| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
|
Data corrente: |
28/10/1999 |
|
Data da última atualização: |
05/02/2014 |
|
Autoria: |
GUIMARAES, C. T. |
|
Título: |
Mapeamento comparativo e deteccao de QTLs em cana-de-acucar utilizando marcadores moleculares. |
|
Ano de publicação: |
1999 |
|
Fonte/Imprenta: |
Vicosa: UFV, 1999. |
|
Páginas: |
70p. |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
A cana-de-acucar e parte do complexo Saccharum, dentro da tribo Andropogoneae, em que tambem estao incluidas especies de grande importancia economica, como sorgo e milho. A poliploidia em Saccharum e de grande ocorrencia entre suas especies, apresentando-se como uma das principais causas da sua complexidade genetica e taxonomica. No entanto, o mapeamento direto de marcadores em dose simples oferece grandes oportunidades para o estudo genetico em poliploides. Com isso, o presente trabalho teve como objetivo construir mapas geneticos para Saccharum officinarum, a cana cultivada, e para S. robustum, seu suposto ancestral, utilizando varios tipos de marcadores moleculares. A partir dos dados extraidos dos mapas de ligacao, varias interferencias geneticas, evolutivas e comparativas foram realizadas. Uma progenie de 100 individuos obtida de um cruzamento entre S. officinarum 'La Purple' e S. robustum 'Mol 5829' foi analisada, utilizando marcadores moleculares em dose simples (MDS). Marcadores do tipo RAPD, RFLP e AFLP, gerando um total de 642 MDS, foram mapeadas em ambas as especies. O mapa genetico de LA Purple foi composto de 341 marcadores, distribuidos em 74 grupos de ligacao e 1.881 cM, enquanto que o mapa de ligacao de Mcl 5829 apresentou 301 marcadores ao longo de 65 grupos de ligacao e 1.189 cM. Os diferentes tipos de marcadores nao foram uniformemente distribuidos entre os grupos de ligacao, devido a grande diferenca no numero de cada tipo de marcador mapeado e a baixa saturacao dos mapas de ligacao. Em LA Purple, 15% dos marcadores estavam ligados em fase de repulsao e 13% desses marcadores foram detectados em Mcl 5829. A identificacao de marcadores ligados em fase de acoplamento e de repulsao em ambos os genomas sugere que as duas especies apresentam polissomia incompleta. O pareamento parcialmente preferencial dos cromossomos na meiose indica que S. officinarum e S. robustum, especies da Nova Guine, estao em fase intermediaria de diploidizacao, sendo da origem evolutiva mais antiga que S. spontaneum, especie originaria da India. Oito grupos de homologia foram determinados para as duas especies de Saccharum, utilizando o mapeamento comparativo com os grupos de ligacao do sorgo e sondas de RFLP altamente polimorficas que geraram mais de um MDS. Devido a polissomia incompleta nessas especies, os marcadores em dose multipla (MDM) nao puderam ser mapeados e, com isso, uma importante ferramenta para identificar grupos de ligacao homologos nao pode ser utilizada. Uma elevada colinearidade dos marcadores foi obtida com o mapeamento comparativo entre sorgo e as especies de Saccharum, sugerindo que o sorgo pode ser considerado a especie diploide filogeneticamente mais proxima da cana, como havia sido preveamente sugerido, utilizando DNA citoplasmatico. Comparacoes entre S. officinarum e S. robustum, especies simpatricas da Nova Guine, nao revelaram nenhuma alteracao relevante na ordem dos marcadores. Metodologias de analise de regressao e mapeamento por intervalo foram utilizadas para detectar e mapear regioes genomicas associadas a locos de caracteres quantitativos (QTLs). Foram detectadas associacoes