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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
24/07/2018 |
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Data da última atualização: |
05/02/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
DIAS, K. O. das G.; GEZAN, S. A.; GUIMARÃES, C. T.; NAZARIAN, A.; SILVA, L. da C. e; PARENTONI, S. N.; GUIMARAES, P. E. de O.; ANONI, C. de O.; PÁDUA, J. M. V.; PINTO, M. de O.; NODA, R. W.; RIBEIRO, C. A. G.; MAGALHAES, J. V. de; GARCIA, A. A. F.; SOUZA, J. C. de; GUIMARAES, L. J. M.; PASTINA, M. M. |
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Afiliação: |
Kaio Olímpio das Graças Dias, Universidade Federal de Lavras; Salvador Alejandro Gezan, School of Forest Resources & Conservation, University of Florida, Gainesville.; CLAUDIA TEIXEIRA GUIMARAES, CNPMS; Alireza Nazarian, School of Forest Resources & Conservation, University of Florida, Gainesville.; Luciano da Costa e Silva, JMP Division, SAS Institute Inc., Cary.; SIDNEY NETTO PARENTONI, CNPMS; PAULO EVARISTO DE O GUIMARAES, CNPMS; Carina de Oliveira Anoni, Escola Superior de Agricultura “Luiz de Queiroz”; José Maria Villela Pádua, Universidade Federal de Lavras; MARCOS DE OLIVEIRA PINTO, CNPMS; ROBERTO WILLIANS NODA, CNPMS; Carlos Alexandre Gomes Ribeiro, Universidade Federal de Viçosa; JURANDIR VIEIRA DE MAGALHAES, CNPMS; Antonio Augusto Franco Garcia, Escola Superior de Agricultura “Luiz de Queiroz”; João Cândido de Souza, Universidade Federal de Lavras; LAURO JOSE MOREIRA GUIMARAES, CNPMS; MARIA MARTA PASTINA, CNPMS. |
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Título: |
Improving accuracies of genomic predictions for drought tolerance in maize by joint modeling of additive and dominance effects in multi-environment trials. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Heredity, London, v. 121, n. 1, p. 24-37, 2018. |
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DOI: |
10.1038/s41437-018-0053-6 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Breeding for drought tolerance is a challenging task that requires costly, extensive, and precise phenotyping. Genomic selection (GS) can be used to maximize selection efficiency and the genetic gains in maize (Zea mays L.) breeding programs for drought tolerance. Here, we evaluated the accuracy of genomic selection (GS) using additive (A) and additive + dominance (AD) models to predict the performance of untested maize single-cross hybrids for drought tolerance in multienvironment trials. Phenotypic data of five drought tolerance traits were measured in 308 hybrids along eight trials under water-stressed (WS) and well-watered (WW) conditions over two years and two locations in Brazil. Hybrids? genotypes were inferred based on their parents? genotypes (inbred lines) using single-nucleotide polymorphism markers obtained via genotyping-by-sequencing. GS analyses were performed using genomic best linear unbiased prediction by fitting a factor analytic (FA) multiplicative mixed model. Two cross-validation (CV) schemes were tested: CV1 and CV2. The FA framework allowed for investigating the stability of additive and dominance effects across environments, as well as the additive-by-environment and the dominance-by-environment interactions, with interesting applications for parental and hybrid selection. Results showed differences in the predictive accuracy between A and AD models, using both CV1 and CV2, for the five traits in both water conditions. For grain yield (GY) under WS and using CV1, the AD model doubled the predictive accuracy in comparison to the A model. Through CV2, GS models benefit from borrowing information of correlated trials, resulting in an increase of 40% and 9% in the predictive accuracy of GY under WS for A and AD models, respectively. These results highlight the importance of multi-environment trial analyses using GS models that incorporate additive and dominance effects for genomic predictions of GY under drought in maize single-cross hybrids. MenosBreeding for drought tolerance is a challenging task that requires costly, extensive, and precise phenotyping. Genomic selection (GS) can be used to maximize selection efficiency and the genetic gains in maize (Zea mays L.) breeding programs for drought tolerance. Here, we evaluated the accuracy of genomic selection (GS) using additive (A) and additive + dominance (AD) models to predict the performance of untested maize single-cross hybrids for drought tolerance in multienvironment trials. Phenotypic data of five drought tolerance traits were measured in 308 hybrids along eight trials under water-stressed (WS) and well-watered (WW) conditions over two years and two locations in Brazil. Hybrids? genotypes were inferred based on their parents? genotypes (inbred lines) using single-nucleotide polymorphism markers obtained via genotyping-by-sequencing. GS analyses were performed using genomic best linear unbiased prediction by fitting a factor analytic (FA) multiplicative mixed model. Two cross-validation (CV) schemes were tested: CV1 and CV2. The FA framework allowed for investigating the stability of additive and dominance effects across environments, as well as the additive-by-environment and the dominance-by-environment interactions, with interesting applications for parental and hybrid selection. Results showed differences in the predictive accuracy between A and AD models, using both CV1 and CV2, for the five traits in both water conditions. For grain yield (GY) under WS a... