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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Roraima. |
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Data corrente: |
15/09/2021 |
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Data da última atualização: |
15/09/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
McMANUS, C.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; HERMUCHE, P.; GUIMARÃES, R. F.; CARVALHO JUNIOR, O. A.; BRAGA, R. M.; CARNEIRO, P. L. S.; MORAES, J. C. F.; SOUZA, C. J. H. de; FACO, O.; SANTOS, S. A.; AZEVEDO, H. C.; ARAUJO, A. M. de; FAÇANHA, D. A. E.; IANELLA, P. |
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Afiliação: |
CONCEPTA MCMANUS, Universidade de Brasília (UnB) - Brasília, DF, Brazil; SAMUEL REZENDE PAIVA, Cenargen; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, Cenargen; POTIRA HERMUCHE, Universidade de Brasília (UnB) - Brasília, DF, Brazil; RENATO FONTES GUIMARÃES, Universidade de Brasília (UnB) - Brasília, DF, Brazil; OSMAR ABILIO CARVALHO JUNIOR, Universidade de Brasília (UnB) - Brasília, DF, Brazil; RAMAYANA MENEZES BRAGA, CPAF-RR; PAULO LUIZ SOUZA CARNEIRO, Universidade Estadual Do Sudoeste da Bahia (UESB) - Vitória da Conquista - BA, Brazil; JOSE CARLOS FERRUGEM MORAES, CPPSUL; CARLOS JOSE HOFF DE SOUZA; OLIVARDO FACO, CNPC; SANDRA APARECIDA SANTOS; HYMERSON COSTA AZEVEDO, CPATC; ADRIANA MELLO DE ARAUJO, CPAMN; DEBORA ANDRÉA E. FAÇANHA, Federal Rural University of the Semi-arid Region (UFERSA) - Mossoró, RN, Brazil; PATRICIA IANELLA, Cenargen. |
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Título: |
Landscape genetics of sheep in Brazil using SNP markers. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Small Ruminant Research, v. 192, e106239, 2020. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.smallrumres.2020.106239 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: The aim of this study was to explore spatial patterns of genetic structure in sheep breeds sampled in Brazil using Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) in order to evaluate whether or not the genetic and geographic dis-tances are interrelated in this species. Samples genotyped using the 50KSheepSNPChip (Illumina) included 215 animals from eight different sheep breeds. All collection sites were georeferenced and data analyzed to determine geographic patterns from genetic data. To evaluate the correlation between genetic and geographic distances Mantel tests, Allelic Aggregation Index Analyses (AAIA), and spatial autocorrelation were performed. Genetic Landscape Shape procedure and Monmonier?s Algorithm were used to generate graphical visualization of the genetic distances across the landscape. The observed correlation observed between genetic and geographical distances was 0.552 (P <0.00099). Observed AAIA results (Rave =0.16, P <0.001) indicated a non-random distribution of genotypes across the landscape. High genetic differentiation was observed in the Southern re-gions of Brazil, separating wool and hair sheep. Low genetic distances were observed between flocks and breeds from north and center-west regions, and may be the result of unrecorded introgressions resulting from past unknown crossbreeding events. Observed Spatial Autocorrelation Analyses results indicate a minimum distance of 400 km should be used between collection sites to maximize genetic variability in future germplasm samplings for conservation of genetic resources. MenosAbstract: The aim of this study was to explore spatial patterns of genetic structure in sheep breeds sampled in Brazil using Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) in order to evaluate whether or not the genetic and geographic dis-tances are interrelated in this species. Samples genotyped using the 50KSheepSNPChip (Illumina) included 215 animals from eight different sheep breeds. All collection sites were georeferenced and data analyzed to determine geographic patterns from genetic data. To evaluate the correlation between genetic and geographic distances Mantel tests, Allelic Aggregation Index Analyses (AAIA), and spatial autocorrelation were performed. Genetic Landscape Shape procedure and Monmonier?s Algorithm were used to generate graphical visualization of the genetic distances across the landscape. The observed correlation observed between genetic and geographical distances was 0.552 (P <0.00099). Observed AAIA results (Rave =0.16, P <0.001) indicated a non-random distribution of genotypes across the landscape. High genetic differentiation was observed in the Southern re-gions of Brazil, separating wool and hair sheep. Low genetic distances were observed between flocks and breeds from north and center-west regions, and may be the result of unrecorded introgressions resulting from past unknown crossbreeding events. Observed Spatial Autocorrelation Analyses results indicate a minimum distance of 400 km should be used between collection sites to maximize genetic variabili... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Delaunay triangulation; Genetic landscape shape; Mantel. |
