russian Journal of Plant Physiology, v. 68, n. 2, p. 254-265, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 87. | | ZIMMER, G.; STRECK, E. A.; AGUIAR, G. A.; SANTOS, R. L.; SEVERO, A. C. M.; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de. Tolerância de linhagens de arroz irrigado frente à toxidez por ferro, safra 2013/2014. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 23.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 16., 2014, Pelotas. [Anais.]. Pelotas: UFPel, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 88. | | PINHO, C. F. de; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; PINTO, J. J. O.; DONIDA, A.; PIVETA, L. Tolerência de cultivares de arroz a mistura comercial dos herbicidas imazethapyr+mazapic, persistente no solo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 6., 2009, Porto Alegre. Estresses e sustentabilidade: desafios para a lavoura arrozeira: anais. Porto Alegre: Palotti, 2009. p. 320-323.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 89. | | STEINMETZ, S.; CUADRA, S. V.; ALMEIDA, I. R. de; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; FAGUNDES, P. R. R. Soma térmica e estádios de desenvolvimento da planta de grupos de cultivares de arroz irrigado. Agrometeoros, Passo Fundo, v. 25, n. 2, p. 405-414, dez. 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 90. | | FACCHINELLO, P. H. K.; FEIJÓ, M. M.; STRECK, E. A.; AGUIAR, G. A.; PEREIRA, R. R.; LONGARAY, M. B.; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de. Adaptabilidade e estabilidade de linhagens de arroz irrigado no ensaio regional para o Sul do Brasil. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 27.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO UFPEL, 20.; SEMANA INTEGRADA DE ENSINO, PESQUISA E EXTENSÃO, 4., 2018, Pelotas. Anais... Pelotas: UFPel, 2018.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 91. | | FACCHINELLO, P. H. K.; FEIJÓ, M. M.; AGUIAR, G. A.; STRECK, E. A.; COLOMBARI FILHO, J. M.; FAGUNDES, P. R. R.; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de. Adaptabilidade e estabilidade de linhagens CL de arroz irrigado no ensaio regional da Embrapa para o Sul do Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 11., 2019. Balneário Camboriú, SC. Inovação e desenvolvimento na orizicultura: anais eletrônico. Itajaí: Epagri: Sosbai, 2019.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 92. | | STRECK, E. A.; MAGALHÃES JÚNIOR, A. M. de; FAGUNDES, P. R. R.; SEVERO, A. C. M.; MORAES, O. P. de; AGUIAR, G.; LOPES, J. L.; OLIVEIRA, F. A. Adaptabilidade e estabilidade de linhagens elites de arroz irrigado (Oryza sativa L.) do Programa de Melhoramento da Embrapa no RS. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 8., 2013, Santa Maria. Avaliando cenários para a produção sustentável de arroz: anais. Santa Maria: UFSM; Porto Alegre: Sosbai, 2013. v.1. p. 169-172.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 94. | | FAGUNDES, P. R. R.; MAGALHÃES JUNIOR, A. M. de; MOURA NETO, F. P.; PETRINI, J. A.; SEVERO, A.; SILVA, M. G. da. Avaliação de cultivares de arroz irrigado da Embrapa no Rio Grande do Sul, safra 2009/10. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 7., 2011, Balneário Camboriú. Racionalizando recursos e ampliando oportunidades: anais. Itajaí: Epagri, 2011. v. 1. p. 129-132.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 97. | | GETZ, B. M.; LUZ, V. K. da; MACHADO, N. D.; SOUSA, R. O. de; BARBOSA NETO, J. F.; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; OLIVEIRA, A. C. de. Avaliação de genótipos de arroz para tolerância ao frio no início do período vegetativo. CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 9., 2015, Pelotas. Ciência e tecnologia para otimização da orizicultura: anais. Brasília, DF: Embrapa; Pelotas: Sosbai, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 98. | | LOPES, J. L.; MAGALHAES JUNIOR, A. M. de; FAGUNDES, P. R. R.; STRECK, E. A.; OLIVEIRA, F. A.; GARCIA, N. da S.; KNABAH, O. Avaliação de linhagens elites de arroz irrigado do programa de melhoramento da Embrapa no rs frente à toxidez causada por ferro, safra 2012/13. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 8., 2013, Santa Maria. Avaliando cenários para a produção sustentável de arroz: anais. Santa Maria: UFSM; Porto Alegre: Sosbai, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 99. | | MAGALHÃES JÚNIOR, A. M. de; FAGUNDES, P. R. R.; FRANCO, D. F.; TERRES, A. L.; RANGEL, P. H.; MOURA NETO, F. P. Avaliação de famílias S0:2 de arroz irrigado do melhoramento genético da Embrapa safra 2002/03 - Pelotas/RS. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 3.; REUNIÃO DA CULTURA DO ARROZ IRRIGADO, 25., 2003, Balneário Camboriú. Anais... Balneário Camboriú: EPAGRI, 2003.. p. 84-86.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 100. | | MAGALHÃES JUNIOR, A. M. de; FRANCO, D. F.; FAGUNDES, P. R. R.; TERRES, A.; RANGEL, P. H.; GUIMARAES, E. P.; MOURA NETO, F. P. Avaliação de famílias S02 oriundas do programa de melhoramento genético de arroz da Embrapa via seleção recorrente - safra 2000/2001. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 2.; REUNIÃO DA CULTURA DO ARROZ IRRIGADO, 24., 2001, Porto Alegre. Anais... Porto Alegre: IRGA, 2001. p. 45-48.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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