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BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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Biblioteca(s):  Embrapa Agroenergia.
Data corrente:  05/11/2020
Data da última atualização:  06/11/2020
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  LIMA, R. A. T.; OLIVEIRA, G. d.; SOUZA, A. A.; LOPES, F. A. C.; SANTANA, R. H.; ISTVAN, P.; QUIRINO, B. F.; BARBOSA, J.; FREITAS, S. d.; GARAY, A. V.; KRUGER, R. H.
Afiliação:  Raul Alcântara Teixeira Lima, Universidade de Brasília; Gideane de Oliveira, Universidade de Brasília; Amanda Araújo Souza, Universidade de Brasília; Fabyano Alvares Cardoso Lopes, Universidade Federal do Tocantins; Renata Henrique Santana, Instituto Federal de Brasília; Paula Istvan, Universidade de Brasília; BETANIA FERRAZ QUIRINO, CNPAE; João Barbosa, Universidade de Brasília; Sônia de Freitas, Universidade de Brasília; Aisel Valle Garay, Universidade de Brasília; Ricardo Henrique Kruger, Universidade de Brasília.
Título:  Functional and structural characterization of a novel GH3 Beta-glucosidase from the gut metagenome of the Brazilian Cerrado termite Syntermes wheeleri.
Ano de publicação:  2020
Fonte/Imprenta:  International Journal of Biological Macromolecules, v. 165, Part A, p. 822-834, Dec. 2020.
Volume:  165
DOI:  https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2020.09.236
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  In this study, a GH3 family Beta-glucosidase (Bgl7226) from metagenomic sequences of the Syntermes wheeleri gut, a Brazilian Cerrado termite, was expressed, purified and characterized. The enzyme showed two optimum pHs (pH 7 and pH 10), and a maximum optimum temperature of about 40 °C using 4-Nitrophenyl ?-D-glucopyranoside (pNPG) as substrate. Bgl7226 showed higher enzymatic activity at basic pH, but higher affinity (Km) at neutral pH. However, at neutral pH the Bgl7226 enzyme showed higher catalytic efficiency (kcat/Km) for pNPG substrate. Predictive analysis about the enzyme structure-function relationship by sequence alignment suggested the presence of multi-domains and conserved catalytic sites. Circular dichroism results showed that the secondary structure composition of the enzyme is pH-dependent. Small conformational changes occurred close to the optimum temperature of 40 o C, and seem important for the highest activity of Bgl7226 observed at pH 7 and 10. In addition, the small transition in the unfolding curves close to 40 o C is typical of intermediates associated with proteins structured in several domains. Bgl7226 has significant Beta-glucosidase activity which could be attractive for biotechnological applications, such as plant roots detoxification; specifically, our group is interested in cassava roots (Manihot esculenta) detoxification.
Palavras-Chave:  Genômica ambiental.
Thesagro:  Cerrado; Enzima; RNA.
Thesaurus Nal:  Beta-glucosidase; Metagenomics.
Categoria do assunto:  --
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Agroenergia (CNPAE)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPAE3728 - 1UPCAP - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoPEIXOTO, J.; SILVA, L. P.; KRÜGER, R. H. Brazilian Cerrado soil reveals an untapped microbial potential forunpretreated polyethylene biodegradation. Journal of Hazardous Materials, v. 324, p. 634-644, 2017.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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2.Imagem marcado/desmarcadoKRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F.; CORDEIRO, D. M. Engenharia de transgênicos: metodologia. In: QUIRINO, B.F. Revolução dos Transgênicos. Rio de Janeiro: Interciência, 2008.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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3.Imagem marcado/desmarcadoCUNHA, I. S.; KRÜGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Construção de uma biblioteca metagenômica de expressão da microbiota de rúmen de caprinos. Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2009. 6 p. (Embrapa Agroenergia. Comunicado técnico, 002).
Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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4.Imagem marcado/desmarcadoCARVALHO, L. S.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Triagem de Bibliotecas Metagenômicas para Isolamento de Clones com Atividade de Celobiohidrolase. In: CONGRESSO LATINO AMERICANO DE MICROBIOLOGIA, 21., 2012, Santos, SP. [Anais...]. São Paulo: Sociedade Brasileira de Microbiologia: Asociación Latinoamericana de Microbiologia, 2012.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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5.Imagem marcado/desmarcadoTAVARES, P.; SILVA, M. R. S. S.; KRUGER, R. H.; NORONHA, E. F.; QUIRINO, B. F. Accessing lipases from soil metagenoma and their application for microbial biofuel production. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 26., 2011, Foz do Iguaçu, PR. Anais... São Paulo: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2011. Não paginado.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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6.Imagem marcado/desmarcadoTAVARES, P.; BERGMANN, J.; KRUGER, R. H.; NORONHA, E.; QUIRINO, B. F. Accessing lipases from soil metagenome as an aid for biofuel production. In: BRAZILIAN BIOENERGY SCIENCE AND TECHNOLOGY CONFERENCE - BBEST, 1., 2011, Campos do Jordão, SP. [Anais...]. São Paulo: FAPESP, 2011. Não paginado.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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7.Imagem marcado/desmarcadoBALESTRINI, V. P.; PINTO, O. H. B.; KRÜGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Análise de genomas montados a partir de uma comunidade microbiana enriquecida com lignina. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 7., 2023, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2023. p. 10.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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8.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, A. P. de; SILVA, M. R. S. S. da; QUIRINO, B. F.; KRUGER, R. H. Combining "Omics" strategies to analyze the biotechnological potential of complex microbial environments. Current Protein and Peptide Science, v. 14, n. 6, 2013.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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9.Imagem marcado/desmarcadoQUIRINO, B. F.; BARRETO, C. C.; PAPPAS, G. J.; ZEGLE, K.; KRAMPIS, K.; KRUGER, R. H. Genomes and post-genome technology. In: FALKOW, S.; ROSENBERG, E.; SCHLEIFER, K-H.; STACKEBRANDT, E.; DWORKIN, M. (Ed.). The prokaryotes. Berlin: Springer-Verlag, 2013.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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10.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, V. H. L.; MAGALHÃES, B. S.; QUIRINO, B. F.; KRÜGER, R. H.; BARRETO, C. C. Enriquecimento de bactérias "ainda não cultivadas" apresentando atividade de xilanase. In: WORKSHOP EM CIÊNCIAS GENÔMICAS E BIOTECNOLOGIA, 1., 2009, Brasília, DF. [Anais...]. Brasília, DF: [UCB], 2009. Não paginado.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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11.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, D. F. K.; ISTVAN, P.; QUIRINO, B. F.; KRUGER, R. H. Functional metagenomics as a tool for idenfication of new antibiotic resistance genes from natural environments. Microbial Ecology, October 2016.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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12.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, D. F. K. dos; ISTVAN, p.; QUIRINO, B. F.; KRUGER, R. H. Functional metagenomics as a tool for identification of new antibiotic resistance genes from natural environments. Microbial Ecology, v. 73, n. 2, p. 479-491, 2017.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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13.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, D. F. K. dos; ISTVAN, P.; NORONHA, E. F.; QUIRINO, B. F.; KRÜGER, R. H. New dioxygenase from metagenomic library from Brazilian soil: insights into antibiotic resistance and bioremediation. Biotechnology Letters, v. 37, n. 9, p.1809-1817, 2015.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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14.Imagem marcado/desmarcadoQUIRINO, B. F.; CANDICO, E. S.; CAMPOS, P. F.; FRANCO, O. L.; KRUGER, R. H. Proteomic approaches to study plant-pathogen interactions. Phytochemistry, v. 71, p. 351-362, 2010.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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15.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, A. P.; PAPPAS, G.; QUIRINO, B. F.; KRUGER, R. H. In silico analysis to compare the 18S rRNA gene libraries and estimate species richeness whitin Biome Cerrado. In: ANNUAL MEETING OF THE SBBq, 36.; IUBMB CONFERENCE, 10., 2007, Salvador, BA. Infectious diseases: biochemistry of parasites, vectors and hosts: program and abstracts. São Paulo, SP: Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2007.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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16.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, V. H. L. de; SCHROEDER, L. F.; QUIRINO, B. F.; KRUGER, R. H.; BARRETO, C. C. Acidobacteria from oligotrophic soil from the Cerrado can grow in a wide range of carbon source concentrations. Canadian Journal of Microbiology, v. 59, p. 1-8, 2013.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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17.Imagem marcado/desmarcadoMENDES, I. V.; GARCIA, M. B.; SANTANA, R. H.; GLADDEN, J.; KRÜGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Análise funcional e da diversidade de um consórcio microbiano capaz de degradar lignina. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 5., 2018, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2018. p. 36.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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18.Imagem marcado/desmarcadoDOMENECH, D.; CANTAO, M. E.; COSTA, O. Y.; CARVALHO B. J.; KYAW, C. M.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Comparative characterization of the archaeal community in the amazon forest: native forest and oil palm plantation by high-throughput sequencing. In: CONGRESSO LATINOAMERICANO DE MICROBIOLOGIA, 22.; CONGRESSO BOLIVIANO DE MICROBIOLOGIA, 4., 2014, Cartagena. Memórias: Clínica- Bioanálisis - Industrial - Ambiental. Cartagena: Universidad de Antioquia; Associação Colombiana de Microbiologia, 2014. p. 87. Publicado em: Hechos Microbiológicos, v. 5. n. 2, suplemento 2, p. 62, noviembre, 2014. p. 87. ALAM 2014; CCM 2014.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Suínos e Aves.
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19.Imagem marcado/desmarcadoGARCIA, M. B.; MENDES, I. V.; SANTANA, R. H.; KRUGER, R. H.; GLADDEN, J.; QUIRINO, B. F. Diversidade microbiana e degradação de lignina em cultura enriquecida. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 5., 2018, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2018. p. 42.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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20.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, A. P. de; QUIRINO, B. F.; PAPPAS JUNIOR, G.; KUROKAWA, A. S.; LEONARDECZ NETO, E.; KRÜGER, R. H. Diversity of soil fungal communities of cerrado and its closely surrounding agriculture fields. Arch Microbiol, v.190, p. 129-139, 2008.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Internacional - A
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