significativas a P < 0,005 para todos os caracteres avaliados, sendo identificados QTLs com contribuicoes complementares provenientes de ambos os genitores para varios deles. Assim, a possibilidade de se utilizarem marcadores moleculares para acessar alelos favoraveis mascarados nos genotipos que nao expressam a caracteristica pode ser uma importante ferramenta no melhoramento de caracteristicas quantitativas de interesse economico. O mapeamento por intervalo aumentou a precisao de estimativas do efeito e da posicao dos QTLs, demonstrando, pela primeira vez, que mapas geneticos baseados em MDS podem ser utilizados para identificar regioes genomicas que controlam caracteres quantitativos em poliploides. O grupo de ligacao 7 de S. officinarum foi particularmente interessante uma vez que ancorou QTLs para tres dos sete caracteres fenotipicos avaliados, dentre eles o florescimento. O loco umc114e 2490 mapeado nessa regiao genomica foi associado com o florescimento em milho, sorgo e arroz por varios outros autores. Alem da grande colinearidade dos marcadores, existe tambem uma conservacao de QTLs controlando fenotipos de interesse agronomico entre Sorghum e Saccharum. Com isso, abrem-se amplas possibilidades para a transferencia dos conhecimentos geneticos ente tais especies, que podem ser aplicados nos estudos de ecologia, evolucao, biologia molecular e no melhoramento genetico. Desta forma, fica evidenciada a grande utilidade do mapeamento genetico em especies poliploides e de estudos comparativos envolvendo gramineas correlacionadas, principalmente entre sorgo e cana. MenosA cana-de-acucar e parte do complexo Saccharum, dentro da tribo Andropogoneae, em que tambem estao incluidas especies de grande importancia economica, como sorgo e milho. A poliploidia em Saccharum e de grande ocorrencia entre suas especies, apresentando-se como uma das principais causas da sua complexidade genetica e taxonomica. No entanto, o mapeamento direto de marcadores em dose simples oferece grandes oportunidades para o estudo genetico em poliploides. Com isso, o presente trabalho teve como objetivo construir mapas geneticos para Saccharum officinarum, a cana cultivada, e para S. robustum, seu suposto ancestral, utilizando varios tipos de marcadores moleculares. A partir dos dados extraidos dos mapas de ligacao, varias interferencias geneticas, evolutivas e comparativas foram realizadas. Uma progenie de 100 individuos obtida de um cruzamento entre S. officinarum 'La Purple' e S. robustum 'Mol 5829' foi analisada, utilizando marcadores moleculares em dose simples (MDS). Marcadores do tipo RAPD, RFLP e AFLP, gerando um total de 642 MDS, foram mapeadas em ambas as especies. O mapa genetico de LA Purple foi composto de 341 marcadores, distribuidos em 74 grupos de ligacao e 1.881 cM, enquanto que o mapa de ligacao de Mcl 5829 apresentou 301 marcadores ao longo de 65 grupos de ligacao e 1.189 cM. Os diferentes tipos de marcadores nao foram uniformemente distribuidos entre os grupos de ligacao, devido a grande diferenca no numero de cada tipo de marcador mapeado e a baixa s... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Cana-de-acucar; Mapeamento; Mapping; Molecular markers; QTLs. |
|
Thesagro: |
Marcador Molecular. |
|
Thesaurus Nal: |
sugarcane. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 05291nam a2200205 a 4500
001 1482789
005 2014-02-05
008 1999 bl uuuu m 00u1 u #d
100 1 $aGUIMARAES, C. T.
245 $aMapeamento comparativo e deteccao de QTLs em cana-de-acucar utilizando marcadores moleculares.
260 $aVicosa: UFV$c1999
300 $a70p.
