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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
06/05/2019 |
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Data da última atualização: |
06/05/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SANT'ANA, G. C.; PEREIRA, L. F. P.; POT, D.; IVAMOTO, S. T.; DOMINGUES, D. S.; FERREIRA, R. V.; PAGIATTO, N. F.; SILVA, B. S. R. da; NOGUEIRA, L. M.; KITZBERGER, C. S. G.; SCHOLZ, M. B. S.; OLIVEIRA, F. F. de; SERA, G. H.; PADILHA, L.; LABOUISSE, J-P.; GUYOT, R.; CHARMETANT, P.; LEROY, T. |
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Afiliação: |
Gustavo C. Sant'Ana, Instituto Agronômico do Paraná - IAPAR/Laboratório de Biotecnologia Vegetal; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, CNPCa; David Pot, CIRAD, UMR AGAP; Suzana T. Ivamoto, Universidade Estadual Paulista/Instituto de Biociências; Douglas S. Domingues, Universidade Estadual Paulista/Instituto de Biociências; Rafaelle V. Ferreira, Instituto Agronômico do Paraná - IAPAR/Laboratório de Biotecnologia Vegetal; Natalia F. Pagiatto, Instituto Agronômico do Paraná - IAPAR/Laboratório de Biotecnologia Vegetal; Bruna S. R. da Silva, Instituto Agronômico do Paraná - IAPAR/Laboratório de Biotecnologia Vegetal; Lívia M. Nogueira, Instituto Agronômico do Paraná - IAPAR/Laboratório de Biotecnologia Vegetal; Cintia S. G. Kitzberger, Instituto Agronômico do Paraná - IAPAR/Laboratório de Biotecnologia Vegetal; Maria B. S. Scholz, Instituto Agronômico do Paraná - IAPAR/Laboratório de Biotecnologia Vegetal; Fernanda F. de Oliveira, Instituto Agronômico do Paraná - IAPAR/Laboratório de Biotecnologia Vegetal; Gustavo H. Sera, Instituto Agronômico do Paraná - IAPAR/Laboratório de Biotecnologia Vegetal; LILIAN PADILHA, CNPCa; Jean-Pierre Labouisse, AGAP, University Montpellier, CIRAD, INRA, Montpellier SupAgro; Romain Guyot, IRD, CIRAD, Universit Montpellier; Pierre Charmetant, AGAP, University Montpellier, CIRAD, INRA, Montpellier SupAgro; Thierry Leroy, AGAP, University Montpellier, CIRAD, INRA, Montpellier SupAgro. |
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Título: |
Genome-wide association study reveals candidate genes influencing lipids and diterpenes contents in Coffea arabica L . |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 8, n. 465, p. 1-12, 2018 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Lipids, including the diterpenes cafestol and kahweol, are key compounds that contribute to the quality of coffee beverages. We determined total lipid content and cafestol and kahweol concentrations in green beans and genotyped 107 Coffea arabica accessions, including wild genotypes from the historical FAO collection from Ethiopia. A genome-wide association study was performed to identify genomic regions associated with lipid, cafestol and kahweol contents and cafestol/kahweol ratio. Using the diploid Coffea canephora genome as a reference, we identified 6,696 SNPs. Population structure analyses suggested the presence of two to three groups (K = 2 and K = 3) corresponding to the east and west sides of the Great Rift Valley and an additional group formed by wild accessions collected in western forests. We identified 5 SNPs associated with lipid content, 4 with cafestol, 3 with kahweol and 9 with cafestol/kahweol ratio. Most of these SNPs are located inside or near candidate genes related to metabolic pathways of these chemical compounds in coffee beans. In addition, three trait-associated SNPs showed evidence of directional selection among cultivated and wild coffee accessions. Our results also confirm a great allelic richness in wild accessions from Ethiopia, especially in accessions originating from forests in the west side of the Great Rift Valley. |
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Palavras-Chave: |
Quality of coffee beverages. |
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Thesaurus Nal: |
Genome; Genomics; Green beans; Lipids. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/196973/1/Genome-wide-association-study-reveals.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
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Data corrente: |
11/02/2009 |
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Data da última atualização: |
25/01/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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Autoria: |
ROMÃO, R. L.; FRANÇA, F.; SANTANA, A. dos S.; MISTURA, G. C. da; MOREIRA, J. N. |
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Afiliação: |
Roberto Lisboa Romão, UEFS; Flavio de França, UEFS; Andréa dos Santos Santana, UEFS; Claudio Mistura. UNEB/DTCS; Grécia Cavalcanti da Silva, UNEB/DTCS; José Nilton Moreira, CPATSA.; JOSÉ NILTON MOREIRA, CPATSA. |
