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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
Data corrente: |
24/09/2018 |
Data da última atualização: |
05/02/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
OLIVEIRA, A. A. de; PASTINA, M. M.; SOUZA, V. F. de; PARRELLA, R. A. da C.; NODA, R. W.; SIMEONE, M. L. F.; SCHAFFERT, R. E.; MAGALHAES, J. V. de; DAMASCENO, C. M. B.; MARGARIDO, G. R. A. |
Afiliação: |
Amanda Avelar de Oliveira; MARIA MARTA PASTINA, CNPMS; Vander Filipe de Souza; RAFAEL AUGUSTO DA COSTA PARRELLA, CNPMS; ROBERTO WILLIANS NODA, CNPMS; MARIA LUCIA FERREIRA SIMEONE, CNPMS; ROBERT EUGENE SCHAFFERT, CNPMS; JURANDIR VIEIRA DE MAGALHAES, CNPMS; CYNTHIA MARIA BORGES DAMASCENO, CNPMS; Gabriel Rodrigues Alves Margarido. |
Título: |
Genomic prediction applied to high-biomass sorghum for bioenergy production. |
Ano de publicação: |
2018 |
Fonte/Imprenta: |
Molecular Breeding, v. 38, n. 49, p. 1-16, 2018. |
DOI: |
10.1007/s11032-018-0802-5 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The increasing cost of energy and finite oil and gas reserves have created a need to develop alternative fuels from renewable sources. Due to its abiotic stress tolerance and annual cultivation, high-biomass sorghum (Sorghum bicolor L. Moench) shows potential as a bioenergy crop. Genomic selection is a useful tool for accelerating genetic gains and could restructure plant breeding programs by enabling early selection and reducing breeding cycle duration. This work aimed at predicting breeding values via genomic selection models for 200 sorghum genotypes comprising landrace accessions and breeding lines from biomass and saccharine groups. These genotypes were divided into two sub-panels, according to breeding purpose. We evaluated the following phenotypic biomass traits: days to flowering, plant height, fresh and dry matter yield, and fiber, cellulose, hemicellulose, and lignin proportions. Genotyping by sequencing yielded more than 258,000 single-nucleotide polymorphism markers, which revealed population structure between subpanels. We then fitted and compared genomic selection models BayesA, BayesB, BayesC?, BayesLasso, Bayes Ridge Regression and random regression best linear unbiased predictor. The resulting predictive abilities varied little between the different models, but substantially between traits. Different scenarios of prediction showed the potential of using genomic selection results between sub-panels and years, although the genotype by environment interaction negatively affected accuracies. Functional enrichment analyses performed with the marker-predicted effects suggested several interesting associations, with potential for revealing biological processes relevant to the studied quantitative traits. This work shows that genomic selection can be successfully applied in biomass sorghum breeding programs. MenosThe increasing cost of energy and finite oil and gas reserves have created a need to develop alternative fuels from renewable sources. Due to its abiotic stress tolerance and annual cultivation, high-biomass sorghum (Sorghum bicolor L. Moench) shows potential as a bioenergy crop. Genomic selection is a useful tool for accelerating genetic gains and could restructure plant breeding programs by enabling early selection and reducing breeding cycle duration. This work aimed at predicting breeding values via genomic selection models for 200 sorghum genotypes comprising landrace accessions and breeding lines from biomass and saccharine groups. These genotypes were divided into two sub-panels, according to breeding purpose. We evaluated the following phenotypic biomass traits: days to flowering, plant height, fresh and dry matter yield, and fiber, cellulose, hemicellulose, and lignin proportions. Genotyping by sequencing yielded more than 258,000 single-nucleotide polymorphism markers, which revealed population structure between subpanels. We then fitted and compared genomic selection models BayesA, BayesB, BayesC?, BayesLasso, Bayes Ridge Regression and random regression best linear unbiased predictor. The resulting predictive abilities varied little between the different models, but substantially between traits. Different scenarios of prediction showed the potential of using genomic selection results between sub-panels and years, although the genotype by environment interaction n... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Genotipagem. |
Thesagro: |
Bioenergia; Biomassa. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/183412/1/Genomic-prediction.pdf
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Marc: |
LEADER 02655naa a2200277 a 4500 001 2096210 005 2019-02-05 008 2018 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1007/s11032-018-0802-5$2DOI 100 1 $aOLIVEIRA, A. A. de 245 $aGenomic prediction applied to high-biomass sorghum for bioenergy production.$h[electronic resource] 260 $c2018 520 $aThe increasing cost of energy and finite oil and gas reserves have created a need to develop alternative fuels from renewable sources. Due to its abiotic stress tolerance and annual cultivation, high-biomass sorghum (Sorghum bicolor L. Moench) shows potential as a bioenergy crop. Genomic selection is a useful tool for accelerating genetic gains and could restructure plant breeding programs by enabling early selection and reducing breeding cycle duration. This work aimed at predicting breeding values via genomic selection models for 200 sorghum genotypes comprising landrace accessions and breeding lines from biomass and saccharine groups. These genotypes were divided into two sub-panels, according to breeding purpose. We evaluated the following phenotypic biomass traits: days to flowering, plant height, fresh and dry matter yield, and fiber, cellulose, hemicellulose, and lignin proportions. Genotyping by sequencing yielded more than 258,000 single-nucleotide polymorphism markers, which revealed population structure between subpanels. We then fitted and compared genomic selection models BayesA, BayesB, BayesC?, BayesLasso, Bayes Ridge Regression and random regression best linear unbiased predictor. The resulting predictive abilities varied little between the different models, but substantially between traits. Different scenarios of prediction showed the potential of using genomic selection results between sub-panels and years, although the genotype by environment interaction negatively affected accuracies. Functional enrichment analyses performed with the marker-predicted effects suggested several interesting associations, with potential for revealing biological processes relevant to the studied quantitative traits. This work shows that genomic selection can be successfully applied in biomass sorghum breeding programs. 650 $aBioenergia 650 $aBiomassa 653 $aGenotipagem 700 1 $aPASTINA, M. M. 700 1 $aSOUZA, V. F. de 700 1 $aPARRELLA, R. A. da C. 700 1 $aNODA, R. W. 700 1 $aSIMEONE, M. L. F. 700 1 $aSCHAFFERT, R. E. 700 1 $aMAGALHAES, J. V. de 700 1 $aDAMASCENO, C. M. B. 700 1 $aMARGARIDO, G. R. A. 773 $tMolecular Breeding$gv. 38, n. 49, p. 1-16, 2018.
