|
|
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Suínos e Aves. |
Data corrente: |
09/09/2021 |
Data da última atualização: |
15/10/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
HUL, L. M.; IBELLI, A. M. G.; SAVOLDI, I. R.; MARCELINO, D. E. P.; FERNANDES, L. T.; PEIXOTO, J. O.; CANTAO, M. E.; HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. |
Afiliação: |
LUDMILA MUDRI HUL, UNIVERSIDADE ESTADUAL DO CENTRO-OESTE, GUARAPUAVA; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; IGOR RICARDO SAVOLDI, UDESC; DÉBORA ESTER PETRY MARCELINO, FACULDADE DE CONCÓRDIA; LANA TEIXEIRA FERNANDES; JANE OLIVEIRA PEIXOTO, UNIVERSIDADE ESTADUAL DO CENTRO-OESTE, GUARAPUAVA; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; LUIZ LEHMANN COUTINHO, ESALQ/USP; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA. |
Título: |
Differentially expressed genes in the femur cartilage transcriptome clarify the understanding of femoral head separation in chickens. |
Ano de publicação: |
2021 |
Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 11, n. 1, p. 1-13. 2021. |
DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41598-021-97306-3 |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
Article number: 17965. |
Conteúdo: |
Locomotor problems are among one of the main concerns in the current poultry industry, causing major economic losses and affecting animal welfare. The most common bone anomalies in the femur are dyschondroplasia, femoral head separation (FHS), and bacterial chondronecrosis with osteomyelitis (BCO), also known as femoral head necrosis (FHN). The present study aimed to identify differentially expressed (DE) genes in the articular cartilage (AC) of normal and FHS-affected broilers by RNA-Seq analysis. In the transcriptome analysis, 12,169 genes were expressed in the femur AC. Of those, 107 genes were DE (FDR < 0.05) between normal and affected chickens, of which 9 were downregulated and 98 were upregulated in the affected broilers. In the gene-set enrichment analysis using the DE genes, 79 biological processes (BP) were identified and were grouped into 12 superclusters. The main BP found were involved in the response to biotic stimulus, gas transport, cellular activation, carbohydrate-derived catabolism, multi-organism regulation, immune system, muscle contraction, multi-organism process, cytolysis, leukocytes and cell adhesion. In this study, the first transcriptome analysis of the broilers femur articular cartilage was performed, and a set of candidate genes (AvBD1, AvBD2, ANK1, EPX, ADA, RHAG) that could trigger changes in the broiler´s femoral growth plate was identified. Moreover, these results could be helpful to better understand FHN in chickens and possibly in humans. |
Palavras-Chave: |
Análises de expressão diferencial; Cartilagem da cabeça do fêmur; Differential expression analysis; Expressão gênica; Reação da cadeia de polimerase; Separação da cabeça femoral; Sequenciamento de RNA; Transcriptoma da cartilagem do fêmur. |
Thesagro: |
Frango; Frango de Corte. |
Thesaurus Nal: |
Broiler chickens; Gene expression; Quantitative polymerase chain reaction; Transcriptome. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/226988/1/final9712.pdf
|
Marc: |
LEADER 02920naa a2200433 a 4500 001 2135377 005 2021-10-15 008 2021 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1038/s41598-021-97306-3$2DOI 100 1 $aHUL, L. M. 245 $aDifferentially expressed genes in the femur cartilage transcriptome clarify the understanding of femoral head separation in chickens.$h[electronic resource] 260 $c2021 500 $aArticle number: 17965. 520 $aLocomotor problems are among one of the main concerns in the current poultry industry, causing major economic losses and affecting animal welfare. The most common bone anomalies in the femur are dyschondroplasia, femoral head separation (FHS), and bacterial chondronecrosis with osteomyelitis (BCO), also known as femoral head necrosis (FHN). The present study aimed to identify differentially expressed (DE) genes in the articular cartilage (AC) of normal and FHS-affected broilers by RNA-Seq analysis. In the transcriptome analysis, 12,169 genes were expressed in the femur AC. Of those, 107 genes were DE (FDR < 0.05) between normal and affected chickens, of which 9 were downregulated and 98 were upregulated in the affected broilers. In the gene-set enrichment analysis using the DE genes, 79 biological processes (BP) were identified and were grouped into 12 superclusters. The main BP found were involved in the response to biotic stimulus, gas transport, cellular activation, carbohydrate-derived catabolism, multi-organism regulation, immune system, muscle contraction, multi-organism process, cytolysis, leukocytes and cell adhesion. In this study, the first transcriptome analysis of the broilers femur articular cartilage was performed, and a set of candidate genes (AvBD1, AvBD2, ANK1, EPX, ADA, RHAG) that could trigger changes in the broiler´s femoral growth plate was identified. Moreover, these results could be helpful to better understand FHN in chickens and possibly in humans. 