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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
06/08/2009 |
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Data da última atualização: |
10/11/2010 |
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Autoria: |
BENÍTEZ, C. M. V.; LOPES, H. S. |
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Afiliação: |
CÉSAR MANUEL VARGAS BENÍTEZ, CPGEI/UTFPR; HEITOR S. LOPES, CPGEI/UTFPR. |
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Título: |
Algoritmo genético aplicado na predição da estrutura de proteínas utilizando o modelo 3D-HP Side Chain. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE COMPUTAÇÃO, 29., 2009, Bento Gonçalves. Anais... Rio Grande do SUL: Instituto de Informática UFRGS. |
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Páginas: |
717-726. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
CSBC 2009. |
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Conteúdo: |
Este trabalho apresenta um algoritmo genético paralelo (AGP) para o problema de dobramento de proteínas, utilizando o modelo 3DHP-SC. Este modelo tem sido pouco abordado devido ao elevado grau de complexidade envolvido. Foi proposta uma função de fitness baseada na energia livre e na compacidade do dobramento. Devido a não existir, até então, benchmarks para teste deste modelo, foi proposto um conjunto de 5 sequências baseado em outro modelo mais simplificado. O AGP obteve dobramentos biologicamente coerentes, sugerindo a adequabilidade da metodologia proposta. Trabalhos futuros incluirão a proposição de operadores genéticos baseados em conhecimento, bem como a expansão do benchmark. |
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Palavras-Chave: |
3DHP- SC; Algoritmo genético paralelo (AGP); Bioinformática; Dobramento de proteínas; Modelagem computacional. |
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Categoria do assunto: |
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Marc: |
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300 $a717-726.
500 $aCSBC 2009.
520 $aEste trabalho apresenta um algoritmo genético paralelo (AGP) para o problema de dobramento de proteínas, utilizando o modelo 3DHP-SC. Este modelo tem sido pouco abordado devido ao elevado grau de complexidade envolvido. Foi proposta uma função de fitness baseada na energia livre e na compacidade do dobramento. Devido a não existir, até então, benchmarks para teste deste modelo, foi proposto um conjunto de 5 sequências baseado em outro modelo mais simplificado. O AGP obteve dobramentos biologicamente coerentes, sugerindo a adequabilidade da metodologia proposta. Trabalhos futuros incluirão a proposição de operadores genéticos baseados em conhecimento, bem como a expansão do benchmark.
653 $a3DHP- SC
653 $aAlgoritmo genético paralelo (AGP)
653 $aBioinformática
653 $aDobramento de proteínas
653 $aModelagem computacional
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773 $tIn: CONGRESSO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE COMPUTAÇÃO, 29., 2009, Bento Gonçalves. Anais... Rio Grande do SUL: Instituto de Informática UFRGS.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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