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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
11/08/2021 |
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Data da última atualização: |
11/08/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GOGONE, I. C. V. P.; FERREIRA, G. H.; GAVA, D.; SCHAEFER, R.; PAULA-LOPES, F. F. de; ROCHA, R. de A.; BARROS, F. R. O. de. |
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Afiliação: |
IZABEL C. V. P. COGONE, UTFPR; GLAUCIA H. FERREIRA, UNIFESP/Diadema; DANIELLE GAVA, CNPSA; REJANE SCHAEFER, CNPSA; FABÍOLA F. DE PAULA-LOPES, UNIFESP/Diadema; RAQUEL DE A. ROCHA, UTFPR; FLAVIA REGINA OLIVEIRA DE BARROS, UTFPR. |
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Título: |
Applicability of Raman spectroscopy on porcine parvovirus and porcine circovirus type 2 detection. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy, v. 249, n. 119336, 2021. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.saa.2020.119336 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Porcine parvovirus (PPV) is one of the major infectious causes of reproductive failure of swine. This disease is characterized by embryonic and fetal infection and death, responsible for important economic losses. PPV is also implicated as a trigger in the development of post-weaning multisystemic wasting syndrome (PMWS) caused by Porcine circovirus type 2 (PCV2). Their detection is PCR-based, which is quite sensitive and specific, but laborious, costly and time-demanding. Therefore, this study aimed to assess Raman spectroscopy (RS) as a diagnostic tool for PPV and PCV2 due to its label-free properties and unique ability to search and identify molecular fingerprints. Briefly, swine testis (ST) cells were inoculated with PPV or PCV2 and in vitro cultured (37 C, 5% CO2) for four days. Fixed cells were then submitted to RS investigation using a 633 nm laser. A total of 225 spectra centered at 1300 cm1 was obtained for each sample (5 spectra/cell; 15 cells/replicate; 3 replicates) of PPV-, PCV2-infected and uninfected (control) ST cells. Clear statistical discrimination between samples from both virus-infected cells was achieved with a Principal Component ? Linear Discriminant Analysis (PCA-LDA) model, reaching sensitivity rates from 95.55% to 97.77%, respectively to PCV2- and PPV-infected cells. These results were then submitted to a Leave-One-Out (LOO) validation algorithm resulting in 99.97% of accuracy. Extensive band assignment was analyzed and compiled for better understanding of PPV and PCV2 virus-cell interaction, demonstrating that specific protein, lipids and DNA/RNA bands are the most important assignments related to discrimination of virus-infected from uninfected cells. In conclusion, these results represent promising bases for RS application on PCV2 and PPV detection for future diagnostic applications. MenosAbstract: Porcine parvovirus (PPV) is one of the major infectious causes of reproductive failure of swine. This disease is characterized by embryonic and fetal infection and death, responsible for important economic losses. PPV is also implicated as a trigger in the development of post-weaning multisystemic wasting syndrome (PMWS) caused by Porcine circovirus type 2 (PCV2). Their detection is PCR-based, which is quite sensitive and specific, but laborious, costly and time-demanding. Therefore, this study aimed to assess Raman spectroscopy (RS) as a diagnostic tool for PPV and PCV2 due to its label-free properties and unique ability to search and identify molecular fingerprints. Briefly, swine testis (ST) cells were inoculated with PPV or PCV2 and in vitro cultured (37 C, 5% CO2) for four days. Fixed cells were then submitted to RS investigation using a 633 nm laser. A total of 225 spectra centered at 1300 cm1 was obtained for each sample (5 spectra/cell; 15 cells/replicate; 3 replicates) of PPV-, PCV2-infected and uninfected (control) ST cells. Clear statistical discrimination between samples from both virus-infected cells was achieved with a Principal Component ? Linear Discriminant Analysis (PCA-LDA) model, reaching sensitivity rates from 95.55% to 97.77%, respectively to PCV2- and PPV-infected cells. These results were then submitted to a Leave-One-Out (LOO) validation algorithm resulting in 99.97% of accuracy. Extensive band assignment was analyzed and compiled for bette... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Molecular fingerprint; PCV2; PPV; Reproductive failure; Viral diagnostic. |
