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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental. |
Data corrente: |
06/03/2023 |
Data da última atualização: |
01/09/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
CASTRO, G. S.; SOUZA, T. F.; SILVA, G. F. da; PEDROSO, R. C. N.; MENEZES, K. S.; SOARES, M. A.; DIAS, G. M.; SANTOS, A. O.; YAMAGISHI, M. E. B.; FARIA, J. V.; JANUÁRIO, A. H.; KOOLEN, H. H. F. |
Afiliação: |
GLEUCINEI S. CASTRO, UNIVERSIDADE DO ESTADO DO AMAZONAS; THIAGO F. SOUSA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS; GILVAN FERREIRA DA SILVA, CPAA; RITA C. N. PEDROSO, UNIVERSIDADE DE FRANCA; KELLY S. MENEZES, UNIVERSIDADE DO ESTADO DO AMAZONAS; MARCOS A. SOARES, UNIVERSIDADE FEDERAL DE MATO GROSSO; GUSTAVO M. DIAS, UNIVERSIDADE FEDERAL DO ABC; ALINE O. SANTOS, UNIVERSIDADE DO ESTADO DO AMAZONAS; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; JÉSSICA V. FARIA, UNIVERSIDADE DO ESTADO DO AMAZONAS; ANA H. JANUÁRIO, UNIVERSIDADE DE FRANCA; HECTOR H. F. KOOLEN, UNIVERSIDADE DO ESTADO DO AMAZONAS. |
Título: |
Characterization of peptaibols produced by a marine strain of the fungus Trichoderma endophyticum via Mass Spectrometry, genome mining and phylogeny-based prediction. |
Ano de publicação: |
2023 |
Fonte/Imprenta: |
Metabolites, v. 13, n. 2, 221, Feb. 2023. |
DOI: |
https://doi.org/10.3390/metabo13020221 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Abstract. Trichoderma is recognized as a prolific producer of nonribosomal peptides (NRPs) known as peptaibols, which have remarkable biological properties, such as antimicrobial and anticancer activities, as well as the ability to promote systemic resistance in plants against pathogens. In this study, the sequencing of 11-, 14- and 15-res peptaibols produced by a marine strain of Trichoderma isolated from the ascidian Botrylloides giganteus was performed via liquid chromatography coupled to high-resolution tandem mass spectrometry (LC-MS/MS). Identification, based on multilocus phylogeny, revealed that our isolate belongs to the species T. endophyticum, which has never been reported in marine environments. Through genome sequencing and genome mining, 53 biosynthetic gene clusters (BGCs) were identified as being related to bioactive natural products, including two NRP-synthetases: one responsible for the biosynthesis of 11- and 14-res peptaibols, and another for the biosynthesis of 15-res. Substrate prediction, based on phylogeny of the adenylation domains in combination with molecular networking, permitted extensive annotation of the mass spectra related to two new series of 15-res peptaibols, which are referred to herein as "endophytins". The analyses of synteny revealed that the origin of the 15-module peptaibol synthetase is related to 18, 19 and 20-module peptaibol synthetases, and suggests that the loss of modules may be a mechanism used by Trichoderma species for peptaibol diversification. This study demonstrates the importance of combining genome mining techniques, mass spectrometry analysis and molecular networks for the discovery of new natural products. MenosAbstract. Trichoderma is recognized as a prolific producer of nonribosomal peptides (NRPs) known as peptaibols, which have remarkable biological properties, such as antimicrobial and anticancer activities, as well as the ability to promote systemic resistance in plants against pathogens. In this study, the sequencing of 11-, 14- and 15-res peptaibols produced by a marine strain of Trichoderma isolated from the ascidian Botrylloides giganteus was performed via liquid chromatography coupled to high-resolution tandem mass spectrometry (LC-MS/MS). Identification, based on multilocus phylogeny, revealed that our isolate belongs to the species T. endophyticum, which has never been reported in marine environments. Through genome sequencing and genome mining, 53 biosynthetic gene clusters (BGCs) were identified as being related to bioactive natural products, including two NRP-synthetases: one responsible for the biosynthesis of 11- and 14-res peptaibols, and another for the biosynthesis of 15-res. Substrate prediction, based on phylogeny of the adenylation domains in combination with molecular networking, permitted extensive annotation of the mass spectra related to two new series of 15-res peptaibols, which are referred to herein as "endophytins". The analyses of synteny revealed that the origin of the 15-module peptaibol synthetase is related to 18, 19 and 20-module peptaibol synthetases, and suggests that the loss of modules may be a mechanism used by Trichoderma species for pept... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
