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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos. |
Data corrente: |
23/08/2023 |
Data da última atualização: |
24/08/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
LEÃO, U. S.; BUENO, L. G.; NEGREIROS, A. B.; SILVA, G. R.; MAGGIONI, R.; BRITTO. F. B.; SARMENTO, J. L. R.; GALVANI, D. B.; DINIZ, F. M. |
Afiliação: |
UESLEI S. LEÃO, Northeast Biotechnology Network (RENORBIO); UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ; LUICE GOMES BUENO GALVANI, CNPC; ALINE B. NEGREIROS, Northeast Biotechnology Network (RENORBIO); UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ; GEICE R. SILVA; RODRIGO MAGGIONI, INSTITUTE OF MARINE SCIENCES (LABOMAR), UNIVERSIDADE FEDERAL DO CEARÁ; FABIO B. BRITTO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ; JOSE L. R. SARMENTO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ; DIEGO BARCELOS GALVANI, CNPC; FABIO MENDONCA DINIZ, CNPC. |
Título: |
Unveiling the demographic background and genetic diversity of Urochloa mosambicensis (Poaceae) through genome-wide identification of simple sequence repeats and molecular marker development. |
Ano de publicação: |
2023 |
Fonte/Imprenta: |
Conservation Genetics Resources, v. 15, p. 1-9, Aug. 2023. |
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s12686-023-01312-8 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Abstract: The first set of simple sequence repeat (SSR) markers for Urochloa mosambicensis (Hack.) Dandy is described in this study. SSRs were isolated from a genomic library with 3491 contigs obtained by high-throughput sequencing. Primers were designed for twenty loci, and all primer pairs were successfully amplified in 39 genotypes, yielding an average of 4.95 alleles per locus. The mean polymorphic information content (PIC) was 0.559, and the mean discriminating power (DP) was 0.520 for all loci considering also all U. mosambicensis genotypes. The non?Bayesian clustering analysis has confirmed clustering consistency of the individuals and provides enough support for the existence of the pattern that also emerged from PCoA and UPGMA. These markers demonstrated potential transferability to U. advena, U. oligotricha, U. brachyura and U. xantholeuca. Our findings showed that the set of molecular markers described here have strong potential for fingerprinting and characterizing genetic diversity in intra-specific plant collections, whose breeding programs could be accelerated by the effective use of these molecular tools, not only in U. mosambicensis, but also within the genus Urochloa. |
Palavras-Chave: |
Capim-corrente; Genetic diversity; High-throughput sequencing; Microsatellites; Next-generation sequencing; SSR; Transferability. |
Thesagro: |
Capim Urochloa; Genética Molecular; Gramínea Forrageira; Marcador Genético; Marcador Molecular; Urochloa Mosambicensis. |
Thesaurus Nal: |
Forage grasses; Genetic markers; Molecular genetics; Plant genetics; Sequence analysis. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
Marc: |
LEADER 02618naa a2200445 a 4500 001 2156061 005 2023-08-24 008 2023 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s12686-023-01312-8$2DOI 100 1 $aLEÃO, U. S. 245 $aUnveiling the demographic background and genetic diversity of Urochloa mosambicensis (Poaceae) through genome-wide identification of simple sequence repeats and molecular marker development.$h[electronic resource] 260 $c2023 520 $aAbstract: The first set of simple sequence repeat (SSR) markers for Urochloa mosambicensis (Hack.) Dandy is described in this study. SSRs were isolated from a genomic library with 3491 contigs obtained by high-throughput sequencing. Primers were designed for twenty loci, and all primer pairs were successfully amplified in 39 genotypes, yielding an average of 4.95 alleles per locus. The mean polymorphic information content (PIC) was 0.559, and the mean discriminating power (DP) was 0.520 for all loci considering also all U. mosambicensis genotypes. The non?Bayesian clustering analysis has confirmed clustering consistency of the individuals and provides enough support for the existence of the pattern that also emerged from PCoA and UPGMA. These markers demonstrated potential transferability to U. advena, U. oligotricha, U. brachyura and U. xantholeuca. Our findings showed that the set of molecular markers described here have strong potential for fingerprinting and characterizing genetic diversity in intra-specific plant collections, whose breeding programs could be accelerated by the effective use of these molecular tools, not only in U. mosambicensis, but also within the genus Urochloa. 650 $aForage grasses 650 $aGenetic markers 650 $aMolecular genetics 650 $aPlant genetics 650 $aSequence analysis 650 $aCapim Urochloa 650 $aGenética Molecular 650 $aGramínea Forrageira 650 $aMarcador Genético 650 $aMarcador Molecular 650 $aUrochloa Mosambicensis 653 $aCapim-corrente 653 $aGenetic diversity 653 $aHigh-throughput sequencing 653 $aMicrosatellites 653 $aNext-generation sequencing 653 $aSSR 653 $aTransferability 700 1 $aBUENO, L. G. 700 1 $aNEGREIROS, A. B. 700 1 $aSILVA, G. R. 700 1 $aMAGGIONI, R. 700 1 $aBRITTO. F. B. 700 1 $aSARMENTO, J. L. R. 700 1 $aGALVANI, D. B. 700 1 $aDINIZ, F. M. 773 $tConservation Genetics Resources$gv. 15, p. 1-9, Aug. 2023.
