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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos. |
Data corrente: |
11/01/2013 |
Data da última atualização: |
13/07/2016 |
Autoria: |
UTSUNOMIYA, A. T. H.; VAZ, R. I.; PIRES, M. P.; ONO, R. K.; FONSECA, R. da. |
Título: |
Desenvolvimento de um software-livre para simulação em melhoramento genético animal. |
Ano de publicação: |
2005 |
Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO INTERNACIONAL DE ZOOTECNIA, 7.; CONGRESSO NACIONAL DE ZOOTECNIA, 10.; REUNIÃO NACIONAL DE ENSINO DE ZOOTECNIA, 11.; FÓRUM DE ENTIDADES DE ZOOTECNIA, 28.; FÓRUM DE COORDENADORES DE CURSOS DE ZOOTECNIA DAS UNIVERSIDADES BRASILEIRAS, 1., 2005, Campo Grande, MS. Zootec 2005: produção animal e responsabilidade. Campo Grande, MS: ABZ: UEMS: UFMS: CPAP: MAPA, 2005. 1 CD ROM. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Resumo: O desenvolvimento de um simulador sobre o modelo de software-livre fornece uma alternativa para a resolução de algumas limitações desse tipo de programa. Foi utilizado o sistema operacional Linux e o compilador g++ para os trabalhos. O software foi dividido nos módulos simulação de dados, métodos de seleção e avaliação genética. Esses serão desenvolvidos em duas etapas. Na primeira, as funções básicas serão implementadas pela equipe da Unesp/Dracena. Posteriormente os arquivos serão distribuídos e outras metodologias serão desenvolvidas por um grupo de colaboradores. Os resultados foram referentes ao módulo de simulação de dados, que compreende o módulo de geração de genomas e geração de populações. Para a simulação do genoma foram declaradas as classes gene, cromossomo e genoma. A classe gene armazena variáveis e matrizes com informações como freqüência dos alelos, efeito do gene e herdabilidade. A classe cromossomo armazena os genes e suas respectivas informações em vetores, utilizando um construtor para inserir os genes criados no vetor. A classe genoma simula o conjunto de cromossomos do indivíduo também por meio de vetores. O módulo de simulação de populações se constitui das classes animal e população. A classe animal contém todas as informações sobre os genes e o pedigree de cada animal simulado. A classe população contém um vetor com todos os animais simulados durante o processo representando a população total e outros vetores para representar as gerações simuladas.
Abstract: The development of a Simulator upon a free-sofware model provides an altenative to surpass some limitations of this kind of program. It was used the Linux operating system and the g++ compiler for the whole work. The sofware has been divided in the data simulation, selection methods and genetic evaluation modules. These will be developed in two steps. In the first one, the basic functions will be implemented by Unesp/Dracena team. After that, the files will be distributed and other methodologies will be developed by a group of colaborators. The results were those from the data simulation module, which encompass the genoma generation and population generation modules. For the genome simulation, have been declared the gene, chromosome and genome classes. The gene class stores variables and matrices with information as alelle frequencies, gene effects and heritability. The chromosome class stores the genes and its information in vectors, using a constructor to insert the genes in the vector. The genome class also simulates the individual set of chromosome by means of vectors. The simulation of population module is formed by animal class and population class. The animal class has all the information about genes and the pedigree of each simulated animal. The population class has a vector with all the simulated animals during the process representing the whole population and others vectors representing the simulated generations. MenosResumo: O desenvolvimento de um simulador sobre o modelo de software-livre fornece uma alternativa para a resolução de algumas limitações desse tipo de programa. Foi utilizado o sistema operacional Linux e o compilador g++ para os trabalhos. O software foi dividido nos módulos simulação de dados, métodos de seleção e avaliação genética. Esses serão desenvolvidos em duas etapas. Na primeira, as funções básicas serão implementadas pela equipe da Unesp/Dracena. Posteriormente os arquivos serão distribuídos e outras metodologias serão desenvolvidas por um grupo de colaboradores. Os resultados foram referentes ao módulo de simulação de dados, que compreende o módulo de geração de genomas e geração de populações. Para a simulação do genoma foram declaradas as classes gene, cromossomo e genoma. A classe gene armazena variáveis e matrizes com informações como freqüência dos alelos, efeito do gene e herdabilidade. A classe cromossomo armazena os genes e suas respectivas informações em vetores, utilizando um construtor para inserir os genes criados no vetor. A classe genoma simula o conjunto de cromossomos do indivíduo também por meio de vetores. O módulo de simulação de populações se constitui das classes animal e população. A classe animal contém todas as informações sobre os genes e o pedigree de cada animal simulado. A classe população contém um vetor com todos os animais simulados durante o processo representando a população total e outros vetores para representar as gerações sim... