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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
26/04/2010 |
Data da última atualização: |
29/09/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
MAIA, L. C. da; SOUZA, V. Q. de; KOPP, M. M.; CARVALHO, F. I. F. de F; OLIVEIRA, A. C. |
Afiliação: |
LUCIANO CARLOS DA MAIA, UFPel; VELCI QUEIRÓZ DE SOUZA, UFSM; MAURICIO MARINI KOPP, CNPGL; ERNANDO IRAJÁ FÉLIX DE CARVALHO, UFPel; ANTÔNIO COSTA OLIVEIRA, UFPel. |
Título: |
Tandem repeat distribution of gene transcripts in three plant families. |
Ano de publicação: |
2009 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 32, n. 4, p. 822-833, 2009. |
DOI: |
https://doi.org/10.1590/S1415-47572009005000091 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Tandem repeats (microsatellites or SSRs) are molecular markers with great potential for plant genetic studies. Modern strategies include the transfer of these markers among widely studied and orphan species. In silico analyses allow for studying distribution patterns of microsatellites and predicting which motifs would be more amenable to interspecies transfer. Transcribed sequences (Unigene) from ten species of three plant families were surveyed for the occurrence of micro and minisatellites. Transcripts from different species displayed different rates of tandem repeat occurrence, ranging from 1.47% to 11.28%. Both similar and different patterns were found within and among plant families. The results also indicate a lack of association between genome size and tandem repeat fractions in expressed regions. The conservation of motifs among species and its implication on genome evolution and dynamics are discussed. |
Palavras-Chave: |
Comparative genomics; EST; SSR. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/711664/1/Tandem-repeat-distribution-of-gene-transcripts-in-three-plant-families.pdf
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Marc: |
LEADER 01601naa a2200217 a 4500 001 1711664 005 2022-09-29 008 2009 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1590/S1415-47572009005000091$2DOI 100 1 $aMAIA, L. C. da 245 $aTandem repeat distribution of gene transcripts in three plant families.$h[electronic resource] 260 $c2009 520 $aTandem repeats (microsatellites or SSRs) are molecular markers with great potential for plant genetic studies. Modern strategies include the transfer of these markers among widely studied and orphan species. In silico analyses allow for studying distribution patterns of microsatellites and predicting which motifs would be more amenable to interspecies transfer. Transcribed sequences (Unigene) from ten species of three plant families were surveyed for the occurrence of micro and minisatellites. Transcripts from different species displayed different rates of tandem repeat occurrence, ranging from 1.47% to 11.28%. Both similar and different patterns were found within and among plant families. The results also indicate a lack of association between genome size and tandem repeat fractions in expressed regions. The conservation of motifs among species and its implication on genome evolution and dynamics are discussed. 653 $aComparative genomics 653 $aEST 653 $aSSR 700 1 $aSOUZA, V. Q. de 700 1 $aKOPP, M. M. 700 1 $aCARVALHO, F. I. F. de F 700 1 $aOLIVEIRA, A. C. 773 $tGenetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto$gv. 32, n. 4, p. 822-833, 2009.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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URL |
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Registros recuperados : 267 | |
101. | | SCURO, V. M.; SILVA, R. D. D.; SILVA, E. F. da; KÖPP, M. M.; OLIVEIRA, J. C. P. Superação de dormência em sementes de Paspalum dilatatum Poir biótipo virasoro pelo uso de ácido sulfúrico. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUL, 6., 2016, Bagé. Resumos... Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2016. p. 35. Claudia Cristina Gulias Gomes, editora técnica.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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102. | | MAIA, L. C. da; SOUZA, V. Q. de; KOPP, M. M.; CARVALHO, F. I. F. de F; OLIVEIRA, A. C. Tandem repeat distribution of gene transcripts in three plant families. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 32, n. 4, p. 822-833, 2009.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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104. | | KOPP, M. M.; SOUSA, S. S.; ALVES, A. L.; MARCHESE, J. A. Q.; HINDERSMANN, R. I.; FERREIRA, J. L. Evaluation of genotypes of white clover (Trifolium repens L.) in the Campanha region of Rio Grande do Sul. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 51., 2014, Barra dos Coqueiros. A produção animal frente às mudanças climáticas e tecnológicas: anais. Aracaju: UFS: DZO: IF-SE, 2014. