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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
28/02/2020 |
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Data da última atualização: |
28/02/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
KLEPA, M. S. |
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Título: |
Taxonomia polifásica de isolados de Chamaecrista fasciculata e descrição da nova espécie Bradyrhizobium niftali. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
2019. |
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Páginas: |
99 p. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Dissertação (Mestrado) - Universidade Estadual de Londrina, Londrina, 2019. Orientadora: Dra. Mariangela Hungria. Co-orientadora: Dra. Jakeline Renata Marçon Delamuta. |
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Conteúdo: |
O crescimento e desenvolvimento vegetal estão intimamente relacionados com a disponibilidade de certos nutrientes no solo. O nitrogênio é necessário devido à sua participação vital em processos biológicos estruturais, metabólicos e genéticos. A principal via de incorporação de nitrogênio à biosfera se dá através da fixação biológica de nitrogênio (FBN), um processo dependente da redução enzimática do N2 atmosférico em formas assimiláveis para espécies vegetais. A habilidade de fixar N2 é restrita a um grupo restrito de bactérias, dentre as quais, os rizóbios se destacam por estabelecerem relações simbióticas com plantas da família Fabaceae, através de estruturas especializadas, denominadas nódulos. Recentemente, um estudo filogenético sugeriu que a tradicional família Fabaceae fosse reclassificada em seis subfamílias, nas quais apenas Papilionoideae e Caesalpinioideae apresentam espécies com habilidade nodulífera. Até o presente momento, o gênero Bradyrhizobium tem sido relatado como o principal microssimbionte isolado de Caesalpinioideae, no entanto, a diversidade de rizóbios isolados dessa subfamília ainda é pouco conhecida. Com base em uma abordagem polifásica e visando a descrição de uma nova espécie bacteriana, o presente estudo teve como objetivo analisar a diversidade de rizóbios isolados de nódulos de Chamaecrista fasciculata, uma leguminosa caesalpinioideae nativa da região leste, centro-oeste e sul dos Estados Unidos. Na filogenia do gene ribossomal 16S RNAr, as três estirpes CNPSo 3394, CNPSo 3442 e CNPSo 3448, foram agrupadas no superclado B. japonicum e compartilharam 100 % de identidade nucleotídica (NI) entre si e com B. diazoefficiens, B. betae, B. shewense e B. ottawaense. Tais resultados confirmam a alta conservação desse gene para análises filogenéticas em Bradyrhizobium. A filogenia do espaço intergênico transcrito (ITS) agrupou as estirpes CNPSo em um clado individual com alto suporte estatístico, sendo B. japonicum a espécie mais relacionada. Para melhores elucidações filogenéticas no grupo em estudo, foi realizada uma análise concatenada com sequências de seis genes housekeeping, atpD, dnaK, glnII, gyrB, rpoB e recA, por meio da técnica de MLSA (multilocus sequence analysis), a qual indicou B. diazoefficiens como a espécie mais próxima, com 83 % de similaridade. O mesmo padrão filogenético foi verificado na filogenia dos genes housekeeping individuais. As filogenias dos genes de nodulação nodC e fixação do N2 nifH agruparam as estirpes com B. arachidis, B. forestalis e B. cajanus. A estirpe CNPSo 3448 foi selecionada para análises genômicas de ANI (average nucleotide identity) e dDDH (digital DNA-DNA hybridization) com as espécies de Bradyrhizobium mais relacionadas. Os valores resultantes foram inferiores a 93.3 % no ANI e 53.50 % na dDDH, confirmando que as estirpes CNPSo pertencem a uma nova espécie de Bradyrhizobium. Os perfis de BOX-PCR indicaram variabilidade genética elevada entre as estirpes CNPSo. Também foi constatada variabilidade fenotípica, principalmente quanto à utilização de fontes C e a tolerância a antibióticos. Considerados em conjunto, esses dados suportam a descrição de uma nova espécie de Bradyrhizobium, para qual o nome Bradyrhizobium niftali foi proposto, com a estirpe CNPSo 3448T(=USDA 10051T =U687T =CL 40T) selecionada como estirpe tipo. MenosO crescimento e desenvolvimento vegetal estão intimamente relacionados com a disponibilidade de certos nutrientes no solo. O nitrogênio é necessário devido à sua participação vital em processos biológicos estruturais, metabólicos e genéticos. A principal via de incorporação de nitrogênio à biosfera se dá através da fixação biológica de nitrogênio (FBN), um