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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
01/06/2022 |
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Data da última atualização: |
01/06/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GLADMAN, N.; HUFNAGEL, B.; REGULSKI, M.; LIU, Z.; WANG, X.; CHOUGULE, K.; KOCHIAN, L.; MAGALHAES, J. V. de; WARE, D. |
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Afiliação: |
NICHOLAS GLADMAN, Cold Spring Harbor Laboratory; BARBARA HUFNAGEL, Centre National de la Recherche Scientifique, Montpellier; MICHAEL REGULSKI, Cold Spring Harbor Laboratory; ZHIGANG LIU, University of Saskatchewan; XIAOFEI WANG, Cold Spring Harbor Laboratory; KAPEEL CHOUGULE, Cold Spring Harbor Laboratory; LEON KOCHIAN, University of Saskatchewan; JURANDIR VIEIRA DE MAGALHAES, CNPMS; DOREEN WARE, Cornell University. |
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Título: |
Sorghum root epigenetic landscape during limiting phosphorus conditions. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant Direct, v. 6, n. 5, e393, 2022. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1002/pld3.393 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Efficient acquisition and use of available phosphorus from the soil is crucial for plant growth, development, and yield. With an ever-increasing acreage of croplands with suboptimal available soil phosphorus, genetic improvement of sorghum germplasm for enhanced phosphorus acquisition from soil is crucial to increasing agricultural output and reducing inputs, while confronted with a growing world population and uncertain climate. Sorghum bicolor is a globally important commodity for food, fodder, and forage. Known for robust tolerance to heat, drought, and other abiotic stresses, its capacity for optimal phosphorus use efficiency (PUE) is still being investigated for optimized root system architectures (RSA). Whilst a few RSA-influencing genes have been identified in sorghum and other grasses, the epigenetic impact on expression and tissue-specific activation of candidate PUE genes remains elusive. Here, we present transcriptomic, epigenetic, and regulatory network profiling of RSA modulation in the BTx623 sorghum background in response to limiting phosphorus (LP) conditions. We show that during LP, sorghum RSA is remodeled to increase root length and surface area, likely enhancing its ability to acquire P. Global DNA 5-methylcytosine and H3K4 and H3K27 trimethylation levels decrease in response to LP, while H3K4me3 peaks and DNA hypomethylated regions contain recognition motifs of numerous developmental and nutrient responsive transcription factors that display disparate expression patterns between different root tissues (primary root apex, elongation zone, and lateral root apex). MenosEfficient acquisition and use of available phosphorus from the soil is crucial for plant growth, development, and yield. With an ever-increasing acreage of croplands with suboptimal available soil phosphorus, genetic improvement of sorghum germplasm for enhanced phosphorus acquisition from soil is crucial to increasing agricultural output and reducing inputs, while confronted with a growing world population and uncertain climate. Sorghum bicolor is a globally important commodity for food, fodder, and forage. Known for robust tolerance to heat, drought, and other abiotic stresses, its capacity for optimal phosphorus use efficiency (PUE) is still being investigated for optimized root system architectures (RSA). Whilst a few RSA-influencing genes have been identified in sorghum and other grasses, the epigenetic impact on expression and tissue-specific activation of candidate PUE genes remains elusive. Here, we present transcriptomic, epigenetic, and regulatory network profiling of RSA modulation in the BTx623 sorghum background in response to limiting phosphorus (LP) conditions. We show that during LP, sorghum RSA is remodeled to increase root length and surface area, likely enhancing its ability to acquire P. Global DNA 5-methylcytosine and H3K4 and H3K27 trimethylation levels decrease in response to LP, while H3K4me3 peaks and DNA hypomethylated regions contain recognition motifs of numerous developmental and nutrient responsive transcription factors that display disparate ex... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Cromatina. |
