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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
24/08/2018 |
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Data da última atualização: |
25/02/2019 |
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Autoria: |
FARAH, M. M.; FORTES, M. R. S.; KELLY, M.; POTO-NETO, L. R.; MEIRA, C. T.; CARREÑO, L. O. D.; FONSECA, R. da; MOORE, S. S. |
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Afiliação: |
Michel Marques Farah, Universidade Estadual Paulista - Unesp/Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias; Marina Rufino Salinas Fortes, The University of Queensland/School of Chemistry and Molecular Biosciences; Matthew Kelly, Australian Agricultural Company, Corporate Office; Laercio Ribeiro Porto-Neto, Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation/Queensland Bioscience Precinct; Camila Tangari Meira, Universidade Estadual Paulista - Unesp/Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias; Luis Orlando Duitama Carreño, Universidade Estadual Paulista - Unesp/Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias; Ricardo da Fonseca, Universidade Estadual Paulista - Unesp/Faculdade de Ciências Agrárias e Tecnológicas; Stephen Stewart Moore, The University of Queensland, Queensland Alliance for Agriculture and Food Innovation/Centre for Animal Science/Queensland Bioscience Precint. |
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Título: |
Accuracy of genomic selection predictions for hip height in Brahman cattle using different relationship matrices. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 53, n. 6, p. 717-726, June, 2018. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Título em português: Acurácia da predição genômica para altura do quadril em bovinos Brahman com uso de diferentes matrizes de parentesco. |
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Conteúdo: |
The objective of this work was to evaluate the effects of genomic information on the genetic evaluation of hip height in Brahman cattle using different matrices built from genomic and pedigree data. Hip height measurements from 1,695 animals, genotyped with high-density SNP chip or imputed from 50 K high-density SNP chip, were used. The numerator relationship matrix (NRM) was compared with the H matrix, which incorporated the NRM and genomic relationship (G) matrix simultaneously. The genotypes were used to estimate three versions of G: observed allele frequency (HGOF), average minor allele frequency (HGMF), and frequency of 0.5 for all markers (HG50). For matrix comparisons, animal data were either used in full or divided into calibration (80% older animals) and validation (20% younger animals) datasets. The accuracy values for the NRM, HGOF, and HG50 were 0.776, 0.813, and 0.594, respectively. The NRM and HGOF showed similar minor variances for diagonal and off-diagonal elements, as well as for estimated breeding values. The use of genomic information resulted in relationship estimates similar to those obtained based on pedigree; however, HGOF is the best option for estimating the genomic relationship matrix and results in a higher prediction accuracy. The ranking of the top 20% animals was very similar for all matrices, but the ranking within them varies depending on the method used. |
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Palavras-Chave: |
Alelo raro; Genômica. |
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Thesagro: |
Bos Indicus; Gado de Corte. |
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Thesaurus Nal: |
Beef cattle; Genomics; Zebu. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/181931/1/Accuracy-of-genomic-selection-predictions-for-hip.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
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| Registros recuperados : 24 | |
| 3. |  | SCHMIDT, F.; SOUSA, R. O.; FORTES, M. A.; WESZ, J.; BUSS, L. G.; SCIVITTARO, W. B. Dinâmica da redução de um planossolo alagado em função de diferentes manejos de água. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR, UEL, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 4. | | FORTES, G. R. de L.; FREITAS, F. de O.; FORTES, M. A.; VALLS, J. F. M. Uso de técnicas de germinação in vitro no resgate de acessos de amendoim - Arachis hypogaea, submetidos a estresse durante a conservação. In: ENCONTRO LATINO AMERICANO DE ESPECIALISTAS EM ARACHIS, 4., 2004, Brasília, DF. IV Encontro Latino-Americano de Especialistas em Arachis. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2004. Não paginado. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 127).| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 6. | | FARAH, M. M.; FORTES, M. R. S.; KELLY, M.; POTO-NETO, L. R.; MEIRA, C. T.; CARREÑO, L. O. D.; FONSECA, R. da; MOORE, S. S. Accuracy of genomic selection predictions for hip height in Brahman cattle using different relationship matrices. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 53, n. 6, p. 717-726, June, 2018. Título em português: Acurácia da predição genômica para altura do quadril em bovinos Brahman com uso de diferentes matrizes de parentesco.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 7. | | KASARAPU, P.; PORTO-NETO, L. R.; FORTES, M. R. S.; LEHNERT, S. A.; MUDADU, M. de A.; COUTINHO, L.; REGITANO, L. C. de A.; GEORGE, A.; REVERTER, A. The Bos taurus-Bos indicus balance in fertility and milk related genes. Plos One, v. 12, n. 8, p. 1-20, 2017. Artigo e0181930. Na publicação: Mauricio A. Mudadu, Luciana Regitano.