processo dependente da redução enzimática do N2 atmosférico em formas assimiláveis para espécies vegetais. A habilidade de fixar N2 é restrita a um grupo restrito de bactérias, dentre as quais, os rizóbios se destacam por estabelecerem relações simbióticas com plantas da família Fabaceae, através de estruturas especializadas, denominadas nódulos. Recentemente, um estudo filogenético sugeriu que a tradicional família Fabaceae fosse reclassificada em seis subfamílias, nas quais apenas Papilionoideae e Caesalpinioideae apresentam espécies com habilidade nodulífera. Até o presente momento, o gênero Bradyrhizobium tem sido relatado como o principal microssimbionte isolado de Caesalpinioideae, no entanto, a diversidade de rizóbios isolados dessa subfamília ainda é pouco conhecida. Com base em uma abordagem polifásica e visando a descrição de uma nova espécie bacteriana, o presente estudo teve como objetivo analisar a diversidade de rizóbios isolados de nódulos de Chamaecrista fasciculata, uma leguminosa caesalpinioideae nativa da região leste, centro-oeste e sul dos Estados Unidos. Na filogenia do gene ribossomal 16S RNAr, as tr... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Leguminosa; Nodulação; Taxonomia. |
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Thesaurus Nal: |
Bradyrhizobium; Caesalpinioideae; Legumes; Nodulation; Taxonomy. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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520 $aO crescimento e desenvolvimento vegetal estão intimamente relacionados com a disponibilidade de certos nutrientes no solo. O nitrogênio é necessário devido à sua participação vital em processos biológicos estruturais, metabólicos e genéticos. A principal via de incorporação de nitrogênio à biosfera se dá através da fixação biológica de nitrogênio (FBN), um processo dependente da redução enzimática do N2 atmosférico em formas assimiláveis para espécies vegetais. A habilidade de fixar N2 é restrita a um grupo restrito de bactérias, dentre as quais, os rizóbios se destacam por estabelecerem relações simbióticas com plantas da família Fabaceae, através de estruturas especializadas, denominadas nódulos. Recentemente, um estudo filogenético sugeriu que a tradicional família Fabaceae fosse reclassificada em seis subfamílias, nas quais apenas Papilionoideae e Caesalpinioideae apresentam espécies com habilidade nodulífera. Até o presente momento, o gênero Bradyrhizobium tem sido relatado como o principal microssimbionte isolado de Caesalpinioideae, no entanto, a diversidade de rizóbios isolados dessa subfamília ainda é pouco conhecida. Com base em uma abordagem polifásica e visando a descrição de uma nova espécie bacteriana, o presente estudo teve como objetivo analisar a diversidade de rizóbios isolados de nódulos de Chamaecrista fasciculata, uma leguminosa caesalpinioideae nativa da região leste, centro-oeste e sul dos Estados Unidos. Na filogenia do gene ribossomal 16S RNAr, as três estirpes CNPSo 3394, CNPSo 3442 e CNPSo 3448, foram agrupadas no superclado B. japonicum e compartilharam 100 % de identidade nucleotídica (NI) entre si e com B. diazoefficiens, B. betae, B. shewense e B. ottawaense. Tais resultados confirmam a alta conservação desse gene para análises filogenéticas em Bradyrhizobium. A filogenia do espaço intergênico transcrito (ITS) agrupou as estirpes CNPSo em um clado individual com alto suporte estatístico, sendo B. japonicum a espécie mais relacionada. Para melhores elucidações filogenéticas no grupo em estudo, foi realizada uma análise concatenada com sequências de seis genes housekeeping, atpD, dnaK, glnII, gyrB, rpoB e recA, por meio da técnica de MLSA (multilocus sequence analysis), a qual indicou B. diazoefficiens como a espécie mais próxima, com 83 % de similaridade. O mesmo padrão filogenético foi verificado na filogenia dos genes housekeeping individuais. As filogenias dos genes de nodulação nodC e fixação do N2 nifH agruparam as estirpes com B. arachidis, B. forestalis e B. cajanus. A estirpe CNPSo 3448 foi selecionada para análises genômicas de ANI (average nucleotide identity) e dDDH (digital DNA-DNA hybridization) com as espécies de Bradyrhizobium mais relacionadas. Os valores resultantes foram inferiores a 93.3 % no ANI e 53.50 % na dDDH, confirmando que as estirpes CNPSo pertencem a uma nova espécie de Bradyrhizobium. Os perfis de BOX-PCR indicaram variabilidade genética elevada entre as estirpes CNPSo. Também foi constatada variabilidade fenotípica, principalmente quanto à utilização de fontes C e a tolerância a antibióticos. Considerados em conjunto, esses dados suportam a descrição de uma nova espécie de Bradyrhizobium, para qual o nome Bradyrhizobium niftali foi proposto, com a estirpe CNPSo 3448T(=USDA 10051T =U687T =CL 40T) selecionada como estirpe tipo.