Data/hora: 01/06/2024 16:35:32

Biblioteca(s): | Embrapa Agricultura Digital.
Data corrente: | 09/03/2007
Data da última atualização: | 17/05/2017
Autoria: | FILETO, R.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; RIBEIRO, A. A.; QUINALIA, T. G.; FRANCO, E. H.; MANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; OLIVEIRA, S. R. M.; SANTOS, E. H.; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; CRUZ, S. A. B.; NESHICH, G.
Afiliação: | RENATO FILETO; PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; ANDRÉ A. RIBEIRO; THIAGO G. QUINALIA; EDUARDO H. FRANCO; ADAUTO LUIZ MANCINI, CNPTIA; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; STANLEY ROBSON DE MEDEIROS OLIVEIRA, CNPTIA; EDGARD HENRIQUE DOS SANTOS, CNPTIA; FABIO DANILO VIEIRA, CNPTIA; IVAN MAZONI, CNPTIA; SERGIO APARECIDO BRAGA DA CRUZ, CNPTIA; GORAN NESHICH, CNPTIA.
Título: | PDB-Metrics: a web tool for exploring the PDB contents.
Ano de publicação: | 2006
Fonte/Imprenta: | Genetics and Molecular Research, v. 5, n. 2, p. 333-341, 2006.
Idioma: | Inglês
Conteúdo: | Abstract. PDB-Metrics (http://sms.cbi.cnptia.embrapa.br/SMS/pdb_metrics/index.html) is a component of the Diamond STING suite of programs for the analysis of protein sequence, structure and function. It summarizes the characteristics of the collection of protein structure descriptions deposited in the Protein Data Bank (PDB) and provides a Web interface to search and browse the PDB, using a variety of alternative criteria. PDB-Metrics is a powerful tool for bioinformaticians to examine the data span in the PDB from several perspectives. Although other Web sites offer some similar resources to explore the PDB contents, PDB-Metrics is among those with the most complete set of such facilities, integrated into a single Web site. This program has been developed using SQLite, a C library that provides all the query facilities of a database management system.
Palavras-Chave: | Banco de dados de proteína; Bioinformática; PDB data distribution statistics; Protein Data Bank.
Thesaurus Nal: | Bioinformatics; Proteins.
Categoria do assunto: | X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
URL: | http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/159948/1/AP-PDB-Metrics-Fileto-GMR-2006.pdf
Registro original: | Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)

Exemplares:

CNPTIA - (11425-1) - UPC - AP - -- -  -  - 2007.00013 - DES
CNPTIA - (11425-2) - UPC - AP - DD -  -  -  - DIS