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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia. |
Data corrente: |
05/11/2020 |
Data da última atualização: |
06/11/2020 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
LIMA, R. A. T.; OLIVEIRA, G. d.; SOUZA, A. A.; LOPES, F. A. C.; SANTANA, R. H.; ISTVAN, P.; QUIRINO, B. F.; BARBOSA, J.; FREITAS, S. d.; GARAY, A. V.; KRUGER, R. H. |
Afiliação: |
Raul Alcântara Teixeira Lima, Universidade de Brasília; Gideane de Oliveira, Universidade de Brasília; Amanda Araújo Souza, Universidade de Brasília; Fabyano Alvares Cardoso Lopes, Universidade Federal do Tocantins; Renata Henrique Santana, Instituto Federal de Brasília; Paula Istvan, Universidade de Brasília; BETANIA FERRAZ QUIRINO, CNPAE; João Barbosa, Universidade de Brasília; Sônia de Freitas, Universidade de Brasília; Aisel Valle Garay, Universidade de Brasília; Ricardo Henrique Kruger, Universidade de Brasília. |
Título: |
Functional and structural characterization of a novel GH3 Beta-glucosidase from the gut metagenome of the Brazilian Cerrado termite Syntermes wheeleri. |
Ano de publicação: |
2020 |
Fonte/Imprenta: |
International Journal of Biological Macromolecules, v. 165, Part A, p. 822-834, Dec. 2020. |
Volume: |
165 |
DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2020.09.236 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
In this study, a GH3 family Beta-glucosidase (Bgl7226) from metagenomic sequences of the Syntermes wheeleri gut, a Brazilian Cerrado termite, was expressed, purified and characterized. The enzyme showed two optimum pHs (pH 7 and pH 10), and a maximum optimum temperature of about 40 °C using 4-Nitrophenyl ?-D-glucopyranoside (pNPG) as substrate. Bgl7226 showed higher enzymatic activity at basic pH, but higher affinity (Km) at neutral pH. However, at neutral pH the Bgl7226 enzyme showed higher catalytic efficiency (kcat/Km) for pNPG substrate. Predictive analysis about the enzyme structure-function relationship by sequence alignment suggested the presence of multi-domains and conserved catalytic sites. Circular dichroism results showed that the secondary structure composition of the enzyme is pH-dependent. Small conformational changes occurred close to the optimum temperature of 40 o C, and seem important for the highest activity of Bgl7226 observed at pH 7 and 10. In addition, the small transition in the unfolding curves close to 40 o C is typical of intermediates associated with proteins structured in several domains. Bgl7226 has significant Beta-glucosidase activity which could be attractive for biotechnological applications, such as plant roots detoxification; specifically, our group is interested in cassava roots (Manihot esculenta) detoxification. |
Palavras-Chave: |
Genômica ambiental. |
Thesagro: |
Cerrado; Enzima; RNA. |
Thesaurus Nal: |
Beta-glucosidase; Metagenomics. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02436naa a2200349 a 4500 001 2126334 005 2020-11-06 008 2020 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2020.09.236$2DOI 100 1 $aLIMA, R. A. T. 245 $aFunctional and structural characterization of a novel GH3 Beta-glucosidase from the gut metagenome of the Brazilian Cerrado termite Syntermes wheeleri.$h[electronic resource] 260 $c2020 300 $a165 490 $v165 520 $aIn this study, a GH3 family Beta-glucosidase (Bgl7226) from metagenomic sequences of the Syntermes wheeleri gut, a Brazilian Cerrado termite, was expressed, purified and characterized. The enzyme showed two optimum pHs (pH 7 and pH 10), and a maximum optimum temperature of about 40 °C using 4-Nitrophenyl ?-D-glucopyranoside (pNPG) as substrate. Bgl7226 showed higher enzymatic activity at basic pH, but higher affinity (Km) at neutral pH. However, at neutral pH the Bgl7226 enzyme showed higher catalytic efficiency (kcat/Km) for pNPG substrate. Predictive analysis about the enzyme structure-function relationship by sequence alignment suggested the presence of multi-domains and conserved catalytic sites. Circular dichroism results showed that the secondary structure composition of the enzyme is pH-dependent. Small conformational changes occurred close to the optimum temperature of 40 o C, and seem important for the highest activity of Bgl7226 observed at pH 7 and 10. In addition, the small transition in the unfolding curves close to 40 o C is typical of intermediates associated with proteins structured in several domains. Bgl7226 has significant Beta-glucosidase activity which could be attractive for biotechnological applications, such as plant roots detoxification; specifically, our group is interested in cassava roots (Manihot esculenta) detoxification. 650 $aBeta-glucosidase 650 $aMetagenomics 650 $aCerrado 650 $aEnzima 650 $aRNA 653 $aGenômica ambiental 700 1 $aOLIVEIRA, G. d. 700 1 $aSOUZA, A. A. 700 1 $aLOPES, F. A. C. 700 1 $aSANTANA, R. H. 700 1 $aISTVAN, P. 700 1 $aQUIRINO, B. F. 700 1 $aBARBOSA, J. 700 1 $aFREITAS, S. d. 700 1 $aGARAY, A. V. 700 1 $aKRUGER, R. H. 773 $tInternational Journal of Biological Macromolecules$gv. 165, Part A, p. 822-834, Dec. 2020.
