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Biblioteca(s):  Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Data corrente:  25/11/2022
Data da última atualização:  01/09/2023
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  FALCAO, L. L.; WERNECK, J. O. S.; ALBUQUERQUE, P. S. B.; ALVES, R. M.; GRYNBERG, P.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; BRIGIDO, M. M.; MARCELLINO, L. H.
Afiliação:  LOENI LUDKE FALCAO, Cenargen; JOSEILDE OLIVEIRA SILVA WERNECK, Cenargen; PAULO SERGIO BEVILAQUA ALBUQUERQUE, COMISSÃO EXECUTIVA DO PLANO DA LAVOURA CACAUEIRA; RAFAEL MOYSES ALVES, CPATU; PRISCILA GRYNBERG, Cenargen; ROBERTO COITI TOGAWA, Cenargen; MARCOS MOTA DO CARMO COSTA, Cenargen; MARCELO MACEDO BRIGIDO, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; LUCILIA HELENA MARCELLINO, Cenargen.
Título:  Comparative transcriptomics of cupuassu (Theobroma grandiflorum) offers insights into the early defense mechanism to Moniliophthora perniciosa, the causal agent of witches' broom disease.
Ano de publicação:  2022
Fonte/Imprenta:  Journal of Plant Interactions, v. 17, n. 1, p. 991-1005, 2022.
DOI:  https://doi.org/10.1080/17429145.2022.2144650
Idioma:  Inglês
Notas:  Na publicação; Joseilde Oliveira Silva-Werneck.
Conteúdo:  Cupuassu (Theobroma grandiflorum) is a fruit tree native to the Amazon region, presenting high social and economic value. Besides, owing to its suitability for agroforestry cultivation, cupuassu is useful for the conservation of the Amazon Forest. Cupuassu plantations are severely affected by Moniliophthora perniciosa. Thus, to gain insights into resistance against M. perniciosa, transcriptomes of susceptible (SG) and resistant (RG) genotypes of cupuassu were analyzed at the early stage of infection using RNA sequencing. A total of 21,441 unigenes were identified, and differentially expressed genes were detected in intra- (440) and inter-genotype (301) analyses. Gene expression was altered at 24 h after inoculation (HAI) in SG. This alteration was prominent at 48 HAI in RG. These datasets allowed the identification of genes potentially involved in defense mechanisms. Phytohormone signature analysis revealed a significant effect of hormones on genotype responses. The present study is the first large-scale transcriptomic analysis of cupuassu.
Palavras-Chave:  Differential gene expression; Functional genomics; Plant-pathogen interaction; RNA-Seq.
Thesaurus Nal:  Transcriptome.
Categoria do assunto:  --
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1148790/1/Comparative-transcriptomics-of-cupuassu-Theobroma-grandiflorum-offers-insights-into-the-early-defense-mechanism-to-Moniliophthora-perniciosa-the-2-16.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Amazônia Oriental (CPATU)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CENARGEN38987 - 1UPCAP - DD
CPATU58954 - 1UPCAP - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoSOLLERO, B. P.; GRYNBERG, P. Tutorial para análise funcional a partir de estudos de associação genômica ampla e transcriptômicos utilizando o banco de dados MeSH (Medical Subject Headings) no programa R. Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2020. 43 p. (Embrapa Pecuária Sul. Documentos, 165).
Tipo: Documentos
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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2.Imagem marcado/desmarcadoARAÚJO, A. C. de; GRYNBERG, P.; FELIX, G. C. S. Exploring the use of bioinformatics tools in teaching genetics to high school and elementary students. In: BRAZILIAN SYMPOSIUM ON BIOINFOMATICS (BSB 2023), 16., 2023, Curitiba, PR. [Proceedings...]. Porto Alegre, RS: Sociedade Brasileira de Computação, 2023.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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3.Imagem marcado/desmarcadoNICKEL, O.; GRYNBERG, P.; FAJARDO, T. V. M. Detection of multiple viruses and viroid in apple trees in Brazil and their possible association with decline. Australasian Plant Disease Notes, v. 18, n. 2, e10, 2023.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 2
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Uva e Vinho.