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Avaliação genética; Linux; Programação. |
Thesagro: |
Melhoramento genético animal. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 03981naa a2200217 a 4500 001 1944723 005 2016-07-13 008 2005 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aUTSUNOMIYA, A. T. H. 245 $aDesenvolvimento de um software-livre para simulação em melhoramento genético animal. 260 $c2005 520 $aResumo: O desenvolvimento de um simulador sobre o modelo de software-livre fornece uma alternativa para a resolução de algumas limitações desse tipo de programa. Foi utilizado o sistema operacional Linux e o compilador g++ para os trabalhos. O software foi dividido nos módulos simulação de dados, métodos de seleção e avaliação genética. Esses serão desenvolvidos em duas etapas. Na primeira, as funções básicas serão implementadas pela equipe da Unesp/Dracena. Posteriormente os arquivos serão distribuídos e outras metodologias serão desenvolvidas por um grupo de colaboradores. Os resultados foram referentes ao módulo de simulação de dados, que compreende o módulo de geração de genomas e geração de populações. Para a simulação do genoma foram declaradas as classes gene, cromossomo e genoma. A classe gene armazena variáveis e matrizes com informações como freqüência dos alelos, efeito do gene e herdabilidade. A classe cromossomo armazena os genes e suas respectivas informações em vetores, utilizando um construtor para inserir os genes criados no vetor. A classe genoma simula o conjunto de cromossomos do indivíduo também por meio de vetores. O módulo de simulação de populações se constitui das classes animal e população. A classe animal contém todas as informações sobre os genes e o pedigree de cada animal simulado. A classe população contém um vetor com todos os animais simulados durante o processo representando a população total e outros vetores para representar as gerações simuladas. Abstract: The development of a Simulator upon a free-sofware model provides an altenative to surpass some limitations of this kind of program. It was used the Linux operating system and the g++ compiler for the whole work. The sofware has been divided in the data simulation, selection methods and genetic evaluation modules. These will be developed in two steps. In the first one, the basic functions will be implemented by Unesp/Dracena team. After that, the files will be distributed and other methodologies will be developed by a group of colaborators. The results were those from the data simulation module, which encompass the genoma generation and population generation modules. For the genome simulation, have been declared the gene, chromosome and genome classes. The gene class stores variables and matrices with information as alelle frequencies, gene effects and heritability. The chromosome class stores the genes and its information in vectors, using a constructor to insert the genes in the vector. The genome class also simulates the individual set of chromosome by means of vectors. The simulation of population module is formed by animal class and population class. The animal class has all the information about genes and the pedigree of each simulated animal. The population class has a vector with all the simulated animals during the process representing the whole population and others vectors representing the simulated generations. 650 $aMelhoramento genético animal 653 $aAvaliação genética 653 $aLinux 653 $aProgramação 700 1 $aVAZ, R. I. 700 1 $aPIRES, M. P. 700 1 $aONO, R. K. 700 1 $aFONSECA, R. da 773 $tIn: CONGRESSO INTERNACIONAL DE ZOOTECNIA, 7.; CONGRESSO NACIONAL DE ZOOTECNIA, 10.; REUNIÃO NACIONAL DE ENSINO DE ZOOTECNIA, 11.; FÓRUM DE ENTIDADES DE ZOOTECNIA, 28.; FÓRUM DE COORDENADORES DE CURSOS DE ZOOTECNIA DAS UNIVERSIDADES BRASILEIRAS, 1., 2005, Campo Grande, MS. Zootec 2005: produção animal e responsabilidade. Campo Grande, MS: ABZ: UEMS: UFMS: CPAP: MAPA, 2005. 1 CD ROM.