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Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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Registros recuperados : 62 | |
41. | | SOUSA, Y. H. L. de; MACHADO, H. C.; MARTINS, F. E. B.; MUNIZ, E. N.; BOMFIM, M. A. D.; GALVANI, D. B.; MAGALHÃES, Y. A. Previsão do teor de proteína bruta e digestibilidade da silagem de mandioca por meio da espectroscopia NIR. Arquivos Latinoamericanos de Produção Animal, v. 24, supl. 1, p. 557-568, 2016. Resumo 739-1. Edición de las Memorias de la 25a. Reunión de la Asociación Latinoamericana de Producción Animal (ALPA), 2016, Recife, Brasil.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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42. | | LIMA, A. C. A.; BUENO, L. G.; LIMA, B. S. L. de; SANTOS, M. de F. N. dos; GALVANI, D. B.; DINIZ, F. M. Variabilidade de acessos de Urochloa mosambicensis para altura de plantas e densidade populacional de perfilhos em época seca no Semiárido. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CAPRINOS E OVINOS, 9., 2020, Sobral. Anais... Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2021. p. 21-22. Embrapa Caprinos e Ovinos. Documentos, 140).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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43. | | MAGALHÃES, Y. A.; MACHADO, H. C.; MARTINS, F. E. B.; MUNIZ, E. N.; BOMFIM, M. A. D.; GALVANI, D. B.; COSTA, H. H. A.; SOUSA, Y. H. L. de. Avaliação da qualidade da fermentação de silagem de mandioca por meio da espectroscopia NIR. Arquivos Latinoamericanos de Produção Animal, v. 24, supl. 1, p. 421-422, 2016. Resumo 93-3. Edición de las Memorias de la 25a. Reunión de la Asociación Latinoamericana de Producción Animal (ALPA), 2016, Recife, Brasil.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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44. | | COSTA, H. H. A.; SALIBA, E. de O. S.; GALVANI, D. B.; BOMFIM, M. A. D.; BORGES, I.; LANA, A. M. Q.; BORGES, A. L. C. C.; LANDIM, A. V. Consumo diferenciado por ovinos em uma pastagem nativa da Caatinga no Semiárido do Brasil, suplementados com sulfato de zinco ou propilenoglicol. Arquivos Latinoamericanos de Produção Animal, v. 24, supl. 1, p. 486, 2016. Resumo 433-1. Edición de las Memorias de la 25a. Reunión de la Asociación Latinoamericana de Producción Animal (ALPA), 2016, Recife, Brasil.Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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45. | | MAGALHÃES, Y. A.; COSTA, H. H. A.; SALIBA, E. de O. S.; GALVANI, D. B.; LANDIM, A. V.; LIMA, L. D. de; BOMFIM, M. A. D.; SILVA, F. A. e. Composição química da carne de ovinos terminados em pastagem nativa da Caatinga durante suplementados com sulfato de zinco ou propilenoglicol. Arquivos Latinoamericanos de Produção Animal, v. 24, supl. 1, p. 277-278, 2016. Resumo 93-1. Edición de las Memorias de la 25a. Reunión de la Asociación Latinoamericana de Producción Animal (ALPA), 2016, Recife, Brasil.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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46. | | BUENO, L. G.; ALVES, M. M. de A.; ROCHA, J. E. da S.; CAVALCANTE, A. C. R.; GALVANI, D. B.; DINIZ, F. M.; VALLE, C. B. do; CÂNDIDO, M. J. D. Caracterização morfogênica de Urochloa mosambicensis para seleção de genótipos elite em programa de melhoramento de forrageiras. Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2019. 19 p. (Embrapa Caprinos e Ovinos. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 11).Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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47. | | ROGERIO, M. C. P.; BORGES, I.; FERREIRA, A. L.; MACHADO, F. S.; POMPEU, R. C. F. F.; GUEDES, L. F.; COSTA, C. dos S.; GUEDES, F. L.; GALVANI, D. B. Especificações padrões para mensurações de gases de efeito estufa e metabolismo de pequenos ruminantes no bioma Caatinga. Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2019. 24 p. (Embrapa Caprinos e Ovinos. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 13).Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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48. | | GOUVEA, V. N.; BATISTEL, F.; SOUZA, J.; CHAGAS, L. J.; SITTA, C.; CAMPANILI, P. R. B.; GALVANI, D. B.; PIRES, A. V.; OWENS, F. N.; SANTOS, F. A. P. Flint corn grain processing and citrus pulp level in finishing diets for feedlot cattle. Journal of Animal Science, v. 94, n. 2, p. 665-677, Feb. 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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49. | | POMPEU, R. C. F. F.; TAVARES, R. de K. O.; MARANGUAPE, J. S.; VASCONCELOS, B. F.; SOUZA, H. A. de; GUEDES, F. L.; BUENO, L. G.; MESQUITA, R. O.; CÂNDIDO, M. J. D.; ROGERIO, M. C. P.; GALVANI, D. B. Genótipos de capim-corrente em condições de luminosidade para sistemas integrados no Semiárido brasileiro. Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2023. 40 p. (Embrapa Caprinos e Ovinos. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 23).Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Meio-Norte. |
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50. | | TELES, A. I. M.; COSTA, H. H. A.; COSTA, A. C.; FERRO, T. B. de M.; SOUSA, D. R. de; SALIBA, E. de O. S.; GALVANI, D. B.; LANDIN, A. V. Características qualitativas da carcaça de cordeiros terminados em pastagem nativa da Caatinga, submetidos a diferentes suplementações de sal mineral. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 9., 2014, Ilhéus. Produção animal: novas diretrizes. Ilhéus: SNPA, 2014. 3 f.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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51. | | COSTA, H. H. A.; SALIBA, E. de O. S.; GALVANI, D. B.; LANDIM, A. V.; BORGES, I.; MOTA, C. M.; SILVA, C. R. da M. e; COSTA, A. C. Desempenho produtivo e características de carcaça de ovinos terminados em pastagem nativa da Caatinga submetidos a diferentes suplementações de sal mineral. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 9., 2014, Ilhéus. Produção animal: novas diretrizes; trabalhos apresentados. Ilhéus: SNPA, 2014. 3 f.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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52. | | POMPEU, R. C. F. F.; ARAÚJO, R. A. de; LUCAS, R. C.; NEIVA, J. N. M.; EGITO, A. S. do; CÂNDIDO, M. J. D.; ROGERIO, M. C. P.; PEREIRA, P. L.; XIMENES, L. V.; GALVANI, D. B.; SALLES, H. O. Destoxificação da torta de mamona por processos químicos alcalinos em escala semi-industrial e seu uso na alimentação de pequenos ruminantes. Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2019. 31 p. (Embrapa Caprinos e Ovinos. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 9).Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
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53. | | COSTA, H. H. A.; SALIBA, E. O. S.; GALVANI, D. B.; LANDIM, A. V.; LIMA, L. D. de; BOERGES, A. L. C. C.; BOMFIM, M. A. D.; BORGES, I.; SILVA, F. A. Efeito da suplementação com sulfato de zinco ou propilenoglicol em ovinos em uma pastagem nativa da Caatinga no período chuvoso: desempenho, características da carcaça e da carne. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, v. 70, n. 1, p. 993-1003, 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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54. | | COSTA, H. H. A.; ROGERIO, M. C. P.; MUIR, J. P.; ALVES, A. A.; GALVANI, D. B.; POMPEU, R. C. F. F.; LANDIM, A. V.; CARNEIRO, M. S. de S. Nutritional evaluation of lamb diets in a tropical setting formulated according to NRC (1985) and NRC (2007) specifications. Small Ruminant Research, Amsterdam, v. 113, n. 1, p. 20-29, June, 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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55. | | FONTELES, N. L. de O.; BOMFIM, M. A. D.; BRITO, E. de S.; GALVANI, D. B.; FACO, O.; FERREIRA, A. M. F.; OLIVEIRA, K. da S.; GONÇALVES, J. de L. Perfil de ácidos graxos e potencial antioxidante do leite de cabras leiteiras alimentadas com pedúnculo de caju e níveis crescentes de óleo de soja. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 7.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 13., 2012, Maceió. Anais... Maceió: Sociedade Nordestina de Produção Animal, 2012. 3 f. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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56. | | COSTA, H. H. A.; SALIBA, E. de O. S.; GALVANI, D. B.; LANDIM, A. V.; LIMA, L. D. de; BOMFIM, M. A. D.; BATISTA, A. S. M.; MOTA, C. M. Peso e rendimento dos componentes não-carcaça de ovinos terminados em pastagem nativa da Caatinga, submetidos a diferentes suplementações de sal mineral. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 9., 2014, Ilhéus. Produção animal: novas diretrizes; trabalhos apresentados. Ilhéus: SNPA, 2014. 3 f.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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57. | | COSTA, H. H. A.; SALIBA, E. de O. S.; GALVANI, D. B.; LANDIM, A. V.; LIMA, L. D. de; BOMFIM, M. A. D.; SILVA, F. A. e; SILVA, C. R. da M. e. Peso e rendimento dos cortes comerciais de ovinos em pastagem nativa da Caatinga, submetidos a diferentes suplementações de sal mineral. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 9., 2014, Ilhéus. Produção animal: novas diretrizes; trabalhos apresentados. Ilhéus: SNPA, 2014. 3 f.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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58. | | MARTINS, F. E. B.; BOMFIM, M. A. D.; GALVANI, D. B.; FERNANDES, A. M. F.; SANTOS, S. F. dos; DUTRA, M. de S.; COSTA, H. H. A.; MACHADO, H. C. Explorando o uso da espectroscopia do infravermelho próximo para prever a proteína bruta do milho. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 12., 2017, Juazeiro, BA. Construindo pontes entre o ensino, a pesquisa e a extensão: anais. Petrolina: Univasf: Embrapa Semiárido: Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia, Sertão de Pernambuco, 2017. 1 CD-ROM. p. 1091-1093.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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59. | | BOMFIM, M. A. D.; BATISTA, A. M. V.; MEDEIROS, A.; MACIEL, M. do V.; SILVA, J. K.; CAVALCANTE, A. C. R.; GALVANI, D. B.; MARTINS, F. E. B.; STEPHEN PRINCE, S. Exploratory analysis of fecal NIR spectra similarity of goats and sheep grazing Brazilian Northeastern rangelands. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON NEAR INFRARED SPECTROSCOPY, 17., 2015, Foz do Iguassu. Book of abstracts. [S.l]: International Council for Near Infrared Spectroscopy, 2015.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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60. | | BOMFIM, M. A. D.; MEDEIROS, A. N.; BATISTA, A. M. V.; SILVA, J. K.; MACIEL, M. do V.; CAVALCANTE, A. C. R.; GALVANI, D. B.; SANTOS, S. F. dos; ANGERER, J. Exploratory data assessment of fecal NIRS from small ruminants: toward a global model to Brazilian Northeastern rangelands. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON NEAR INFRARED SPECTROSCOPY, 17., 2015, Foz do Iguassu. Book of abstracts. [S.l]: International Council for Near Infrared Spectroscopy, 2015.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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