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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
15/01/2014 |
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Data da última atualização: |
15/01/2014 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GLENN, T. C.; LANCE, S. L.; MCKEE, A. M.; WEBSTER, B. L.; EMERY, A. M.; ZERLOTINI, A.; OLIVEIRA, G.; ROLLINSON, D.; FAIRCLOTH, B. C. |
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Afiliação: |
TRAVIS C. GLENN, University of Georgia; STACEY L. LANCE, University of Georgia; ANNA M. MCKEE, University of Georgia; BONNIE L. WEBSTER, Wolfson Wellcome Biomedical Laboratories, Imperial College Faculty of Medicine (St Mary’s Campus); AIDAN M. EMERY, Wolfson Wellcome Biomedical Laboratories; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, Oswaldo Cruz Foundation, CNPTIA; GUILHERME OLIVEIRA, Oswaldo Cruz Foundation; DAVID ROLLINSON, Wolfson Wellcome Biomedical Laboratories; BRANT C. FAIRCLOTH, University of California. |
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Título: |
Significant variance in genetic diversity among populations of Schistosoma haematobium detected using microsatellite DNA loci from a genome-wide database. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
Parasites & Vectors, v. 6, p. 1-12, 2013. |
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DOI: |
10.1186/1756-3305-6-300 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Background: Urogenital schistosomiasis caused by Schistosoma haematobium is widely distributed across Africa and is increasingly being targeted for control. Genome sequences and population genetic parameters can give nsight into the potential for population- or species-level drug resistance. Microsatellite DNA loci are genetic markers in wide use by Schistosoma researchers, but there are few primers available for S. haematobium. Methods: We sequenced 1,058,114 random DNA fragments from clonal cercariae collected from a snail infected with a single Schistosoma haematobium miracidium. We assembled and aligned the S. haematobium sequences to the genomes of S. mansoni and S. japonicum, identifying microsatellite DNA loci across all three species and designing primers to amplify the loci in S. haematobium. To validate our primers, we screened 32 randomly selected primer pairs with population samples of S. haematobium. Results: We designed >13,790 primer pairs to amplify unique microsatellite loci in S. haematobium, (available at http://www.cebio.org/projetos/schistosoma-haematobium-genome). The three Schistosoma genomes contained similar overall frequencies of microsatellites, but the frequency and length distributions of specific motifs differed among species. We identified 15 primer pairs that amplified consistently and were easily scored. We genotyped these 15 loci in S. haematobium individuals from six locations: Zanzibar had the highest levels of diversity; Malawi, Mauritius, Nigeria, and Senegal were nearly as diverse; but the sample from South Africa was much less diverse. Conclusions: About half of the primers in the database of Schistosoma haematobium microsatellite DNA loci should yield amplifiable and easily scored polymorphic markers, thus providing thousands of potential markers. Sequence conservation among S. haematobium, S. japonicum, and S. mansoni is relatively high, thus it should now be possible to identify markers that are universal among Schistosoma species (i.e., using DNA sequences conserved among species), as well as other markers that are specific to species or species-groups (i.e., using DNA sequences that differ among species). Full genome-sequencing of additional species and specimens of S. haematobium, S. aponicum, and S. mansoni is desirable to better characterize differences within and among these species, to develop additional genetic markers, and to examine genes as well as conserved non-coding elements associated with drug resistance. MenosBackground: Urogenital schistosomiasis caused by Schistosoma haematobium is widely distributed across Africa and is increasingly being targeted for control. Genome sequences and population genetic parameters can give nsight into the potential for population- or species-level drug resistance. Microsatellite DNA loci are genetic markers in wide use by Schistosoma researchers, but there are few primers available for S. haematobium. Methods: We sequenced 1,058,114 random DNA fragments from clonal cercariae collected from a snail infected with a single Schistosoma haematobium miracidium. We assembled and aligned the