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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
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Data corrente: |
15/03/2021 |
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Data da última atualização: |
10/08/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BOARI, A. de J.; QUADROS, A. F. F.; KAUFFMANN, C. M.; PANTOJA, K. F. C.; GOMES JUNIOR, R. A.; FREIRE FILHO, F. R.; OLIVEIRA, R. P. de; CORDOVIL, G. A.; GAVINHO, B. E. S.; KITAJIMA, E. W.; BLAWID, R.; NAGATA, T. |
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Afiliação: |
ALESSANDRA DE JESUS BOARI, CPATU; AYANE F. F. QUADROS, UFRA; CATERYNNE M. KAUFFMANN, UFRA; KÉSSIA F. C. PANTOJA, Univesidade Estadual de São Paulo; RUI ALBERTO GOMES JUNIOR, CPATU; FRANCISCO RODRIGUES FREIRE FILHO, CPATU; RAIMUNDO PARENTE DE OLIVEIRA, CPATU; GABRIELE A. CORDOVIL, UFRA; BRENDA E. S. GAVINHO, UFRA; ELLIOT W. KITAJIMA, ESALQ/USP; ROSANA BLAWID, Universidade Federal Rural de Pernambuco; TATSUYA NAGATA, UNB. |
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Título: |
Near-complete genome sequence of cowpea severe mosaic virusin South America and reduced yardlong bean production dueto the viral infection. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Tropical Plant Pathology, v. 46, n. 4, p. 487-491, Aug. 2021. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s40858-021-00420-w |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The sequence of a near-complete genome (two RNA segments) of cowpea severe mosaic virus (CpSMV) in the Comovirus genus is revealed in South America. High-throughput sequencing (HTS) was performed using total RNA extracted from partially purified virus preparations obtained from infected yardlong bean leaves (Vigna unguiculata subsp. sesquipedalis), collected in Santa Izabel, state of Pará, Brazil. The YLB (yardlong bean) isolate has an RNA-1 with 5896 nucleotides (nt) and an RNA-2 with 3515 nt, showing 74.2% and 67.9% identity, respectively, with the CpSMV-DG isolate sequences from the USA, the only complete genome available so far. Despite the low percentage in nt identity, the amino acid (aa) sequence of the viral protease together with the RNA-dependent RNA polymerase (Pro/RdRp) and the large and small coat proteins (CP-L/CP-S), used as species demarcation criteria of the Secoviridae family, showed 92.2% (Pro-RdRp) and 85.6% (CP-L/CL-S) identities between DG and YLB isolates sequences. The nucleotide identity of partial RNA-1 sequences of 2199 nt (part of the helicase, VPg, Pro, and 2/3 of the RdRP) varied from 95.1 to 95.3% among YLB and eleven isolates from Brazil available on GenBank. Phylogenetic analysis based on this 2199 nt sequence revealed that the YLB isolate was positioned in a different clade compared to other CpSMV isolates. An estimate of damage caused by CpSMV under experimental conditions revealed a reduction of 39.4% in the total number of pods and 54.3% in the total number of grains, regardless of the yardlong bean cultivar evaluated. The reduction of total weight of the grains by CpSMV infection was dependent on the cultivar and was higher in cv. De metro (66.2%) than in cv. Slin (38.9%). MenosThe sequence of a near-complete genome (two RNA segments) of cowpea severe mosaic virus (CpSMV) in the Comovirus genus is revealed in South America. High-throughput sequencing (HTS) was performed using total RNA extracted from partially purified virus preparations obtained from infected yardlong bean leaves (Vigna unguiculata subsp. sesquipedalis), collected in Santa Izabel, state of Pará, Brazil. The YLB (yardlong bean) isolate has an RNA-1 with 5896 nucleotides (nt) and an RNA-2 with 3515 nt, showing 74.2% and 67.9% identity, respectively, with the CpSMV-DG isolate sequences from the USA, the only complete genome available so far. Despite the low percentage in nt identity, the amino acid (aa) sequence of the viral protease together with the RNA-dependent RNA polymerase (Pro/RdRp) and the large and small coat proteins (CP-L/CP-S), used as species demarcation criteria of the Secoviridae family, showed 92.2% (Pro-RdRp) and 85.6% (CP-L/CL-S) identities between DG and YLB isolates sequences. The nucleotide identity of partial RNA-1 sequences of 2199 nt (part of the helicase, VPg, Pro, and 2/3 of the RdRP) varied from 95.1 to 95.3% among YLB and eleven isolates from Brazil available on GenBank. Phylogenetic analysis based on this 2199 nt sequence revealed that the YLB isolate was positioned in a different clade compared to other CpSMV isolates. An estimate of damage caused by CpSMV under experimental conditions revealed a reduction of 39.4% in the total number of pods and 54.3% ... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Feijão; Genoma; Vigna Unguiculata; Vírus. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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| Registros recuperados : 548 | |
