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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
31/08/2015 |
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Data da última atualização: |
25/05/2017 |
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Autoria: |
PEREIRA, G. da S.; CAZÉ, A. L. R.; SILVA, M. G. da; ALMEIDA, V. C.; MAGALHAES, F. O. da C.; SILVA FILHO, J. L. da; BARROSO, P. A. V.; HOFFMANN, L. V. |
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Afiliação: |
GULHERME DA SILVA PEREIRA, Universidade Estadual da Paraíba; ANA LUÍZA RAMOS CAZÉ, Universidade Estadual da Paraíba; MICHELLE GARCIA DA SILVA, Universidade Estadual da Paraíba; VANESSA CAVALCANTE ALMEIDA, Universidade Estadual da Paraíba; FERNANDA OLIVEIRA DA C MAGALHAES, CNPA; JOAO LUIS DA SILVA FILHO, CNPA; PAULO AUGUSTO VIANNA BARROSO, CNPA; LUCIA VIEIRA HOFFMANN, CNPA. |
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Título: |
Optimal use of SSR markers for varietal identification of upland cotton. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 50, n. 7, p. 571-581, jul. 2015. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Título em português: Uso otimizado de marcadores SSR para identificação varietal de algodoeiro herbáceo. |
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Conteúdo: |
The objective of this work was to identify polymorphic simple sequence repeat (SSR) markers for varietal identification of cotton and evaluation of the genetic distance among the varieties. Initially, 92 SSR markers were genotyped in 20 Brazilian cotton cultivars. Of this total, 38 loci were polymorphic, two of which were amplified by one primer pair; the mean number of alleles per locus was 2.2. The values of polymorphic information content (PIC) and discrimination power (DP) were, on average, 0.374 and 0.433, respectively. The mean genetic distance was 0.397 (minimum of 0.092 and maximum of 0.641). A panel of 96 varieties originating from different regions of the world was assessed by 21 polymorphic loci derived from 17 selected primer pairs. Among these varieties, the mean genetic distance was 0.387 (minimum of 0 and maximum of 0.786). The dendrograms generated by the unweighted pair group method with arithmetic average (UPGMA) did not reflect the regions of Brazil (20 genotypes) or around the world (96 genotypes), where the varieties or lines were selected. Bootstrap resampling shows that genotype identification is viable with 19 loci. The polymorphic markers evaluated are useful to perform varietal identification in a large panel of cotton varieties and may be applied in studies of the species diversity. |
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Palavras-Chave: |
Cultivar discrimination; Intraspecific polymorhism; Microsatellite; Microssatélite; Polimorfismo intraespecífico. |
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Thesagro: |
Gossypium Hirsutum. |
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Thesaurus Nal: |
Microsatellite repeats. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/128830/1/Optimal-use-of-SSR-markers.pdf
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Marc: |
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245 $aOptimal use of SSR markers for varietal identification of upland cotton.
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520 $aThe objective of this work was to identify polymorphic simple sequence repeat (SSR) markers for varietal identification of cotton and evaluation of the genetic distance among the varieties. Initially, 92 SSR markers were genotyped in 20 Brazilian cotton cultivars. Of this total, 38 loci were polymorphic, two of which were amplified by one primer pair; the mean number of alleles per locus was 2.2. The values of polymorphic information content (PIC) and discrimination power (DP) were, on average, 0.374 and 0.433, respectively. The mean genetic distance was 0.397 (minimum of 0.092 and maximum of 0.641). A panel of 96 varieties originating from different regions of the world was assessed by 21 polymorphic loci derived from 17 selected primer pairs. Among these varieties, the mean genetic distance was 0.387 (minimum of 0 and maximum of 0.786). The dendrograms generated by the unweighted pair group method with arithmetic average (UPGMA) did not reflect the regions of Brazil (20 genotypes) or around the world (96 genotypes), where the varieties or lines were selected. Bootstrap resampling shows that genotype identification is viable with 19 loci. The polymorphic markers evaluated are useful to perform varietal identification in a large panel of cotton varieties and may be applied in studies of the species diversity.