S. haematobium sequences to the genomes of S. mansoni and S. japonicum, identifying microsatellite DNA loci across all three species and designing primers to amplify the loci in S. haematobium. To validate our primers, we screened 32 randomly selected primer pairs with population samples of S. haematobium. Results: We designed >13,790 primer pairs to amplify unique microsatellite loci in S. haematobium, (available at http://www.cebio.org/projetos/schistosoma-haematobium-genome). The three Schistosoma genomes contained similar overall frequencies of microsatellites, but the frequency and length distributions of specific motifs differed among species. We identified 15 primer pairs that amplified consistently and were easily scored. We genotyped these 15 loci in S. haematobium individuals from six locations: Zanzibar had the highest levels of diversity; Malawi, Mauritius... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Esquistossomose urogenital; Microssatélites. |
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Thesagro: |
Genética. |
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Thesaurus Nal: |
Genetics; Microsatellite repeats; Schistosoma haematobium; Schistosomiasis. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/95291/1/Significant.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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Cutter |
Registro |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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Data corrente: |
06/12/1999 |
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Data da última atualização: |
08/09/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
LAGUNA, L. E.; ARAUJO, A. M. de; EGITO, A. S. do. |
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Afiliação: |
LUIS EDUARDO LAGUNA, CNPC; ADRIANA MELLO DE ARAUJO, CNPC; ANTONIO SILVIO DO EGITO, CNPC. |
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Título: |
Avaliação físico-química do leite de cabra das raças Saanen e Anglo-Nubiana. |
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Ano de publicação: |
1999 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista do Instituto de Laticínios Cândido Tostes, v. 54, n. 309, p. 57-61, 1999. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Edição dos Anais do 16o. Congresso Nacional de Laticínios, Juiz de Fora, agosto de 1999. |
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Conteúdo: |
Resumo: Foram estudadas amostras de leite de cabra de dois rebanhos puros das raças Saanen (50 amostras) e Anglo-nubiana (50 amostras), coletadas da ordenha das manhãs e da tarde, sendo analisadas em triplicata, quinzenalmente, por um periodo de vinte e cinco semanas (02/05/97 a 14/04/98), com o objetivo principal de avaliar as variáveis físico-quimicas do leite, que contribuem no rendimento agro-industrial de produtos lácteos, como: densidade a 15°C, pH; acidez titulável °D, lactose %, gordura %, indice crioscópico °C, cinzas %, proteina %, extrato seco total % (EST), extrato seco desengordurado % (ESD) e água. As amostras foram coletadas de 133 cabras em lactaçao, por um período de onze meses, no rebanho da Embrapa Caprinos, sendo 58 cabras Saanen e 75 cabras Anglo-nubiana. A alimentaçao consistia em silagem de milho ou de sorgo e capim elefante picado ( pentsetum purpureum). Durante a época de chuva (janeiro a junho), as cabras tiveram acesso a uma área de caatinga nativa rebaixada, permanecendo em regime semi intensivo. Na época seca (Julho a Dezembro) devido à escassez de pastagem de boa qualidade, os animais ficaram em regime de confinamento. 0 concentrado, à base de milho, farelo de soja e suplemento minerai, era oferecido pela manha e a tarde, num total de 400g/litro de leite produzido. As análises estatisticas foram feitas mediante o teste não paramétrico de Wilcoxon, utilizando o programa SAS. As raças diferiram significativamente quanto as caracteristicas de densidade, pH, acidez, teor de gordura, cinza, proteína, água, EST, e ESD ao nivel de p<0,01; quanto ao índice crioscópico apresentaram significância ao nivel de p<0,05 e não diferiram quanto ao teor de lactose. Na Anglo-nubiana, os turnos de ordenha (manha e tarde) apresentaram efeito significativo (p<0,01) apenas sobre a densidade, a gordura, a água, o EST e o ESD, e ao nivel p<0,05 para pH, acidez e indice crioscópico. Na raça Saanen, houve efeito do turno para densidade, gordura, indice crioscópico, água e EST ao nível p<0,01 e proteina e ESD ao nivel de p<0,05. [Physical and chemical evaluation of goat milk from Saanen and Anglo-nubian