| 521. |  | CANELLAS, L. P.; ESPINDOLA, J. A. A.; REZENDE, C. E.; CAMARGO, P. B. de; ZANDONADI, D. B.; RUMJANEK, V. M.; GUERRA, J. G. M.; TEIXEIRA, M. G.; BRAZ-FILHO, R. Organic matter quality in a soil cultivated with perennial herbaceous legumes. Scientia Agricola, Piracicaba, v. 61, n. 1, p. 53-61, jan./fev. 2004. Qualidade da matéria orgânica de um solo cultivado com leguminosas herbáceas perenes.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 524. | | RUMJANEK, N. G.; ZILLI, J. E.; RANGEL, F. W.; PASSOS, S. R.; MARTINS, C. M.; FERREIRA, E. P. de B.; ABOIM, M. C. R.; VINCENTIN, R.; GUERRA, J. G. M.; XAVIER, G. R. Uso do Meio Solo e PCR/DGGE como estratégia para caracterização da comunidade bacteriana. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2008. 27p. (Embrapa Agrobiologia. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 31).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia; Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 525. | | PIMENTA, A. G.; GUERRA, J. G. M.; GOULART, J. M.; SOUZA, L. R. M. de; GARCIA, A. J.; SILVA, D. G. da; ARAUJO, E. da S.; ESPINDOLA, J. A. A. Produção de mudas orgânicas de beterraba em substrato .comercial enriquecido com composto vegetal fermentado In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 22., 2022, Seropédica. Bicentenário da Independência: 200 anos de ciência, tecnologia e inovação no Brasil: caderno de resumos... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2022.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 526. | | SOARES, J. P. G.; DIAS, J.; ALMEIDA, D. L. de; GUERRA, J. G. M.; SILVA, S. N. da; OLIVEIRA, A. D. de; SALMAN, A. K. D.; COSTA, J. R. da. Produção orgânica de capim elefante em consórcio com siratro sob manejo de cortes. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2006. 4 p. Trabalho apresentado no IV Congresso Brasileiro de Agroecologia, Belo Horizonte/MG, 20 a 24 de novembro de 2006.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 527. | | SOARES, J. P. G.; DIAS, J.; ALMEIDA, D. L. de; GUERRA, J. G. M.; SILVA, S. N. da; OLIVEIRA, A. D. de; SALMAN, A. K. D.; ROUWS, J. R. C. Produção orgânica de capim elefante em consórcio com siratro sob manejo de cortes. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROECOLOGIA, 4., 2006, Belo Horizonte. Construindo horizontes sustentáveis: anais. Belo Horizonte: Emater-MG, 2006. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 528. | | SOARES, J. P. G.; SALMAN, A. K. D.; DIAS, J.; ALMEIDA, D. L. de; GUERRA, J. G. M.; SILVA, S. N. da; OLIVEIRA, A. D. de; COSTA, J. R. Produção orgânica de capim-elefante em consórcio com siratro sob manejo de cortes. In: REUNIÃO AMAZÔNICA DE AGROECOLOGIA, 1., 2007, Manaus. A agroecologia no contexto amazônico: palestras, relatos de experiência e resumos. Manaus: Embrapa Amazônia Ocidental, 2007. 1 CD ROM. Parceria: Embrapa Agrobiologia.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 529. | | OLIVEIRA, F. L. de; GUERRA, J. G. M.; ALMEIDA, D. L. de; SILVA, E. E. da; JUNQUEIRA, R. M.; RIBEIRO, R. de L. D.; ESPÍNDOLA, J. A. A.; SILVA, V. V. Produção orgânica de inhame (Colocasia esculenta) no sistema plantio direto: Efeito de doses crescentes de "cama" de aviário em adubação verde. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2005. 4 p. (Embrapa Agrobiologia. Comunicado Técnico, 81).| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 530. | | CORDEIRO, A. A. do S.; GUERRA, J. G. M.; ARAUJO, E. da S.; ESPINDOLA, J. A. A.; SILVA NETO, E. C.; GONÇALVES JÚNIOR, M.; ALMEIDA, L. H. M. de. Produção de biomassa seca de plantas de cobertura do solo, nas condições da Baixada Fluminense, RJ. Cadernos de Agroecologia, 15, n. 2, 2020 Anais do XI Congresso Brasileiro de Agroecologia, São Cristóvão, Sergipe| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
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| 533. | | PADOVAN, M. P.; ALMEIDA, D. L. de; GUERRA, J. G. M.; RIBEIRO, R. de L. D.; OLIVEIRA, F. L. de; SANTOS, L. A.; ALVES, B. J. R.; SOUTO, S. M. Soja cultivar celeste: uma boa alternativa de adubação verde para culturas de ciclo curto. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2004. 20 p. (Embrapa Agrobiologia. Documentos, 175).| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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