650 $aMicrosatellite repeats
650 $aGossypium Hirsutum
653 $aCultivar discrimination
653 $aIntraspecific polymorhism
653 $aMicrosatellite
653 $aMicrossatélite
653 $aPolimorfismo intraespecífico
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700 1 $aSILVA, M. G. da
700 1 $aALMEIDA, V. C.
700 1 $aMAGALHAES, F. O. da C.
700 1 $aSILVA FILHO, J. L. da
700 1 $aBARROSO, P. A. V.
700 1 $aHOFFMANN, L. V.
773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF$gv. 50, n. 7, p. 571-581, jul. 2015.
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Registro original: |
Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
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| Registros recuperados : 20 | |
| 3. |  | RIBEIRO, T. G.; KATAKI, L. A.; HOFFMANN, L. V.; MAGALHÃES, F. O. da C.; TRIPODE, B. M. D. Amplificação por PCR do gene de um fator de transcrição de Fusarium oxysporum f.sp. vasinfectum. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 7., 2013, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2013. p. 57. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 292). Pôster - graduação.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 5. | | CARDOSO, K. C. M.; BELTRAMI, P. M.; MAGALHAES, F. O. da C.; GIBAND, M.; HOFFMANN, L. V. Presença de marcadores moleculares ligados a genes de resistência a quatro doenças em algodão. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 6. | | SUASSUNA, N. D.; MORELLO, C. de L.; BARROSO, P. A. V.; HOFFMANN, L. V.; BEZERRA, W.; MAGALHAES, F. O. da C. Avaliação em campo e com uso de marcadores moleculares da resistência de linhagens de algodoeiro às principais doenças. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 8.; COTTON EXPO, 1., 2011, São Paulo. Evolução da cadeia para construção de um setor forte: Anais. Campina Grande, PB: Embrapa Algodão, 2011. p.1301-1310| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 7. | | SUASSUNA, N. D.; MORELLO, C. de L.; SILVA FILHO, J. L. da; PEDROSA, M. B.; PERINA, F. J.; MAGALHAES, F. O. da C.; SOFIATTI, V.; LAMAS, F. M. BRS 372 and BRS 416: high-yielding cotton cultivars with multiple disease resistance. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 20, n. 1, e27242016, 2020. Cultivar release.| Tipo: Nota Técnica/Nota Científica | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Algodão. |
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| 8. | | MAGALHAES, F. O. da C.; ALLEN, L. N.; FARIA, J. C. de; NAGATA, A. K. I.; HOFFMANN, L. V.; SUASSUNA, N. D.; FERREIRA, A. C. de B.; BARROSO, P. A. V. Caracterização parcial de BEGOMOVÍRUS associados ao algodoeiro em Goiás. In: Congresso Brasileiro do Algodão, 9., 2013, Brasília, DF.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 9. | | SUASSUNA, N. D.; MORELLO, C. de L.; SILVA FILHO, J. L. da; PEDROSA, M. B.; BARROSO, P. A. V.; SUASSUNA, T. de M. F.; PERINA, F. J.; SOFIATTI, V.; MAGALHAES, F. O. da C.; FARIAS, F. J. C. BRS 430 B2RF e BRS 432 B2RF: cultivares de algodoeiro de alto potencial produtivo no cerrado do Brasil com resistência a lepidópteros e tolerância ao herbicida glisofato. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 11., 2017, Maceió. Resumos... Inovação e rentabilidade na cotonicultura: resumos... Brasília, DF: Associação Brasileira dos Produtores de Algodão - Abrapa, 2017.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Algodão. |