520 $aA cana-de-acucar e parte do complexo Saccharum, dentro da tribo Andropogoneae, em que tambem estao incluidas especies de grande importancia economica, como sorgo e milho. A poliploidia em Saccharum e de grande ocorrencia entre suas especies, apresentando-se como uma das principais causas da sua complexidade genetica e taxonomica. No entanto, o mapeamento direto de marcadores em dose simples oferece grandes oportunidades para o estudo genetico em poliploides. Com isso, o presente trabalho teve como objetivo construir mapas geneticos para Saccharum officinarum, a cana cultivada, e para S. robustum, seu suposto ancestral, utilizando varios tipos de marcadores moleculares. A partir dos dados extraidos dos mapas de ligacao, varias interferencias geneticas, evolutivas e comparativas foram realizadas. Uma progenie de 100 individuos obtida de um cruzamento entre S. officinarum 'La Purple' e S. robustum 'Mol 5829' foi analisada, utilizando marcadores moleculares em dose simples (MDS). Marcadores do tipo RAPD, RFLP e AFLP, gerando um total de 642 MDS, foram mapeadas em ambas as especies. O mapa genetico de LA Purple foi composto de 341 marcadores, distribuidos em 74 grupos de ligacao e 1.881 cM, enquanto que o mapa de ligacao de Mcl 5829 apresentou 301 marcadores ao longo de 65 grupos de ligacao e 1.189 cM. Os diferentes tipos de marcadores nao foram uniformemente distribuidos entre os grupos de ligacao, devido a grande diferenca no numero de cada tipo de marcador mapeado e a baixa saturacao dos mapas de ligacao. Em LA Purple, 15% dos marcadores estavam ligados em fase de repulsao e 13% desses marcadores foram detectados em Mcl 5829. A identificacao de marcadores ligados em fase de acoplamento e de repulsao em ambos os genomas sugere que as duas especies apresentam polissomia incompleta. O pareamento parcialmente preferencial dos cromossomos na meiose indica que S. officinarum e S. robustum, especies da Nova Guine, estao em fase intermediaria de diploidizacao, sendo da origem evolutiva mais antiga que S. spontaneum, especie originaria da India. Oito grupos de homologia foram determinados para as duas especies de Saccharum, utilizando o mapeamento comparativo com os grupos de ligacao do sorgo e sondas de RFLP altamente polimorficas que geraram mais de um MDS. Devido a polissomia incompleta nessas especies, os marcadores em dose multipla (MDM) nao puderam ser mapeados e, com isso, uma importante ferramenta para identificar grupos de ligacao homologos nao pode ser utilizada. Uma elevada colinearidade dos marcadores foi obtida com o mapeamento comparativo entre sorgo e as especies de Saccharum, sugerindo que o sorgo pode ser considerado a especie diploide filogeneticamente mais proxima da cana, como havia sido preveamente sugerido, utilizando DNA citoplasmatico. Comparacoes entre S. officinarum e S. robustum, especies simpatricas da Nova Guine, nao revelaram nenhuma alteracao relevante na ordem dos marcadores. Metodologias de analise de regressao e mapeamento por intervalo foram utilizadas para detectar e mapear regioes genomicas associadas a locos de caracteres quantitativos (QTLs). Foram detectadas associacoes significativas a P < 0,005 para todos os caracteres avaliados, sendo identificados QTLs com contribuicoes complementares provenientes de ambos os genitores para varios deles. Assim, a possibilidade de se utilizarem marcadores moleculares para acessar alelos favoraveis mascarados nos genotipos que nao expressam a caracteristica pode ser uma importante ferramenta no melhoramento de caracteristicas quantitativas de interesse economico. O mapeamento por intervalo aumentou a precisao de estimativas do efeito e da posicao dos QTLs, demonstrando, pela primeira vez, que mapas geneticos baseados em MDS podem ser utilizados para identificar regioes genomicas que controlam caracteres quantitativos em poliploides. O grupo de ligacao 7 de S. officinarum foi particularmente interessante uma vez que ancorou QTLs para tres dos sete caracteres fenotipicos avaliados, dentre eles o florescimento. O loco umc114e 2490 mapeado nessa regiao genomica foi associado com o florescimento em milho, sorgo e arroz por varios outros autores. Alem da grande colinearidade dos marcadores, existe tambem uma conservacao de QTLs controlando fenotipos de interesse agronomico entre Sorghum e Saccharum. Com isso, abrem-se amplas possibilidades para a transferencia dos conhecimentos geneticos ente tais especies, que podem ser aplicados nos estudos de ecologia, evolucao, biologia molecular e no melhoramento genetico. Desta forma, fica evidenciada a grande utilidade do mapeamento genetico em especies poliploides e de estudos comparativos envolvendo gramineas correlacionadas, principalmente entre sorgo e cana.
650 $asugarcane
650 $aMarcador Molecular
653 $aCana-de-acucar
653 $aMapeamento
653 $aMapping
653 $aMolecular markers
653 $aQTLs
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 1 | |
| 1. |  | ARAUJO, R. R. de; SANTOS, E. D.; FARIAS, D. B. S.; LEMOS, E. E. P. de; ALVES, R. E. Byrsonima crassifolia e B. verbascifolia: murici. In: CORADIN, L.; CAMILLO, J.; PAREYN, F. G. C. (Ed.).Espécies nativas da flora brasileira de valor econômico atual ou potencial: plantas para o futuro: região Nordeste. Brasília, DF: MMA, 2018. cap. 5 p. 137-146| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
|    |
| Registros recuperados : 1 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
