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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sul. |
Data corrente: |
29/03/2011 |
Data da última atualização: |
26/02/2024 |
Tipo da produção científica: |
Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
Autoria: |
HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; IBELLI, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A.; CARDOSO, F. F. |
Afiliação: |
ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; ADRIANA MÉRCIA GUARATINI IBELLI, Bolsista Capes, CNPTIA; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL. |
Título: |
Análise de agrupamento de dados de expressão gênica na Rede Genômica Animal. |
Ano de publicação: |
2010 |
Fonte/Imprenta: |
Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. |
Páginas: |
11 p. |
Série: |
(Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 101). |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho é apresentar a análise de agrupamento de dados de expressão gênica, conforme realizada no escopo da ?Rede Genômica Animal?. Na seção 2, são apresentados conceitos básicos sobre análises de agrupamento. Em particular, os algoritmos de agrupamento utilizados nessas análises compreendem aqueles mais conhecidos, como k-means, SOM e agrupamento hierárquico. A plataforma de análise escolhida para realização das análises de agrupamento na ?Rede Genômica Animal? é o ambiente de análise estatística R (R DEVELOPMENT CORE TEAM, 2010) e o projeto Bioconductor (GENTLEMAN et al., 2004). Assim, na seção 3 é apresentado um exemplo completo de análise de agrupamento e seu respectivo script R. |
Palavras-Chave: |
Agrupamento de dados; Análise de componentes principais; Expressão gênica; PCA; Rede Genômica Animal. |
Thesagro: |
Análise Estatística. |
Thesaurus Nal: |
Algorithms; Gene expression; Principal component analysis; Statistical analysis. |
Categoria do assunto: |
-- X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/32433/1/ct101-10-4.pdf
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Marc: |
LEADER 01721nam a2200313 a 4500 001 1883623 005 2024-02-26 008 2010 bl uuuu u0uu1 u #d 100 1 $aHIGA, R. H. 245 $aAnálise de agrupamento de dados de expressão gênica na Rede Genômica Animal.$h[electronic resource] 260 $aCampinas: Embrapa Informática Agropecuária$c2010 300 $a11 p. 490 $a(Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 101). 520 $aO objetivo deste trabalho é apresentar a análise de agrupamento de dados de expressão gênica, conforme realizada no escopo da ?Rede Genômica Animal?. Na seção 2, são apresentados conceitos básicos sobre análises de agrupamento. Em particular, os algoritmos de agrupamento utilizados nessas análises compreendem aqueles mais conhecidos, como k-means, SOM e agrupamento hierárquico. A plataforma de análise escolhida para realização das análises de agrupamento na ?Rede Genômica Animal? é o ambiente de análise estatística R (R DEVELOPMENT CORE TEAM, 2010) e o projeto Bioconductor (GENTLEMAN et al., 2004). Assim, na seção 3 é apresentado um exemplo completo de análise de agrupamento e seu respectivo script R. 650 $aAlgorithms 650 $aGene expression 650 $aPrincipal component analysis 650 $aStatistical analysis 650 $aAnálise Estatística 653 $aAgrupamento de dados 653 $aAnálise de componentes principais 653 $aExpressão gênica 653 $aPCA 653 $aRede Genômica Animal 700 1 $aGIACHETTO, P. F. 700 1 $aYAMAGISHI, M. E. B. 700 1 $aIBELLI, A. M. G. 700 1 $aREGITANO, L. C. de A. 700 1 $aCARDOSO, F. F.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
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Volume |
Status |
URL |
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Registros recuperados : 131 | |
2. | | GIACHETTO, P. F. Transcriptoma do carrapato dos bovinos. In: ANDREOTI, R.; GARCIA, M. V.; KOLLER, W. W. (Ed.). Carrapatos na cadeia produtiva de bovinos. Brasília, DF: Embrapa, 2019. cap. 16, p. 205-222.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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4. | | ANDREOTTI, R.; GIACHETTO, P. F. Phylogenetic of phylogeographic relations of Rhipicephalus microplus ( Acari: ixodidae) in Brazil. In: AMERICAN ASSOCIATION OF VETERINARY PARASITOLOGISTS ANNUAL MEETING, 60.; LIVESTOCK INSECT WORKERS CON-FERENCE, 59.; INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ECTOPARASITES OF PETS, 13.,2015, Boston, MA. Parasitic Evolution Scientific Revolu-tion: Proceedings... Boston, MA: American Association of Veterinary Parasitologists, 2015. Resumo 146. 1 p.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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8. | | GIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H. Bioinformática aplicada à agricultura. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; ROMANI, L. A. S. (Ed.). Tecnologias da informação e comunicação e suas relações com a agricultura. Brasília, DF: Embrapa, 2014. Cap. 4. p. 67-83.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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9. | | GIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H. Bioinformatics applied to agriculture. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; ROMANI, L. A. S. (Ed.). Information and communication technologies and their relations with agriculture. Brasília, DF: Embrapa, 2016. ch. 4, p. 67-86.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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Registros recuperados : 131 | |
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