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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
Data corrente: |
29/05/2012 |
Data da última atualização: |
22/05/2024 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
FARIA, L. C. B.; ROCHA, A. S. L.; KLEINSCHMIDT, J. H.; SILVA-FILHO, M. C.; BIM, E.; HERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B.; PALAZZO JÚNIOR, R. |
Afiliação: |
LUZINETE C. B. FARIA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS; ANDRÉA S. L. ROCHA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS; JOÃO H. KLEINSCHMIDT, UNIVERSIDADE FEDERAL DO ABC; MÁRCIO C. SILVA-FILHO, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; EDSON BIM, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS; ROBERTO H. HERAI, UNIVERSITY OF CALIFORNIA; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; REGINALDO PALAZZO JÚNIOR, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS. |
Título: |
Is a genome a codeword of an error-correcting code? |
Ano de publicação: |
2012 |
Fonte/Imprenta: |
PLoS ONE, San Francisco, v. 7, n. 5, e105396, May 2012. |
DOI: |
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0036644 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Since a genome is a discrete sequence, the elements of which belong to a set of four letters, the question as to whether or not there is an error-correcting code underlying DNA sequences is unavoidable. The most common approach to answering this question is to propose a methodology to verify the existence of such a code. However, none of the methodologies proposed so far, although quite clever, has achieved that goal. In a recent work, we showed that DNA sequences can be identified as codewords in a class of cyclic error-correcting codes known as Hamming codes. In this paper, we show that a complete intron-exon gene, and even a plasmid genome, can be identified as a Hamming code codeword as well. Although this does not constitute a definitive proof that there is an error-correcting code underlying DNA sequences, it is the first evidence in this direction. |
Palavras-Chave: |
Biology; Sequência de DNA. |
Thesagro: |
Biologia. |
Thesaurus Nal: |
Genome; Nucleotide sequences. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/60323/1/journal.pone.0036644.pdf
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Marc: |
LEADER 01659naa a2200277 a 4500 001 1925637 005 2024-05-22 008 2012 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1371/journal.pone.0036644$2DOI 100 1 $aFARIA, L. C. B. 245 $aIs a genome a codeword of an error-correcting code?$h[electronic resource] 260 $c2012 520 $aSince a genome is a discrete sequence, the elements of which belong to a set of four letters, the question as to whether or not there is an error-correcting code underlying DNA sequences is unavoidable. The most common approach to answering this question is to propose a methodology to verify the existence of such a code. However, none of the methodologies proposed so far, although quite clever, has achieved that goal. In a recent work, we showed that DNA sequences can be identified as codewords in a class of cyclic error-correcting codes known as Hamming codes. In this paper, we show that a complete intron-exon gene, and even a plasmid genome, can be identified as a Hamming code codeword as well. Although this does not constitute a definitive proof that there is an error-correcting code underlying DNA sequences, it is the first evidence in this direction. 650 $aGenome 650 $aNucleotide sequences 650 $aBiologia 653 $aBiology 653 $aSequência de DNA 700 1 $aROCHA, A. S. L. 700 1 $aKLEINSCHMIDT, J. H. 700 1 $aSILVA-FILHO, M. C. 700 1 $aBIM, E. 700 1 $aHERAI, R. H. 700 1 $aYAMAGISHI, M. E. B. 700 1 $aPALAZZO JÚNIOR, R. 773 $tPLoS ONE, San Francisco$gv. 7, n. 5, e105396, May 2012.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Algodão. Para informações adicionais entre em contato com cnpa.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Algodão. |
Data corrente: |
20/09/2007 |
Data da última atualização: |
08/05/2008 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Circulação/Nível: |
-- - -- |
Autoria: |