De novo sequencing; Fungo marinho; Marine fungus; Molecular networking; Nonribosomal peptides; Peptídeos não ribossomais; Rede molecular; Synteny analysis; Tricoderma. |
Thesagro: |
Peptídeo. |
Thesaurus Nal: |
Hypocreaceae. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1152102/1/metabolites-13-00221-v2.pdf
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Marc: |
LEADER 02911naa a2200397 a 4500 001 2152102 005 2023-09-01 008 2023 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.3390/metabo13020221$2DOI 100 1 $aCASTRO, G. S. 245 $aCharacterization of peptaibols produced by a marine strain of the fungus Trichoderma endophyticum via Mass Spectrometry, genome mining and phylogeny-based prediction.$h[electronic resource] 260 $c2023 520 $aAbstract. Trichoderma is recognized as a prolific producer of nonribosomal peptides (NRPs) known as peptaibols, which have remarkable biological properties, such as antimicrobial and anticancer activities, as well as the ability to promote systemic resistance in plants against pathogens. In this study, the sequencing of 11-, 14- and 15-res peptaibols produced by a marine strain of Trichoderma isolated from the ascidian Botrylloides giganteus was performed via liquid chromatography coupled to high-resolution tandem mass spectrometry (LC-MS/MS). Identification, based on multilocus phylogeny, revealed that our isolate belongs to the species T. endophyticum, which has never been reported in marine environments. Through genome sequencing and genome mining, 53 biosynthetic gene clusters (BGCs) were identified as being related to bioactive natural products, including two NRP-synthetases: one responsible for the biosynthesis of 11- and 14-res peptaibols, and another for the biosynthesis of 15-res. Substrate prediction, based on phylogeny of the adenylation domains in combination with molecular networking, permitted extensive annotation of the mass spectra related to two new series of 15-res peptaibols, which are referred to herein as "endophytins". The analyses of synteny revealed that the origin of the 15-module peptaibol synthetase is related to 18, 19 and 20-module peptaibol synthetases, and suggests that the loss of modules may be a mechanism used by Trichoderma species for peptaibol diversification. This study demonstrates the importance of combining genome mining techniques, mass spectrometry analysis and molecular networks for the discovery of new natural products. 650 $aHypocreaceae 650 $aPeptídeo 653 $aDe novo sequencing 653 $aFungo marinho 653 $aMarine fungus 653 $aMolecular networking 653 $aNonribosomal peptides 653 $aPeptídeos não ribossomais 653 $aRede molecular 653 $aSynteny analysis 653 $aTricoderma 700 1 $aSOUZA, T. F. 700 1 $aSILVA, G. F. da 700 1 $aPEDROSO, R. C. N. 700 1 $aMENEZES, K. S. 700 1 $aSOARES, M. A. 700 1 $aDIAS, G. M. 700 1 $aSANTOS, A. O. 700 1 $aYAMAGISHI, M. E. B. 700 1 $aFARIA, J. V. 700 1 $aJANUÁRIO, A. H. 700 1 $aKOOLEN, H. H. F. 773 $tMetabolites$gv. 13, n. 2, 221, Feb. 2023.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Ocidental (CPAA) |
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Registros recuperados : 46 | |
