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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio-Norte. |
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Data corrente: |
10/03/2008 |
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Data da última atualização: |
14/09/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
DINIZ, F. M.; IYENGAR, A.; LIMA, P. S. da C.; MACLEAN, N.; BENTZEN, P. |
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Afiliação: |
FABIO MENDONCA DINIZ, CPAMN; ARATI IYENGAR; PAULO SARMANHO DA COSTA LIMA, CPAMN; NORMAN MACLEAN; PAUL BENTZEN. |
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Título: |
Application of a double-enrichment procedure for microsatellite isolation and the use tailed primers for high throughput genotyping. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, São Paulo, v. 30, n. 2, p. 380-384, mar. 2007. |
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ISSN: |
1415-4757 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The number of microsatellite loci and their allelic diversity contribute to increase accuracy and informativity of genetic estimates, however, the isolation of microsatellite loci is not only laborious but also quite expensive. We used (GATA)n and (GACA)n tetranucleotide probes and single- and double-enrichment hybridization to construct and screen a genomic library with an increased proportion of DNA fragments containing repeat motifs. Repeats were found using both types of hybridization but the double-enrichment procedure recovered sequences of which 100% contained (GATA)n and (GACA)n motifs. Microsatellite loci primers were then designed with an M13R-tail or CAG-tag to produce scorable PCR products with minimal stutter. The approach used in this study suggests that double-enrichment is a worthwhile strategy when isolating repeat motifs from eukaryotic genomes. Moreover, the use of tailed microsatellite primers provides increased resolution for compound microsatellite loci, with a significant decrease in costs. |
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Palavras-Chave: |
Banda polimórfica; double-enrichment; double-hybridization; Enriquecimento duplo; Hibridação dupla; Microssatélite; stutter bands; tailed microsatellite primer. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/65872/1/Application-21449.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Meio-Norte (CPAMN) |
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Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
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Status |
URL |
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| Registros recuperados : 8 | |
| 3. |  | FERREIRA, G. B.; SILVA, M. S. L. da; COSTA, M. B. B. da; MOURA, M. M.; GAVA, C. A. T.; MENDONÇA, C. E. S.; CHAVES, V. C. Carbono orgânico total em solos sob influência de barragens subterrâneas no semiárido da Paraíba, Brasil. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 29., 2010, Guarapari, ES. Anais... Guarapari, ES: FertBio, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 4. | | FERREIRA, G. B.; BARBOSA, V. C.; MOREIRA, M. M.; SILVA, M. S. L. da; COSTA, M. B. B. da; ALVES, C. de A.; MENDONÇA, C. E. dos S. Metodologias participativas: uma alternativa para o estudo de agroecossistemas com barragens subterrâneas no semiárido. Cadernos de Agroecologia, v. 4, n. 1, p. 3784-3787, 2009. Trabalho apresentado no 6º Congresso Brasileiro de Agroecologia e 2º Congresso Latinoamericano de Agroecologia, 2009, Curitiba.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 5. | | FERREIRA, G. B.; SILVA, M. S. L. da; COSTA, M. B. B. da; MOREIRA, M. M.; GAVA, C. A. T.; CHAVES, V. C.; MENDONÇA, C. E. S. Manejo ecológico dos solos em barragens subterrâneas no Semiárido da Paraíba. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE MANEJO E CONSERVAÇÃO DO SOLO E DA ÁGUA, 18., 2010, Teresina. Novos caminhos para a agricultura conservacionista no Brasil. Teresina: Embrapa Meio-Norte: Universidade Federal do Piauí, 2010. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido; Embrapa Solos. |
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| 6. | | FERREIRA, G. B.; MOREIRA, M. M.; CHAVES, V. C.; SILVA, M. S. L. da; COSTA, M. B. B. da; ALVES, C. de A.; MEIRA, R. A. A organização do trabalho em agroecossistemas com barragens subterrâneas no semiarido brasileiro. Cadernos de Agroecologia, v. 4, n. 1, p. 3669-3672, 2009. Trabalho apresentado no 6º Congresso Brasileiro de Agroecologia e 2º Congresso Latinoamericano de Agroecologia, 2009, Curitiba.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 7. | | FERREIRA, G. B.; COSTA, M. B. B. da; SILVA, M. S. L. da; MOREIRA, M. M.; GAVA, C. A. T.; CHAVES, V. C.; MENDONÇA, C. E. S. Sustentabilidade de agroecossistemas com barragens subterrâneas no semi-árido brasileiro: a percepção dos agricultores na Paraíba. Revista Brasileira de Agroecologia. v. 6, n.1, p. 19-36, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido; Embrapa Solos. |
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| 8. | | FERREIRA, G. B.; SILVA, M. S. L. da; COSTA, M. B. B. da; MOREIRA, M. M.; GAVA, C. A. T.; ALVES, C. de A.; MENDONÇA, C. E. S.; CHAVES, V. C. A influência das barragens subterrâneas na sustentabilidade social em assentamentos da Paraíba - uma abordagem participativa. In: SIMPÓSIO SOBRE REFORMA AGRÁRIA E ASSENTAMENTOS RURAIS, 4., 2010, Araraquara. Anais... Araraquara: Uniara, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido; Embrapa Solos. |
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