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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
25/03/2008 |
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Data da última atualização: |
05/07/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
LESCOT, M.; PIFFANELLI, P.; CIAMPI, A. Y.; RUIZ, M.; BLANC, G.; LEEBENS-MACK, J.; SILVA, F. R. da; SANTOS, C. M. R.; D'HONT, A.; GARSMEUR, O.; VILARINHOS, A. D.; KANAMORI, H.; MATSUMOTO, T.; RONNING, C. M.; CHEUNG, F.; HAAS, B. J.; ALTHOFF, R.; ARBOGAST, T.; HIRE, E.; PAPPAS JUNIOR, G.; SASAKI, T.; SOUZA JUNIOR, M. T.; MILLER, R. N. G.; GLASZMANN, J. C.; TOWN, C. D. |
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Afiliação: |
Magali Lescot, CIRAD/IBSM; Pietro Piffanelli, CIRAD/PADANO; Ana Y. Ciampi, CENARGEN; Manuel Ruiz, CIRAD; Guillaume Blanc, IGS; Jim Leebens-Mack, University of Georgia; Felipe R. da Silva, CENARGEN; Candice M. R. Santos, CENARGEN; Angélique D'Hont, CIRAD; Olivier Garsmeur, CIRAD; Alberto Duarte Vilarinhos, CNPMF; Hiroyuki Kanamori, RGP; Takashi Matsumoto, RGP; Catherine M. Ronning, J. Craig Venter Institute; Foo Cheung, J. Craig Venter Institute; Brian J. Haas, J. Craig Venter Institute; Ryan Althoff, J. Craig Venter Institute; Tammy Arbogast, J. Craig Venter Institute; Erin Hine, J. Craig Venter Institute; Georgios J. Pappas Junior, UCB; Takuji Sasaki, RGP; Manoel T. Souza Junior, CENARGEN; Robert N. G. Miller, UCB; Jean-Christophe Glaszmann, CIRAD; Christopher D. Town, J. Craig Venter Institute. |
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Título: |
Insights into the Musa genome: syntenic relationships to rice and between Musa species. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, London, v. 9, 2007. |
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Descrição Física: |
il. |
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ISSN: |
1471-2164 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Musa species (Zingiberaceae, Zingiberales) including bananas and plantains are collectively the fourth most important crop in developing countries. Knowledge concerning Musa genome structure and the origin of distinct cultivars has greatly increased over the last few years. Until now, however, no large-scale analyses of Musa genomic sequence have been conducted. This study compares genomic sequence in two Musa species with orthologous regions in the rice genome.We produced 1.4 Mb of Musa sequence from 13 BAC clones, annotated and analyzed them along with 4 previously sequenced BACs. The 443 predicted genes revealed that Zingiberales genes share GC content and distribution characteristics with eudicot and Poaceae genomes. Comparison with rice revealed microsynteny regions that have persisted since the divergence of the Commelinid orders Poales and Zingiberales at least 117 Mya. The previously hypothesized large-scale duplication event in the common ancestor of major cereal lineages within the Poaceae was verified. The divergence time distributions for Musa-Zingiber (Zingiberaceae, Zingiberales) orthologs and paralogs provide strong evidence for a large-scale duplication event in the Musa lineage after its divergence from the Zingiberaceae approximately 61 Mya. Comparisons of genomic regions from M. acuminata and M. balbisiana revealed highly conserved genome structure, and indicated that these genomes diverged circa 4.6 Mya. These results point to the utility of comparative analyses between distantly-related monocot species such as rice and Musa for improving our understanding of monocot genome evolution. Sequencing the genome of M. acuminata would provide a strong foundation for comparative genomics in the monocots. In addition a genome sequence would aid genomic and genetic analyses of cultivated Musa polyploid genotypes in research aimed at localizing and cloning genes controlling important agronomic traits for breeding purposes. MenosMusa species (Zingiberaceae, Zingiberales) including bananas and plantains are collectively the fourth most important crop in developing countries. Knowledge concerning Musa genome structure and the origin of distinct cultivars has greatly increased over the last few years. Until now, however, no large-scale analyses of Musa genomic sequence have been conducted. This study compares genomic sequence in two Musa species with orthologous regions in the rice genome.We produced 