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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
05/09/2006 |
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Data da última atualização: |
03/11/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BEVITORI, R.; SIRCAR, S.; TOGAWA, R. C.; CÔRTES, M. V. de C. B.; OLIVEIRA, T. S.; GROSSI-DE-SÁ, M. F.; PAREKH, N. |
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Afiliação: |
ROSANGELA BEVITORI, CNPAF; S. SIRCAR, INTERNATIONAL INSTITUTE OF INFORMATION TECHNOLOGY, Hyderabad-India; ROBERTO COITI TOGAWA, Cenargen; MARCIO VINICIUS DE C BARROS CORTES, CNPAF; T. S. OLIVEIRA, UNICAMP; MARIA FATIMA GROSSI DE SA, Cenargen; N. PAREKH, INTERNATIONAL INSTITUTE OF INFORMATION TECHNOLOGY, Hyderabad-India. |
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Título: |
Identification of co-expression gene networks controlling rice blast disease during an incompatible reaction. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 19, n. 3, gmr18579, 2020. |
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ISSN: |
1676-5680 |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.4238/gmr18579 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Rice blast disease is a major threat to rice production worldwide; the causative pathogenic fungus Magnaporthe oryzae induces rice (Oryza sativa) plants to undergo molecular changes that help them to circumvent this fungal attack. Transcriptome studies have demonstrated that many genes are involved in the defense response of rice to M. oryzae, but most of these studies focused on the screening of differentially expressed genes and the studies did not investigate the interactions among genes. We examined the interaction of rice and M. oryzae in a network context. Two near-isogenic lines were profiled at different time-points. Using transcriptome data obtained from an RNA-Seq analysis, a network based on the relationships among genes was developed through weighted gene co-expression network analysis. The analysis of degree centrality identified numerous hub genes and potential key regulators that control the rice response, providing new insights into the molecular network underlying the resistance of rice to M. oryzae infection. Additionally, a protein-protein interaction network was derived to identify complexes that might physically interact. For example, complexes of OsbHLH148/OsJAZ, OsMYB4 and some components of the phenylpropanoid pathway, as well as MYB/bHLH and NB-LRR/OsWRKYs were identified, suggesting possible roles in regulating M. oryzae infection. The combination of in silico data with transcription factor binding indicates that OsbZIP45 may serve as a driver of complex gene expression changes that result in resistance to rice blast disease, and can thus act as an integrator of multiple signals and as a coordinator of diverse cellular pathways to control the defense responses. MenosRice blast disease is a major threat to rice production worldwide; the causative pathogenic fungus Magnaporthe oryzae induces rice (Oryza sativa) plants to undergo molecular changes that help them to circumvent this fungal attack. Transcriptome studies have demonstrated that many genes are involved in the defense response of rice to M. oryzae, but most of these studies focused on the screening of differentially expressed genes and the studies did not investigate the interactions among genes. We examined the interaction of rice and M. oryzae in a network context. Two near-isogenic lines were profiled at different time-points. Using transcriptome data obtained from an RNA-Seq analysis, a network based on the relationships among genes was developed through weighted gene co-expression network analysis. The analysis of degree centrality identified numerous hub genes and potential key regulators that control the rice response, providing new insights into the molecular network underlying the resistance of rice to M. oryzae infection. Additionally, a protein-protein interaction network was derived to identify complexes that might physically interact. For example, complexes of OsbHLH148/OsJAZ, OsMYB4 and some components of the phenylpropanoid pathway, as well as MYB/bHLH and NB-LRR/OsWRKYs were identified, suggesting possible roles in regulating M. oryzae infection. The combination of in silico data with transcription factor binding indicates that OsbZIP45 may serve as a driver of co... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Arroz; Brusone; Doença de Planta; Gene; Oryza Sativa. |