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Registro |
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URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Meio-Norte. |
Data corrente: |
11/07/2013 |
Data da última atualização: |
14/12/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
PINHEIRO, É. M.; PORTO, R. G. C. L.; ARAÚJO, M. A. da M.; MOREIRA-ARAÚJO, R. S. dos R.; ROCHA, M. de M. |
Afiliação: |
ÉRICA MENDONÇA PINHEIRO, UFPI; RAYSSA GABRIELA COSTA LIMA PORTO, UFPI; MARCOS ANTÔNIO DA MOTA ARAÚJO; REGILDA SARAIVA DOS REIS MOREIRA-ARAÚJO, UFPI; MAURISRAEL DE MOURA ROCHA, CPAMN. |
Título: |
Capacidade antioxidante e efeito do cozimento em genótipos elite de feijão-caupi. |
Ano de publicação: |
2013 |
Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 3., 2013, Recife. Feijão-Caupi como alternativa sustentável para os sistemas produtivos familiares e empresariais. Recife: IPA, 2013. |
Idioma: |
Português |
Notas: |
CONAC 2012. Disponível em: http://www.conac2012.org/resumos/pdf/124f.pdf. Acesso em: 11 jul. 2013. |
Conteúdo: |
O feijão-caupi é uma das leguminosas mais adaptadas, versáteis e nutritiva, componente essencial dos sistemas de produção nas regiões secas dos trópicos, com grande importância sócioeonômica na região Nordeste do Brasil. O seu grão, além de rico em proteínas e minerais, apresenta adicionalmente em sua composição química, substâncias antioxidantes que podem que atuam na captação de radicais livres, prevenindo certas doenças. Este trabalho objetivou determinar a capacidade antioxidante, antes e após o cozimento, em genótipos elite de feijão-caupi. Foram avaliados genótipos elites de feijão-caupi MNC03-737F-5-9, MNC03-737F-5-4 e Pingo de Ouro 1-2, quanto à capacidade antioxidante, por meio da metodoligia de P. A cultivar Pingo de Ouro 1-2 apresentou a maior atividade antioxidante, antes e após o cozimento, relativamente aos outros genótipos avaliados. |
Palavras-Chave: |
Efeito antioxidante. |
Thesagro: |
Cocção; Vigna Unguiculata. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/85873/1/124f.pdf
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Marc: |
LEADER 01737nam a2200205 a 4500 001 1961899 005 2023-12-14 008 2013 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aPINHEIRO, É. M. 245 $aCapacidade antioxidante e efeito do cozimento em genótipos elite de feijão-caupi.$h[electronic resource] 260 $aIn: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 3., 2013, Recife. Feijão-Caupi como alternativa sustentável para os sistemas produtivos familiares e empresariais. Recife: IPA$c2013 500 $aCONAC 2012. Disponível em: http://www.conac2012.org/resumos/pdf/124f.pdf. Acesso em: 11 jul. 2013. 520 $aO feijão-caupi é uma das leguminosas mais adaptadas, versáteis e nutritiva, componente essencial dos sistemas de produção nas regiões secas dos trópicos, com grande importância sócioeonômica na região Nordeste do Brasil. O seu grão, além de rico em proteínas e minerais, apresenta adicionalmente em sua composição química, substâncias antioxidantes que podem que atuam na captação de radicais livres, prevenindo certas doenças. Este trabalho objetivou determinar a capacidade antioxidante, antes e após o cozimento, em genótipos elite de feijão-caupi. Foram avaliados genótipos elites de feijão-caupi MNC03-737F-5-9, MNC03-737F-5-4 e Pingo de Ouro 1-2, quanto à capacidade antioxidante, por meio da metodoligia de P. A cultivar Pingo de Ouro 1-2 apresentou a maior atividade antioxidante, antes e após o cozimento, relativamente aos outros genótipos avaliados. 650 $aCocção 650 $aVigna Unguiculata 653 $aEfeito antioxidante 700 1 $aPORTO, R. G. C. L. 700 1 $aARAÚJO, M. A. da M. 700 1 $aMOREIRA-ARAÚJO, R. S. dos R. 700 1 $aROCHA, M. de M.
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Embrapa Meio-Norte (CPAMN) |
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