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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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Data corrente: |
23/08/2023 |
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Data da última atualização: |
24/08/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
LEÃO, U. S.; BUENO, L. G.; NEGREIROS, A. B.; SILVA, G. R.; MAGGIONI, R.; BRITTO. F. B.; SARMENTO, J. L. R.; GALVANI, D. B.; DINIZ, F. M. |
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Afiliação: |
UESLEI S. LEÃO, Northeast Biotechnology Network (RENORBIO); UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ; LUICE GOMES BUENO GALVANI, CNPC; ALINE B. NEGREIROS, Northeast Biotechnology Network (RENORBIO); UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ; GEICE R. SILVA; RODRIGO MAGGIONI, INSTITUTE OF MARINE SCIENCES (LABOMAR), UNIVERSIDADE FEDERAL DO CEARÁ; FABIO B. BRITTO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ; JOSE L. R. SARMENTO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ; DIEGO BARCELOS GALVANI, CNPC; FABIO MENDONCA DINIZ, CNPC. |
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Título: |
Unveiling the demographic background and genetic diversity of Urochloa mosambicensis (Poaceae) through genome-wide identification of simple sequence repeats and molecular marker development. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Conservation Genetics Resources, v. 15, p. 1-9, Aug. 2023. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s12686-023-01312-8 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: The first set of simple sequence repeat (SSR) markers for Urochloa mosambicensis (Hack.) Dandy is described in this study. SSRs were isolated from a genomic library with 3491 contigs obtained by high-throughput sequencing. Primers were designed for twenty loci, and all primer pairs were successfully amplified in 39 genotypes, yielding an average of 4.95 alleles per locus. The mean polymorphic information content (PIC) was 0.559, and the mean discriminating power (DP) was 0.520 for all loci considering also all U. mosambicensis genotypes. The non?Bayesian clustering analysis has confirmed clustering consistency of the individuals and provides enough support for the existence of the pattern that also emerged from PCoA and UPGMA. These markers demonstrated potential transferability to U. advena, U. oligotricha, U. brachyura and U. xantholeuca. Our findings showed that the set of molecular markers described here have strong potential for fingerprinting and characterizing genetic diversity in intra-specific plant collections, whose breeding programs could be accelerated by the effective use of these molecular tools, not only in U. mosambicensis, but also within the genus Urochloa. |
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Palavras-Chave: |
Capim-corrente; Genetic diversity; High-throughput sequencing; Microsatellites; Next-generation sequencing; SSR; Transferability. |
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Thesagro: |
Capim Urochloa; Genética Molecular; Gramínea Forrageira; Marcador Genético; Marcador Molecular; Urochloa Mosambicensis. |
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Thesaurus Nal: |
Forage grasses; Genetic markers; Molecular genetics; Plant genetics; Sequence analysis. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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Biblioteca |
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Cutter |
Registro |
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| Registros recuperados : 7 | |
| 1. |  | SANTOS, M. de F. N. dos; AZEVEDO, B. L. S.; LEÃO, U. S.; JESUS, A. A. de; BUENO, L. G.; DINIZ, F. M. Caracterização molecular de genótipos das coleções de trabalho de Urochloa mosambicensis. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CAPRINOS E OVINOS, 8., 2019, Sobral. Anais... Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2019. p. 15-16. (Embrapa Caprinos e Ovinos. Documentos, 126).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 2. | | NOGUEIRA, M. do S. da R.; MOURA, R. M. de; LEÃO, U. S.; FREIRE FILHO, F. R.; RIBEIRO, V. Q.; BRIOSO, P. S. T. Avaliação da resistência e da produção de massa seca em genótipos de feijão-caupi submetidos à infecção viral. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 3., 2013, Recife. Feijão-Caupi como alternativa sustentável para os sistemas produtivos familiares e empresariais. Recife: IPA, 2013. CONAC 2012. Disponível em: http://www.conac2012.org/resumos/pdf/220a.pdf. Acesso em: 07 ago. 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 3. | | AZEVEDO, B. L. S.; SANTOS, M. de F. N. dos; LEÃO, U. S.; JESUS, A. A. de; BUENO, L. G.; DINIZ, F. M. Sequenciamento do genoma de Urochloa mosambicensis com o uso da tecnologia de alto desempenho (NGS) e mineração por regiões repetitivas. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CAPRINOS E OVINOS, 8., 2019, Sobral. Anais... Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2019. p. 17-18. (Embrapa Caprinos e Ovinos. Documentos, 126).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 4. | | LEAO, U. S.; BUENO, L. G.; WILKE, D. V.; MAGGIONI, R.; SILVA, G. R. da; NEGREIROS, A. B.; DINIZ, F. M. Sequenciamento de Nova Geração (NGS) de Urochloa mosambicensis: uma forrageira promissora para o semiárido. In: ENCONTRO DE BIOTECNOLOGIA DO NORDESTE, 2017, Natal. Livro de resumos. [Recife: Rede Nordeste de Biotecnologia, 2017]. Resumo RAS0002. 1 f. RENORBIO 2017.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 5. | | LEÃO, U. S.; EIRAS, M.; FREIRE FILHO, F. R.; NOGUEIRA, M. do S. da R.; RODRIGUES, L. K.; RIBEIRO, V. Q.; LOPES, A. C. de A. Selection of phenotypic traits and resistance to Cowpea severe mosaic virus and Cowpea aphid-borne mosaic virus in cowpea [Vigna unguiculata (L.) Walp.] seeds with rugose white coat. Australian Journal of Crop Science, v. 10, n. 4, p. 470-481, Apr. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Meio-Norte. |
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| 6. | | LEÃO, U. S.; BUENO, L. G.; NEGREIROS, A. B.; SILVA, G. R.; MAGGIONI, R.; BRITTO. F. B.; SARMENTO, J. L. R.; GALVANI, D. B.; DINIZ, F. M. Unveiling the demographic background and genetic diversity of Urochloa mosambicensis (Poaceae) through genome-wide identification of simple sequence repeats and molecular marker development. Conservation Genetics Resources, v. 15, p. 1-9, Aug. 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 7. | | MELO, L. F. de; FREIRE FILHO, F. R.; RIBEIRO, V. Q.; MOURA, R. M. de; LEÃO, U. S.; VIEIRA, P. F. de M. J. Desempenho de linhagens de feijão-caupi com grãos de tegumento branco rugoso extra grandes sob cultivo irrigado. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 3., 2013, Recife. Feijão-Caupi como alternativa sustentável para os sistemas produtivos familiares e empresariais. Recife: IPA, 2013. CONAC 2012. Disponível em: http://www.conac2012.org/resumos/pdf/182b.pdf. Acesso em: 05 ago. 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| Registros recuperados : 7 | |
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