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Milho; Resistência a Seca. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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| Registros recuperados : 175 | |
| 141. |  | PASTINA, M. M.; SILVA, R. R.; GUIMARAES, L. J. M.; GUIMARAES, C. T.; DIAS, K. O. das G.; SILVA, L. da C. e; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARAES, P. E. de O.; PARENTONI, S. N.; GARCIA, A. A. F. Modelos GBLUP univariados e multivariados para seleção genômica para tolerância ao déficit hídrico em milho. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2016. 12 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Circular Técnica, 223).| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 142. | | GUIMARAES, C. T.; SOUSA, S. M. de; VASCONCELOS, M. J. V. de; BELICUAS, S. N. J.; GOMES, E. A.; SOUZA, F. A. de; PARENTONI, S. N.; SCHAFFERT, R. E.; ALVES, V. M. C.; MAGALHAES, J. V. de. Mecanismos de tolerância ao alumínio e eficiência na aquisição de fósforo. In: SOUZA, F. H. D. de; MATTA, F. de P.; FAVERO, A. P. (Ed.). Construção de ideótipos de gramíneas para usos diversos. Brasília, DF: Embrapa, 2013. p. 103-123.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 143. | | FRANÇA, C. O. L.; VELOSO, L. M. S.; BARROS, B. de A.; MITRE, L. K.; PINTO, M. de O.; LANA, U. G. de P.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARAES, L. J. M.; GUIMARÃES, C. T. Marker-assisted introgression of ZmMATE1 gene to improve aluminum tolerance in maize elite lines. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 6., 2017, Ouro Preto. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2017.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 144. | | PARENTONI, S. N.; ALVES, V. M. C.; GAMA, E. E. G. e; COELHO, A. M.; GUIMARAES, C. T.; PACHECO, C. A. P.; MAGALHAES, J. V. de; MEIRELLES, W. F. Seleção para tolerância ao alumínio e eficiência de utilização do fósforo na Embrapa Milho e Sorgo. In: SIMPÓSIO SOBRE ATUALIZAÇÃO EM GENÉTICA E MELHORAMENTO DE PLANTAS, 10., 2006, Lavras. Melhoramento de plantas visando a tolerância a estresses abiótiicos: anais. Lavras: UFLA, 2006. p. 23-28.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 145. | | LIVIO, D. F.; FIGUEIREDO JÚNIOR, J. M. M. de; PINTO, M. de O.; MAGALHAES, J. V. de; MENEZES, C. B. de; GUIMARÃES, C. T.; COTA, L. V.; DAMASCENO, C. M. B.; SILVA, D. D. da; SCHAFFERT, R. E. Seleção de fontes de resistência ao míldio, à helmintosporiose e de tolerância ao alumínio em sorgo. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2019. 14 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Documentos, 244).| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 146. | | PENA, G. C.; BARROS, B. de A.; CARNEIRO, A. A.; CARNEIRO, N. P.; BELICUAS, S. N. J.; MAGALHAES, J. V. de; LANA, U. G. de P.; TINOCO, C. F. da S.; GUIMARAES, C. T. Retrocruzamento assistido por marcadores moleculares para introgressão do gene AltSB em milho. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 4., 2012, Sete Lagoas. [Trabalhos apresentados]. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 148. | | DIAS, K. O. G.; PIEPHO, H. P.; GUIMARAES, L. J. M.; GUIMARAES, P. E. de O.; PARENTONI, S. N.; PINTO, M. de O.; NODA, R. W.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARÃES, C. T.; GARCIA, A. A. F.; PASTINA, M. M. Novel strategies for genomic prediction of untested single-cross maize hybrids using unbalanced historical data. Theoretical and Applied Genetics, v. 133, p. 443-455, 2020. Publicado online em 22 nov. 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 149. | | SANTOS, F. C. dos; RESENDE, A. V. de; GUIMARÃES, C. T.; MAGALHAES, J. V. de; MENEZES, C. B. de; DURAES, F. O. M.; ALBUQUERQUE FILHO, M. R. de; SANTOS, R. S. Nutrição e adubação do sorgo na região do Cerrado. In: FLORES, R. A.; CUNHA, P. P. da; MARCHÃO, R. L.; MORAES, M. F. (Ed.). Nutrição e adubação de grandes culturas na região do Cerrado. Goiânia: UFG, 2019. p. 503-530.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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| 150. | | LOPES, S. S.; COSTA, J. F. V.; PALHARES, P. L.; LANA, U. G. de P.; ALVES, M. C.