1.4 Mb of Musa sequence from 13 BAC clones, annotated and analyzed them along with 4 previously sequenced BACs. The 443 predicted genes revealed that Zingiberales genes share GC content and distribution characteristics with eudicot and Poaceae genomes. Comparison with rice revealed microsynteny regions that have persisted since the divergence of the Commelinid orders Poales and Zingiberales at least 117 Mya. The previously hypothesized large-scale duplication event in the common ancestor of major cereal lineages within the Poaceae was verified. The divergence time distributions for Musa-Zingiber (Zingiberaceae, Zingiberales) orthologs and paralogs provide strong evidence for a large-scale duplication event in the Musa lineage after its divergence from the Zingiberaceae approximately 61 Mya. Comparisons of genomic regions from M. acuminata and M. balbisiana revealed highly conserved genome structure, and indicated that these genomes diverged circa 4.6 Mya. These results point to the utility of comparative a... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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| Registros recuperados : 44 | |
| 2. |  | SAMPAIO, A. C. F.; SILVA, E. S.; CARMO, I. L. G. da S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; RIBEIRO, T. T. S.; MEDEIROS, R. D. de. Adubação potássica e local de semeadura do milho cultivado em sucessão a melancia no Cerrado de Roraima. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 3. | | SILVA, E. S. da; CARMO, I. L. G. da S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; MENEZES, P. H. S.; SILVA, J. A. da; MEDEIROS, R. D. de. Adubação de Ribumin na cultura da melancia no cerrado de Roraima. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGRONOMIA, 29., 2015, Foz do Iguaçu. Desafios e oportunidades profissionais: anais. Curitiba: CONFEA-PR, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 4. | | RIBEIRO, C. M. C.; SILVA, E. S.; CARMO, I. L. G. S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; TRASSATO, L. B.; MIRINIGO, E. E. V.; MEDEIROS, R. D. de. Comparação de dois anos de cultivo da soja em sistemas de plantio direto em sucessão ou não com a cultura do milho. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 7.; MERCOSOJA, 2015, Florianópolis. Tecnologia e mercado global: perspectivas para soja: anais. Londrina: Embrapa Soja, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 5. | | MENESES, P. H. S.; SILVA, E. S.; CARMO, I. L. D. da S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; SAMPAIO, A. C. F.; MEDEIROS, R. D. de. Consórcio soja-teca em sistema integração lavoura-pecuária-floresta. In: SEMANA NACIONAL DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA NO ESTADO DE RORAIMA, 10., 2015, Boa Vista. Resumos... Boa Vista, RR: UERR, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 6. | | MEDEIROS, R. D. de; SILVA, E. S.; CARMO, I. L. G. S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; TRASSATO, L. B.; SILVA, A. P.; MORINIGO, E. E. V. Consortium corn-teak in crop-livestock-forest integration system in the state of Roraima. In: CONGRESSO MUNDIAL SOBRE SISTEMAS DE INTEGRAÇÃO; SIMPÓSIO INTERNACIONAL SOBRE SISTEMAS DE INTEGRAÇÃO LAVOURA PECUÁRIA, 3., 2015, Brasília. Rumo à intensificação sustentável, 2015. Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 7. | | SILVA, E. S. da; CARMO, I. L. G. da S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; MEDEIROS, R. D. de; MENEZES, P. H. S. de; RODRIGUEZ, C. A. Características agronômicas de cultivares de melancia nas condições do cerrado de Roraima, Brasil. Scientia Agropecuaria, v. 8, n. 3, p.193-201, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 8. | | CARMO, I. L. G. da S.; SILVA, E. S. da; MONTEIRO NETO, J. L. L.; MEDEIROS, R. D. de; ALVES, A. K. S.; CUNHA, L. R. de A. Características das sementes em cultivares de melão no cerrado de Roraima. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGRONOMIA, 29., 2015, Foz do Iguaçu. Desafios e oportunidades profissionais: anais. Curitiba: CONFEA-PR, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 9. | | LIRA, A. A.; SILVA, E. S.; CARMO, I. L. G. S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; NASCIMENTO, F. R.; MEDEIROS, R. D. de. Características de sementes de doze cultivares de melancia. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SEMENTES, 19., 2015, Foz do Iguaçu. A Semente e a evolução tecnológica para os sistemas de produção: anais. Informativo ABRATES, Brasília, v. 25, n. 2, set. 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 10. | | SILVA, E. S. da; CARMO, I. L. G. da S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; COSTA, P. G.; MEDEIROS, R. D. de. Características de sementes de oito cultivares de melão. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SEMENTES, 19., 2015, Foz do Iguaçu. A Semente e a evolução tecnológica para os sistemas de produção: anais. Informativo ABRATES, Brasília, v. 25, n. 2, set. 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 11. | | MEDEIROS, R. D. de; SILVA, E. S.; CARMO, I. L. G. S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; TRASSATO, L. B.; SILVA, A. P.; NASCIMENTO, F. R. Corn response in consortium with cedar and chestnut integration system Crop-Livestock-Forest. In: CONGRESSO MUNDIAL SOBRE SISTEMAS DE INTEGRAÇÃO; SIMPÓSIO INTERNACIONAL SOBRE SISTEMAS DE INTEGRAÇÃO LAVOURA PECUÁRIA, 3., 2015, Brasília. Rumo à intensificação sustentável, 2015. Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 12. | | CARMO, I. L. G. S.; SILVA, E. S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; SILVA, A. P.; NASCIMENTO, F. R.; MORINIGO, E. E. V.; MEDEIROS, R. D. de. Cultivo da soja rotacionada com a cultura do arroz em sistema de plantio direto. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 7.; MERCOSOJA, 2015, Florianópolis. Tecnologia e mercado global: perspectivas para soja: anais. Londrina: Embrapa Soja, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 13. | | VENÂNCIO, J. B.; ARAÚJO, W. F.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; CHAGAS, E. A.; MENDES, P. dos S.; PRADO, R. J. do. Crescimento de cultivares de abacaxizeiro aclimatizado em diferentes substratos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 22., 2012, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: SBF, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 14. | | CARMO, I. L. G. S.; SILVA, E. S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; SILVA, A. P.; NASCIMENTO, F. R.; RIBEIRO, C. M. C.; MEDEIROS, R. D. de. Desempenho da soja em consórcio com teca no Sistema iLPF em dois anos de cultivo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 7.; MERCOSOJA, 2015, Florianópolis. Tecnologia e mercado global: perspectivas para soja: anais. Londrina: Embrapa Soja, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 15. | | MEDEIROS, R. D. de; SILVA, E. S. da; CARMO, I. L. G. da S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; SILVA, A. P. da; TRASSATO, L. B. Doses de nitrogênio e locais de semeadura do milho em sucessão ao meloeiro no segundo ano de cultivo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 16. | | VALE, H. S. do; SILVA, E. S. da; CARMO, I. L. G. da S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; SILVA, A. P. da; MEDEIROS, R. D. de. Doses de nitrogênio na produção de milho cultivado em sucessão ao meloeiro no Cerrado de Roraima. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 17. | | CASTRO, J. C.; SILVA, E. S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; CARMO, I. L. G. da S.; NASCIMENTO, F. R. do; MEDEIROS, R. D. de. Doses de potássio na cultura do milho em sucessão ao cultivo de melancia no Cerrado de Roraima. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 18. | | SAMPAIO, A. C. F.; SILVA, E. S. da; CARMO, I. L. G. da S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; MORINIGO, E. E. V.; MEDEIROS, R. D. de. Doses de fósforo e potássio na produção e qualidade de frutos de melancia no Cerrado de Roraima. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 19. | | MONTEIRO NETO, J. L. L.; LIMA, N. D.; CARMO, I. L. G. da S.; SILVA, E. S. da; SILVA, A. P.; MEDEIROS, R. D. de. Sucessão de culturas e doses de nitrogênio no rendimento da melancia em condições edafoclimáticas de Savana. Revista Agro@mbiente On-line, v. 10, n. 4, p. 309-316, out.-dez., 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 20. | | SILVA, B. C. L.; SILVA, E. S. da; CARMO, I. L. G. dA S.; MONTEIRO NETO, J. L. L.; NASCIMENTO, F. R. do; MEDEIROS, R. D. de. Sucessão de culturas e doses de nitrogênio no rendimento da melancia em segundo ano de cultivo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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