21. | | RAPOSO, D. de S.; MACIEL, J. B. de S.; SOUSA, T. F. de; SILVA, G. F. da; KOOLEN, H. H. F. Otimização das condições para a produção de metabólitos no co-cultivo de Quambalaria cyanescens e Paecilomyces sp. In: OLIVEIRA, L. A. de; OLIVEIRA, J. G. de S.; GASPAROTTO, L.; JESUS, M. A. de; ROCHA, L. C. da; BENTES, J. L. da S.; KIRSCH, L. de S.; ANDRADE, S. L. de (Org.). Diversidade microbiana da Amazônia. Manaus: Inpa, 2019. p. 194-199.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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22. | | ARAÚJO JÚNIOR, M. B. de; SOUSA, T.; CASTRO, G. dos S.; SANTOS, V. S. dos; SOMAN, L.; HANADA, R. E.; SILVA, G. F. da; KOOLEN, H. Peptaibol production of a New Trichoderma species from the Amazon. In: BRAZILIAN CONFERENCE ON NATURAL PRODUCT (BCNP), 9.; MEETING ON MICROMOLECULAR EVOLUTION, SYSTEMATICS AND ECOLOGY (RESEM), 35., 2023, Salvador. Proceedings [...] Campinas: Galoá, 2023.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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23. | | SILVA, J. C. I. da; NEVES, K. de O. G.; QUEIROZ, C. A.; YAMAGISHI, M. E. B.; KOOLEN, H. H. F.; SILVA, G. F. da. Mineração genômica de Penicillium labradorum INPA-AP10: prospecção de produtos naturais em linhagem isolada de sedimentos do rio Amazonas. In: CONGRESSO SOBRE DIVERSIDADE MICROBIANA DA AMAZÔNIA, 8., 2023, Manaus. Diversidade microbiana: desafios e oportunidades: anais. Manaus: UFAM: EMBRAPA: UFRR, 2023. p. 70.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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26. | | NEVES, K. de O. G.; SILVA, J. C. I. da; QUEIROZ, C. A.; YAMAGISHI, M. E. B.; KOOLEN, H. H.; SILVA, G. F. da. Prospecção de produtos naturais de interesse biotecnológico com base na análise genômica de Streptomyces sp. MAD 27. In: CONGRESSO SOBRE DIVERSIDADE MICROBIANA DA AMAZÔNIA, 8., 2023, Manaus. Diversidade microbiana: desafios e oportunidades: anais. Manaus: UFAM: EMBRAPA: UFRR, 2023. p. 78. CDMICRO 2023.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental. |
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28. | | RAPOSO, D. de S.; RODRIGUES, A. de M.; GUIMARÃES, D. R.; ALBUQUERQUE, J. M. da R.; MACIEL, J. B. de S.; SOUSA, T. F.; SILVA, G. F. da; KOOLEN, H. H. F. Avaliação da produção de metabólitos secundários pelo basidiomiceto, Quambalaria cyanescens, endofítico do açaí-da-Amazônia (Euterpe precatoria). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICOLOGIA, 9., 2019, Manaus. Anais... Manaus: Inpa, 2019. p. 67.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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29. | | FONSECA, J. S. da; GWINNER, R.; SOUZA, T. F. de; KOOLEN, H. H. F.; SILVA, G. F. da; FERNANDES, K. R. P.; SOUZA, A. D. L. de; SOUZA, A. Q. L. Análise in silico do potencial de produção de metabólitos de Trichoderma asperelloides. In: CONGRESSO SOBRE DIVERSIDADE MICROBIANA DA AMAZÔNIA, 8., 2023, Manaus. Diversidade microbiana: desafios e oportunidades: anais. Manaus: UFAM: EMBRAPA: UFRR, 2023. p. 64.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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30. | | ALMEIDA, R. A.; GORDO, M.; SILVA, F. M. A. da; ARAÚJO, R. C. de; RAMADA, M. H. S.; ABRÃO, F. Y.; COSTA, T. O. G.; KOOLEN, H. H. F.; SOUZA, A. D. L. de; BLOCH JUNIOR, C. Cinerascetins, new peptides from Hypsiboas cinerascens: MALDI LIFT-TOF-MS/MS de novo sequence and imaging analysis. Journal of the Brazilian Chemical Society, v. 26, n. 11, p. 2290-2297, 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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31. | | CASTRO, G. S.; SOUZA, T. F.; SILVA, G. F. da; PEDROSO, R. C. N.; MENEZES, K. S.; SOARES, M. A.; DIAS, G. M.; SANTOS, A. O.; YAMAGISHI, M. E. B.; FARIA, J. V.; JANUÁRIO, A. H.; KOOLEN, H. H. F. Characterization of peptaibols produced by a marine strain of the fungus Trichoderma endophyticum via Mass Spectrometry, genome mining and phylogeny-based prediction. Metabolites, v. 13, n. 2, 221, Feb. 2023.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 3 |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental. |