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4.Imagem marcado/desmarcadoSALGADO, F. F.; GRYNBERG, P.; SOUZA JUNIOR, M. T. The role of noncoding RNAs in the response of oil palm plants to abiotic stresses. In: TUTAR, L. Recent advances in noncoding RNAs. London: IntechOpen Ltda, 2022. 236 p.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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5.Imagem marcado/desmarcadoQUEIROZ, P.; TOGAWA, R. C.; GRYNBERG, P.; MARTINS, E.; MONNERAT, R. Draft genome sequence of Bacillus thuringiensis strain 2193, an isolate toxic for lepidopteran. Brazilian Applied Science Review, v. 6, n. 3, p. 952-956, 2022. Na publicação: Roberto Togawa.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: C - 0
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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6.Imagem marcado/desmarcadoQUEIROZ, P.; TOGAWA, R. C.; GRYNBERG, P.; MARTINS, E.; MONNERAT, R. Draft genome sequence of Bacillus thuringiensis Strain 907, an isolate toxic for Coleopteran. Brazilian Applied Science Review, v. 6, n. 3, p. 920-924, 2022. Na publicação: Roberto Togawa.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: C - 0
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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7.Imagem marcado/desmarcadoQUEIROZ, P.; TOGAWA, R. C.; MARTINS, E.; GRYNBERG, P.; MONNERAT, R. Draft genome sequence of Bacillus thuringiensis strain S1287, an isolate showing insecticidal activity against coleoptera. Brazilian Applied Science Review, v. 6, n. 3, p. 925-929, 2022. Na publicação: Roberto Togawa.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: C - 0
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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8.Imagem marcado/desmarcadoTOGAWA, R. C.; MARTINS, E.; QUEIROZ, P.; GRYNBERG, P.; MONNERAT, R. Draft genome sequence of Bacillus thuringiensis strain S1307, an isolate toxic for lepidoptera. Brazilian Applied Science Review, v. 6, n. 3, p. 942-946, 2022. Na publicação: Roberto Togawa.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: C - 0
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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9.Imagem marcado/desmarcadoMARTINS, E.; QUEIROZ, P.; GRYNBERG, P.; TOGAWA, R. C.; MONNERAT, R. Draft genome sequence of Bacillus thuringiensis strain s1785, an isolate showing insecticidal activity. Brazilian Applied Science Review, v. 6, n. 3, p. 1037-1040, 2022. Na publicação: Roberto Togawa.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: C - 0
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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10.Imagem marcado/desmarcadoMARTINS, E.; GRYNBERG, P.; TOGAWA, R. C.; QUEIROZ, P.; MONNERAT, R. Draft genome sequence of Bacillus thuringiensis strain S1905, an isolate toxic for lepidoptera. Brazilian Applied Science Review, v. 6, n. 3, p. 947-951, 2022. Na publicação: Roberto Togawa.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: C - 0
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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11.Imagem marcado/desmarcadoQUEIROZ, P.; GRYNBERG, P.; MARTINS, E.; TOGAWA, R. C.; MONNERAT, R. Draft genome sequence of Bacillus thuringiensis strain S2195, an isolate toxic for lepidoptera. Brazilian Applied Science Review, v. 6, n. 3, p. 957-961, 2022. Na publicação: Roberto Togawa.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: C - 0
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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12.Imagem marcado/desmarcadoMARTINS, E.; QUEIROZ, P.; GRYNBERG, P.; TOGAWA, R. C.; PONTES, R. G. M. S. de. Draft genome sequence of Bacillus thuringiensis strain S601, a toxic strain to Anthonomous grandis. Brazilian Applied Science Review, v. 6, n. 3, p. 898-902, 2022. Na publicação: Roberto Togawa; Rose Monnerat.
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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13.Imagem marcado/desmarcadoGRYNBERG, P.; QUEIROZ, P.; TOGAWA, R. C.; MARTINS, E.; MONNERAT, R. Draft genome sequence of Bacillus thuringiensis strain s908, an isolate toxic for coleopteran. Brazilian Applied Science Review, v. 6, n. 3, p. 1032-1036, 2022. Na publicação: Roberto Togawa.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: C - 0
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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14.Imagem marcado/desmarcadoCOSTA, E. de C.; BASTOS, L. S.; TOGAWA, R. C.; GRYNBERG, P.; MILLER, R. N. G. Differential gene expression analysis of Musa acuminata subsp. burmannicoides var. 'Calcutta 4' root tissues during interaction with Fusarium oxysporum f. sp. cubense. In: BRAZILIAN SYMPOSIUM ON BIOINFOMATICS (BSB 2023), 16., 2023, Curitiba, PR. [Proceedings...]. Porto Alegre, RS: Sociedade Brasileira de Computação, 2023.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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15.Imagem marcado/desmarcadoAMORA, D. X.; BRESSO, E.; TOGAWA, R. C.; GRYNBERG, P.; MAIGRET, B.; MARTINS, N. F. Prediction of G protein coupled receptors from plant genomes. International Journal of Current Research in Biosciences and Plant Biology, v. 3, n. 11, p. 92-107, 2016. (Online).
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: C - 0
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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16.Imagem marcado/desmarcadoROCHA, G.; GRYNBERG, P.; QUEIROZ, P.; TOGAWA, R. C.; PURCENA, T.; MARTINS, E. Draft genome sequence of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum strain S2784, an isolate useful for microbial control. Brazilian Applied Science Review, v. 6, n. 3, p. 908-919, 2022. Na publicação: Roberto Togawa
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: C - 0
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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17.Imagem marcado/desmarcadoROCHA, G.; TOGAWA, R. C.; QUEIROZ, P.; GRYNBERG, P.; PURCENA, T.; MARTINS, E.; MONNERAT, R. Draft genome sequence of Bacillus subtilis strain S2794, an isolate useful for microbial control. Brazilian Applied Science Review, v. 6, n. 3, p. 930-941, 2022. Na publicação: Roberto Togawa.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: C - 0
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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18.Imagem marcado/desmarcadoQUEIROZ, P.; MARTINS, E.; GRYNBERG, P.; TOGAWA, R. C.; MONNERAT, R. Draft genome sequence of bacillus thuringiensis S906, a toxic strain to coleoptera and lepidoptera orders. Brazilian Applied Science Review, v. 6, n. 3, p. 903-907, 2022. Na publicação: Roberto Togawa.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: C - 0
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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19.Imagem marcado/desmarcadoDA SILVA, T. L. C.; TOGAWA, R. C.; GRYNBERG, P.; SOUZA JUNIOR, M. T. Smarthtpcloning - a primer design software for PCR-based cloning of non-model species. In: BRAZILIAN SYMPOSIUM ON BIOINFOMATICS (BSB 2023), 16., 2023, Curitiba, PR. [Proceedings...]. Porto Alegre, RS: Sociedade Brasileira de Computação, 2023.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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20.Imagem marcado/desmarcadoRIBEIRO, Z. M. de A.; SILVA, J. B. T. da; MENEZES, J. E.; BARROS, L. M. G.; GRYNBERG, P. (ed.). Anais: resumos dos trabalhos. Brasília: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2019. 23 111 (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, Documentos, 362) XXIII Encontro do Talento Estudantil da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Tipo: Documentos
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