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Thesaurus Nal: |
Brazil; Genetic polymorphism; Germplasm conservation; Sampling; Sheep; Sheep breeds; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Roraima (CPAF-RR) |
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| Registros recuperados : 75 | |
| 61. |  | SHIOTSUKI, L.; VILLELA, L. C. V.; KIRSCHNIK, L. N. G.; FREITAS, L. E. L. de; REZENDE, F. P.; VARELA, E. S.; TORATI, L. S.; IANELLA, P.; CAETANO, A. R. Fundação das bases genéticas para um futuro Programa de Melhoramento de Tambaqui (Colossoma macropomum). Aquaculture Brasil, n. 17, p. 11-14, mar./abr. 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 62. | | IANELLA, P.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, F. S. de; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. SNP discovery in the South American Frehwater fish tambaqui (Colossoma macroponum) by deep sequenciang of reduced representation libraries. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s. n.], 2016. P0484.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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| 63. | | IANELLA, P.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, F. S. de; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. SNP discovery in the South American Frehwater fish tambaqui (Colossoma macroponum) by deep sequenciang of reduced representation libraries. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s. n.], 2016. P0484.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 64. | | IANELLA, P.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, F. S. de; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. SNP discovery in the South American freshwater fish tambaqui (Colossoma macropomum) by deep sequencing of reduced representation libraries. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s. n.], 2016. Não paginado. PAG 2016. Pôster P0484.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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| 65. | | IANELLA, P.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, F. S. de; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. SNP discovery in the South American freshwater fish tambaqui (Colossoma macropomum) by deep sequencing of reduced representation libraries. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2016. Não paginado. PAG 2016. Pôster P0484.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 66. | | SILVA, E. C. da; DUTRA JUNIOR, W. M.; IANELLA, P.; GOMES FILHO, M. A.; OLIVEIRA, C. J. P. de; FERREIRA, D. N. de M.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Patterns of genetic diversity of local pig populations in the State of Pernambuco, Brazil. Revista Brasileira de Zootecnia, v. 40, n. 8, p. 1691-1699, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 67. | | ALBUQUERQUE, M. do S. M.; RAMOS, A. F.; PAIVA, S. R.; FACO, O.; SILVA, K. de M.; MARQUES, J. R. F.; CARNEIRO, P. C. F.; SANTOS, S. A.; CARVALHO, G. M. C. de; PEREIRA, F. de M.; LEDUR, M. C.; ALVES, A. L.; IANELLA, P.; CASTRO, C. S. P. de; MARIANTE, A. da S. Transposição da rede de recursos genéticos animais para o portfólio de recursos genéticos para a alimentação, agricultura e bioindústria. In: SIMPÓSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA E O CARIBE, 10., 2015, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: Aptor Software, 2015. p. 195.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 68. | | ALBUQUERQUE, M. do S. M.; RAMOS, A. F.; PAIVA, S. R.; FACO, O.; SILVA, K. de M.; MARQUES, J. R. F.; CARNEIRO, P. C. F.; SANTOS, S. A.; CARVALHO, G. M. C. de; PEREIRA, F. de M.; LEDUR, M. C.; ALVES, A. L.; IANELLA, P.; CASTRO, C. S. P. de; MARIANTE, A. da S. Transposição da rede de recursos genéticos animais para o portfólio de recursos genéticos para a alimentação, agricultura e bioindústria. In: SIMPÓSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA E O CARIBE, 10., 2015, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: Aptor Software, 2015. p. 195.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Pantanal; Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 72. | | McMANUS, C.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; HERMUCHE, P.; GUIMARÃES, R. F.; CARVALHO JUNIOR, O. A.; BRAGA, R. M.; CARNEIRO, P. L. S.; MORAES, J. C. F.; SOUZA, C. J. H. de; FACO, O.; SANTOS, S. A.; AZEVEDO, H. C.; ARAUJO, A. M. de; FAÇANHA, D. A. E.; IANELLA, P. Landscape genetics of sheep in Brazil using SNP markers. Small Ruminant Research, v. 192, e106239, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 75. | | ALBUQUERQUE, M. do S. M.; RAMOS, A. F.; CARVALHO, G. M. C.; SANTOS, S. A.; SILVA, K. de M.; LEDUR, M. C.; KIRSCHNIK, L. N. G.; PEREIRA, F. de M.; CASTRO, C. S. P. de; IANELLA, P.; MARIANTE, A. da S. Nova estrutura para conservação de recursos genéticos animais da Embrapa: vertente animal do Portfólio Regen. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 4., 2016, Curitiba. Recursos genéticos no Brasil: a base para o desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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