| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
|
Data corrente: |
26/08/2014 |
|
Data da última atualização: |
19/06/2017 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
GOMES, D. F.; BATISTA, J. S. da S.; ROLLA, A. A. P.; SILVA, L. P. da; BLOCH, C.; GALLI-TARASAWA, L. V.; HUNGRIA, M. |
|
Afiliação: |
DOUGLAS FABIANO GOMES, Departamento de Génetica UFPR; JESSIANE STEFÂNIA DA SILVA BATISTA, DEBIOGEM UEPG; AMANDA ALVES PAIVA ROLLA; LUCIANO PAULINO DA SILVA, CENARGEN; CARLOS BLOCH JUNIOR, Cenargen; LYGIA VITORIA GALLI TERASAWA, Departamento de Génetica UFPR; MARIANGELA HUNGRIA DA CUNHA, CNPSO. |
|
Título: |
Proteomic analysis of free-living Bradyrhizobium diazoefficiens: highlighting potential determinants of a successful symbiosis |
|
Ano de publicação: |
2014 |
|
Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, v. 15, n. 643, 2014. |
|
DOI: |
10.1186/1471-2164-15-643 |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
Strain CPAC 7 (=SEMIA 5080) was recently reclassified into the new species Bradyrhizobium diazoefficiens; due to its outstanding efficiency in fixing nitrogen, it has been used in commercial inoculants for application to crops of soybean [Glycine max (L.) Merr.] in Brazil and other South American countries. Although the efficiency of B. diazoefficiens inoculant strains is well recognized, few data on their protein expression are available. We provided a two-dimensional proteomic reference map of CPAC 7 obtained under free-living conditions, with the successful identification of 115 spots, representing 95 different proteins. The results highlighted the expression of molecular determinants potentially related to symbiosis establishment (e.g. inositol monophosphatase, IMPase), fixation of atmospheric nitrogen (N 2) (e.g. NifH) and defenses against stresses (e.g. chaperones). By using bioinformatic tools, it was possible to attribute probable functions to ten hypothetical proteins. For another ten proteins classified as? NO related COG? group, we analyzed by RT-qPCR the relative expression of their coding-genes in response to the nodulation-gene inducer genistein. Six of these genes were up-regulated, including blr0227, which may be related to polyhydroxybutyrate (PHB) biosynthesis and competitiveness for nodulation. The proteomic map contributed to the identification of several proteins of B. diazoefficiens under free-living conditions and our approach? combining bioinformatics and gene-expression assays ? resulted in new information about unknown genes that might play important roles in the establishment of the symbiosis with soybean. MenosStrain CPAC 7 (=SEMIA 5080) was recently reclassified into the new species Bradyrhizobium diazoefficiens; due to its outstanding efficiency in fixing nitrogen, it has been used in commercial inoculants for application to crops of soybean [Glycine max (L.) Merr.] in Brazil and other South American countries. Although the efficiency of B. diazoefficiens inoculant strains is well recognized, few data on their protein expression are available. We provided a two-dimensional proteomic reference map of CPAC 7 obtained under free-living conditions, with the successful identification of 115 spots, representing 95 different proteins. The results highlighted the expression of molecular determinants potentially related to symbiosis establishment (e.g. inositol monophosphatase, IMPase), fixation of atmospheric nitrogen (N 2) (e.g. NifH) and defenses against stresses (e.g. chaperones). By using bioinformatic tools, it was possible to attribute probable functions to ten hypothetical proteins. For another ten proteins classified as? NO related COG? group, we analyzed by RT-qPCR the relative expression of their coding-genes in response to the nodulation-gene inducer genistein. Six of these genes were up-regulated, including blr0227, which may be related to polyhydroxybutyrate (PHB) biosynthesis and competitiveness for nodulation. The proteomic map contributed to the identification of several proteins of B. diazoefficiens under free-living conditions and our approach? combining bioinformatics... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
RT-qPCR; Two-dimensional proteomics. |
|
Thesaurus Nal: |
Bradyrhizobium; nitrogen fixation; symbiosis. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/160837/1/12864-2014-Article-6775.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02463naa a2200265 a 4500
001 1993458
005 2017-06-19
008 2014 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1186/1471-2164-15-643$2DOI
100 1 $aGOMES, D. F.