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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Registros recuperados : 64 | |
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Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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6. | | TAVARES, P.; BERGMANN, J.; KRUGER, R. H.; NORONHA, E.; QUIRINO, B. F. Accessing lipases from soil metagenome as an aid for biofuel production. In: BRAZILIAN BIOENERGY SCIENCE AND TECHNOLOGY CONFERENCE - BBEST, 1., 2011, Campos do Jordão, SP. [Anais...]. São Paulo: FAPESP, 2011. Não paginado.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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7. | | BALESTRINI, V. P.; PINTO, O. H. B.; KRÜGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Análise de genomas montados a partir de uma comunidade microbiana enriquecida com lignina. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 7., 2023, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2023. p. 10.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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9. | | QUIRINO, B. F.; BARRETO, C. C.; PAPPAS, G. J.; ZEGLE, K.; KRAMPIS, K.; KRUGER, R. H. Genomes and post-genome technology. In: FALKOW, S.; ROSENBERG, E.; SCHLEIFER, K-H.; STACKEBRANDT, E.; DWORKIN, M. (Ed.). The prokaryotes. Berlin: Springer-Verlag, 2013.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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10. | | CASTRO, V. H. L.; MAGALHÃES, B. S.; QUIRINO, B. F.; KRÜGER, R. H.; BARRETO, C. C. Enriquecimento de bactérias "ainda não cultivadas" apresentando atividade de xilanase. In: WORKSHOP EM CIÊNCIAS GENÔMICAS E BIOTECNOLOGIA, 1., 2009, Brasília, DF. [Anais...]. Brasília, DF: [UCB], 2009. Não paginado.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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15. | | CASTRO, A. P.; PAPPAS, G.; QUIRINO, B. F.; KRUGER, R. H. In silico analysis to compare the 18S rRNA gene libraries and estimate species richeness whitin Biome Cerrado. In: ANNUAL MEETING OF THE SBBq, 36.; IUBMB CONFERENCE, 10., 2007, Salvador, BA. Infectious diseases: biochemistry of parasites, vectors and hosts: program and abstracts. São Paulo, SP: Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2007.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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17. | | MENDES, I. V.; GARCIA, M. B.; SANTANA, R. H.; GLADDEN, J.; KRÜGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Análise funcional e da diversidade de um consórcio microbiano capaz de degradar lignina. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 5., 2018, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2018. p. 36.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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18. | | DOMENECH, D.; CANTAO, M. E.; COSTA, O. Y.; CARVALHO B. J.; KYAW, C. M.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Comparative characterization of the archaeal community in the amazon forest: native forest and oil palm plantation by high-throughput sequencing. In: CONGRESSO LATINOAMERICANO DE MICROBIOLOGIA, 22.; CONGRESSO BOLIVIANO DE MICROBIOLOGIA, 4., 2014, Cartagena. Memórias: Clínica- Bioanálisis - Industrial - Ambiental. Cartagena: Universidad de Antioquia; Associação Colombiana de Microbiologia, 2014. p. 87. Publicado em: Hechos Microbiológicos, v. 5. n. 2, suplemento 2, p. 62, noviembre, 2014. p. 87. ALAM 2014; CCM 2014.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Suínos e Aves. |
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19. | | GARCIA, M. B.; MENDES, I. V.; SANTANA, R. H.; KRUGER, R. H.; GLADDEN, J.; QUIRINO, B. F. Diversidade microbiana e degradação de lignina em cultura enriquecida. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 5., 2018, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2018. p. 42.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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