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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
Data corrente: |
04/10/2011 |
Data da última atualização: |
16/02/2023 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
GRATTAPAGLIA, D.; RESENDE, M. D. V. de; RESENDE, M. F. R.; SANSALONI, C. P.; PETROLI, C. D.; MISSIAGGIA, A. A.; TAKAHASHI, E. K.; ZAMPROGNO, K. C.; KILIAN, A. |
Afiliação: |
DARIO GRATTAPAGLIA, CENARGEN; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; Marcio F. R. Resende, UFV; Carolina P. Sansaloni, UnB; Cesar D. Petroli, UnB; Alexandre A. Missiaggia, FIBRIA; Elisabete K. Takahashi, CENIBRA; Karina C. Zamprogno, VERACEL; Andrzej Kilian, DArT - Diversity Arrays Technology. |
Título: |
High realized accuracies of genomic selection for volume growth and wood density in Eucalyptus breeding populations with contrasting effective sizes. |
Ano de publicação: |
2011 |
Fonte/Imprenta: |
In: PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 19., 2011, San Diego. Conference... [S.l.]: International Plant & Animal Genome, 2011. |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
Abstract. W235: Forest Trees. |
Conteúdo: |
Genomic Selection (GS) will likely cause a paradigm shift in tree breeding due to the prospects of radically increasing gain per unit time and improving selection accuracy. Deterministic simulations show GEBV (Genome Estimated Breeding Values) accuracies matching or exceeding phenotypic BLUP-based-accuracy (0.68) even with low-density marker panels (2-3 markers/centiMorgan) in breeding populations with effective sizes Ne ? 60. Furthermore, a GS-based reduction in breeding cycle time by 50% should provide a gain ?100% in selection efficiency for low heritability traits (Grattapaglia&Resende, 2010; DOI: 10.1007/s11295-010-0328-4). We now report on experimentally realized accuracies of GS for three key traits in Eucalyptus in two breeding populations (CEN and FIB) with contrasting effective sizes (Ne= 11 and Ne= 120). Genotypes at ~3,500 DArT markers and de-regressed phenotypes for Height (H), Diameter at Breast Height (DBH) and wood density (WD) (age 4yr.) were obtained for 783 and 920 random trees from CEN and FIB respectively. Sets of 700 and 838 trees for CEN and FIB were used for training and the remaining trees for validation in a jackknifing scheme. Realized GEBV accuracies for H, DBH and WD were 0.67,0.69 and 0.54 for CEN and 0.62,0.54 and 0.53 for FIB respectively. Accuracies matched and slightly surpassed expectations from simulations for FIB, possibly due to its hybrid composition. GEBV accuracies were low (zero to 0.18) across populations suggesting that population specific GS models will be necessary. These are the first experimental results of GS in forest trees and among the first public ones in plant breeding. MenosGenomic Selection (GS) will likely cause a paradigm shift in tree breeding due to the prospects of radically increasing gain per unit time and improving selection accuracy. Deterministic simulations show GEBV (Genome Estimated Breeding Values) accuracies matching or exceeding phenotypic BLUP-based-accuracy (0.68) even with low-density marker panels (2-3 markers/centiMorgan) in breeding populations with effective sizes Ne ? 60. Furthermore, a GS-based reduction in breeding cycle time by 50% should provide a gain ?100% in selection efficiency for low heritability traits (Grattapaglia&Resende, 2010; DOI: 10.1007/s11295-010-0328-4). We now report on experimentally realized accuracies of GS for three key traits in Eucalyptus in two breeding populations (CEN and FIB) with contrasting effective sizes (Ne= 11 and Ne= 120). Genotypes at ~3,500 DArT markers and de-regressed phenotypes for Height (H), Diameter at Breast Height (DBH) and wood density (WD) (age 4yr.) were obtained for 783 and 920 random trees from CEN and FIB respectively. Sets of 700 and 838 trees for CEN and FIB were used for training and the remaining trees for validation in a jackknifing scheme. Realized GEBV accuracies for H, DBH and WD were 0.67,0.69 and 0.54 for CEN and 0.62,0.54 and 0.53 for FIB respectively. Accuracies matched and slightly surpassed expectations from simulations for FIB, possibly due to its hybrid composition. GEBV accuracies were low (zero to 0.18) across populations suggesting that population ... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Melhoramento genético; Seleção genômica. |
Thesaurus Nal: |
Eucalyptus. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/40976/1/2011-RAC-M.Deon-PAG-XIX-HighRealized-1.pdf
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Marc: |
LEADER 02562nam a2200253 a 4500 001 1902325 005 2023-02-16 008 2011 bl uuuu u01u1 u #d 100 1 $aGRATTAPAGLIA, D. 245 $aHigh realized accuracies of genomic selection for volume growth and wood density in Eucalyptus breeding populations with contrasting effective sizes.$h[electronic resource] 260 $aIn: PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 19., 2011, San Diego. Conference... [S.l.]: International Plant & Animal Genome$c2011 500 $aAbstract. W235: Forest Trees. 520 $aGenomic Selection (GS) will likely cause a paradigm shift in tree breeding due to the prospects of radically increasing gain per unit time and improving selection accuracy. Deterministic simulations show GEBV (Genome Estimated Breeding Values) accuracies matching or exceeding phenotypic BLUP-based-accuracy (0.68) even with low-density marker panels (2-3 markers/centiMorgan) in breeding populations with effective sizes Ne ? 