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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105. | | COIMBRA, J. L. M.; GUIDOLIN, A. F.; KOPP, M. M.; BERTOLDO, J. G.; ARRUDA, B.; STINGHEN, J. C. Erro experimental em marcadores AFLP: consequências e estimativas. Semina: ciências agrárias, Londrina, v. 33, n. 1, p. 87-100, jan./mar. 2012.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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106. | | VEY, R. T.; BORTOLIN, G. S.; OLIVEIRA, J. C. P.; KOPP, M. M.; SILVA, A. C. F. da. Estudo da germinação de sementes de Paspalum regnellii Mez através deo tratamento com nitrato de potássio e bioestimulante. In: JORNADA DE PÓS-GRADUAÇÃO E PESQUISA, 12.; MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 12.; MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA JÚNIOR, 10.; MOSTRA INTERNACIONAL DE FOTOGRAFIA, 2., 2014, Bagé. Anais... Bagé: Ediurcamp, 2014. 1 CD-ROM. CONGREGA.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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110. | | REIS, C. R. G. dos; MARQUES, R.; KELMER, G. A. R; CHIAVEGATTO, R. B.; PASSOS, L. P.; KOPP, M. M. Efeito da pré-suplementação com ferro no estudo da toxidez por alumínio em Brachiaria brizantha. In: SIMPÓSIO MINEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 2010, Viçosa, MG. Anais... Viçosa: UFV, 2010. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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111. | | CHIAVEGATTO, R. B.; SUZUKI, L. S.; CAMPOS, F. V.; SILVA, C. O.; SANTISTEVAN, G.; KOPP, M. M.; PASSOS, L. P. Effects of magnesium pretreatment on the response of Brachiaria ruziziensis to toxic aluminum. In: Congresso Brasileiro de Fisiologia Vegetal, 13., 2011, Campos de Goytacazes. Resumos...Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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112. | | CHIAVEGATTO, R. B.; SUZUKI, L. S.; SILVA, C. O.; CAMPOS, F. V.; SANTISTEVAN, G.; KOPP, M. M.; PASSOS, L. P. Effects of magnesium pretreatment on the response of Brachiaria ruziziensis to toxic aluminum. Brazilian Journal of Plant Physiology, Londrina, v. 23, p. 209-210, 2011. Suplemento. Resumo apresentado no XIII CONGRESSO BRASILEIRO DE FISIOLOGIA VEGETAL e XIV REUNIÃO LATINO-AMERICANA DE FISIOLOGIA VEGETAL, de 19 a 22 de setembro 2011, Búzios, RJ.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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114. | | VEY, R. T.; BORTOLIN, G. S.; OLIVEIRA, J. C. P.; KOPP, M. M.; SILVA, A. C. F. da. Germinação de sementes de Paspalum regnellii Mez: influência do pré-condicionamento térmico. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 23.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 16., 2014, Pelotas. Anais... Pelotas: UFPel, 2014. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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115. | | FERREIRA, J. L.; ARTICO, L. L.; SOLARI, B. L.; MONTARDO, D. P.; MAZZOCATO, A. C.; KOPP, M. M.; DALL'AGNOL, M. Genetic diversity evaluation of oat promise genotypes by means of forage production variables. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 61., 2015, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2015.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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116. | | VEY, R. T.; BORTOLIN, G. S.; OLIVEIRA, J. C. P.; KOPP, M. M.; SILVA, A. C. F. da. Influência da assepsia na germinação de sementes de Paspalum regnellii Mez. In: JORNADA DE PÓS-GRADUAÇÃO E PESQUISA, 12.; MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 12.; MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA JÚNIOR, 10.; MOSTRA INTERNACIONAL DE FOTOGRAFIA, 2., 2014, Bagé. Anais... Bagé: Ediurcamp, 2014. 1 CD-ROM. CONGREGA.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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117. | | BORTOLIN, G. S.; FACCO, F. B.; OLIVEIRA, J. C. P.; KÖPP, M. M.; SILVA, A. C. F. da. Influência de métodos de superação de dormência na germinação de sementes de Paspalum regnellii Mez. In: SIMPÓSIO DE ENSINO, PESQUISA E EXTENSÃO, 19., 2015, Santa Maria. Olhares sustentáveis em favor da vida: anais. Santa Maria: UNIFRA, 2015. SEPE.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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120. | | MAZZOCATO, A. C.; ARTICO, L. L.; DEWES, I. S. L.; FERRONATO, J.; FERREIRA, J. L.; KÖPP, M. M. Redução de germoplasma in situ de Bromus auleticus (Poaceae) relacionada a ações antrópicas no Bioma Pampa. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 67., 2016, Vitória. Conectando diversidades, revelando o desconhecido: anais. Brasília, DF: SBB, 2016.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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