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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pantanal. |
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Data corrente: |
11/04/2003 |
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Data da última atualização: |
11/04/2003 |
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Autoria: |
CIAMPI, A. Y.; BRONDANI, R. P. V.; GRATTAPAGLIA, D. |
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Afiliação: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Título: |
Otimização de sistemas fluorescentes de genotipagem mltiloco e desenvolvimento de marcadores microssatélites para Copaifera Langsdorffii Desf. (Copaíba) Leguminosae - Caesalpinoideae. |
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Ano de publicação: |
2000 |
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Fonte/Imprenta: |
Brasília: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2000. |
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Páginas: |
40 p. |
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Série: |
(Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Boletim de Pesquisa, 16). |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Microssatelites contituem marcadores genéticos altamente informativos para estudos de genética de populações pela sua natureza co-dominante, multialélica e pela ampla distribuição no genoma. Marcadores microssatélites foram desenvolvidos para Copaifera langsdorffii a partir de bibliotecas enriquecidas para seqüências simples repetidas (SSR) AG. Clones positivos foram selecionados por hibridização de colônia e seqüenciados. Para 34% dos clones seqüenciados foi possível desenhar pares de primers específicos (de 17 a 20 bases) complementares às seqüências únicas que flanqueiam o microssatélite. Utilizando-se um único programa de PCR, 26 locos microssatélites foram verificados a partir dos 45 pares de primers desenhados. Uma resolução e identificação robusta dos alelos a cada loco foram realizadas em gel de poliacrilamida com detecção a laser de fluorescências multi coloridas em seqüenciador automatico. Oito locos resolvidos em três sistemas "multiplex" foram caracterizados para conteúdo informativo a partir de genótipos obtidos para 96 indivíduos adultos das populações de matas de galeria. Verificou-se uma média de 24,5 alelos por loco, e um elevado conteúdo informativo com heterozigosidade média observada (Ho) de 0,89 e heterozigosidade média esperada (He) de 0,88. Com uma bateria de 8 locos SSR de copaíba, foram estimados a probabilidade de identidade (I) que variou de 0,00072 a 0,0402, com valor combinado para 8 locos de 1,11 x 10 -15 e o poder de exclusão (Q) de 0,7093 a 0,88536, com valor combinado de 99,999993%. Marcadores SSR para copaíba abrem uma ampla perspectiva para a geração de dados precisos sobre estrutura genética, fluxo gênico e paternidade em populações naturais. Estas informações serão fundamentais para dar suporte a programas de coleta e conservação in situ e ex situ desta espécie. MenosMicrossatelites contituem marcadores genéticos altamente informativos para estudos de genética de populações pela sua natureza co-dominante, multialélica e pela ampla distribuição no genoma. Marcadores microssatélites foram desenvolvidos para Copaifera langsdorffii a partir de bibliotecas enriquecidas para seqüências simples repetidas (SSR) AG. Clones positivos foram selecionados por hibridização de colônia e seqüenciados. Para 34% dos clones seqüenciados foi possível desenhar pares de primers específicos (de 17 a 20 bases) complementares às seqüências únicas que flanqueiam o microssatélite. Utilizando-se um único programa de PCR, 26 locos microssatélites foram verificados a partir dos 45 pares de primers desenhados. Uma resolução e identificação robusta dos alelos a cada loco foram realizadas em gel de poliacrilamida com detecção a laser de fluorescências multi coloridas em seqüenciador automatico. Oito locos resolvidos em três sistemas "multiplex" foram caracterizados para conteúdo informativo a partir de genótipos obtidos para 96 indivíduos adultos das populações de matas de galeria. Verificou-se uma média de 24,5 alelos por loco, e um elevado conteúdo informativo com heterozigosidade média observada (Ho) de 0,89 e heterozigosidade média esperada (He) de 0,88. Com uma bateria de 8 locos SSR de copaíba, foram estimados a probabilidade de identidade (I) que variou de 0,00072 a 0,0402, com valor combinado para 8 locos de 1,11 x 10 -15 e o poder de exclusão (Q) de 0,7093 a 0,... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Microsatelite. |
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Thesagro: |
Copaíba; Copaifera Langsdorffii; Marcador Genético. |
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Thesaurus Nal: |
genetic markers. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pantanal (CPAP) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
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| Registros recuperados : 383 | |
| 87. |  | MISSIAGGIA, A. A.; BUENO, N. W.; DEHON, G.; GRATTAPAGLIA, D. Mapeamento de QTL para características da madeira em clones híbridos de Eucalyptus sp. com base em microssatélites. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia, SP. A era da genômica: da bioestatística à bioinformática: anais. Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. p. 599.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 90. | | NOVAES, E.; SOARES, B. L.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; GRATTAPAGLIA, D. Localização de microssatélites em clones BAC de Eucalyptus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia, SP. A era da genômica: da bioestatística à bioinformática: anais. Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. p. 474.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 96. | | PÁDUA, J. G.; VIEIRA, M. C.; MISSIAGGIA, A.; GRATTAPAGLIA, D. Reconstruindo a história de clones elite de Eucalyptus no Brasil com base em SNP, SSR e morfometria. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52., 2006, Foz do Iguaçu, PR. Resumos... Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2006. p. 1147| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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