60. Furthermore, a GS-based reduction in breeding cycle time by 50% should provide a gain ?100% in selection efficiency for low heritability traits (Grattapaglia&Resende, 2010; DOI: 10.1007/s11295-010-0328-4). We now report on experimentally realized accuracies of GS for three key traits in Eucalyptus in two breeding populations (CEN and FIB) with contrasting effective sizes (Ne= 11 and Ne= 120). Genotypes at ~3,500 DArT markers and de-regressed phenotypes for Height (H), Diameter at Breast Height (DBH) and wood density (WD) (age 4yr.) were obtained for 783 and 920 random trees from CEN and FIB respectively. Sets of 700 and 838 trees for CEN and FIB were used for training and the remaining trees for validation in a jackknifing scheme. Realized GEBV accuracies for H, DBH and WD were 0.67,0.69 and 0.54 for CEN and 0.62,0.54 and 0.53 for FIB respectively. Accuracies matched and slightly surpassed expectations from simulations for FIB, possibly due to its hybrid composition. GEBV accuracies were low (zero to 0.18) across populations suggesting that population specific GS models will be necessary. These are the first experimental results of GS in forest trees and among the first public ones in plant breeding. 650 $aEucalyptus 653 $aMelhoramento genético 653 $aSeleção genômica 700 1 $aRESENDE, M. D. V. de 700 1 $aRESENDE, M. F. R. 700 1 $aSANSALONI, C. P. 700 1 $aPETROLI, C. D. 700 1 $aMISSIAGGIA, A. A. 700 1 $aTAKAHASHI, E. K. 700 1 $aZAMPROGNO, K. C. 700 1 $aKILIAN, A.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
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URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Meio-Norte. |
Data corrente: |
19/03/2009 |
Data da última atualização: |
02/08/2023 |
Tipo da produção científica: |
Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
Autoria: |
RAMOS, S. R. R.; SANTOS, E. P. A. dos; FREIRE FILHO, F. R.; ROCHA, M. de M.; RIBEIRO, V. Q.; LOPES, Â. C. de A.; SOBRAL, P. V. C. |
Afiliação: |
Semíramis Rabelo Ramalho Ramos, Embrapa Tabuleiros Costeiros; Erinalda Paz Amorim dos Santos, Estagiária/ Embrapa Meio-Norte; Francisco Rodrigues Freire Filho, Embrapa Meio-Norte; Maurisrael de Moura Rocha, Embrapa Meio-Norte; Valdenir Queiroz Ribeiro, Embrapa Meio-Norte; Ângela Celis de Almeida Lopes, Estagiária/ Embrapa Meio-Norte; Paula Verena Carvalho Sobral, Estagiária/ Embrapa Meio-Norte. |
Título: |
Descrição morfoagronômica de acessos de feijão-caupi e feijão-mungo introduzidos no Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Meio-Norte: dados quantitativos. |
Ano de publicação: |
2008 |
Fonte/Imprenta: |
Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2008. |
Páginas: |
20 p. |
Série: |
(Embrapa Meio-Norte. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 80). |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
O trabalho objetivou descrever e diferenciar, preliminarmente, 35 acessos de feijão-caupi e 23 de feijão-mungo introduzidos no Banco Ativo de Germoplasma. O experimento foi conduzido no campo experimental da Embrapa Meio-Norte, em Teresina, PI, no período de maio a dezembro de 2003, em condições de telado. A parcela foi constituída por uma fileira de 20 plantas e os dados foram obtidos em seis plantas escolhidas aleatoriamente. Foram utilizados os seguintes descritores: altura e largura da planta, número de internódios no ramo principal, número de dias para antese, altura de inserção da vagem superior, comprimento do pedúnculo, número de vagens por planta, comprimento de vagem, número de grãos por vagem, peso de 100 grãos e produção de grãos por planta. A caracterização foi eficiente na descrição preliminar das espécies e na identificação de acessos potenciais a serem incorporados em programas de pré-melhoramento de feijão-caupi. |
Thesagro: |
Feijão; Melhoramento Genético Vegetal; Morfologia Vegetal; Recurso Genético. |
Categoria do assunto: |
-- G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/80674/1/boletim-80.PDF
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Marc: |
LEADER 01817nam a2200253 a 4500 001 1070681 005 2023-08-02 008 2008 bl uuuu u0uu1 u #d 100 1 $aRAMOS, S. R. R. 245 $aDescrição morfoagronômica de acessos de feijão-caupi e feijão-mungo introduzidos no Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Meio-Norte$bdados quantitativos. 260 $aTeresina: Embrapa Meio-Norte$c2008 300 $a20 p. 490 $a(Embrapa Meio-Norte. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 80). 520 $aO trabalho objetivou descrever e diferenciar, preliminarmente, 35 acessos de feijão-caupi e 23 de feijão-mungo introduzidos no Banco Ativo de Germoplasma. O experimento foi conduzido no campo experimental da Embrapa Meio-Norte, em Teresina, PI, no período de maio a dezembro de 2003, em condições de telado. A parcela foi constituída por uma fileira de 20 plantas e os dados foram obtidos em seis plantas escolhidas aleatoriamente. Foram utilizados os seguintes descritores: altura e largura da planta, número de internódios no ramo principal, número de dias para antese, altura de inserção da vagem superior, comprimento do pedúnculo, número de vagens por planta, comprimento de vagem, número de grãos por vagem, peso de 100 grãos e produção de grãos por planta. A caracterização foi eficiente na descrição preliminar das espécies e na identificação de acessos potenciais a serem incorporados em programas de pré-melhoramento de feijão-caupi. 650 $aFeijão 650 $aMelhoramento Genético Vegetal 650 $aMorfologia Vegetal 650 $aRecurso Genético 700 1 $aSANTOS, E. P. A. dos 700 1 $aFREIRE FILHO, F. R. 700 1 $aROCHA, M. de M. 700 1 $aRIBEIRO, V. Q. 700 1 $aLOPES, Â. C. de A. 700 1 $aSOBRAL, P. V. C.
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Registro original: |
Embrapa Meio-Norte (CPAMN) |
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