650 $aBroiler chickens 650 $aGene expression 650 $aQuantitative polymerase chain reaction 650 $aTranscriptome 650 $aFrango 650 $aFrango de Corte 653 $aAnálises de expressão diferencial 653 $aCartilagem da cabeça do fêmur 653 $aDifferential expression analysis 653 $aExpressão gênica 653 $aReação da cadeia de polimerase 653 $aSeparação da cabeça femoral 653 $aSequenciamento de RNA 653 $aTranscriptoma da cartilagem do fêmur 700 1 $aIBELLI, A. M. G. 700 1 $aSAVOLDI, I. R. 700 1 $aMARCELINO, D. E. P. 700 1 $aFERNANDES, L. T. 700 1 $aPEIXOTO, J. O. 700 1 $aCANTAO, M. E. 700 1 $aHIGA, R. H. 700 1 $aGIACHETTO, P. F. 700 1 $aCOUTINHO, L. L. 700 1 $aLEDUR, M. C. 773 $tScientific Reports$gv. 11, n. 1, p. 1-13. 2021.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registros recuperados : 22 | |
4. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | RECH, R. R.; GAVA, D.; SILVA, M. C. da; FERNANDES, L. T.; HAACH, V.; ZANELLA, J. R. C.; SCHAEFER, R. Porcine respiratory disease complex after the introduction of H1N1/2009 influenza virus in Brazil. Zoonoses and Public Health, v. 65, n.1, p. e155-e161, 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso restrito ao objeto digital](/consulta/web/img/lock.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
5. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | GAVA, D.; SERRÃO, V. H. B.; FERNANDES, L. T.; CANTAO, M. E.; ZANELLA, J. R. C.; MORES, N.; SCHAEFER, R. Structure analysis of capsid protein of porcine circovirus type 2 from pigs with systemic disease. Brazilian Journal of Microbiology, v. 49, p. 351-357, 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso restrito ao objeto digital](/consulta/web/img/lock.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
6. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | FERNANDES, L. T.; GOLDONI, I.; HUL, L. M.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C. Comparação de transcriptomas evidencia vias de diferenciação de condrócitos e desenvolvimento da cartilagem envolvidas na manifestação da necrose da cabeça do fêmur em frangos de corte. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL ON-LINE, 14., 2021. Anais.... Chapecó: UDESC: Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2022.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/consulta/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
7. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | GOLDONI, I.; IBELLI, A. M. G.; FERNANDES, L. T.; PEIXOTO, J. de O.; HUL, L. M.; CANTAO, M. E.; GOUVEIA, J. J. de S.; LEDUR, M. C. Comprehensive analyses of bone and cartilage transcriptomes evince ion transport, inflammation and cartilage development-related genes involved in chickens femoral head separation. Animals, v. 12, n. 788, 2022.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso restrito ao objeto digital](/consulta/web/img/lock.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
8. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | ZANELLA, J. R. C.; SIMON, N. L.; PINTO, L. da S.; VIANCELLI, A.; FERNANDES, L. T.; MARCELO, H.; ODIR, A. D.; ESTEVES, P. A. Detection of porcine circovirus type 2 (PCV2) variants PCV2-1 and PCV2-2 in Brazilian pig population. In: INTERNATIONAL PIG VETERINARY SOCIETY, 20., 2008, Durban, South Africa. Proceedings. Durban: IPVS, 2008. p. 33 Projeto/Plano de Ação: 03.07.51.900-07.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
9. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | LEDUR, M. C.; FERNANDES, L. T.; ZANELLA, J. R. C.; SCHAEFER, R.; PEIXOTO, J. de O.; MILLER, L. C.; SILVA, M. V. B. da. Prospecting and identifying genes related to resistance/susceptibility to postweaning multisystemic wasting syndrome (PMWS) In: SIMPÓSIO EMBRAPA LABEX DE SANIDADE ANIMAL, 1, Campo Grande, MS, 2009. Anais.... Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, Labex-USA, CNPq, 2009. 1 CD-ROM. Projeto/Plano de Ação: 01.02.102.10-10Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
10. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | FORNARI, M. B.; ZANELLA, R.; IBELLI, A. M. G.; FERNANDES, L. T.; CANTAO, M. E.; SOCCOL, V. T.; LEDUR, M. C.; PEIXOTO, J. de O. Unraveling the associations of osteoprotegerin gene with production traits in a paternal broiler line. SpringerPlus, v. 3, n. 682, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso restrito ao objeto digital](/consulta/web/img/lock.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
11. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | SANTOS, C. E.; PEIXOTO, J. de O.; FERNANDES, L. T.; MARCELINO, D. E. P.; KAWSKI, V. L.; NEIS, F. T.; LEDUR, M. C.; IBELLI, A. M. G. Upregulated genes in articular cartilage may help to counteract femoral head separation in broilers with 21 days of age. Research in Veterinary Science, v. 147, p. 92-95, 2022.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso restrito ao objeto digital](/consulta/web/img/lock.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
13. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | FERNANDES, L. T.; GODOY, T. F.; SILVA, V. H.; PANDOLFI, J. R. C.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Sex-specific association of a SNP in the ADIPOR2 gene with carcass traits in a paternal broiler line. In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Vancouver: WCGALP: American Society of Animal Science, 2014.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/consulta/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
14. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | LAGOS, E. B.; PIRES, M. P.; ONO, R. K.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; MORES, M. A. Z.; FERNANDES, L. T.; PEDROSA, V. B.; LEDUR, M. C. Análise de associação genômica para hérnia umbilical em suínos comerciais utilizando abordagem de marcadores múltiplos. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 13., 2019, Salvador. Anais... Salvador: SBMA, 2019. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/consulta/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
15. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | HUL, L. M.; IBELLI, A. M. G.; SAVOLDI, I. R.; MARCELINO, D. E. P.; FERNANDES, L. T.; PEIXOTO, J. O.; CANTAO, M. E.; HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Differentially expressed genes in the femur cartilage transcriptome clarify the understanding of femoral head separation in chickens. Scientific Reports, v. 11, n. 1, p. 1-13. 2021. Article number: 17965.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Suínos e Aves. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/consulta/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
16. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | DAL PIZZOL, M. S.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; CAMPOS, F. G.; OLIVEIRA, H. C. de; PEIXOTO, J. de O.; FERNANDES, L. T.; TAVERNARI, F. de C.; MORES, M. A. Z.; BASTOS, A. P. A.; LEDUR, M. C. Differential expression of miRNAs associated with pectoral myopathies in young broilers: insights from a comparative transcriptome analysis. BMC Genomics, v. 25, n. 104, p. 1-14, 2024.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Suínos e Aves. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/consulta/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
17. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | MARCIANO, C. M. M.; IBELLI, A. M. G.; MARCHESI, J. A. P.; PEIXOTO, J. de O.; FERNANDES, L. T.; SAVOLDI, I. R.; CARMO, K. B. do; LEDUR, M. C. Differential expression of myogenic and calcium signaling-related genes in broilers affected with white striping. Frontiers in Physiology, v. 12, n. 712464, 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso restrito ao objeto digital](/consulta/web/img/lock.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
18. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; FERNANDES, L. T.; HAACH, V.; GAVA, D.; BASTOS, A. P. A.; FONSECA, F. M. da; MORES, M. A. Z.; CANTAO, M. E.; SCHAEFER, R.; LEDUR, M. C. Molecular mechanisms involved with influenza A nanovaccine immunogenicity in pigs. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 12., 2022, Rotterdam. Proceedings: technical and species orientated innovations in animal breeding, and contribution of genetics to solving societal challenges. Wageningen: Wageningen Academic Publishers, 2022. Edited by R. F. Veerkamp and Y. de Haas.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/consulta/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
19. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | FERNANDES, L. T.; PEIXOTO, J. de O.; DAL PIZZOL, M. S.; IBELLI, A. M. G.; MORES, M. A. Z.; TAVERNARI, F. de C.; COLDEBELLA, A.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C. Effects of age, line and diet on the occurrence of white striping lesions in broiler breast muscle. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 12., 2022, Rotterdam. Proceedings: technical and species orientated innovations in animal breeding, and contribution of genetics to solving societal challenges. Wageningen: Wageningen Academic Publishers, 2022. Edited by R. F. Veerkamp and Y. de Haas.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/consulta/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
20. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | FERNANDES, L. T.; ONO, R. K.; IBELLI, A. M. G.; LAGOS, E. B.; MORES, M. A. Z.; CANTAO, M. E.; LORENZETTI, W. R.; PEIXOTO, J. de O.; PEDROSA, V. B.; LEDUR, M. C. Novel putative candidate genes associated with umbilical hernia in pigs. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 11., 2018, Auckland, New Zealand. Proceedings... Massey University, 2018. Digital Archive.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| ![Visualizar detalhes do registro](/consulta/web/img/visualizar.png) ![Acesso ao objeto digital](/consulta/web/img/pdf.png) ![Imprime registro no formato completo](/consulta/web/img/print.png) |
Registros recuperados : 22 | |
|
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|