SILVA, J. C. A. da; SANTANA, J. C. F. de; CARTAXO, W. V.; VANDERLEI, J. C. MOTA, V. de J.; SILVA, O. R. R. F. da; MIRANDA, J. E.; VALE, D. G.; ALVES, I.; SOUSA, M. F. de; OLIVEIRA, J. M. C. de; ALBUQUERQUE, F. A. de. |
Afiliação: |
José Carlos Aguiar da Silva, Embrapa Algodão; João Cecílio Farias de Santana, Embrapa Algodão; Waltemilton Vieira Cartaxo, Embrapa Algodão; Job Carneiro Vanderlei, Agência Rural-GO; Valons de Jesus Mota, COOSTEC; Odilon Reny Ribeiro Ferreira da Silva, Em. |
Título: |
Unidades de teste e demonstração: Desempenho da cultivar BRS Aroeira avaliadas em três municípios do Estado de Goiás, safra 2002/2003. |
Ano de publicação: |
2007 |
Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 6., 2007, Uberlândia. Anais... Uberlândia, 2007. |
Páginas: |
p. 1-4 |
Descrição Física: |
1 CD-ROM |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
O presente trabalho teve como objetivo, avaliar o desempenho da cultivar aroeia cultivada em Unidades de Teste e Demonstração em três municípios de Goiás na safra 2002/2003. Para isso, a Embrapa Algodão em parceria com a FETAEG-GO, AGÊNCIA RURAL-GO e a COOSTEC-GO com aporte financeiro do FIALGO, instalaram nos municípios de Professor Jamil, Orizona e Morrinhos UTDs com área de aproximadamente 10.000 m² (1,0 ha) cada. Essas áreas foram conduzidas pelos agricultores locais em regime de sequeiro, seguindo as orientações técnicas de Embrapa Algodão com
acompanhamento de um Pesquisador da Agência Rural e de técnicos da Coostec. Para a análise da fibra, coletaram-se amostras de algodão das Unidades de Teste, nas quais foram levadas para o laboratório análises de fibras da Embrapa Algodão para avaliação da qualidade dessas fibras, em (HVI) e pelo finurímetro-maturímetro (FMT2). Os resultados obtidos demonstram que a variedade BRS Aroeira apresentou níveis razoáveis de produtividade mesmo nas condições locais, já a rentabilidade não proporcionou índices de lucratividade elevados. Mesmo assim, as UTDs demonstraram ser um
instrumento metodológico adequado para promover a transferência de tecnologias para agricultores de base familiar da região. |
Palavras-Chave: |
Fibras. |
Thesagro: |
Agricultura Familiar; Algodão. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02211naa a2200289 a 4500 001 1275485 005 2008-05-08 008 2007 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aSILVA, J. C. A. da 245 $aUnidades de teste e demonstração$bDesempenho da cultivar BRS Aroeira avaliadas em três municípios do Estado de Goiás, safra 2002/2003. 260 $c2007 300 $ap. 1-4$c1 CD-ROM 520 $aO presente trabalho teve como objetivo, avaliar o desempenho da cultivar aroeia cultivada em Unidades de Teste e Demonstração em três municípios de Goiás na safra 2002/2003. Para isso, a Embrapa Algodão em parceria com a FETAEG-GO, AGÊNCIA RURAL-GO e a COOSTEC-GO com aporte financeiro do FIALGO, instalaram nos municípios de Professor Jamil, Orizona e Morrinhos UTDs com área de aproximadamente 10.000 m² (1,0 ha) cada. Essas áreas foram conduzidas pelos agricultores locais em regime de sequeiro, seguindo as orientações técnicas de Embrapa Algodão com acompanhamento de um Pesquisador da Agência Rural e de técnicos da Coostec. Para a análise da fibra, coletaram-se amostras de algodão das Unidades de Teste, nas quais foram levadas para o laboratório análises de fibras da Embrapa Algodão para avaliação da qualidade dessas fibras, em (HVI) e pelo finurímetro-maturímetro (FMT2). Os resultados obtidos demonstram que a variedade BRS Aroeira apresentou níveis razoáveis de produtividade mesmo nas condições locais, já a rentabilidade não proporcionou índices de lucratividade elevados. Mesmo assim, as UTDs demonstraram ser um instrumento metodológico adequado para promover a transferência de tecnologias para agricultores de base familiar da região. 650 $aAgricultura Familiar 650 $aAlgodão 653 $aFibras 700 1 $aSANTANA, J. C. F. de 700 1 $aCARTAXO, W. V. 700 1 $aVANDERLEI, J. C. MOTA, V. de J. 700 1 $aSILVA, O. R. R. F. da 700 1 $aMIRANDA, J. E. 700 1 $aVALE, D. G. 700 1 $aALVES, I. 700 1 $aSOUSA, M. F. de 700 1 $aOLIVEIRA, J. M. C. de 700 1 $aALBUQUERQUE, F. A. de 773 $tIn: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 6., 2007, Uberlândia. Anais... Uberlândia, 2007.
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Embrapa Algodão (CNPA) |
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