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Título: |
Resgate de germoplasma de Stylosanthes em áreas do semi-árido baiano. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
In: ENCONTRO DA REDE DE RECURSOS GENÉTICOS VEGETAIS DO ESTADO DA BAHIA, 3.; SIMPÓSIO DE RECURSOS GENÉTICOS DE PLANTAS CULTIVADAS NO NORDESTE BRASILEIRO, 2., 2008, Vitória da Conquista. Resumos expandidos... Vitória da Conquista: UESB, 2008. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O bioma caatinga apresenta uma paisagem bastante diversificada, na qual se destaca principalmente a família guminosae.Algumas espécies de leguminosas têm potencial para serem empregadas na alimentação animal, permitindo o pastoreio direto ou, sendo conservada, na forma de feno ou silagem. Entre as diversas leguminosas existentes em ambientes tropicais e subtropicais, destaca-se o gênero Stylosanthes. Neste, a maioria das espécies constituintes são perenes, dotadas de um potente sistema radicular, resistente à seca e apresentando boa adaptação a solos de baixa fertilidade. Para enriquecimento do banco de germoplasma de espécies forrageiras da Universidade Estadual de Feira de Santana, no estado da Bahia, foram realizadas expedições para coleta de acessos de Stylosanthes, com os dados de passaporte registrados em caderneta de coleta, com as principais informações tais como latitude e longitude, tipo de solo, de vegetação, dentre outros. Foram feitas exsicatas e os acessos coletados, após a triagem dos frutos e manejo de sementes, foram armazenados em um banco de sementes e acondicionados em potes herméticos com sílica gel; as exsicatas foram depositadas no herbário da Universidade Estadual de Feira de Santana ? HUEFS, onde estão sendo identificados por especialistas. Dentre os 57 acessos coletados, foram identificados cinco espécies, havendo diferenças de cor de sementes e tipo de planta prostrada ou ereta. |
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Palavras-Chave: |
Bahia; Germoplasma vegetal; Semi-Árido; Stylosante. |
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Thesagro: |
Caatinga; Leguminosa Forrageira. |
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Thesaurus NAL: |
Forage legumes. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CPATSA-2009-09/40181/1/OPB2222.pdf
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Marc: |
LEADER 02332nam a2200253 a 4500
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100 1 $aROMÃO, R. L.
245 $aResgate de germoplasma de Stylosanthes em áreas do semi-árido baiano.
260 $aIn: ENCONTRO DA REDE DE RECURSOS GENÉTICOS VEGETAIS DO ESTADO DA BAHIA, 3.; SIMPÓSIO DE RECURSOS GENÉTICOS DE PLANTAS CULTIVADAS NO NORDESTE BRASILEIRO, 2., 2008, Vitória da Conquista. Resumos expandidos... Vitória da Conquista: UESB$c2008
300 $c1 CD-ROM.
520 $aO bioma caatinga apresenta uma paisagem bastante diversificada, na qual se destaca principalmente a família guminosae.Algumas espécies de leguminosas têm potencial para serem empregadas na alimentação animal, permitindo o pastoreio direto ou, sendo conservada, na forma de feno ou silagem. Entre as diversas leguminosas existentes em ambientes tropicais e subtropicais, destaca-se o gênero Stylosanthes. Neste, a maioria das espécies constituintes são perenes, dotadas de um potente sistema radicular, resistente à seca e apresentando boa adaptação a solos de baixa fertilidade. Para enriquecimento do banco de germoplasma de espécies forrageiras da Universidade Estadual de Feira de Santana, no estado da Bahia, foram realizadas expedições para coleta de acessos de Stylosanthes, com os dados de passaporte registrados em caderneta de coleta, com as principais informações tais como latitude e longitude, tipo de solo, de vegetação, dentre outros. Foram feitas exsicatas e os acessos coletados, após a triagem dos frutos e manejo de sementes, foram armazenados em um banco de sementes e acondicionados em potes herméticos com sílica gel; as exsicatas foram depositadas no herbário da Universidade Estadual de Feira de Santana ? HUEFS, onde estão sendo identificados por especialistas. Dentre os 57 acessos coletados, foram identificados cinco espécies, havendo diferenças de cor de sementes e tipo de planta prostrada ou ereta.
650 $aForage legumes
650 $aCaatinga
650 $aLeguminosa Forrageira
653 $aBahia
653 $aGermoplasma vegetal
653 $aSemi-Árido
653 $aStylosante
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700 1 $aSANTANA, A. dos S.
700 1 $aMISTURA, G. C. da
700 1 $aMOREIRA, J. N.
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Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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