| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
|
Data corrente: |
12/08/2022 |
|
Data da última atualização: |
12/08/2022 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; ZANELLA, R.; GOUVEIA, J. J. de S.; CANTAO, M. E.; COUTINHO, L. L.; MARCHESI, J. A. P.; DAL PIZZOL, M. S.; MARCELINO, D. E. P.; LEDUR, M. C. |
|
Afiliação: |
ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; JANE DE OLIVEIRA PEIXOTO, CNPSA; RICARDO ZANELLA, UPF; JOÃO JOSÉ DE SIMONI GOUVEIA, UNIVASF; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; LUIZ LEHMANN COUTINHO, Esalq; JORGE AUGUSTO PETROLI MARCHESI, USP; MARIANE SPUDEIT DAL PIZZOL, UDESC/Chapecó; DÉBORA ESTER PETRY MARCELINO, FACC; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA. |
|
Título: |
Downregulation of growth plate genes involved with the onset of femoral head separation in young broilers. |
|
Ano de publicação: |
2022 |
|
Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Physiology, v. 3, n. 941134, 2022. doi: 10.3389/fphys.2022.941134 |
|
DOI: |
https://doi.org/10.3389/fphys.2022.941134 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Abstract: Femoral head separation (FHS) is characterized by the detachment of growth plate (GP) and articular cartilage, occurring in tibia and femur. However, the molecular mechanisms involved with this condition are not completely understood. Therefore, genes and biological processes (BP) involved with FHS were identified in 21-day-old broilers through RNA sequencing of the femoral GP. 13,487 genes were expressed in the chicken femoral head transcriptome of normal and FHS-affected broilers. From those, 34 were differentially expressed (DE; FDR ≤0.05) between groups, where all of them were downregulated in FHS-affected broilers. The main BP were enriched in receptor signaling pathways, ossification, bone mineralization and formation, skeletal morphogenesis, and vascularization. RNA-Seq datasets comparison of normal and FHS-affected broilers with 21, 35 and 42 days of age has shown three shared DE genes (FBN2, C1QTNF8, and XYLT1) in GP among ages. Twelve genes were exclusively DE at 21 days, where 10 have already been characterized (SHISA3, FNDC1, ANGPTL7, LEPR, ENSGALG00000049529, OXTR, ENSGALG00000045154, COL16A1, RASD2, BOC, GDF10, and THSD7B). Twelve SNPs were associated with FHS (p < 0.0001). Out of those, 5 were novel and 7 were existing variants located in 7 genes (RARS, TFPI2, TTI1, MAP4K3, LINK54, and AREL1). We have shown that genes related to chondrogenesis and bone differentiation were downregulated in the GP of FHS-affected young broilers. Therefore, these findings evince that candidate genes pointed out in our study are probably related to the onset of FHS in broilers. MenosAbstract: Femoral head separation (FHS) is characterized by the detachment of growth plate (GP) and articular cartilage, occurring in tibia and femur. However, the molecular mechanisms involved with this condition are not completely understood. Therefore, genes and biological processes (BP) involved with FHS were identified in 21-day-old broilers through RNA sequencing of the femoral GP. 13,487 genes were expressed in the chicken femoral head transcriptome of normal and FHS-affected broilers. From those, 34 were differentially expressed (DE; FDR ≤0.05) between groups, where all of them were downregulated in FHS-affected broilers. The main BP were enriched in receptor signaling pathways, ossification, bone mineralization and formation, skeletal morphogenesis, and vascularization. RNA-Seq datasets comparison of normal and FHS-affected broilers with 21, 35 and 42 days of age has shown three shared DE genes (FBN2, C1QTNF8, and XYLT1) in GP among ages. Twelve genes were exclusively DE at 21 days, where 10 have already been characterized (SHISA3, FNDC1, ANGPTL7, LEPR, ENSGALG00000049529, OXTR, ENSGALG00000045154, COL16A1, RASD2, BOC, GDF10, and THSD7B). Twelve SNPs were associated with FHS (p < 0.0001). Out of those, 5 were novel and 7 were existing variants located in 7 genes (RARS, TFPI2, TTI1, MAP4K3, LINK54, and AREL1). We have shown that genes related to chondrogenesis and bone differentiation were downregulated in the GP of FHS-affected young broilers. Therefore, these... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
FBN2; Femoral head necrosis; FHS; Necrose da cabeça femoral; RNA-Seq. |
|
Thesagro: |
Frango; Galinha; Genética Animal. |
|
Thesaurus Nal: |
Chickens; Gene expression. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1145416/1/final9937.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02692naa a2200361 a 4500
001 2145416
005 2022-08-12
008 2022 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.3389/fphys.2022.941134$2DOI
100 1 $aIBELLI, A. M. G.
