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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
09/03/2007 |
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Data da última atualização: |
17/05/2017 |
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Autoria: |
FILETO, R.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; RIBEIRO, A. A.; QUINALIA, T. G.; FRANCO, E. H.; MANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; OLIVEIRA, S. R. M.; SANTOS, E. H.; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; CRUZ, S. A. B.; NESHICH, G. |
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Afiliação: |
RENATO FILETO; PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; ANDRÉ A. RIBEIRO; THIAGO G. QUINALIA; EDUARDO H. FRANCO; ADAUTO LUIZ MANCINI, CNPTIA; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; STANLEY ROBSON DE MEDEIROS OLIVEIRA, CNPTIA; EDGARD HENRIQUE DOS SANTOS, CNPTIA; FABIO DANILO VIEIRA, CNPTIA; IVAN MAZONI, CNPTIA; SERGIO APARECIDO BRAGA DA CRUZ, CNPTIA; GORAN NESHICH, CNPTIA. |
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Título: |
PDB-Metrics: a web tool for exploring the PDB contents. |
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Ano de publicação: |
2006 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 5, n. 2, p. 333-341, 2006. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract. PDB-Metrics (http://sms.cbi.cnptia.embrapa.br/SMS/pdb_metrics/index.html) is a component of the Diamond STING suite of programs for the analysis of protein sequence, structure and function. It summarizes the characteristics of the collection of protein structure descriptions deposited in the Protein Data Bank (PDB) and provides a Web interface to search and browse the PDB, using a variety of alternative criteria. PDB-Metrics is a powerful tool for bioinformaticians to examine the data span in the PDB from several perspectives. Although other Web sites offer some similar resources to explore the PDB contents, PDB-Metrics is among those with the most complete set of such facilities, integrated into a single Web site. This program has been developed using SQLite, a C library that provides all the query facilities of a database management system. |
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Palavras-Chave: |
Banco de dados de proteína; Bioinformática; PDB data distribution statistics; Protein Data Bank. |
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Thesaurus Nal: |
Bioinformatics; Proteins. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/159948/1/AP-PDB-Metrics-Fileto-GMR-2006.pdf
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Marc: |
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005 2017-05-17
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100 1 $aFILETO, R.
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260 $c2006
520 $aAbstract. PDB-Metrics (http://sms.cbi.cnptia.embrapa.br/SMS/pdb_metrics/index.html) is a component of the Diamond STING suite of programs for the analysis of protein sequence, structure and function. It summarizes the characteristics of the collection of protein structure descriptions deposited in the Protein Data Bank (PDB) and provides a Web interface to search and browse the PDB, using a variety of alternative criteria. PDB-Metrics is a powerful tool for bioinformaticians to examine the data span in the PDB from several perspectives. Although other Web sites offer some similar resources to explore the PDB contents, PDB-Metrics is among those with the most complete set of such facilities, integrated into a single Web site. This program has been developed using SQLite, a C library that provides all the query facilities of a database management system.
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653 $aProtein Data Bank
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700 1 $aNESHICH, G.
773 $tGenetics and Molecular Research$gv. 5, n. 2, p. 333-341, 2006.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 60 | |
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| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 3. | | OLIVEIRA, J. V. de; FREIRE, E.; POLIDORO, J. C. Fontes de matéria prima de origem orgânica para produção de fertilizantes organominerais. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 32.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 16.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 14.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 11., 2016, Goiânia. Rumo aos novos desafios: anais. Goiânia: SBCS, Núcleo Regional Centro-Oeste, 2016. FertBio 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 4. | | BREDA, M. O.; OLIVEIRA, J. V. de; MARQUES, E. J.; FERREIRA, R. G.; SANTANA, M. F. Inseticidas botânicos aplicados sobre Aphis gossypii e seu predador Cycloneda sanguinea em algodão-colorido. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 11, p. 1424-1431, out. 2011 Título em inglês: Botanical insecticides applied on Aphis gossypii and its predator Cycloneda sanguinea on naturally colored cotton.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 8. | | BREDA, M. O.; OLIVEIRA, J. V. de; CARVALHO, A. N. M.; QUEIROZ, D. L. de. Registro de Glycaspis brimblecombei em Eucalyptus spp., em Petrolina, Pernambuco, Brasil. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 30, n. 63, p. 253-255, ago./out. 2010. Nota científica.| Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 10. | | MOREIRA, A. N.; OLIVEIRA, J. V. de; HAJI, F. N. P. Efeito de diferentes niveis de NPK na infestacao do microacaro do tomateiro Aculops lycopersici (Massee, 1937) (Acari: Eriophyidae) no Submedio Sao Francisco. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 16.; ENCONTRO NACIONAL DE FITOSSANITARISTAS, 7., 1997, Salvador. Resumos... Salvador: SEB: EMBRAPA-CNPMF: EBDA: CEPLAC, 1997. p. 39,| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 15. | | WOLFF, J. L.; VALICENTE, F. H.; MARTINS, R.; OLIVEIRA, J. V. de C.; ZANOTTO, P. M. de A. Analysis of the genome of Spodoptera frugiperda nucleopolyhedrovirus (SfMNPV-19) and of the high genomic heterogeneity in group II nucleopolyhedroviruses. Journal of General Virology, Cambridge, v. 89, n. 6, p. 1202-1211, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 16. | | MOREIRA, A. N.; OLIVEIRA, J. V. de; OLIVEIRA, J. E. de M.; SOUZA, G. M. M. de; BREDA, M. O. Injuries caused by Frankliniella spp. (Thysanoptera: Thripidae) on seedless grapes. Ciência e Agrotecnologia, Lavras, v. 38, n. 4, p. 328-334, jul./ago. 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 17. | | FERREIRA, R. C. F.; OLIVEIRA, J. V. de; HAJI, F. N. P.; GONDIM JÚNIOR, M. G. C. Biologia, exigências térmicas e tabela de vida de fertilidade do ácaro-branco (Acari: Tarsonemidae) em videira cv. Itália. In: SEMINÁRIO BRASILEIRO DE PRODUÇÃO INTEGRADA DE FRUTAS, 7., 2005, Fortaleza. Programa e resumos... Fortaleza: Embrapa Agroindústria Tropical, 2005. p. 194. (Embrapa Agroindústria Tropical. Documentos, 99).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 18. | | FERREIRA, R. C. F.; OLIVEIRA, J. V. de; HAJI, F. N. P.; GONDIM JÚNIOR, M. G. C. Biologia, exigências térmicas e tabela de vida de fertilidade do ácaro-branco Polyphagotarsonemus latus (Banks) (Acari: Tarsonemidae) em videira (Vitis vinifera L.) cv. Itália. Neotropical Entomology, Piracicaba, v. 35, n. 1, p. 126-132, Jan./Feb. 2006.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 19. | | BARBOSA, F. R.; NASCIMENTO, A. S. do; OLIVEIRA, J. V. de; ALENCAR, J. A. de; HAJI, F. N. P. Pragas. In: BARBOSA, F. R. (Ed). Goiaba: fitossanidade. Brasília, DF: Embrapa Informação Tecnológica: Petrolina: Embrapa Semi-Árido, 2001. cap. 4, p. 29-56. il. (Frutas do Brasil, 18).| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 20. | | MOREIRA, A. N.; OLIVEIRA, J. V. de; OLIVEIRA, J. E. de M.; TORRES, J. B.; CAMPOS, S. M. S. Plantas hospedeiras alternativas de tripes em pomares de videira, em Petrolina, PE. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 23., 2010, Natal. Anais... Natal: Sociedade Brasileira de Entomologia, 2010. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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