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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
Data corrente: |
13/06/2016 |
Data da última atualização: |
19/06/2017 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
ARDISSON-ARAÚJO, D. M. P.; LIMA, R. N.; MELO, F. L.; CLEM, R. J.; HUANG, N.; BÁO, S. N.; SOSA-GÓMEZ, D. R.; RIBEIRO, B. M. |
Afiliação: |
DANIEL M. P. ARDISSON-ARAÚJO, UNB; RAYANE NUNES LIMA, UNB; FERNANDO L. MELO, UNB; ROLLIE J. CLEM, KANSAS STATE UNIVERSITY; NING HUANG, Kansas State University; SÔNIA NAIR BÁO, UNB; DANIEL RICARDO SOSA GOMEZ, CNPSO; BERGMANN M. RIBEIRO, UNB. |
Título: |
Genome sequence of Perigonia lusca single nucleopolyhedrovirus: insights into the evolution of a nucleotide metabolism enzyme in the family Baculoviridae. |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 6, n. 24612, jun. 2016. |
ISSN: |
2045-2322 |
DOI: |
10.1038/srep24612 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The genome of a novel group II alphabaculovirus, Perigonia lusca single nucleopolyhedrovirus (PeluSNPV), was sequenced and shown to contain 132,831bp with 145 putative ORFs (open reading frames) of at least 50 amino acids. An interesting feature of this novel genome was the presence of a putative nucleotide metabolism enzyme-encoding gene (pelu112). The pelu112 gene was predicted to encode a fusion of thymidylate kinase (tmk) and dUTP diphosphatase (dut). Phylogenetic analysis indicated that baculoviruses have independently acquired tmk and dut several times during their evolution. Two homologs of the tmk-dut fusion gene were separately introduced into the Autographa californica multiple nucleopolyhedrovirus (AcMNPV) genome, which lacks tmk and dut. The recombinant baculoviruses produced viral DNA, virus progeny, and some viral proteins earlier during in vitro infection and the yields of viral occlusion bodies were increased 2.5-fold when compared to the parental virus. Interestingly, both enzymes appear to retain their active sites, based on separate modeling using previously solved crystal structures. We suggest that the retention of these tmk-dut fusion genes by certain baculoviruses could be related to accelerating virus replication and to protecting the virus genome from deleterious mutation. |
Thesagro: |
Baculovirus; Genoma; Virus. |
Thesaurus Nal: |
Baculoviridae; Genome assembly. |
Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/144282/1/Genome-sequence-of-Perigonia-lusca-2016.pdf
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Marc: |
LEADER 02182naa a2200289 a 4500 001 2046809 005 2017-06-19 008 2016 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a2045-2322 024 7 $a10.1038/srep24612$2DOI 100 1 $aARDISSON-ARAÚJO, D. M. P. 245 $aGenome sequence of Perigonia lusca single nucleopolyhedrovirus$binsights into the evolution of a nucleotide metabolism enzyme in the family Baculoviridae.$h[electronic resource] 260 $c2016 520 $aThe genome of a novel group II alphabaculovirus, Perigonia lusca single nucleopolyhedrovirus (PeluSNPV), was sequenced and shown to contain 132,831bp with 145 putative ORFs (open reading frames) of at least 50 amino acids. An interesting feature of this novel genome was the presence of a putative nucleotide metabolism enzyme-encoding gene (pelu112). The pelu112 gene was predicted to encode a fusion of thymidylate kinase (tmk) and dUTP diphosphatase (dut). Phylogenetic analysis indicated that baculoviruses have independently acquired tmk and dut several times during their evolution. Two homologs of the tmk-dut fusion gene were separately introduced into the Autographa californica multiple nucleopolyhedrovirus (AcMNPV) genome, which lacks tmk and dut. The recombinant baculoviruses produced viral DNA, virus progeny, and some viral proteins earlier during in vitro infection and the yields of viral occlusion bodies were increased 2.5-fold when compared to the parental virus. Interestingly, both enzymes appear to retain their active sites, based on separate modeling using previously solved crystal structures. We suggest that the retention of these tmk-dut fusion genes by certain baculoviruses could be related to accelerating virus replication and to protecting the virus genome from deleterious mutation. 650 $aBaculoviridae 650 $aGenome assembly 650 $aBaculovirus 650 $aGenoma 650 $aVirus 700 1 $aLIMA, R. N. 700 1 $aMELO, F. L. 700 1 $aCLEM, R. J. 700 1 $aHUANG, N. 700 1 $aBÁO, S. N. 700 1 $aSOSA-GÓMEZ, D. R. 700 1 $aRIBEIRO, B. M. 773 $tScientific Reports$gv. 6, n. 24612, jun. 2016.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
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Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Clima Temperado. |
Data corrente: |
19/11/2014 |
Data da última atualização: |
25/03/2015 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
SCIVITTARO, W. B.; BÜSS, G. L.; SILVEIRA, A. D.; FARIAS, M. de O.; CORRÊA, G. da S.; LACERDA, C. L.; SOUSA, R. O. de; SILVA, J. J. C. da. |
Afiliação: |
WALKYRIA BUENO SCIVITTARO, CPACT; Gerson Lubke Büss, UFPEL; Anderson Dias Silveira, UFPEL; Marla de Oliveira Farias, UFPEL; Gessiele da Silva Corrêa, UFPEL; Camila Lemos Lacerda, UFPEL; Rogério Oliveira de Sousa, UFPEL; JULIO JOSE CENTENO DA SILVA, CPACT. |
Título: |
Emissões de Metano e Óxido Nitroso de Planossolo: Efeito do Manejo do Solo e da Cobertura Vegetal. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO SUL-BRASILEIRA DE CIÊNCIA DO SOLO, 10., 2014, Pelotas. Fatos e mitos em ciência do solo. Pelotas: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo; UFPEL, 2014. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
RESUMO- Em áreas de produção de arroz irrigado, a época e as operações de preparo do solo determinam potenciais distintos de incorporação de carbono (C) ao solo e de emissão de gases de efeito estufa (GEE). Realizou-se um trabalho para avaliar o efeito do manejo do solo e da cobertura vegetal sobre as emissões de metano (CH4) e óxido nitroso (N2O), durante o outono/inverno, de Planossolo cultivado com arroz irrigado. O estudo foi realizado de abril a outubro de 2013, em Capão do Leão-RS. Avaliaram-se três sistemas de preparo do solo: preparo antecipado de outono; preparo convencional de primavera e preparo com rolo-faca no outono. As coletas dos gases foram realizadas semanalmente, utilizando-se o método da câmara estática fechada. A época e as operações de preparo do solo proporcionaram potenciais distintos de emissão de metano e óxido nitroso em Planossolo durante o outono/inverno. As emissões totais de metano foram maiores na área preparada com rolo-faca, seguida daquela com preparo convencional e antecipado. Também as emissões totais de óxido nitroso foram maiores para o preparo com rolo-faca, seguida da área com preparo antecipado; o preparo convencional não proporcionou emissões de óxido nitroso. Em todos os sistemas de preparo, o metano foi o principal componente do potencial de aquecimento global parcial (PAGp) de Planossolo cultivado com arroz irrigado durante o período de entressafra. |
Palavras-Chave: |
Gás de efeito estufa; Potencial de aquecimento global; Preparo do solo; Solos. |
Thesagro: |
Arroz Irrigado. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/120957/1/W.B.Scivittaro-1.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/112020/1/Walkyria-Bueno-Scivittaro-trab-6-4858-398.pdf
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Marc: |
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Embrapa Clima Temperado (CPACT) |
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