245 $aProteomic analysis of free-living Bradyrhizobium diazoefficiens$bhighlighting potential determinants of a successful symbiosis$h[electronic resource]
260 $c2014
520 $aStrain CPAC 7 (=SEMIA 5080) was recently reclassified into the new species Bradyrhizobium diazoefficiens; due to its outstanding efficiency in fixing nitrogen, it has been used in commercial inoculants for application to crops of soybean [Glycine max (L.) Merr.] in Brazil and other South American countries. Although the efficiency of B. diazoefficiens inoculant strains is well recognized, few data on their protein expression are available. We provided a two-dimensional proteomic reference map of CPAC 7 obtained under free-living conditions, with the successful identification of 115 spots, representing 95 different proteins. The results highlighted the expression of molecular determinants potentially related to symbiosis establishment (e.g. inositol monophosphatase, IMPase), fixation of atmospheric nitrogen (N 2) (e.g. NifH) and defenses against stresses (e.g. chaperones). By using bioinformatic tools, it was possible to attribute probable functions to ten hypothetical proteins. For another ten proteins classified as? NO related COG? group, we analyzed by RT-qPCR the relative expression of their coding-genes in response to the nodulation-gene inducer genistein. Six of these genes were up-regulated, including blr0227, which may be related to polyhydroxybutyrate (PHB) biosynthesis and competitiveness for nodulation. The proteomic map contributed to the identification of several proteins of B. diazoefficiens under free-living conditions and our approach? combining bioinformatics and gene-expression assays ? resulted in new information about unknown genes that might play important roles in the establishment of the symbiosis with soybean.
650 $aBradyrhizobium
650 $anitrogen fixation
650 $asymbiosis
653 $aRT-qPCR
653 $aTwo-dimensional proteomics
700 1 $aBATISTA, J. S. da S.
700 1 $aROLLA, A. A. P.
700 1 $aSILVA, L. P. da
700 1 $aBLOCH, C.
700 1 $aGALLI-TARASAWA, L. V.
700 1 $aHUNGRIA, M.
773 $tBMC Genomics$gv. 15, n. 643, 2014.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 25 | |
| 2. |  | COELHO, E. F.; COSTA, É. L.; SANTANA, J. A. do V.; PAMPONET, A. J. M. Variáveis de crescimento e produtividade de bananeira 'Grand Naine' sob diferentes áreas molhadas e níveis de irrigação. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20.; ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HORTICULTURE, 54., 2008, Vitória. Frutas para todos: estratégias, tecnologias e visão sustentável: anais. Vitória: INCAPER: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
|   |
| 3. | | ANDRADE NETO, T. M. de; ALVES, M. da S.; SANTANA, J. A. do V.; COELHO, E. F. Condutividade elétrica do solo sob duas fontes nitrogenadas aplicadas via fertirrigação em bananeira no 1º ciclo de produção. In: SEMINÁRIO DE PESQUISA DO RECÔNCAVO DA BAHIA, 1.; SEMINÁRIO ESTUDANTIL DE PESQUISA, 1.; SEMINÁRIO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA UFRB, 1., 2007, Cruz das Almas. Ano internacional do planeta Terra. Cruz das Almas: UFRB, 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
|  |