245 $aDownregulation of growth plate genes involved with the onset of femoral head separation in young broilers.$h[electronic resource]
260 $c2022
520 $aAbstract: Femoral head separation (FHS) is characterized by the detachment of growth plate (GP) and articular cartilage, occurring in tibia and femur. However, the molecular mechanisms involved with this condition are not completely understood. Therefore, genes and biological processes (BP) involved with FHS were identified in 21-day-old broilers through RNA sequencing of the femoral GP. 13,487 genes were expressed in the chicken femoral head transcriptome of normal and FHS-affected broilers. From those, 34 were differentially expressed (DE; FDR ≤0.05) between groups, where all of them were downregulated in FHS-affected broilers. The main BP were enriched in receptor signaling pathways, ossification, bone mineralization and formation, skeletal morphogenesis, and vascularization. RNA-Seq datasets comparison of normal and FHS-affected broilers with 21, 35 and 42 days of age has shown three shared DE genes (FBN2, C1QTNF8, and XYLT1) in GP among ages. Twelve genes were exclusively DE at 21 days, where 10 have already been characterized (SHISA3, FNDC1, ANGPTL7, LEPR, ENSGALG00000049529, OXTR, ENSGALG00000045154, COL16A1, RASD2, BOC, GDF10, and THSD7B). Twelve SNPs were associated with FHS (p < 0.0001). Out of those, 5 were novel and 7 were existing variants located in 7 genes (RARS, TFPI2, TTI1, MAP4K3, LINK54, and AREL1). We have shown that genes related to chondrogenesis and bone differentiation were downregulated in the GP of FHS-affected young broilers. Therefore, these findings evince that candidate genes pointed out in our study are probably related to the onset of FHS in broilers.
650 $aChickens
650 $aGene expression
650 $aFrango
650 $aGalinha
650 $aGenética Animal
653 $aFBN2
653 $aFemoral head necrosis
653 $aFHS
653 $aNecrose da cabeça femoral
653 $aRNA-Seq
700 1 $aPEIXOTO, J. de O.
700 1 $aZANELLA, R.
700 1 $aGOUVEIA, J. J. de S.
700 1 $aCANTAO, M. E.
700 1 $aCOUTINHO, L. L.
700 1 $aMARCHESI, J. A. P.
700 1 $aDAL PIZZOL, M. S.
700 1 $aMARCELINO, D. E. P.
700 1 $aLEDUR, M. C.