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARÃES, C. T.; CARNEIRO, A. A.; SOUSA, S. M. de. Overexpression of maize and sorghum Phosphorus-Starvation Tolerance 1 genes enhance vegetative growth and root surface area in transgenic tobacco In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 7., 2019, Campos do Jordão. Resumos. [S.l.]: Sociedade Brasileira de Genética, 2019.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 151. | | BERNARDELI, A.; DAMASCENO, C. M. B.; MAGALHAES, J. V. de; SOUZA, V. F. de; MELO, J. de O.; OLIVEIRA, A. A. de; SIMEONE, M. L. F.; BORÉM, A.; SCHAFFERT, R. E.; PARRELLA, R. A. da C.; PASTINA, M. M. Population genomics and molecular breeding of sorghum. In: RAJORA, O. M. (ed.). Population genomics: crop plants, population genomics. Switzerland: Springer Nature, 2022. p. 1-52.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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| 152. | | MAGALHAES, J. V. de; KOCHIAN, L.; LIU, J.; GUIMARAES, C.; LANA, U.; ALVES, V.; WANG, Y.; SCHAFFERT, R. E.; HOEKENGA, O.; PINEROS, M.; SHAFF, J.; KLEIN, P.; CARNEIRO, N.; COELHO, C.; TRICK, H.; CANIATO, F.; KRESOVICH, S.; MITCHELL, S. Positional cloning and association analysis of a mate gene that confers aluminum tolerance in sorghum via the AltSB locus. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 16., 2008, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2008. p. 13.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 153. | | MAGALHAES, J. V. de; LIU, J.; ALVES, V. M. C.; GUIMARAES, C. T.; WANG, Y.; LANA, U. G. de P.; SCHAFFERT, R. E.; KLEIN, P.; HOEKENGA, O.; PINEROS, M.; KOCHIAN, L. Positional cloning and characterization of AltSB, a major aluminum tolerance gene in sorghum: toward the identification of the molecular and physiological basis of allelic effects. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 15., 2007, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 154. | | VASCONCELLOS, R. C. C.; MENDES, F. F.; OLIVEIRA, A. C. de; GUIMARAES, L. J. M.; ALBUQUERQUE, P. E. P. de; PINTO, M. de O.; BARROS, B. de A.; PASTINA, M. M.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARÃES, C. T. ZmMATE1 improves grain yield and yield stability in maize cultivated on acid soil. Crop Science, v. 61. n. 5, p. 3497-3506, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 155. | | NODA, R. W.; GUIMARAES, C. T.; GOMES, E. A.; CARNEIRO, N. P.; LANA, U. G. de P.; MAGALHAES, J. V. de; COSTA, M. M. do C.; SILVA, F. R.; BRAMMER, S. P.; LÂNGARO, N. C.; CARVALHO, L. J. C. B.; BEVITORI, R.; PURCINO, A. A. C. Aluminum-induced genes in grass species. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010. p. 185. AB3C X-meeting 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 156. | | NODA, R. W.; GUIMARAES, C. T.; GOMES, E. A.; CARNEIRO, N. P.; LANA, U. G. de P.; MAGALHAES, J. V. de; COSTA, M. M. do C.; SILVA, F. R. D.; BRAMMER, S. P.; LÂNGARO, N. C.; CARVALHO, L. J. C. B.; BEVITORI, R.; PURCINO, A. A. C. Aluminum-induced genes in grass species. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010. p. 185. AB3C X-meeting 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 157. | | MATONYEI, T. K.; BARROS, B. de A.; GUIMARÃES, R. G. N.; OUMA, E. O.; CHEPROT, R. K.; APOLINÁRIO, L. C.; LIGEYO, D. O.; COSTA, M. B. R.; WERE, B. A.; KISINYO, P. O.; ONKWARE, A. O.; NODA, R. W.; GUDU, S. O.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARÃES, C. T. Aluminum tolerance mechanisms in Kenyan maize germplasm are independent from the citrate transporter ZmMATE1. Scientific Reports, v. 10, article 7320, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 158. | | PARENTONI, S. N.; SOUZA JUNIOR, C. L. de; ALVES, V. M. C.; GUIMARAES, C.; COELHO, A. M.; PACHECO, C. A. P.; GUIMARAES, P. E. O.; MEIRELLES, W. F.; GUIMARAES, L. J. M.; SILVA, A. R. da; VASCONCELOS, M. J.; MAGALHAES, J. V. de; OLIVEIRA, A. C.; SCHAFFERT, R. E. Eficiência de aquisição e utilização interna de fósforo em milho tropical: importância relativa e critérios de seleção. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 27.; SIMPOSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 3.; WORKSHOP SOBRE MANEJO E ETIOLOGIA DA MANCHA BRANCA DO MILHO, 2008, Londrina. Agroenergia, produção de alimentos e mudanças climáticas: desafios para milho e sorgo: trabalhos e palestras. [Londrina]: IAPAR; [Sete Lagoas]: Embrapa Milho e Sorgo, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 159. | | DIAS, K. O. das G.; GEZAN, S. A.; GUIMARÃES, C. T.; NAZARIAN, A.; SILVA, L. da C. e; PARENTONI, S. N.; GUIMARAES, P. E. de O.; ANONI, C. de O.; PÁDUA, J. M. V.; PINTO, M. de O.; NODA, R. W.; RIBEIRO, C. A. G.; MAGALHAES, J. V. de; GARCIA, A. A. F.; SOUZA, J. C. de; GUIMARAES, L. J. M.; PASTINA, M. M. Improving accuracies of genomic predictions for drought tolerance in maize by joint modeling of additive and dominance effects in multi-environment trials. Heredity, London, v. 121, n. 1, p. 24-37, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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