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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
14/07/2009 |
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Data da última atualização: |
06/06/2018 |
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Autoria: |
TOLEDO, B. F. B. de; MARCONDES, J.; LEMOS, E. G. de M. |
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Afiliação: |
Bethânia Figueiredo Barbosa de Toledo, Universidade Estadual Paulista/Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias/Departamento de Tecnologia; Jackson Marcondes, Universidade Estadual Paulista/Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias/Departamento de Tecnologia; Eliana Gertrudes de Macedo Lemos, Universidade Estadual Paulista/Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias/Departamento de Tecnologia. |
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Título: |
Caracterização de rizóbios indicados para produção de inoculantes por meio de sequenciamento parcial do 16S rRNA. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 44, n. 4, p. 384-391, abr. 2009 |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Título em inglês: Characterization of rhizobia indicated for inoculant production using 16S rRNA partial sequencing. |
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Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi confrontar as sequências parciais do gene 16S rRNA de estirpes padrão de rizóbios com as de estirpes recomendadas para a produção de inoculantes no Brasil, com vistas à verificação da confiabilidade do sequenciamento parcial desse gene para a identificação rápida de estirpes. Foram realizados sequenciamentos através de reação em cadeia da polimerase (PCR) com iniciadores relativos à região codificadora do gene 16S rRNA entre as bactérias estudadas. Os resultados foram analisados pela consulta de similaridade de nucleotídeos aos do "Basic Local Alignment Search Tool" (Blastn) e por meio da interpretação de árvores filogenéticas geradas usando ferramentas de bioinformática. A classificação taxonômica das estirpes Semia recomendadas para inoculação de leguminosas com base em propriedades morfológicas e especificidade hospedeira não foi confirmada em todas as estirpes. A maioria das estirpes estudadas, consultadas no Blastn, é consistente com a classificação proposta pela construção de árvores filogenéticas das sequências destas estirpes, com base na similaridade pelo sequenciamento parcial do gene considerado. |
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Thesagro: |
Filogenia; Rhizobium. |
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Thesaurus Nal: |
Bradyrhizobium; phylogeny. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/106106/1/Caracterizacao-de.pdf
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Marc: |
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520 $aO objetivo deste trabalho foi confrontar as sequências parciais do gene 16S rRNA de estirpes padrão de rizóbios com as de estirpes recomendadas para a produção de inoculantes no Brasil, com vistas à verificação da confiabilidade do sequenciamento parcial desse gene para a identificação rápida de estirpes. Foram realizados sequenciamentos através de reação em cadeia da polimerase (PCR) com iniciadores relativos à região codificadora do gene 16S rRNA entre as bactérias estudadas. Os resultados foram analisados pela consulta de similaridade de nucleotídeos aos do "Basic Local Alignment Search Tool" (Blastn) e por meio da interpretação de árvores filogenéticas geradas usando ferramentas de bioinformática. A classificação taxonômica das estirpes Semia recomendadas para inoculação de leguminosas com base em propriedades morfológicas e especificidade hospedeira não foi confirmada em todas as estirpes. A maioria das estirpes estudadas, consultadas no Blastn, é consistente com a classificação proposta pela construção de árvores filogenéticas das sequências destas estirpes, com base na similaridade pelo sequenciamento parcial do gene considerado.
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Registro original: |
Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
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Registro |
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Status |
URL |
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| Registros recuperados : 13 | |
| 8. |  | WICKERT, E.; LEMOS, E. G. de M.; PEREIRA, F. M.; MAYER, N. A. Marcadores fAFLP na caracterização de três genótipos de umezeiro selecionados como porta-enxertos para pessegueiro. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 42, n. 12, p. 1741-1746, dez. 2007 Título em inglês: fAFLP markers to characterize three mume genotypes selected as rootstocks for peach tree.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 9. | | VAL-MORAES, S. P.; VALARINI, M. J.; GHINI, R.; LEMOS, E. G. de M.; CARARETO-ALVES, L. M. Diversidade de bactérias de solo sob vegetação natural e cultivo de hortaliças. Revista Ciência Agronômica, v. 40, n. 1, p. 7-16, jan-mar, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 10. | | SILVEIRA, E. L. da; PEREIRA, R. M.; SCAQUITTO, D. C.; PEDRINHO, E. A. N.; VAL-MORAES, S.P.; WICKERT, E.; CARARETO-ALVES, L.M.; LEMOS, E. G. de M. Bacterial diversity of soil under eucalyptus assessed by 16S rDNA sequencing analysis. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 41, n. 10, p. 1507-1516, out. 2006 Título em português: Diversidade bacteriana de solo sob eucaliptos obtida por seqüenciamento do 16S rDNA.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 11. | | STOLF-MOREIRA, R.; LEMOS, E. G. de M.; ABDELNOOR, R. V.; BENEVENTI, M. A.; ROLLA, A. A. P.; PEREIRA, S. dos S.; OLIVEIRA, M. C. N. de; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Identification of reference genes for expression analysis by real-time quantitative PCR in drought-stressed soybean. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 1, p. 58-65, jan. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 12. | | STOLF, R.; LEMOS, E. G. de M.; CARARETO-ALVES, L.; PEREIRA, R.; KISHI, L.; MARCONDES, J.; PEREIRA, S. dos S.; ROLLA, A. A. de P.; YAMANAKA, N.; OLIVEIRA, M. C. N. de; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; FARIAS, J. R. B.; NEPOMUCENO, A. L. Identificação de genes de soja diferencialmente expressos durante a seca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 4., 2007, São Lourenço. Anais... São Lourenço: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2007. 1 CD-ROM. Pdf. 411.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 13. | | ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L.; BARROS, E. G. de; SA, M. de F. G. de; BINNECK, E.; MARCELINO, F. C.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; ALMEIDA, J.; ISEPPON, A. M. B.; SCHUSTER, I.; KIDO, E. A.; LOUREIRO, M. E.; MARGIS, R.; HUNGRIA, M.; MOREIRA, M. A.; BACARAT-PEREIRA, M. C.; FIETTO, L. G.; BODANESE-ZANETTINI, M. H.; ROMANO, E.; ZERBINI, F. M.; LEMOS, E. G. de M.; PEREIRA, G. A. G. GENOSOJA - A brazilian soybean genome consortium. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 8., 2009, Beijing. Developing a global soy blueprint for a safe secure and sustainable supply: abstracts. Beijing: Chinese Academy of Agricultural Sciences: Institute of Crop Science, 2009. p. 108, ref. O201. WSRC 2009. Editado por Lijuan Qiu, Rongxia Guan, Jian Jin, Qijan Song, Shuntang Guo, Wenbin Li, Yuanchao Wang, Tianfu Han, Xiaobing Liu, Deyue Yu, Lianzhou Jiang, Deliang Peng.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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