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Thesagro: |
Diagnostico; Parvovirose; Sanidade Animal; Suíno. |
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Thesaurus Nal: |
Animal diseases; Porcine circovirus-2; Raman spectroscopy; Reproductive success; Swine. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02976naa a2200373 a 4500
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005 2021-08-11
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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| Registros recuperados : 45 | |
| 1. |  | LOPES, F. F. R.; KRATKA, P. C.; BIANCHETTI, L.; FERREIRA, M. E.; AMARAL, Z. P.; BUSO, G. S. C. Análise genética de novas espécies de capsicum e sua relação com espécies cultivadas do gênero, através de marcadores moleculares. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 7., 2002, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2002. p. 59.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 3. | | GOGONE, I. C. V. P.; FERREIRA, G. H.; GAVA, D.; SCHAEFER, R.; PAULA-LOPES, F. F. de; ROCHA, R. de A.; BARROS, F. R. O. de. Applicability of Raman spectroscopy on porcine parvovirus and porcine circovirus type 2 detection. Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy, v. 249, n. 119336, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 4. | | LIMA, R. L. de; FERREIRA, G. B.; SOFIATTI, V.; GOLDFARB, M.; BRANDAO, Z. N.; LOPES, F. F. de M.; BELTRAO, N. E. de M. Adubação e disponibilidade de água no crescimento e frutificação do algodoeiro cv. Fibermax 966. Engenharia ambiental, v. 6, n. 3, p. 496-507, set./dez., 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 5. | | CRUZ, J. L.; GALVÃO, T. D. L.; LOPES, F. F.; SILVA, T. M. da; PEIXOTO JÚNIOR, E. E.; ANDRADE, P. R. O. de. Alguns benefícios decorrentes da implantação do sistema de produção integrada de mamão na Bahia. In: MARTINS, D. dos S.; COSTA, A. N. da; COSTA, A. de F. S. da. (Ed.). Papaya Brasil: manejo, qualidade e mercado do mamão. Vitória: Incaper, 2007. p. 685-687.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 8. | | HABIBE, T. C.; NASCIMENTO, A. S. do; FRIGHETTO, R. T. S.; OLIVEIRA, D. N. dos S.; LOPES, F. F.; VIANA, R. E.; MALAVASI, A. BITC: proteção natural dos frutos de mamoeiros contra o ataque das moscas-das-frutas. Bahia Agrícola, Salvador, v. 6, n. 3, p. 63-66, nov. 2004.| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 9. | | HABIBE, T. C.; NASCIMENTO, A. S. do; FRIGHETTO, R. T. S.; OLIVEIRA, D. N. dos S.; LOPES, F. F.; VIANA, R. E.; MALAVASI, A. BITC: proteção natural dos frutos de mamoeiros contra o ataque das moscas-das-frutas. Bahia Agrícola, Salvador, v. 6, n. 3, p. 63-66, nov. 2004.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - C |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 10. | | CRUZ, J. L.; PEIXOTO JÚNIOR, E. E. P.; SILVA, T. M. da; GALVÃO, T. D. L.; LOPES, F. F.; ANDRADE, P. R. O. de. Certificação de áreas de mamão em produção integrada de frutas. In: MARTINS, D. dos S.; COSTA, A. N. da; COSTA, A. de F. S. da. (Ed.). Papaya Brasil: manejo, qualidade e mercado do mamão. Vitória: Incaper, 2007. p. 688-690.