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32. | | ALVES, B. G.; MATIAS, R. R.; ALBUQUERQUE, J. M. da R.; RODRIGUES, A. de M.; ROCHA, F. A. da S.; SOUSA, T. F.; SILVA, G. F. da; KOOLEN, H. H. F. Estudo microbiológico e avaliação do potencial bioativo da família Hypocreaceae. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICOLOGIA, 9., 2019, Manaus. Anais... Manaus: Inpa, 2019. p. 74.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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33. | | COSTA, G. V. da; QUEIROZ, C. A. de; MENDES, V. da C.; RAPOSO, D. de S.; SOUSA, T. F.; BANDEIRA, I. C.; KOOLEN, H. H. F.; SILVA, G. F. da. Genômica comparativa e Potencial biossintético de Streptomyces MAD1003, isolada de sedimentos do Rio Madeira, para produção de metabólitos secundários. In: CONGRESSO SOBRE DIVERSIDADE MICROBIANA DA AMAZÔNIA, 8., 2023, Manaus. Diversidade microbiana: desafios e oportunidades: anais. Manaus: UFAM: EMBRAPA: UFRR, 2023. p. 53.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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34. | | SOUZA, K. R. de; ALVES, B. G.; RAPOSO, D. de S.; SOUSA, T. F.; DANTAS, P. H. S.; FELIX, C. G. S.; KRAMER, Y. V.; SILVA, G. F. da; KOOLEN, H. H. F. Criação de uma micoteca de fungos endofíticos de frutas regionais com potencial antimalárico. In: OLIVEIRA, L. A. de; OLIVEIRA, J. G. de S.; GASPAROTTO, L.; JESUS, M. A. de; ROCHA, L. C. da; BENTES, J. L. da S.; KIRSCH, L. de S.; ANDRADE, S. L. de (Org.). Diversidade microbiana da Amazônia. Manaus: Inpa, 2019. p. 39-45.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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35. | | SOUZA, K. R. de; ALVES, B. G.; GONÇALVES, K. D.; RAPOSO, D. de S.; SOUSA, T. F.; DANTAS, P. H. S.; FELIX, C. G. S.; KRAMER, Y. V.; SILVA, G. F. da; KOOLEN, H. H. F. Criação de uma micoteca de fungos endofíticos de frutas regionais e seu potencial antimalárico. In: CONGRESSO SOBRE DIVERSIDADE MICROBIANA DA AMAZÔNIA, 7., 2018, Manaus. Resumos... Manaus: UEA, 2018. p. 51.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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36. | | SILVA, I. J. S. da; SOUSA, T. F.; QUEIROZ, C. A. de; CASTRO, G. dos S.; CANIATO, F. F.; MEDEIROS, L. S. de; ANGOLINI, C. F. F.; HANADA, R. E.; KOOLEN, H. H. F.; SILVA, G. F. da. Penicillium amapaense sp. nov., section Exilicaulis, and new records of Penicillium labradorum in Brazil isolated from Amazon River sediments with potential applications in agriculture and biotechnology. Mycological Progress, v. 22, art. 23, 2023.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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37. | | GUIMARÃES, D. R.; SOUSA, T. F.; ANGOLINI, C. F. F.; SOUZA, A. D. L.; SILVA, F. M. A. da; SOUZA, A. Q. L. de; SILVA, G. F. da; KOOLEN, H. H. F. Produção de pigmentos do tipo azafilonas por Penicillium sclerotiorum. In: OLIVEIRA, L. A. de; OLIVEIRA, J. G. de S.; GASPAROTTO, L.; JESUS, M. A. de; ROCHA, L. C. da; BENTES, J. L. da S.; KIRSCH, L. de S.; ANDRADE, S. L. de (Org.). Diversidade microbiana da Amazônia. Manaus: Inpa, 2019. p. 18-23.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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38. | | BATALHA, A. D. de S. J.; SOUZA, D. C. de M.; UBIERA, R. D.; CHAVES, F. C. M.; MONTEIRO, W. M.; SILVA, F. M. A. da; KOOLEN, H. H. F.; BOECHAT, A. L.; SARTIM, M. A. Therapeutic potential of leaves from Fridericia chica (Bonpl.) L. G. Lohmann: botanical aspects, phytochemical and biological, anti-Inflammatory, antioxidant and healing action. Biomolecules, v. 12, art. 1208, 2022.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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39. | | SOUSA, T. F.; SANTOS, A. O. dos; SILVA, F. M. A. da; CANIATO, F. F.; QUEIROZ, C. A. de; SOUZA, T. M. de; MACIEL, J. B. S.; CATARINO, A. de M.; GWINNER, R.; PRACHYA, S.; KITTAKOOP, P.; ANGOLINI, C. F. F.; KOOLEN, H. H. F.; SILVA, G. F. da. Arcopilus amazonicus (Chaetomiaceae), a new fungal species from the Amazon rainforest native plant Paullinia cupana. Phytotaxa, v. 456, n. 2, p. 145-156, 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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40. | | GALENO, D. M. L.; NASCIMENTO, O. V. do; ARAÚJO, M. S. B. de; SOUZA, T. P. de; SILVA, E. L.; CARVALHO, R. P.; CHIONG NETO, F. V.; SANTOS, R. H.; ANDRADE, Z. G. de; CORRÊA, J. W. do N.; SILVA, F. M. A. da; KOOLEN, H. H. F.; PINHEIRO, C. C.; CHAVES, F. C. M. Eugenia punicifolia leaf extract has a hypotensive effect and inhibits angiotensin-converting enzyme activity in both in vitro and in vivo models. European Academic Research, v. 8, n. 6, p. 2963-2981, Sept. 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
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