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Thesagro: |
Deficiência; DNA; Fósforo; Metilação; Sistema Radicular; Sorghum Bicolor; Sorgo. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1143596/1/Sorghum-root-epigenetic-landscape.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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| Registros recuperados : 175 | |
| 61. |  | ALVES, V. M. C.; OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; PITTA, G. V. E.; SCHAFFERT, R. E.; MAGALHAES, J. V. de. Nova metodologia para seleção de genótipos de sorgo quanto a tolerância ao alumínio em solução nutritiva. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 25.; SIMPOSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 1., 2004, Cuiabá, MT. Da agricultura familiar ao agronegócio: tecnologia, competitividade e sustentabilidade: [resumos expandidos]. Sete Lagoas: ABMS: Embrapa Milho e Sorgo; Cuiabá: Empaer, 2004. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 64. | | APOLINÁRIO, L. C.; BARROS, B. de A.; PINTO, M. de O.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARAES, L. J. M.; GUIMARÃES, F. F. M.; GUIMARÃES, C. T. Aumento da tolerância ao alumínio em linhagens elites de milho conferido pela introgressão do alelo superior do gene ZmMATE1. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 32., 2018, Lavras. Soluções integradas para os sistemas de produção de milho e sorgo no Brasil: resumos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2018. p. 237.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 65. | | ROSA, J. R. B. F.; GUIMARÃES, C. T.; MAGALHAES, J. V. de; DIAS, K. O. das G.; SILVA, L. da C. e; PASTINA, M. M. Aplicação da associação genômica no melhoramento de plantas. In: PEIXOTO, L. de A.; BHERING, L. L.; CRUZ, C. D. (ed.). Seleção genômica aplicada ao melhoramento genético. Viçosa, MG: Universidade Federal de Viçosa, 2022. p. 47-71.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 66. | | MENDES, G. S. B.; OLIVEIRA, R. P. de; BARROS, B. de A.; PINTO, M. de O.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARÃES, C. T. Associação de polimorfismos no gene ZmAATE1 com a tolerância ao alumínio em genótipos de milho de ampla diversidade. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 33., 2022, Sete Lagoas. Brasil: 200 anos de independência: sustentabilidade e desafios para a cadeia produtiva de grãos: resumos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2022. Evento online.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 67. | | GUEDES, F. L.; TARDIN, F. D.; MAGALHAES, J. V. de; NASCIMENTO, J. M. S.; SANTOS, F. G. dos; SCHAFFERT, R. E. Avaliação fenotípica de linhagens de sorgo granífero quanto a tolerância a seca em pós-florescimento. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 4., 2007, São Lourenço. Melhoramento de plantas e agronegócio: Anais... Lavras: UFLA: SBMP, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 68. | | RODRIGUES, F.; SILVA, L. A.; ROCHA, M. C. da; COELHO, A. M.; MAGALHAES, J. V. de; RODRIGUES, J. A. S.; SCHAFFERT, R. E. Avaliação da produtividade de linhagens recombinantes contrastantes para gene de tolerância ao Al tóxico em sorgo - AltSB. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 27.; SIMPOSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 3.; WORKSHOP SOBRE MANEJO E ETIOLOGIA DA MANCHA BRANCA DO MILHO, 2008, Londrina. Agroenergia, produção de alimentos e mudanças climáticas: desafios para milho e sorgo: trabalhos e palestras. [Londrina]: IAPAR; [Sete Lagoas]: Embrapa Milho e Sorgo, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 69. | | TOME, L. G. O.; GAMA, E. E. G.; GUIMARAES, C. T.; MAGALHAES, J. V. de; OLIVEIRA, R. M. O.; CRUZ, C. D. Avaliação do potencial, da variabilidade e de parâmetros genéticos em população de milho com e sem estresse hídrico In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 4., 2007, São Lourenço. Melhoramento de plantas e agronegócio: Anais... Lavras: UFLA: SBMP, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 70. | | MAGALHAES, J. V. de; ALVES, V. M. C.; NOVAIS, R. F. de; MAGALHAES, J. R.; BAHIA FILHO, A. F. de C. Ammonium absorption by maize (Zea mays L.) under increasing periods of phosphorus starvation in nutritive solution. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON PLANT SOIL INTERACTIONS AT LOW pH, 4., 1996, Belo Horizonte. Abstracts... Sete Lagoas: EMBRAPA-CNPMS, 1996. Section 3, p. 10.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 71. | | LIU, Z.; QIN, T.; ATIENZA, M.; ZHAO, Y.; NGUYEN, H.; SHENG, H.; OLUKAYODE, O.; SONG, H.; PANJVANI, K.; MAGALHAES, J. V. de; LUCAS, W. J.; KOCHIAN, L. V. Constitutive basis of root system architecture: uncovering a promising trait for breeding nutrient-and drought-resilient crops. aBIOTECH, v. 4, p. 315–331, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 72. | | LANA, U. G. de P.; GUIMARAES, C. T.; ALVES, V. M. C.; SCHAFFERT, R. E.; KOCHIAN, L. V.; MAGALHAES, J. V. de. Caracterização molecular do gene SbMATE, principal responsável pela tolerância ao alumínio em sorgo. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 27.; SIMPOSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 3.; WORKSHOP SOBRE MANEJO E ETIOLOGIA DA MANCHA BRANCA DO MILHO, 2008, Londrina. Agroenergia, produção de alimentos e mudanças climáticas: desafios para milho e sorgo: trabalhos e palestras. [Londrina]: IAPAR; [Sete Lagoas]: Embrapa Milho e Sorgo, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 74. | | MAGALHAES, J. V. de; DAMASCENO, C. B.; MENEZES, C. B. de; GUIMARAES, C. T.; FIGUEIREDO, L. F. de A.; CARNEIRO, A. A.; SCHAFFERT, R. E. Biotecnologia na cultura do sorgo. In: CANÇADO, G. M. de A.; LONDE, L. N. (Ed.). Biotecnologia aplicada à agropecuária. Caldas: EPAMIG, 2012. p. 557-592.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 75. | | RODRIGUES, F.; SILVA, L. A.; ROCHA, M. C.; COELHO, A. M.; TARDIN, F. D.; RODRIGUES, J. A. S.; MAGALHAES, J. V. de; SCHAFFERT, R. E. Correlação genética entre características de linhagens recombinantes de sorgo em três níveis de saturação de alumínio. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 27.; SIMPOSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 3.; WORKSHOP SOBRE MANEJO E ETIOLOGIA DA MANCHA BRANCA DO MILHO, 2008, Londrina. Agroenergia, produção de alimentos e mudanças climáticas: desafios para milho e sorgo: trabalhos e palestras. [Londrina]: IAPAR; [Sete Lagoas]: Embrapa Milho e Sorgo, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 76. | | SILVA, L. A.; CARVALHO JUNIOR, G. A. de; TARDIN, F. D.; MAGALHAES, J. V. de; RODRIGUES, J. A. S.; SCHAFFERT, R. E. Crescimento radicular de híbridos de sorgo isogênicos avaliados quanto a tolerância ao alumínio tóxico. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 5., 2009, Vitória. O melhoramento e os novos cenários da agricultura: anais. Vitória: Incaper, 2009. 1 CD-ROM. (Incaper. Documentos, 11).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 77. | | SILVA, L. A.; RODRIGUES, F.; ROCHA, M. C. da; SOUZA, J. C.; TARDIN, F. D.; MAGALHAES, J. V. de; RODRIGUES, J. A. S.; SCHAFFERT, R. E. Desenvolvimento radicular de híbridos isogênicos de sorgo avaliados em cinco níveis de alumínio em solução nutritiva. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 27.; SIMPOSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 3.; WORKSHOP SOBRE MANEJO E ETIOLOGIA DA MANCHA BRANCA DO MILHO, 2008, Londrina. Agroenergia, produção de alimentos e mudanças climáticas: desafios para milho e sorgo: trabalhos e palestras. [Londrina]: IAPAR; [Sete Lagoas]: Embrapa Milho e Sorgo, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 79. | | TINOCO, C. F. D. S.; MAGALHAES, J. V. de; LANA, U. G. de P.; NODA, R. W.; SIMÕES, C. C.; GUIMARAES, C. T. Data mining and phylogeny to select candidate genes responsible for aluminum tolerance in maize. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010. p. 15. AB3C X-meeting 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 80. | | KOCHIAN, L. V.; MAGALHAES, J. V. de; LIU, J.; GUIMARAES, C. T.; ALVES, V. M. C.; MARON, L.; SHAFF, J.; LYI, M.; SCHAFFERT, R. E. Elucidating the molecular determinants of aluminum tolerance in sorghum and maize. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 15., 2007, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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