773 $tFrontiers in Physiology$gv. 3, n. 941134, 2022. doi: 10.3389/fphys.2022.941134
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 35 | |
| 4. |  | CARVALHO, G. D.; MADARI, B. E.; SANTOS, A. B. dos; LEAL, W. G. de O. Emissão de amônia em arroz irrigado em várzea tropical, usando clorofilômetro na racionalização de nitrogênio. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 6., 2012, Santo Antônio de Goiás. Resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2012. p. 76. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 275).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
|    |
| 5. | | MOTTA, I. P. da; LEAL, W. G. de O.; GAMBETTA, R.; FAVARO, S. P. Identificação de compostos químicos no bio-óleo proveniente da pirólise do endocarpo da macaúba. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 7., 2023, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2023. p. 17.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
| |
| 6. | | RAMOS, R. M. V.; SANTOS, M. R. de A.; SCHULTZ, E. L.; LEAL, W. G. de O.; SOARES, I. P. Desidratação do ácido lático para obtenção de ácido acrílico. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 6., 2020, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2020. p. 254-260 il.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
| |
| 8. | | CORRÊA, R. S.; CARVALHO, G. D.; MADARI, B. E.; CARVALHO, M. T. de M.; LEAL, W. G. de O. Perda de N-NH3 do solo oriundo de diferentes fontes nitrogenadas em feijoeiro (Phaseolus vulgaris) irrigado. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 6., 2012, Santo Antônio de Goiás. Resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2012. p. 90. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 275).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 11. | | SANTOS, M. R. de A.; RAMOS, R. M. V.; NAKAI, D. K.; LEAL, W. G. de O.; SOARES, I. P. Hidrodesoxigenação de óleo de palma utilizando catalisadores à base de níquel. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 6., 2020, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2020. p. 261-266 il.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
| |
| 13. | | CARVALHO, G. D.; MADARI, B. E.; SILVA, M. A. S. da; SANTOS, A. B. dos; LEAL, W. G. de O. Transformações químicas na solução do solo de várzea tropical sob cultivo de arroz irrigado. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 7., 2013, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2013. p. 92. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 292). Pôster - pós-graduação.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 16. | | CARVALHO, G. D.; MADARI, B. E.; SANTOS, A. B. dos; SILVA, M. A. S. da; COSTA, A. R. da; CORRÊA, R. S.; LEAL, W. G. de O. Emissão de óxido nitroso em sistema de produção de arroz irrigado em várzea tropical. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 9., 2015, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2015. p. 107. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 309).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 17. | | MAIA, C. M. B. de F.; BARATTO, R. L.; GUIOTOKU, M.; SIQUEIRA, F. C. de J.; MADARI, B. E.; LEAL, W. G. de O. Efeito da temperatura de carbonização sobre características físico-químicas dos carvões de duas espécies de bambu. In: ENCONTRO BRASILEIRO DE SUBSTÂNCIAS HÚMICAS, 10., 2013, Santo Antônio de Goiás. Matéria orgânica e qualidade ambiental: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2013. p. 324-327.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 18. | | MAIA, C. M. B. de F.; BARATTO, R. L.; GUIOTOKU, M.; SIQUEIRA, F. C. de J.; MADARI, B. E.; LEAL, W. G. de O. Efeito da temperatura de carbonização sobre características físico-químicas dos carvões de duas espécies de bambu. In: ENCONTRO BRASILEIRO DE SUBSTÂNCIAS HÚMICAS, 10., 2013, Santo Antônio de Goiás. Matéria orgânica e qualidade ambiental: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2013. p. 324-327| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
| 19. | | LIMA, L. B. de; MADARI, B. E.; LEAL, W. G. de O.; ALCANTARA, F. A. de; NOVOTNY, E. H.; CARVALHO, M. T. de M.; PETTER, F. A. Efeito do carvão vegetal para a matéria orgânica de um Plintossolo arenoso do Cerrado. In: ENCONTRO BRASILEIRO DE SUBSTÂNCIAS HÚMICAS, 9., 2011, Aracaju. Matéria orgânica natural e substâncias húmicas: dos avanços das técnicas de caracterização ao sequestro de C. [Aracaju: UFS: IHSS, 2011]. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
| |
| 20. | | LIMA, L. B. de; MADARI, B. E.; LEAL, W. G. de O.; ALCANTARA, F. A. de; NOVOTNY, E. H.; CARVALHO, M. T. de M.; PETTER, F. A. Efeito do carvão vegetal na matéria orgânica de um plintossolo arenoso do cerrado. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 5., 2011, Santo Antônio de Goiás. Resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2011. p. 41. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 270).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| Registros recuperados : 35 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