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Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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61. | | KOAKUZU, S. N.; ARAÚJO, E. J. de; CARVALHO, R. N.; TEIXEIRA, M. C.; FONSECA, R. C.; BASSINELLO, P. Z. Avaliação do efeito do processamento e armazenamento na formação de amido resistente em arrozes com diferentes teores de amilose. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DE ALIMENTOS, 24.; CONGRESSO DO INSTITUTO NACIONAL DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DE FRUTOS TROPICAIS, 4., 2014, Aracajú. Anais... Aracajú: SBCTA, 2014. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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63. | | MARTINS, D. de S.; SCHIEDECK, G.; SCHIAVON, G. de A.; FONSECA, R. de M.; STASINSKI, R.; SCHWENGBER, J. E. Avaliação preliminar de extratos vegetais com potencial de uso para extração de minhocas do solo. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 16.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 9., 2007, Pelotas. Pesquisa e responsabilidade ambiental: resumos expandidos ... Pelotas: UFPel: Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, 2007. 01 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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65. | | FONSECA, R. C.; BASSINELLO, P. Z.; CARVALHO, A. V.; CAETANO, R. K. M.; SANTIAGO, R. de A. C. Análise tecnológica, nutricional e sensorial de massa de lasanha sem glúten à base de farinha pré-gelatinizada de arroz com diferentes teores de amilose. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DE ALIMENTOS, 24.; CONGRESSO DO INSTITUTO NACIONAL DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DE FRUTOS TROPICAIS, 4., 2014, Aracaju. Inovação e sustentabilidade em ciência e tecnologia de alimentos: resumos. Aracaju: SBCTA, 2014. p. 330.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão. |
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66. | | BASSINELLO, P. Z.; FONSECA, R. C.; KOAKUZU, S. N.; CARVALHO, R. N.; MORAIS, J.; FRANCO, C. M. L. Cooking quality and physicochemical traits of upland rice with different amylose content. In: INTERNATIONAL RICE CONGRESS, 4., 2014, Bangkok. Rice for the world. Bangkok: IRRI, 2014. IRC14-0643.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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67. | | FREITAS, A. C.; BALEEIRO, F. C. F.; FONSECA, R. F.; BERTUCCI NETO, V.; PINTO, G. A. S.; FARINAS, C. S. Bioprocess development to add value to canola cake used as substrate for proteolytic enzyme production. Food and Bioproducts Processing, [S. l.], v. 95, p. 173-182, 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Instrumentação. |
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68. | | De BONI, L. FONSECA, R. D. CARDOSO, K. R. A. GROVA, I. AKCELRUD, L.; CORREA, D. S.; MENDONÇA, C. R. Characterization of two- and three-photon absorption of polyfluorene derivates. Journal of Polymer Science: part B: Polymer Physics, New York, v. 52, p. 747-754, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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70. | | BALEEIRO, F. C. F.; FONSECA, R. F.; PIROTA, R. D. P. B.; BERTUCCI NETO, V.; FARINAS, C. S. Estudo de um modelo cinético para a análise da temperatura na velocidade específica de crescimento de aspergillus niger em fermentação em estado sólido. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE BIOPROCESSOS - SINAFERM, 19.; SIMPÓSIO DE HIDRÓLISE ENZIMÁTICA DE BIOMASSA - SHEB, 10., 2013, Foz do Iguaçu. [Anais...]. São Paulo: ABEQ, 2013.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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71. | | FREITAS, A. C. de; FONSECA. R. F.; BERTUCCI NETO, V.; PINTO, G. A. S.; FARINAS, C. S. Estudo das condições fermentativas para produção de proteases por fermentação semi-sólida em bioreator de colunas instrumentado. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 2., 2010, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação Agropecuária: Embrapa Pecuária Sudeste, 2010. p. 75. (Embrapa Instrumentação Agropecuária. Documentos, 50).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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72. | | FONSECA, R. F.; BALEEIRO, F. C. F.; PIROTA, R. D.; BERTUCCI NETO, V.; FARINAS, C. S.; KWONG, W. H. Evaluating the effects of temperature on enzyme production in solid-state fermentation process. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE BIOPROCESSOS - SINAFERM, 19.; SIMPÓSIO DE HIDRÓLISE ENZIMÁTICA DE BIOMASSA - SHEB, 10., 2013, Foz do Iguaçu. [Anais...]. São Paulo: ABEQ, 2013.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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76. | | BASSINELLO, P. Z.; FONSECA, R. C.; KOAKUZU, S. N.; ALMEIDA, A. J. B.; COSTA, M. S.; FRANCO, C. M. L. Qualidade de grãos de arroz de terras altas por métodos simples e refinados. In: CONFERENCIA INTERNACIONAL DO ARROZ PARA AMÉRICA LATINA E CARIBE, 12., 2015, Porto Alegre. Horizonte para a competitividade: anais. Porto Alegre: IRGA, 2015.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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80. | | FONSECA, R. C.; KOAKUZU, S. N.; CARVALHO, R. N.; BORBA, T. C. de O.; CALIARI, M.; BASSINELLO, P. Z. Relação da amilose com o padrão culinário e molecular de arroz de terras altas. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 8., 2014, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2014. p. 115. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 306).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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