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 8. | | UTSUNOMIYA, Y. T.; MILANESI, M.; FORTES, M. R. S.; PORTO?NETO, L. R.; UTSUNOMIYA, A. T. H.; SILVA, M. V. G. B.; GARCIA, J. F.; AJMONE-MARSAN, P. Genomic clues of the evolutionary history of Bos indicus cattle. Animal Genetics, v. 50, n. 6, p. 557-568, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 9. | | BUSS, G. L.; FORTES, M. A.; WESZ, J.; SCHMIDT, F.; WOLTER, R. C. D.; SOUZA, S. O.; GOMES, A. da S. Formas de fósforo em planossolo cultivado com soja sob diferentes manejos da adubação fosfatada e a nutrição por fósforo do arroz subsequente. In: REUNIÃO SUL-BRASILEIRA DE CIÊNCIA DO SOLO, 7., 2008, Santa Maria. anais...Santa Maria: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, Núcleo Regional Sul, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 10. | | FORTES, M. A, BUSS, G. I.; SCHMIDT, F.; WOLTER, R. C. D.; SOUSA, R. O.; FERREIRA, L. H.; CHIARELO, C.; OSANES, L. S.; GOMES, A. da S.; SCIVITTARO, W. B. Adubação fosfatada para o arroz irrigado em resteva de milho e soja em um planossolo Háplico. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR, UEL, 2008. 1 CD-ROM. 1 CD-ROM| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 11. | | FORTES, M. A.; BUSS, G. L.; WESZ, J.; SCHMIDT, R. C. D.; SOUSA, R. O.; FERREIRA, L. H.; CHIARELO, C.; OSSANES, L. S.; GOMES, A. da S.; SCIVITTARO, W. B. Adubação fosfatada para o arroz irrigado em resteva milho e soja em um planossolo háplico. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR, UEL, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 12. | | CURI, R. A.; KRAUSKOPF, M. K.; HADLICH, J. C.; FORTES, M. R. S.; VANKAN, D. M.; SILVA, J. A. V.; OLIVEIRA, H. N. de; MOTA, M. D. S. da. Candidate SNPs for carcass and meat traits in Nelore animals and in their crosses with Bos taurus. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 47, n. 2, p. 294-302, fev. 2012. Título em português: SNPs candidatos para características da carcaça e da carne em Nelore e nos seus cruzamentos com Bos taurus.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 13. | | WESZ, J.; SOUSA, R. O. de; GOMES, A. da S.; PEREIRA, R. S. D.; WINKLER, A. S.; CHIARELO, C.; SCHMIDT, F.; FORTES, M. A.; SCIVITTARO, W. B.; FERREIRA, L. H. G. Disponibilidade de fósforo para o arroz irrigado em planossolo háplico, adubado com superfosfato tripo e fosfato natural. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 5.; REUNIÃO DA CULTURA DO ARROZ IRRIGADO, 27., 2007, Pelotas. Anais... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2007. v. 1, p. 514-517| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 14. | | KASARAPU, P.; PORTO NETO, L. R.; FORTES, M. R. S.; LEHNERT, S. A.; MUDADU, M. de A.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.; GEORGE, A.; REVERTER, A. The Bos taurus-Bos indicus balance in fertility and milk related genes. PLOS one, v. 12, n. 8, p. 1-20, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 15. | | GOUVEIA, G. C.; RIBEIRO, V. M. P.; FORTES, M. R. S.; RAIDAN, F. S. S.; REVERTER, A.; PORTO-NETO, L. R.; MORAES, M. M. de; GONÇALVES, D. R.; SILVA, M. V. G. B.; TORAL, F. L. B. Unravelling the genetic variability of host resilience to endo and ectoparasites in Nellore commercial herds. Genetics Selection Evolution, v. 55, article 81, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 16. | | WELLER, M. M. D. C. A.; FORTES, M. R. S.; MARCONDES, M. I.; ROTTA, P. P.; GIONBELI, T. R. S.; VALADARES FILHO, S. C.; CAMPOS, M. M.; SILVA, F. F.; SILVA, W.; MOORE, S.; GUIMARÃES, S. E. F. Effect of maternal nutrition and days of gestation on pituitary gland and gonadal gene expression in cattle. Journal of Dairy Science, v. 99, n. 4, p. 3056-3071, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 17. | | DUARTE, D. A. S.; FORTES, M. R. S.; DUARTE, M. de S.; GUIMARÃES, S. E. F.; VERARDO, L. L.; VERONEZE, R.; RIBEIRO, A. M. F.; LOPES, P. S.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e. Genome-wide association studies, meta-analyses and derived gene network for meat quality and carcass traits in pigs. Animal Production Science, v. 58, n. 6, p. 1100-1008, May 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 18. | | CURI, R. A.; FORTES, M. R. S.; CHARDULO, L. A. L.; SILVEIRA, A. C.; DE BENI ARRIGONE, M.; MARTINS, C. L.; ASSUMPÇÃO, M. E. O. D'A.; OLIVEIRA, H. N. de. Genetic polymorphisms related to meat traits in purebred and crossbred Nelore cattle. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 44, n. 12, p. 1660-1666, dez. 2009 Título em português: Polimorfi smos genéticos relacionados às características da carne em bovinos Nelore puros e cruzados.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 19. | | FORTES, M. A.; WESZ, J.; BUSS, G. L.; SCHMIDT, F.; WOLTER, R. C. D.; SOUSA. R. O.; GAMES, A. da G.; SCIVITTARO, W. B.; FERREIRA, L. H.; SANTOS, L. O.; CHIARELO, C. Formas de fósforo em planossolo cultivado em milho sob diferentes manejos de adubação fosfatada e e nutrição por fósforo do arroz subseqüente. In: REUNIÃO SUL-BRASILEIRA DE CIÊNCIA DO SOLO, 7., 2008, Santa Maria. anais...Santa Maria: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, Núcleo Regional Sul, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 20. | | FORTES, M. de A.; SOUSA, R. O. de; GOMES, A. da S.; SCHMIDT, F.; SCIVITTARO, W. B.; FERREIRA, L. H. G.; TEIXEIRA, J. B. da S.; VEÇOZZI, T. A. Phosphorus Availability for Irrigated Rice Cultivated Under No-Tillage and Different Phosphate Sources. Journal of Agricultural Science, v. 10, n. 5, p. 276-287, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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