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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
13/08/2021 |
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Data da última atualização: |
13/08/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, A. A.; SILVA, D. A.; SILVA, F. F.; COSTA, C. N.; SILVA, H. T.; LOPES, P. S.; VERONEZE, R.; THOMPSON, G.; CARVALHEIRA, J. |
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Afiliação: |
ALESSANDRA ALVES SILVA, Universidade Federal de Viçosa; DELVAN ALVES SILVA, Universidade Federal de Viçosa; FABYANO FONSECA SILVA, Universidade Federal de Viçosa; CLAUDIO NAPOLIS COSTA, CNPGL; HUGO TEIXEIRA SILVA, Universidade Federal de Viçosa; PAULO SÁVIO LOPES, Universidade Federal de Viçosa; RENATA VERONEZE, Universidade Federal de Viçosa; GERTRUDE THOMPSON, Universidade do Porto; JULIO CARVALHEIRA, Universidade do Porto. |
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Título: |
GWAS and gene networks for milk-related traits from test-day multiple lactations in Portuguese Holstein cattle. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Applied Genetics, v. 61, p. 465-476, 2020. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s13353-020-00567-3 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
This study focused on the identification of QTL regions, candidate genes, and network related genes based on the first 3 lactations (LAC3) of milk, fat, and protein yields, and somatic cell score (SCS) in Portuguese Holstein cattle. Additionally, the results were compared with those from only first lactation (LAC1) data. The analyses were performed using the weighted single-step GWAS under an autoregressive test-day (TD) multiple lactations model. A total of 11,434,294 and 4,725,673 TD records from LAC3 and LAC1, respectively, including 38,323 autosomal SNPs and 1338 genotyped animals were used inGWAS analyses. A total of 51 (milk), 5 (fat), 24 (protein), and 4 (SCS) genes were associated to previously annotated relevant QTL regions for LAC3. The CACNA2D1 at BTA4 explained the highest proportion of genetic variance respectively for milk, fat, and protein yields. For SCS, the TRNAG-CCC at BTA14, MAPK10, and PTPN3 genes, both at BTA6 were considered important candidate genes. The accessed network refined the importance of the reported genes. CACNA2D1 regulates calcium density and activation/inactivation kinetics of calcium transport in the mammary gland; whereas TRNAG-CCC, MAPK10, and PTPN3 are directly involved with inflammatory processes widely derived from mastitis. In conclusion, potential candidate genes (TRNAG-CCC, MAPK10, and PTPN3) associated with somatic cell were highlighted, which further validation studies are needed to clarify its mechanism action in response to mastitis. Moreover, most of the candidate genes identified were present in both (LAC3 and LAC1) for milk, fat and protein yields, except for SCS, in which no candidate genes were shared between LAC3 and LAC1. The larger phenotypic information provided by LAC3 dataset was more effective to identify relevant genes, providing a better understanding of the genetic architecture of these traits over all lactations simultaneously. MenosThis study focused on the identification of QTL regions, candidate genes, and network related genes based on the first 3 lactations (LAC3) of milk, fat, and protein yields, and somatic cell score (SCS) in Portuguese Holstein cattle. Additionally, the results were compared with those from only first lactation (LAC1) data. The analyses were performed using the weighted single-step GWAS under an autoregressive test-day (TD) multiple lactations model. A total of 11,434,294 and 4,725,673 TD records from LAC3 and LAC1, respectively, including 38,323 autosomal SNPs and 1338 genotyped animals were used inGWAS analyses. A total of 51 (milk), 5 (fat), 24 (protein), and 4 (SCS) genes were associated to previously annotated relevant QTL regions for LAC3. The CACNA2D1 at BTA4 explained the highest proportion of genetic variance respectively for milk, fat, and protein yields. For SCS, the TRNAG-CCC at BTA14, MAPK10, and PTPN3 genes, both at BTA6 were considered important candidate genes. The accessed network refined the importance of the reported genes. CACNA2D1 regulates calcium density and activation/inactivation kinetics of calcium transport in the mammary gland; whereas TRNAG-CCC, MAPK10, and PTPN3 are directly involved with inflammatory processes widely derived from mastitis. In conclusion, potential candidate genes (TRNAG-CCC, MAPK10, and PTPN3) associated with somatic cell were highlighted, which further validation studies are needed to clarify its mechanism action in response to m... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Gene function; Regiões QTL. |
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Thesagro: |
Bovino; Gado Holandês; Gado Leiteiro; Gene; Produção Leiteira. |
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Thesaurus Nal: |
Milk yield; Somatic cells. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
LEADER 02891naa a2200337 a 4500
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005 2021-08-13