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 11. | | SANCHES, N. F.; SANTOS FILHO, H. P.; OLIVEIRA, A. A. R.; LOPES, F. F.; ANDRADE, P, R.; CRUZ, J. L.; SANTOS, M. de J. Comportamento de mamoeiros dos grupos de Solo e Formosa ante a presença do ácaro rajado (Tetranychus urticae), da cigarrinha verde (Solanasca bordia) e da cochonilha (Aonidiella comperei). In:CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Frutas: saúde, inovação e responsabilidade: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010. pdf 2460| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 12. | | BUSO, G. S. C.; DUSI, A. N.; PAIVA, M. R.; LOPES, F. F. R.; CERQUEIRA, A. A.; AMORIM, J. C.; AMARAL, Z. P. S.; BUSO, J. A. Identificação de marcadores RAPD no controle de qualidade de produção de alho-semente da cultivar Amarante e análise de diversidade de cultivares de alho. In: SIMPOSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA Y EL CARIBE, 4., 2003, Mar del Plata. Libro de resúmenes... Mar del Plata: Universidad de Buenos Aires: INTA, 2003. p. 141. Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 13. | | PAIVA, M. R.; LOPES, F. F. R.; CERQUEIRA, A. A.; AMORIM, J. C.; AMARAL, Z. P. S.; DUSI, A. N.; BUSO J. A.; BUSO, G. S. C. Identificação de marcadores rapd para utilização no controle de qaualidade de produção de alho-semente da cultivar amarante. ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENETICOS E BIOTECNOLOGIA, 8., 2003, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2003. p. 76| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 14. | | PAIVA, M. R.; LOPES, F. F. R.; CERQUEIRA, A. A.; AMORIM, J. C.; AMARAL, Z. P. S.; DUSI, A. N.; BUSO, J. A.; BUSO, G. S. C. Identificação de marcadores RAPD para utilização no controle de qualidade de produção de alho-semente da cultivar Amarante. In: CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA, 49., 2003, Ribeirão Preto. A dupla hélice do DNA: [Resumos]. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2003. CD-ROM. Resumo.| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 16. | | OLIVEIRA, A. A. R.; SANTOS FILHO, H. P.; SANCHES, N. F.; CRUZ, J. L.; OLIVEIRA, A. M. G.; ANDRADE, P. R. O. de; LOPES, F. F. Monitoramento da pinta preta do mamoeiro no município de Itamaraju, BA, com ênfase na produção integrada. In:SIMPÓSIO DO PAPAYA BRASILEIRO, 4., 2009, VITÓRIA-ES. Pesquisa científica e a crise no mercado do mamão: anais... Vitória: Incaper, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 17. | | OLIVEIRA, A. A. R.; SANTOS FILHO, H. P.; SANCHES, N. F.; NORONHA, A. C. da S.; LOPES, F. F.; ANDRADE, P. R. O.; OLIVEIRA, A. M. G. Monitoramento de doenças como fator de redução do uso de fungicidas no controle da pinta-preta (Asperisporium caricae) do mamoeiro. In: SIMPÓSIO SOBRE INOVAÇÃO E CRIATIVIDADE CIENTÍFICA NA EMBRAPA, 2., 2010, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2010. Disponível em: Acesso em: 21 fev. 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 18. | | SANTOS FILHO, H. P.; NORONHA, A. C. da S.; SANCHES, N. F.; OLIVEIRA, A. A. R.; OLIVEIRA, A. M. G.; ANDRADE, P. R. O. de; LOPES, F. F. Manejo integrado de pragas e doenças do mamoeiro com base em resultados de monitoramento. In: SIMPÓSIO SOBRE MANEJO DE PRAGAS, 1., 2009, Belém, PA. Manejo integrado de pragas, doenças e plantas daninhas em grãos e fruteiras: anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 19. | | SANCHES, N. F.; SANTOS FILHO, H. P.; NORONHA, A. C. da S.; OLIVEIRA, A. A. R.; SANTOS, M. J.; LOPES, F. F.; ANDRADE, P. R. O. Ocorrência de ataque do mandarová Erinnyis ello em mamoeiro na Fazenda Palmeiras, Município de Porto Seguro-BA: estudo de caso. In: MARTINS, D. dos S.; COSTA, A. N. da; COSTA, A. de F. S. da. (Ed.). Papaya Brasil: manejo, qualidade e mercado do mamão. Vitória: Incaper, 2007. p. 502-503.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 20. | | CROZARA, A. S.; GUIMARAES, N. C.; VIU, M. A. de O.; MAGNABOSCO, C. de U.; LOPES, F. F. B.; LOPES, D. T.; MAMEDE, M. M. S.; JACOVETTI, R. Parâmetros genéticos de caracteres de crescimento em bovinos da raça nelore em rebanhos selecionados. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 27., 2017, Santos. Anais [eletrônicos]... Brasília, DF: Associação Brasileira de Zootecnistas, 2017. Zootec.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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