races]. MenosResumo: Foram estudadas amostras de leite de cabra de dois rebanhos puros das raças Saanen (50 amostras) e Anglo-nubiana (50 amostras), coletadas da ordenha das manhãs e da tarde, sendo analisadas em triplicata, quinzenalmente, por um periodo de vinte e cinco semanas (02/05/97 a 14/04/98), com o objetivo principal de avaliar as variáveis físico-quimicas do leite, que contribuem no rendimento agro-industrial de produtos lácteos, como: densidade a 15°C, pH; acidez titulável °D, lactose %, gordura %, indice crioscópico °C, cinzas %, proteina %, extrato seco total % (EST), extrato seco desengordurado % (ESD) e água. As amostras foram coletadas de 133 cabras em lactaçao, por um período de onze meses, no rebanho da Embrapa Caprinos, sendo 58 cabras Saanen e 75 cabras Anglo-nubiana. A alimentaçao consistia em silagem de milho ou de sorgo e capim elefante picado ( pentsetum purpureum). Durante a época de chuva (janeiro a junho), as cabras tiveram acesso a uma área de caatinga nativa rebaixada, permanecendo em regime semi intensivo. Na época seca (Julho a Dezembro) devido à escassez de pastagem de boa qualidade, os animais ficaram em regime de confinamento. 0 concentrado, à base de milho, farelo de soja e suplemento minerai, era oferecido pela manha e a tarde, num total de 400g/litro de leite produzido. As análises estatisticas foram feitas mediante o teste não paramétrico de Wilcoxon, utilizando o programa SAS. As raças diferiram significativamente quanto as caracteristicas de densi... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Chemicophysical properties; Densidade; Fats; Protein; Raça Anglo-Nubiana; Raça Saanen. |
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Thesagro: |
Caprino; Composição de alimento; Gordura; Leite de cabra; Ordenha; Propriedade físico-química; Proteína. |
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Thesaurus NAL: |
Brazil; Density; Goat milk; Goats; Milking; Physicochemical properties. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/66130/1/AAC-Avaliacao-fisico-quimica.pdf
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Marc: |
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500 $aEdição dos Anais do 16o. Congresso Nacional de Laticínios, Juiz de Fora, agosto de 1999.
520 $aResumo: Foram estudadas amostras de leite de cabra de dois rebanhos puros das raças Saanen (50 amostras) e Anglo-nubiana (50 amostras), coletadas da ordenha das manhãs e da tarde, sendo analisadas em triplicata, quinzenalmente, por um periodo de vinte e cinco semanas (02/05/97 a 14/04/98), com o objetivo principal de avaliar as variáveis físico-quimicas do leite, que contribuem no rendimento agro-industrial de produtos lácteos, como: densidade a 15°C, pH; acidez titulável °D, lactose %, gordura %, indice crioscópico °C, cinzas %, proteina %, extrato seco total % (EST), extrato seco desengordurado % (ESD) e água. As amostras foram coletadas de 133 cabras em lactaçao, por um período de onze meses, no rebanho da Embrapa Caprinos, sendo 58 cabras Saanen e 75 cabras Anglo-nubiana. A alimentaçao consistia em silagem de milho ou de sorgo e capim elefante picado ( pentsetum purpureum). Durante a época de chuva (janeiro a junho), as cabras tiveram acesso a uma área de caatinga nativa rebaixada, permanecendo em regime semi intensivo. Na época seca (Julho a Dezembro) devido à escassez de pastagem de boa qualidade, os animais ficaram em regime de confinamento. 0 concentrado, à base de milho, farelo de soja e suplemento minerai, era oferecido pela manha e a tarde, num total de 400g/litro de leite produzido. As análises estatisticas foram feitas mediante o teste não paramétrico de Wilcoxon, utilizando o programa SAS. As raças diferiram significativamente quanto as caracteristicas de densidade, pH, acidez, teor de gordura, cinza, proteína, água, EST, e ESD ao nivel de p<0,01; quanto ao índice crioscópico apresentaram significância ao nivel de p<0,05 e não diferiram quanto ao teor de lactose. Na Anglo-nubiana, os turnos de ordenha (manha e tarde) apresentaram efeito significativo (p<0,01) apenas sobre a densidade, a gordura, a água, o EST e o ESD, e ao nivel p<0,05 para pH, acidez e indice crioscópico. Na raça Saanen, houve efeito do turno para densidade, gordura, indice crioscópico, água e EST ao nível p<0,01 e proteina e ESD ao nivel de p<0,05. [Physical and chemical evaluation of goat milk from Saanen and Anglo-nubian races].
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Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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