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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
30/12/2019 |
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Data da última atualização: |
06/02/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SBARDELLA, A. P.; WELLER, M. M. D. C. A.; I. FONSECA; N. B. STAFUZZA; P. A. BERNARDES; F. F. e SILVA; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; D. P. MUNARI. |
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Afiliação: |
A. P. SBARDELLA; M. M. D. C. A. WELLER; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; MARTA FONSECA MARTINS, CNPGL. |
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Título: |
Ribonucleic acid sequencing differential gene expression analysis of isolated perfused bovine udders experimentally inoculated with Streptococcus agalactiae. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Dairy Science, v. 102, n. 2, p. 1761-1767, 2019. |
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DOI: |
https://doi.org/10.3168/jds.2018-15516 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The aim of this study was to elucidate the differential gene expression in the RNA sequencing transcriptome of isolated perfused udders collected from 4 slaughtered Holstein × Zebu crossbred dairy cows experimentally inoculated with Streptococcus agalactiae. We studied 3 different statistical tools (edgeR, baySeq, and Cuffdiff 2). In summary, 2 quarters of each udder were experimentally inoculated with Strep. agalactiae and the other 2 were used as a control. Mammary tissue biopsies were collected at times 0 and 3 h after infection. The total RNA was extracted and sequenced on an Illumina HiSeq 2000 (Illumina Inc., San Diego, CA). Transcripts were assembled from the reads aligned to the bovine UMD 3.1 reference genome, and the statistical analyses were performed using the previously mentioned tools (edgeR, baySeq, and Cuffdiff 2). Finally, the identified genes were submitted to pathway enrichment analysis. A total of 1,756, 1,161, and 3,389 genes with differential gene expression were identified when using edgeR, baySeq, and Cuffdiff 2, respectively. A total of 122 genes were identified by the overlapping of the 3 methods; however, only the platelet activation presented a significantly enriched pathway. From the results, we suggest the FCER1G, GNAI2, ORAI1, and VASP genes shared among the 3 methods in this pathway for posterior biological validation. |
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Palavras-Chave: |
BaySeq; Crossbred dairy cow; Cuffdiff 2; EdgeR; RNA sequencing. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Rondônia. |
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Data corrente: |
26/03/2015 |
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Data da última atualização: |
26/03/2015 |
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Tipo da produção científica: |
Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
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Autoria: |
GODINHO, V. de P. C.; UTUMI, M. M.; BROGIN, R. L.; OLIVEIRA, S. J. de M.; BOTELHO, F. J. E.; PASSOS, A. M. A. dos; ARAUJO, L. V. de; TARDIN, F. D.; RODRIGUES, J. A. S. |
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Afiliação: |
VICENTE DE PAULO CAMPOS GODINHO, CPAF-RO; MARLEY MARICO UTUMI, CPAF-RO; RODRIGO LUIS BROGIN, CNPSO; SAMUEL JOSE DE MAGALHAES OLIVEIRA, CPAF-RO; FREDERICO JOSE EVANGELISTA BOTELHO, CPAF-RO; ALEXANDRE MARTINS ABDAO DOS PASSOS, CPAF-RO; LEONARDO VENTURA DE ARAUJO, CPAF-RO; FLAVIO DESSAUNE TARDIN, CNPMS; JOSE AVELINO SANTOS RODRIGUES, CNPMS. |
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Título: |
Custo estimado de produção de sorgo safrinha, em plantio direto, na região de Vilhena, Rondônia, safra 2011/2012. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Porto Velho: Embrapa Rondônia, 2012. |
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Páginas: |
4 p. |
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Série: |
(Embrapa Rondônia. Comunicado Técnico, 386). |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Neste trabalho, o custo de oportunidade da terra e o custo fixo de benfeitorias foram totalmente remunerados pela cultura principal de época normal (soja), em virtude de o sorgo ser uma cultura de sucessão pouco utilizada e de maior risco climático e financeiro. O custo variável se refere às despesas realizadas com fatores de produção, cujas quantidades podem ser modificadas de acordo com o nível de produção escolhido, tais como aquisição de sementes, fertilizantes, defensivos, combustíveis, lubrificantes, manutenção de máquinas e equipamentos, mão de obra e juros sobre capital circulante. O somatório do custo fixo e variável é denominado custo total. A metodologia utilizada foi proposta por Melo Filho e Mesquita (1983), utilizada por Melo Filho e Kruker (1990) e Melo Filho et al. (1995) e comumente utilizada para estimar custos de produção de grãos em Rondônia. |
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Thesagro: |
Custo de Produção; Plantio Direto; Safrinha; Sorgo. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/121145/1/cot386-sorgosafrinha.pdf
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Marc: |
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490 $a(Embrapa Rondônia. Comunicado Técnico, 386).
520 $aNeste trabalho, o custo de oportunidade da terra e o custo fixo de benfeitorias foram totalmente remunerados pela cultura principal de época normal (soja), em virtude de o sorgo ser uma cultura de sucessão pouco utilizada e de maior risco climático e financeiro. O custo variável se refere às despesas realizadas com fatores de produção, cujas quantidades podem ser modificadas de acordo com o nível de produção escolhido, tais como aquisição de sementes, fertilizantes, defensivos, combustíveis, lubrificantes, manutenção de máquinas e equipamentos, mão de obra e juros sobre capital circulante. O somatório do custo fixo e variável é denominado custo total. A metodologia utilizada foi proposta por Melo Filho e Mesquita (1983), utilizada por Melo Filho e Kruker (1990) e Melo Filho et al. (1995) e comumente utilizada para estimar custos de produção de grãos em Rondônia.
650 $aCusto de Produção
650 $aPlantio Direto
650 $aSafrinha
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Registro original: |
Embrapa Rondônia (CPAF-RO) |
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