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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| 81. |  | SILVA, P. V.; MIRANDA, C. L.; FONSECA, I.; GUIMARÃES, M. F. M.; GUIMARÃES, S. E. F.; NASCIMENTO, C. S.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, J. D. Avaliação de dois métodos para extração de RNA total de células da granulosa de fêmeas suínas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2007. p. 118.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 82. | | PAIVA, J. T.; RESENDE, M. D. V. de; RESENDE, R. T.; OLIVEIRA, H. R. de; SILVA, H. T.; CAETANO, G. C.; LOPES, P. S.; SILVA, F. F. Transgenerational epigenetic variance for body weight in meat quails. Journal of Animal Breeding and Genetics, v. 135, n. 3, p. 178-185, June 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 83. | | SAKAGUTI, E. S.; SILVA, M. de A. e; QUAAS, R. L.; SILVA, L. O. C.; REGAZZI, A. J.; MARTINS, E. N.; LOPES, P. S.; EUCLYDES, R. F. Utilização de polinômios para ajustar efeitos fixos de modelos de regressão aleatória em análises de pesos corporais de bovinos jovens. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 38., 2001, Piracicaba. Anais... Piracicaba: FEALQ, 2001. p. 560-561. CNPGC. SBZ.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 84. | | PAIVA, D. A. de F.; GUIMARÃES, S. E. F.; LOPES, P. S.; SOLERO, B. P.; PAIVA, S. R.; VENDRAMINI, P.; PEIXOTO, J. de O.; WENCESLAU, A. A. Uso do microssatélite IGF-I na seleção assistida por marcadores em suínos. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 42., 2005, Goiânia, GO. A produção animal e o foco no agronegócio. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2005. Paginação irregular.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 85. | | SOUZA, A. R. DE; VIEIRA, J. M.; GUSMÃO, C. A. G.; LOPES, P. S.; EUGÊNIO, S. G.; ALVARENGA C. D.; QUERINO, R. B.; GIUSTOLIN, T. MACIEL, M. L. TRICHOGRAMMA SPP. (HYMENOPTERA: TRICHOGRAMMATIDAE) parasitando ovos de DIATRAEA SACCHARALIS no semi-árido mineiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 22., 2008, Uberlândia. Resumos... Uberlândia, 2008.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 86. | | SANTOS, P. M. dos; NASCIMENTO, A. C. C.; NASCIMENTO, M.; SILVA, F. F. e; AZEVEDO, C. F.; MOTA, R. R.; GUIMARÃES, S. E. F.; LOPES, P. S. Use of regularized quantile regression to predict the genetic merit of pigs for asymmetric carcass traits. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 53, n. 9, p. 1011-1017, Sept. 2018. Título em português: Uso da regressão quantílica regularizada para predição de mérito genético em suínos quanto a características assimétricas de carcaça.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 87. | | CANDA, R. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; LOPES, P. S.; MONIZ, F.; NASCIMENTO, F. D.; PERES, B. da C.; SANTOS, G. G. dos; BRUNELI, F. A. T. Tendência genética da produção de gordura e proteína no leite em rebanhos da raça Guzerá. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DO LEITE, 12.; WORKSHOP DE POLÍTICAS PÚBLICAS, 12.; SIMPÓSIO DE SUSTENTABILIDADE DA ATIVIDADE LEITEIRA, 13., 2013, Porto Velho. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2013. 3 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 88. | | CARRARA, E. R.; LOPES, P. S.; BRUNELI, F. A. T.; SILVA, F. F.; JOSAHKIAN, L. A.; PEIXOTO, M. G. C. D. The inbreeding pattern by generation and its effect on milk yield, growth, and reproductive traits in Guzerá cattle. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 56., 2021, Florianópolis. Animal science: challenges in production and sustainability: proceedings... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2021. p. 345. Evento virtual.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 90. | | CANAZA-CAYO, A. W.; LOPES, P. S.; SILVA, M. V. G. B.; TORRES, R. de A.; COBUCI, J. A.; DALTRO, D. dos S. Estimativas de parâmetros genéticos para a produção de leite utilizando modelos de regressão aleatória em bovinos da raça Girolando. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 11., 2015, Santa Maria, RS. Melhoramento animal da academia ao campo: uma parceria em construção: anais. Santa Maria, RS: SBMA: UFSM, 2015. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 91. | | ASSIS, G. M. L. de; ALBUQUERQUE, L. G. de; SARMENTO, J. L. R.; CARNEIRO JUNIOR, J. M.; LOPES, P. S.; RODRIGUES, M. T. Estimação de parâmetros genéticos em caprinos leiteiros por meio de análise de regressão aleatória utilizando-se a Amostragem de Gibbs. Revista Brasileira de Zootecnia, v. 35, n. 3, p. 706-714, 2006.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 92. | | WENCESLAU, A. A.; LOPES, P. S.; TEODORO, R. L.; VERNEQUE, R. da S.; EUCLYDES, R. F.; FERREIRA, W. J.; SILVA, M. de A. e. Estimação de parâmetros genéticos de medidas de conformação, produção de leite e idade ao primeiro parto em vacas da raça Gir Leiteiro. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, v. 29, n. 1, p. 153-158, 2000.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 93. | | PAIVA, J. T.; RESENDE, M. D. V. de; RESENDE, R. T.; OLIVEIRA, H. R.; SILVA, H. T.; CAETANO, G. C.; LOPES, P. S.; SILVA, F. F. Epigenética: mecanismos, herança e implicações no melhoramento animal. Archivos de Zootecnia, v. 68, n. 262, p. 304-311, 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 94. | | LOPES, P. S.; SILVA, M. de A. e; TORRES, R. de A.; LUDWIG, A.; OLIVEIRA, L. M. de; SOARES, P. R. Estudo de indices de selecao para aves Legorne. In: REUNIAO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 21., 1984, Belo Horizonte, MG. Anais... Belo Horizonte: SBZ, 1984. p.24| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 96. | | NASCIMENTO, C. S.; MACHADO, M. A.; GUIMARÃES, S. E. F.; GUIMARÃES, M. F. M.; CAMPOS, A. L.; VERNEQUE, R. da S.; LOPES, P. S. Expressão aumentada do gene S100A7 em bovinos F2 desafiados com o parasita Boophilus microplus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2007. p. 241.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 98. | | CANAZA-CAYO, A. W.; LOPES, P. S.; SILVA, M. V. G. B.; COBUCI, J. A.; TORRES, R. de A.; MARTINS, M. F.; ARBEX, W. A. Estrutura populacional da raça Girolando. Ciência Rural, v. 44, n. 11, p. 2072-2077, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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