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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
Data corrente: |
15/10/2020 |
Data da última atualização: |
06/07/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
BERNARDINO, K. C.; MENEZES, C. B. de; SOUSA, S. M. de; GUIMARÃES, C. T.; CARNEIRO, P. C. S.; SCHAFFERT, R. E.; KOCHIAN, L. V.; HUFNAGEL, B.; PASTINA, M. M.; MAGALHAES, J. V. de. |
Afiliação: |
Karine C. Bernardino, Universidade Federal de Viçosa; CICERO BESERRA DE MENEZES, CNPMS; SYLVIA MORAIS DE SOUSA TINOCO, CNPMS; CLAUDIA TEIXEIRA GUIMARAES, CNPMS; Pedro C. S. Carneiro, Universidade Federal de Viçosa; ROBERT EUGENE SCHAFFERT, CNPMS; Leon V. Kochian, University of Saskatchewan; Barbara Hufnagel, University of Montpellier; MARIA MARTA PASTINA, CNPMS; JURANDIR VIEIRA DE MAGALHAES, CNPMS. |
Título: |
Association mapping and genomic selection for sorghum adaptation to tropical soils of Brazil in a sorghum multiparental random mating population. |
Ano de publicação: |
2021 |
Fonte/Imprenta: |
Theoretical and Applied Genetics, v. 134, p. 295-312, 2021. |
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00122-020-03697-8 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Tropical soils where low phosphorus (P) and aluminum (Al) toxicity limit sorghum [Sorghum bicolor (L.) Moench] production are widespread in the developing world. We report on BRP13R, a multiparental random mating population (MPRMP), which is commonly used in sorghum recurrent selection targeting tropical soil adaptation. Recombination dissipated much of BRP13R?s likely original population structure and average linkage disequilibrium (LD) persisted up to 2.5 Mb, establishing BRP13R as a middle ground between biparental populations and sorghum association panels. Genome-wide association mapping (GWAS) identifed conserved QTL from previous studies, such as for root morphology and grain yield under low-P, and indicated the importance of dominance in the genetic architecture of grain yield. By overlapping consensus QTL regions, we mapped two candidate P efciency genes to a ~5 Mb region on chromosomes 6 (ALMT) and 9 (PHO2). Remarkably, we fnd that only 200 progeny genotyped with~45,000 markers in BRP13R can lead to GWAS-based positional cloning of naturally rare, subpopulation-specifc alleles, such as for SbMATE-conditioned Al tolerance. Genomic selection was found to be useful in such MP-RMP, particularly if markers in LD with major genes are ftted as fxed efects into GBLUP models accommodating dominance. Shifts in allele frequencies in progeny contrasting for grain yield indicated that intermediate to minor-efect genes on P efciency, such as SbPSTOL1 genes, can be employed in pre-breeding via allele mining in the base population. Therefore, MP-RMPs such as BRP13R emerge as multipurpose resources for efcient gene discovery and deployment for breeding sorghum cultivars adapted to tropical soils. MenosTropical soils where low phosphorus (P) and aluminum (Al) toxicity limit sorghum [Sorghum bicolor (L.) Moench] production are widespread in the developing world. We report on BRP13R, a multiparental random mating population (MPRMP), which is commonly used in sorghum recurrent selection targeting tropical soil adaptation. Recombination dissipated much of BRP13R?s likely original population structure and average linkage disequilibrium (LD) persisted up to 2.5 Mb, establishing BRP13R as a middle ground between biparental populations and sorghum association panels. Genome-wide association mapping (GWAS) identifed conserved QTL from previous studies, such as for root morphology and grain yield under low-P, and indicated the importance of dominance in the genetic architecture of grain yield. By overlapping consensus QTL regions, we mapped two candidate P efciency genes to a ~5 Mb region on chromosomes 6 (ALMT) and 9 (PHO2). Remarkably, we fnd that only 200 progeny genotyped with~45,000 markers in BRP13R can lead to GWAS-based positional cloning of naturally rare, subpopulation-specifc alleles, such as for SbMATE-conditioned Al tolerance. Genomic selection was found to be useful in such MP-RMP, particularly if markers in LD with major genes are ftted as fxed efects into GBLUP models accommodating dominance. Shifts in allele frequencies in progeny contrasting for grain yield indicated that intermediate to minor-efect genes on P efciency, such as SbPSTOL1 genes, can be employed in pr... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Seleção genômica. |
Thesagro: |
Gene; Genética Vegetal; Melhoramento Genético Vegetal; Sorgo. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/223127/1/Association-mapping.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados. |
Data corrente: |
08/02/2022 |
Data da última atualização: |
08/02/2022 |
Tipo da produção científica: |
Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
Autoria: |
RINALDI, M. M.; FIALHO, J. de F.; VIEIRA, E. A.; BRAZ, S. F. de O. A. |
Afiliação: |
MARIA MADALENA RINALDI, CPAC; JOSEFINO DE FREITAS FIALHO, CPAC; EDUARDO ALANO VIEIRA, CPAC; SAMARA FIGUEIREDO DE OLIVEIRA ASSIS BRAZ. |
Título: |
Adição de agente de massa como alternativa no cozimento de raízes de mandioca. |
Ano de publicação: |
2021 |
Fonte/Imprenta: |
Planaltina, DF : Embrapa Cerrados, 2021. |
Páginas: |
34 p. |
Série: |
(Embrapa Cerrados. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 383). |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Resumo ? No Distrito Federal e entorno, a produção e o consumo de mandioca de mesa são expressivos. Entretanto, em determinadas épocas do ano, as raízes da mandioca de mesa podem apresentar dificuldade para o cozimento em função de questões genéticas e ambientais. O bicarbonato de sódio tem sido apontado, de forma empírica, como alternativa de solução. Assim, avaliou-se o bicarbonato de sódio como agente de massa no cozimento de raízes de mandioca de mesa. Diferentes concentrações desse agente de massa no cozimento de raízes de mandioca das cultivares BRS 397 e BRS 399 foram estudadas. Foram avaliadas a adição do produto diretamente na água de fervura para o cozimento das raízes e no tratamento prévio ao cozimento, em que as raízes foram mantidas submersas no produto por diferentes tempos de tratamento. Os melhores resultados foram obtidos quando a mandioca foi mantida sob imersão por, no mínimo, 24 horas na solução, contendo a concentração de bicarbonato de sódio a partir de 1,5%. No entanto, a mandioca apresentou acentuado odor e sabor característicos de bicarbonato de sódio em todas as concentrações e tempos de imersão utilizados, não sendo o método recomendado como alternativa para a melhoria do cozimento de raízes de mandioca de mesa. |
Thesagro: |
Bicarbonato de Sódio; Mandioca; Processamento Mínimo. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/231073/1/Bolpd-383.pdf
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Marc: |
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