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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| 4. |  | TULLIO, L. D.; PAULITSCH, F.; REICHERT, P. R. S.; KLEPA, M. S.; KLEPA, M. S.; PILEGGI, M.; GOMES, D. F.; HUNGRIA, M.; BATISTA, J. S. S. Proteomic analysis of Rhizobium freirei PRF 81 responses to low pH. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 28.; SIMPÓSIO DE FERMENTAÇÃO ALCOÓLICA, 3.; SIMPÓSIO DE MICRORGANISMOS FOTOSSINTETIZANTES, 3.; SIMPÓSIO DE ESCHERICHIA COLI LUIZ RACHID TRABULSI, 4., 2015, Florianópolis. Anais... [São Paulo]: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2015. Res. 1407-2.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 5. | | KLEPA, M. S.; HELENE, L. C. F.; O´HARA, G.; HUNGRIA, M. Bradyrhizobium agreste sp. nov., Bradyrhizobium glycinis sp. nov. and Bradyrhizobium diversitatis sp. nov., isolated from a biodiversity hotspot of the genus Glycine in Western Australia. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, v. 71, n. 3, 004742, 2021. 13 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 6. | | HELENE, L. C. F.; KLEPA, M. S.; O'HARA, G.; HUNGRIA, M. Bradyrhizobium archetypum sp. nov., Bradyrhizobium australiense sp. nov. and Bradyrhizobium murdochi sp. nov., isolated from nodules of legumes indigenous to Western Australia International journal of systematic and evolutionary microbiology, v. 70, n. 8, p. 4623-4636, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 7. | | KLEPA, M. S.; HELENE, L. C. F.; O´HARA, G.; HUNGRIA, M. Bradyrhizobium cenepequi sp. nov., Bradyrhizobium semiaridum sp. nov., Bradyrhizobium hereditatis sp. nov. and Bradyrhizobium australafricanum sp. nov., symbionts of different leguminous plants of Western Australia and South Africa and definition of three novel symbiovars. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, v. 72, n. 7, 005446, 2022. 18 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 8. | | URQUIAGA, M. C. O.; KLEPA, M. S.; SOMASEGARAN, P.; RIBEIRO, R. A.; DELAMUTA, J. R. M.; HUNGRIA, M. Bradyrhizobium frederickii sp. nov., a nitrogen-fixing lineage isolated from nodules of the caesalpinioid species Chamaecrista fasciculata and characterized by tolerance to high temperature in vitro. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, v. 69, n. 12, p. 3863-3877, 2019. 15 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 9. | | KLEPA, M. S.; URQUIAGA, M. C. O.; SOMASEGARAN, P.; DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; HUNGRIA, M. Bradyrhizobium niftali sp. nov., an effective nitrogen-fixing symbiont of partridge pea [Chamaecrista fasciculata (Michx.) Greene], a native caesalpinioid legume broadly distributed in USA. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, v. 69, p. 3448-3459, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 11. | | MOURA, F. T.; HELENE, L. C. F.; KLEPA, M. S.; RIBEIRO, R. A.; NOGUEIRA, M. A.; HUNGRIA, M. Genomes of two type strains of the Rhizobium tropici group: R. calliandrae CCGE524T and R. mayense CCGE526T. Microbiology Resource Announcements, v. 12, n. 9, e00472-23, 2023. 4 p. Os Ts dos códigos são sobrescrito.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
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| 12. | | PROTACHEVICZ, A. P.; PAULITSCH, F.; KLEPA, M. S.; HAINOSZ, J.; OLCHANHESKI, L. R.; HUNGRIA, M.; BATISTA, J. S. da S. Pioneering Desmodium spp. are nodulated by natural populations of stress‑tolerant alpha‑ and beta‑rhizobia. Brazilian Journal of Microbiology, v. 54, p. 3127–3135, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 13. | | KLEPA, M. S.; JANONI, V.; PAULITSCH, F.; SILVA, A. R. da; CARMO, M. R. B. do; DELAMUTA, J. R. M.; HUNGRIA, M.; BATISTA, J. S. da S. Molecular diversity of rhizobia-nodulating native Mimosa of Brazilian protected areas. Archives of Microbiology, v. 203, p. 5533-5545, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 14. | | PAULITSCH, F.; KLEPA, M. S.; SILVA, A. R. da; CARMO, M. R. B. do; DALL'AGNOL, R. F.; DELAMUTA, J. R. M.; HUNGRIA, M.; BATISTA, J. S. da S. Phylogenetic diversity of rhizobia nodulating native Mimosa gymnas grown in a South Brazilian ecotone. Molecular Biology Reports, v. 46, p. 529-540, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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