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| 10. | | SUASSUNA, N. D.; MORELLO, C. de L.; PEDROSA, M. B.; BARROSO, P. A. V.; SILVA FILHO, J. L. da; SUASSUNA, T. de M. F.; PERINA, F. J.; SOFIATTI, V.; MAGALHAES, F. O. da C.; FARIAS, F. J. C. BRS 430 B2RF and BRS 432 B2RF: insectresistant and glyphosate-tolerant high-yielding cotton cultivars. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 18, p. 221-225, 2018. p. 221-225.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 11. | | MORELLO, C. de L.; SUASSUNA, N. D.; PEDROSA, M. B.; SILVA FILHO, J. L. da; BARRETO, P. V.; SUASSUNA, T. de M. F.; PERINA, F. J.; SOFIATTI, V.; FARIAS, F. J. C.; MAGALHAES, F. O. da C. BRS 433 FL B2RF: cultivar de algodoeiro de fibra longa com resistência a Lepidópteros e tolerância ao herbicida Glifosato. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 11., 2017, Maceió. Resumos... Inovação e rentabilidade na cotonicultura: resumos... Brasília, DF: Associação Brasileira dos Produtores de Algodão - Abrapa, 2017.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 12. | | MORELLO, C. de L.; SUASSUNA, N. D.; PEDROSA, M. B.; SILVA FILHO, J. L. da; BARROSO, P. A. V.; SUASSUNA, T. de M. F.; PERINA, F. J.; SOFIATTI, V.; FARIAS, F. J. C.; MAGALHAES, F. O. da C. BRS 433 FL B2RF: cultivar de algodoeiro de fibra longa com resistência a Lepidópteros e tolerância ao herbicida Glifosato. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 11., 2017, Maceió. Resumos... Inovação e rentabilidade na cotonicultura: resumos... Brasília, DF: Associação Brasileira dos Produtores de Algodão - Abrapa, 2017 Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 13. | | MORELLO, C. de L.; SUASSUNA, N. D.; PEDROSA, M. B.; BARROSO, P. A. V.; SILVA FILHO, J. L. da; SUASSUNA, T. de M. F.; PERINA, F. J.; SOFIATTI, V.; MAGALHAES, F. O. da C.; LAMAS, F. M. Cultivar BRS 433FL B2RF: upland cotton with high-quality fiber, insect resistance and glyphosate tolerance for the Brazilian Savanna. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 20, n. 3, e29262039, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 15. | | PEREIRA, G. da S.; CAZÉ, A. L. R.; SILVA, M. G. da; ALMEIDA, V. C.; MAGALHAES, F. O. da C.; SILVA FILHO, J. L. da; BARROSO, P. A. V.; HOFFMANN, L. V. Optimal use of SSR markers for varietal identification of upland cotton. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 50, n. 7, p. 571-581, jul. 2015. Título em português: Uso otimizado de marcadores SSR para identificação varietal de algodoeiro herbáceo.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 17. | | PEREIRA, G. DA S.; CAZÉ, A. L. R.; SILVA, M. G. DA; ALMEIDA, V. C.; MAGALHAES, F. O. da C.; SILVA FILHO, J. L. da; BARROSO, P. A. V.; HOFFMANN, L. V. Uso otimizado de marcadores SSR para identificação varietal de algodoeiro herbáceo. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasíla, DF, v. 50, n. 7, p. 571-581, jul. 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 18. | | CARDOSO, R. M.; MAGALHAES, F. O. da C.; CARDOSO, K. C. M.; MOURA, E. C. de; SILVA, J. F. A. e; HOFFMANN, L. V.; QUINTELA, E. D.; FARIA, J. C. de. Transmissão do vírus causador do mosaico comum do algodoeiro por Bemisia tabaci. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 10., 2016, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2016. p. 66. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 311).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 19. | | CARDOSO, R. M.; MAGALHAES, F. O. da C.; CARDOSO, K. C. M.; MOURA, E. C. de; SILVA, J. F. A. e; HOFFMANN, L. V.; QUINTELA, E. D.; FARIA, J. C. de. Transmissão do vírus causador do mosaico comum do algodoeiro por Bemisia tabaci. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 10., 2016, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2016. p. 66. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 311).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 20. | | SUASSUNA, N. D.; MORELLO, C. de L.; PERINA, F. J.; SILVA FILHO, JOÃO LUIS DA; PEDROSA, M. B.; MAGALHÃES, F. O. DA C.; SOFIATTI, V.; LAMAS, F. M.; CHITARRA, L. G.; FARIAS, F. J. C.; O, W. C. R. do; FARIAS, F. J. C. BRS 500 B2RF: transgenic cotton cultivar expressing Cry1Ac, Cry2Ab, and CP4-EPSPS with multiple disease resistance. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 21, n. 2, e35012127, p. 1-5, 2021. 5 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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