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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
12/07/2018 |
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Data da última atualização: |
12/07/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
FERNANDES, L. T.; ONO, R. K.; IBELLI, A. M. G.; LAGOS, E. B.; MORES, M. A. Z.; CANTAO, M. E.; LORENZETTI, W. R.; PEIXOTO, J. de O.; PEDROSA, V. B.; LEDUR, M. C. |
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Afiliação: |
LANA TEIXEIRA FERNANDES, CEDISA; RAFAEL KEITH ONO; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; UEPG; MARCOS ANTONIO ZANELLA MORES, CNPSA; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; WILLIAM RAPHAEL LORENZETTI, UDESC/Chapecó; JANE DE OLIVEIRA PEIXOTO, CNPSA; VICTOR BRENO PEDROSA; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA. |
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Título: |
Novel putative candidate genes associated with umbilical hernia in pigs. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 11., 2018, Auckland, New Zealand. Proceedings... Massey University, 2018. Digital Archive. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Umbilical hernia is one of the most frequent anatomical defects in pigs in which abdominal contents protrude through the umbilical ring. This condition is considered to have a multifactorial basis in which environmental, infectious and genetic factors play a role. However, a better understanding about the genetic components involved in the umbilical hernia development has not yet been achieved. Although a few studies have mapped QTL for umbilical hernia, just a few candidate genes were reported. Therefore, the aim of this study was to identify genomic regions related to the development of umbilical hernias in pigs and search for potential candidate genes. A GWAS was performed with 92 cases and 233 control crossbred pigs. Five SNPs were associated with umbilical hernia: on SSC4/SSC6/SSC13 and one with unknown position. Candidate genes TBX15 and WARS2 were identified close to the SNP on SSC4. Another two candidate genes were located near the SNP associated with umbilical hernia on SSC13 (LIPI and RBM11). Further validation of these genes should be performed to improve the knowledge about umbilical hernia development in order to improve pig welfare and production by eliminating susceptible animals through genetic selection Resumo: A hérnia umbilical é um dos defeitos anatômicos mais freqüentes em suínos nos quais o conteúdo abdominal se projeta através do anel umbilical. Considera-se que esta condição tem uma base multifatorial na qual fatores ambientais, infecciosos e genéticos desempenham um papel. Entretanto, um melhor entendimento sobre os componentes genéticos envolvidos no desenvolvimento da hérnia umbilical ainda não foi alcançado. Embora alguns estudos tenham mapeado o QTL para a hérnia umbilical, apenas alguns genes candidatos foram relatados. Portanto, o objetivo deste estudo foi identificar regiões genômicas relacionadas ao desenvolvimento de hérnias umbilicais em porcos e buscar potenciais genes candidatos. Um GWAS foi realizado com 92 casos e 233 porcos cruzados de controle. Cinco SNPs foram associados com hérnia umbilical: em SSC4 / SSC6 / SSC13 e um com posição desconhecida. Os genes candidatos TBX15 e WARS2 foram identificados próximos ao SNP em SSC4. Outros dois genes candidatos foram localizados perto do SNP associado à hérnia umbilical na SSC13 (LIPI e RBM11). A validação adicional desses genes deve ser realizada para melhorar o conhecimento sobre o desenvolvimento de hérnia umbilical, a fim de melhorar o bem-estar ea produção de suínos, eliminando os animais suscetíveis por meio da seleção genética MenosAbstract: Umbilical hernia is one of the most frequent anatomical defects in pigs in which abdominal contents protrude through the umbilical ring. This condition is considered to have a multifactorial basis in which environmental, infectious and genetic factors play a role. However, a better understanding about the genetic components involved in the umbilical hernia development has not yet been achieved. Although a few studies have mapped QTL for umbilical hernia, just a few candidate genes were reported. Therefore, the aim of this study was to identify genomic regions related to the development of umbilical hernias in pigs and search for potential candidate genes. A GWAS was performed with 92 cases and 233 control crossbred pigs. Five SNPs were associated with umbilical hernia: on SSC4/SSC6/SSC13 and one with unknown position. Candidate genes TBX15 and WARS2 were identified close to the SNP on SSC4. Another two candidate genes were located near the SNP associated with umbilical hernia on SSC13 (LIPI and RBM11). Further validation of these genes should be performed to improve the knowledge about umbilical hernia development in order to improve pig welfare and production by eliminating susceptible animals through genetic selection Resumo: A hérnia umbilical é um dos defeitos anatômicos mais freqüentes em suínos nos quais o conteúdo abdominal se projeta através do anel umbilical. Considera-se que esta condição tem uma base multifatorial na qual fatores ambientais, infecciosos ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Candidate genes; Congenital defect; GWAS; Hérnia umbilical; Umbilical hernia. |
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Thesagro: |
Melhoramento Genético Animal; Suíno. |
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Thesaurus Nal: |