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Thesaurus Nal: |
Gene expression; Magnaporthe oryzae; Rice; Transcriptome. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/217376/1/CNPAF-2020-gmb2.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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| Registros recuperados : 368 | |
| 161. |  | BEVITORI, R.; REIS, M. S.; DIÓGENES, R.; BRONDANI, R. V.; DA SILVA, F. R.; DE PAULA, A. W. M; GROSSI DE SÁ, M. F. Identificação de seqüências expressas etiquetadas (ESTs) envolvidas na interação de arroz e do fungo causador da brusone (Magnaphorte grisea). In: WORKSHOP INTERAÇÃO MOLECULAR PLANTA-PRAGAS, 2., 2007, Brasília, DF. II Workshop Interação Molecular Planta-Praga. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. p. 144-146. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 229).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 162. | | BEVITORI, R.; SIRCAR, S.; TOGAWA, R. C.; CÔRTES, M. V. de C. B.; OLIVEIRA, T. S.; GROSSI-DE-SÁ, M. F.; PAREKH, N. Identification of co-expression gene networks controlling rice blast disease during an incompatible reaction. Genetics and Molecular Research, v. 19, n. 3, gmr18579, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 164. | | LOPES, M. J. C.; CAMPOS, M. de A.; PAIVA, L. V.; SÁ, M. E. L. de; ARANTES, N. E.; SALGADO, S. M. L.; GROSSI-DE-SÁ, M. F. Histopathological aspects of root-knot nematode resistance in soybean genotype. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 5.; MERCOSOJA 2009, Goiânia. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p. 224, trab. 409. Editado por Adilson de Oliveira Júnior, Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann Campo, César de Castro| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 165. | | LOURENÇO, I. T.; ANTONINO-SOUZA JÚNIOR, J. D.; FRAGOSO, R. da R.; SOUZA, D. S. L. E.; ROCHA, T. L.; GROSSI-DE-SÁ, M. F. Gene isolation and vector construction for tobacco transformation aiming gene silence of plant parasitic nematode Meloidogyne incognita. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 2., 2009, Búzios, RJ. Programa e resumos... [Ribeirão Preto]: Sociedade Brasileira de Genética, 2009. p. 229.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 166. | | CAMPOS, M. A.; SILVA, M. S.; MAGALHÃES, C. P.; RIBEIRO, S. G.; DEL SARTO, R. P. CRUZ, C. C. M.; MONTE, D. C.; GROSSI de SÁ, M. F. Gene PR-5 isolado de Solanum nigrum apresenta alta atividade antifúngica contra Ascomicetos patogênicos de soja, algodoeiro e Stylosanthes e contra um Oomiceto patogênico de citros. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 31, S192-S193, ago. 2006. Suplemento. Trabalho apresentado no 39. Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2006, Salvador, BA.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 167. | | SILVA, M. S.; CAMPOS, M. A.; MAGALHÃES, C. P.; RIBEIRO, S. G.; DEL SARTO, R. P. CRUZ, C. C. M.; MONTE, D. C.; GROSSI de SÁ, M. F. Gene PR-5 isolado de Solanum nigrum apresenta alta atividade antifúngica contra Ascomicetos patogênicos de soja, algodoeiro e Stylosanthes e contra um Oomiceto patogênico de citros. Fitopatologia Brasileira, v. 31, suppl., ago. 2006. Anais do: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 39.; ANNUAL MEETING OF THE BRAZILIAN PHYTOPATHOLOGICAL SOCIETY, 39., 2006, Salvador, BA. p. S192.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 169. | | SILVA, M. C. M.; CRUZ, C. M.; TEIXEIRA, F. R.; SARTO, R. P.; BEZERRA-AGASIE, I. C.; COUTINHO, M. V.; GROSSI de SÁ, M. F. Insecticidal activity of shuffled alpha-amylase inhibitors. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR, 35., 2006, Águas de Lindóia, SP. Programas e resumos... São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006. Não paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 170. | | OLIVEIRA, G. R.; RAMOS, H. B.; BARBOSA, A. E. A. D.; BRUNETTA, P. S. F.; SILVA, M. C. M.; GROSSI de SÁ, M. F. Insecticidal effects of Cry8H mutants generated by DNA Shuffling and Phage Display techniques against fall armyworm (Spodoptera frugiperda). In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR, 35., 2006, Águas de Lindóia, SP. Programas e resumos... São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006. Não paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 172. | | FRAGOSO, R. R.; BATISTA, J. A. N.; PINTO, A. C. M.; OLIVEIRA-NETO, O. B.; CORDEIRO, M. C. R.; GROSSI-DE-SÁ, M. F. Isolamento e caracterização de cDNAs codificadores de aspártico e serino proteases de nematóides de galha Meloidogyne incognita e M. javanica. In: WORKSHOP DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 4., 1999, Brasília. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: EMBRAPA-CENARGEN, 1999. p. 56.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
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| 173. | | OLIVEIRA-NETO, O. B; BATISTA, J. A. N.; SILVA, R. O.; FRAGOSO, R. R.; DIAS, S. C.; MONNERAT, R. G.; GROSSI-de-SÁ, M. F. Isolamento e caracterização de cDNAs codificadores de proteinases serina e cisteína de Bicudo-do-algodoeiro (Anthonomus grandis, Boheman, 1843). In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 5., 2000, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2000. p. 36.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 174. | | MULINARI, F.; STANISCUASKI, R. BERTHOLDO VARGAS, L. R.; POSTAL, M.; OLIVEIRA NETO, O. B.; RIGDEN, D. J.; GROSSI DE SÁ, M. F.; CARLINI, C. R. Jaburetox-2Ec: An insecticidal peptide derived from an isoform of urease from the plant Canavalia ensiformis. Peptides, New York, v. 28, p. 2042-2050, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 175. | | SILVA, M. C. M.; SARTO, R. P.; TEIXEIRA, F. R.; CRUZ, C. M.; COUTINHO, M. V.; GROSSI DE SÁ, M. F. Efficiency of shuffed alpha-amylase inhibitor in inhibit Anthonomus grandis alpha-amylase. In: ANNUAL MEETING OF THE SBBq, 36.; IUBMB CONFERENCE, 10., 2007, Salvador, BA. Infectious diseases: biochemistry of parasites, vectors and hosts. [S.l.]: SBBq, 2007. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 176. | | BODENS, F. W. P.; MUCHAGATA, I. S.; EVANGELISTA, I. B. R.; PAES, N. S.; TEIXEIRA, J. B.; GROSSI-DE-SÁ, M. F. Embriogênese somática de plantas de Gossypium hirsutum e transformação de calos embriogênicos via Agrobacterium. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 11., 2006, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2006. p. 51.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 178. | | EVANGELISTA, I. B. R.; LACERDA, H. M.; ALMEIDA, S. D. S.; OLIVEIRA-NETO, O. B.; PAES, N. S.; GROSSI-DE-SÁ, M. F. Estabelecimento de um protocolo para transformação de cultivares brasileiras de algodoeiro. ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENETICOS E BIOTECNOLOGIA, 8., 2003, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2003. p. 39| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 179. | | RAMOS, H. B.; OLIVEIRA, G. R.; BRUNETTA, P. S. F.; BARBOSA, A. E. A. D.; SILVA, M. C. M.; GROSSI-DE-SÁ, M. F. Evolução molecular in vitro: prospecção de novas toxinas cry com atividade melhorada para o bicudo-do-algodoeiro, Anthonomus grandis. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 11., 2006, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2006. p. 82.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
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| 180. | | OLIVEIRA, G. R.; RAMOS, H. B.; BARBOSA, A. E. A. D.; FIGUEIRA, E. L. Z.; SILVA, M. C. M.; GROSSI-de-SÁ, M. F. Evolução molecular in vitro: seleção de genes para toxinas Cry melhoradas com potencial uso no controle de Spodoptera frugiperd. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 10., 2005, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2005. p. 65.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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