| 4. | | ALVES, M. da S.; ANDRADE NETO, T. M. de; SANTANA, J. A. do V.; COELHO, E. F. Crescimento de bananeira "Grande Naine" sob diferentes fontes de nitrogênio no 2º ciclo. In: SEMINÁRIO DE PESQUISA DO RECÔNCAVO DA BAHIA, 1.; SEMINÁRIO ESTUDANTIL DE PESQUISA, 1.; SEMINÁRIO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA UFRB, 1., 2007, Cruz das Almas. Ano internacional do planeta Terra. Cruz das Almas: UFRB, 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 8. | | ALVES, M. da S.; COELHO, E. F.; ANDRADE NETO, T. M. de; SANTANA, J. A. do V.; SANTANA JUNIOR, E. B. Application of calcium nitrate and urea by frtirrigation on banana crop and their efects on soil ph and electrical conductivity. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF AGRICULTURAL ENGINEERING; BRAZILIAN CONGRESS OF AGRICULTURAL ENGINEERING, 38.; INTERNATIONAL LIVESTOCK ENVIRONMENT SYMPOSIUM, 8., 2008, Iguassu Falls. [Foz do Iguaçu]: CIGR, 2008. PAP0825.pdf.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
|  |
| 9. | | COELHO, E. F.; SANTANA JUNIOR, E. B.; SANTANA, J. A. do V.; SILVA, A. J. P. da; VEIMROBER JUNIOR, L. A. dos A. Approach for nitrate balance in the soil solution under fertirrigation. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF AGRICULTURAL ENGINEERING; BRAZILIAN CONGRESS OF AGRICULTURAL ENGINEERING, 38.; INTERNATIONAL LIVESTOCK ENVIRONMENT SYMPOSIUM, 8., 2008, Iguassu Falls. [Foz do Iguaçu]: CIGR, 2008. PAP0958.pdf.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 10. | | ALVES, M. da S.; COELHO, E. F.; LÊDO, C. A. da S.; ANDRADE NETO, T. M. de; SANTANA, J. A. do V.; SANTANA JUNIOR, E. B. Concentração do íon NO3- no solo sob diferentes combinações de fontes nitrogenadas via fertirrigação em bananeira no segundo ciclo de produção. In: CONGRESSO NACIONAL DE IRRIGAÇÃO E DRENAGEM, 18., 2008, São Mateus. O equilíbrio do fluxo hídrico para uma agricultura irrigada sustentável: anais... São Mateus: ABID, 2008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 12. | | ANDRADE NETO, T. M. de; COELHO, E. F.; ALVES, M. da S.; SANTANA JUNIOR, E. B.; SANTANA, J. A. do V. Concentração de nitrato na solução do solo pela aplicação de diferentes concentrações de nitrato de cálcio na água irrigação de por microaspersão e gotejamento. In: WORKSHOP INTERNACIONAL DE INOVAÇÕES TECNOLÓGICAS NA IRRIGAÇÃO, 2.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE USO MÚLTIPLO DA ÁGUA, 1., 2008, Fortaleza. Anais... Fortaleza: CENTEC, 2008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 13. | | COSTA, F. da S.; COELHO, E. F.; CARVALHO, G. C.; BARROS, D. L.; SANTANA, J. A. do V.; NASCIMENTO JUNIOR, A. L. do. Condutividade elétrica do solo sob fertirrigação com diferentes concentrações de uréia e nitrato de potássio em bananeira da terra. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios: anais. Fortaleza: SBCS: UFC, 2009. 01 CD ROM. Trabalho 3095| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 15. | | ALVES, M. da S.; ANDRADE NETO, T. M. de; COELHO, E. F.; SANTANA JUNIOR, E. B.; SANTANA, J. A. do V. Crescimento e produtividade de bananeira 'Terra' sob diferentes concentrações de nitrato de cálcio e uréia aplicados via fertirrigação por gotejamento. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20.; ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HORTICULTURE, 54., 2008, Vitória. Frutas para todos: estratégias, tecnologias e visão sustentável: anais. Vitória: INCAPER: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| 16. | | ANDRADE NETO, T. M. de; COELHO, E. F.; SANTANA, J. A. do V.; SANTANA JUNIOR, E. B.; ALVES, M. da S. Efeito da concentração de nitrato de cálcio e uréia na água de irrigação via gotejamento na salinidade do solo. In: WORKSHOP INTERNACIONAL DE INOVAÇÕES TECNOLÓGICAS NA IRRIGAÇÃO, 2.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE USO MÚLTIPLO DA ÁGUA, 1., 2008, Fortaleza. Anais... Fortaleza: CENTEC, 2008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
| Registros recuperados : 25 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