Animal genetic resources; Swine. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/179728/1/final8696.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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| 4. |  | RECH, R. R.; GAVA, D.; SILVA, M. C. da; FERNANDES, L. T.; HAACH, V.; ZANELLA, J. R. C.; SCHAEFER, R. Porcine respiratory disease complex after the introduction of H1N1/2009 influenza virus in Brazil. Zoonoses and Public Health, v. 65, n.1, p. e155-e161, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 5. | | GAVA, D.; SERRÃO, V. H. B.; FERNANDES, L. T.; CANTAO, M. E.; ZANELLA, J. R. C.; MORES, N.; SCHAEFER, R. Structure analysis of capsid protein of porcine circovirus type 2 from pigs with systemic disease. Brazilian Journal of Microbiology, v. 49, p. 351-357, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 6. | | FERNANDES, L. T.; GOLDONI, I.; HUL, L. M.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C. Comparação de transcriptomas evidencia vias de diferenciação de condrócitos e desenvolvimento da cartilagem envolvidas na manifestação da necrose da cabeça do fêmur em frangos de corte. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL ON-LINE, 14., 2021. Anais.... Chapecó: UDESC: Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2022.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 7. | | GOLDONI, I.; IBELLI, A. M. G.; FERNANDES, L. T.; PEIXOTO, J. de O.; HUL, L. M.; CANTAO, M. E.; GOUVEIA, J. J. de S.; LEDUR, M. C. Comprehensive analyses of bone and cartilage transcriptomes evince ion transport, inflammation and cartilage development-related genes involved in chickens femoral head separation. Animals, v. 12, n. 788, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 8. | | ZANELLA, J. R. C.; SIMON, N. L.; PINTO, L. da S.; VIANCELLI, A.; FERNANDES, L. T.; MARCELO, H.; ODIR, A. D.; ESTEVES, P. A. Detection of porcine circovirus type 2 (PCV2) variants PCV2-1 and PCV2-2 in Brazilian pig population. In: INTERNATIONAL PIG VETERINARY SOCIETY, 20., 2008, Durban, South Africa. Proceedings. Durban: IPVS, 2008. p. 33 Projeto/Plano de Ação: 03.07.51.900-07.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 9. | | LEDUR, M. C.; FERNANDES, L. T.; ZANELLA, J. R. C.; SCHAEFER, R.; PEIXOTO, J. de O.; MILLER, L. C.; SILVA, M. V. B. da. Prospecting and identifying genes related to resistance/susceptibility to postweaning multisystemic wasting syndrome (PMWS) In: SIMPÓSIO EMBRAPA LABEX DE SANIDADE ANIMAL, 1, Campo Grande, MS, 2009. Anais.... Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, Labex-USA, CNPq, 2009. 1 CD-ROM. Projeto/Plano de Ação: 01.02.102.10-10| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 10. | | FERNANDES, L. T.; GODOY, T. F.; SILVA, V. H.; PANDOLFI, J. R. C.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Sex-specific association of a SNP in the ADIPOR2 gene with carcass traits in a paternal broiler line. In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Vancouver: WCGALP: American Society of Animal Science, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 12. | | SANTOS, C. E.; PEIXOTO, J. de O.; FERNANDES, L. T.; MARCELINO, D. E. P.; KAWSKI, V. L.; NEIS, F. T.; LEDUR, M. C.; IBELLI, A. M. G. Upregulated genes in articular cartilage may help to counteract femoral head separation in broilers with 21 days of age. Research in Veterinary Science, v. 147, p. 92-95, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 13. | | FORNARI, M. B.; ZANELLA, R.; IBELLI, A. M. G.; FERNANDES, L. T.; CANTAO, M. E.; SOCCOL, V. T.; LEDUR, M. C.; PEIXOTO, J. de O. Unraveling the associations of osteoprotegerin gene with production traits in a paternal broiler line. SpringerPlus, v. 3, n. 682, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 14. | | LAGOS, E. B.; PIRES, M. P.; ONO, R. K.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; MORES, M. A. Z.; FERNANDES, L. T.; PEDROSA, V. B.; LEDUR, M. C. Análise de associação genômica para hérnia umbilical em suínos comerciais utilizando abordagem de marcadores múltiplos. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 13., 2019, Salvador. Anais... Salvador: SBMA, 2019. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 15. | | HUL, L. M.; IBELLI, A. M. G.; SAVOLDI, I. R.; MARCELINO, D. E. P.; FERNANDES, L. T.; PEIXOTO, J. O.; CANTAO, M. E.; HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Differentially expressed genes in the femur cartilage transcriptome clarify the understanding of femoral head separation in chickens. Scientific Reports, v. 11, n. 1, p. 1-13. 2021. Article number: 17965.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Suínos e Aves. |
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| 16. | | DAL PIZZOL, M. S.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; CAMPOS, F. G.; OLIVEIRA, H. C. de; PEIXOTO, J. de O.; FERNANDES, L. T.; TAVERNARI, F. de C.; MORES, M. A. Z.; BASTOS, A. P. A.; LEDUR, M. C. Differential expression of miRNAs associated with pectoral myopathies in young broilers: insights from a comparative transcriptome analysis. BMC Genomics, v. 25, n. 104, p. 1-14, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 20. | | FERNANDES, L. T.; ONO, R. K.; IBELLI, A. M. G.; LAGOS, E. B.; MORES, M. A. Z.; CANTAO, M. E.; LORENZETTI, W. R.; PEIXOTO, J. de O.; PEDROSA, V. B.; LEDUR, M. C. Novel putative candidate genes associated with umbilical hernia in pigs. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 11., 2018, Auckland, New Zealand. Proceedings... Massey University, 2018. Digital Archive.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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