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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia; Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Milho e Sorgo. |
Data corrente: |
02/12/2020 |
Data da última atualização: |
11/01/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
PEREIRA, V. M.; FERREIRA FILHO, J. A.; LEAO, A. P.; VARGAS, L. H. G.; FARIAS, M. P. de; RIOS, S. de A.; CUNHA, R. N. V. da; FORMIGHIERI, E. F.; ALVES, A. A.; SOUZA JUNIOR, M. T. |
Afiliação: |
Valquíria Martins Pereira, Universidade Federal de Lavras; Jaire Alves Ferreira Filho, Universidade Federal de Lavras; ANDRE PEREIRA LEAO, CNPAE; Luiz Henrique Galli Vargas, Universidade Federal de Lavras; Marcelo Picanço de Farias, Universidade Federal de Lavras; SARA DE ALMEIDA RIOS, CNPMS; RAIMUNDO NONATO VIEIRA DA CUNHA, CPAA; EDUARDO FERNANDES FORMIGHIERI, CNPAE; ALEXANDRE ALONSO ALVES, CNPAE; MANOEL TEIXEIRA SOUZA JUNIOR, CNPAE. |
Título: |
American oil palm from Brazil: Genetic diversity, population structure, and core collection. |
Ano de publicação: |
2020 |
Fonte/Imprenta: |
Crop Science, v. 60, p. 3212-3227, Nov./Dec. 2020. |
Descrição Física: |
il. |
DOI: |
https://doi.org/10.1002/csc2.20276 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The American oil palm [Elaeis oleifera (Knuth) Cortés] has pronounced importance in oil palm breeding programs. Here, a germplasm bank (GB) of E. oleifera plants collected in the Amazon rainforest in Brazil was submitted to single nucleotide polymorphism (SNP) marker identification, selection, and use, aiming to characterize genetic diversity and population structure and to design a core collection (CC). Five hundred and fifty-three plants from 206 subsamples, collected at 19 localities spread throughout six geographic regions, were submitted to genotyping-by-sequencing analysis. A set of 1,827 high-quality SNP markers was then selected and used to run the genetic diversity and population structure analysis. The genetic diversity found is of moderate degree, and probably only a small portion of the species diversity is represented in the collection. The possible reason for that is the collecting strategy used, which collected subsamples only around the most prominent watercourses in the region. The average degree of genetic differentiation among subsamples is very high, indicating the presence of high interpopulation differentiation. The collection showed a low level of endogamy. The low average gene flow found indicates that genetic isolation caused by drift is occurring, and there is a need to review the conservation strategy. A set of 245 SNPs distributed throughout all 16 chromosomes was used to design CC based on maximizing the strategy of diversity. The optimal adjustment of the validated parameters, maintained while taking fewest subsamples, led to the choice of a model containing 20% of the entire collection as the ideal to form the CC. MenosThe American oil palm [Elaeis oleifera (Knuth) Cortés] has pronounced importance in oil palm breeding programs. Here, a germplasm bank (GB) of E. oleifera plants collected in the Amazon rainforest in Brazil was submitted to single nucleotide polymorphism (SNP) marker identification, selection, and use, aiming to characterize genetic diversity and population structure and to design a core collection (CC). Five hundred and fifty-three plants from 206 subsamples, collected at 19 localities spread throughout six geographic regions, were submitted to genotyping-by-sequencing analysis. A set of 1,827 high-quality SNP markers was then selected and used to run the genetic diversity and population structure analysis. The genetic diversity found is of moderate degree, and probably only a small portion of the species diversity is represented in the collection. The possible reason for that is the collecting strategy used, which collected subsamples only around the most prominent watercourses in the region. The average degree of genetic differentiation among subsamples is very high, indicating the presence of high interpopulation differentiation. The collection showed a low level of endogamy. The low average gene flow found indicates that genetic isolation caused by drift is occurring, and there is a need to review the conservation strategy. A set of 245 SNPs distributed throughout all 16 chromosomes was used to design CC based on maximizing the strategy of diversity. The optimal adjustm... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
American oil palm; Brazilian Elaeis oleifera; Diversidade genética. |
Thesagro: |
Banco de Germoplasma; Dendê; Melhoramento Genético Vegetal; Óleo. |
Thesaurus Nal: |
Breeding and Genetic Improvement; Genetic improvement. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/220143/1/American-oil-palm-2020.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/225602/1/American-oil.pdf
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Marc: |
LEADER 02765naa a2200361 a 4500 001 2127457 005 2021-01-11 008 2020 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1002/csc2.20276$2DOI 100 1 $aPEREIRA, V. M. 245 $aAmerican oil palm from Brazil$bGenetic diversity, population structure, and core collection.$h[electronic resource] 260 $c2020 300 $cil. 520 $aThe American oil palm [Elaeis oleifera (Knuth) Cortés] has pronounced importance in oil palm breeding programs. Here, a germplasm bank (GB) of E. oleifera plants collected in the Amazon rainforest in Brazil was submitted to single nucleotide polymorphism (SNP) marker identification, selection, and use, aiming to characterize genetic diversity and population structure and to design a core collection (CC). Five hundred and fifty-three plants from 206 subsamples, collected at 19 localities spread throughout six geographic regions, were submitted to genotyping-by-sequencing analysis. A set of 1,827 high-quality SNP markers was then selected and used to run the genetic diversity and population structure analysis. The genetic diversity found is of moderate degree, and probably only a small portion of the species diversity is represented in the collection. The possible reason for that is the collecting strategy used, which collected subsamples only around the most prominent watercourses in the region. The average degree of genetic differentiation among subsamples is very high, indicating the presence of high interpopulation differentiation. The collection showed a low level of endogamy. The low average gene flow found indicates that genetic isolation caused by drift is occurring, and there is a need to review the conservation strategy. A set of 245 SNPs distributed throughout all 16 chromosomes was used to design CC based on maximizing the strategy of diversity. The optimal adjustment of the validated parameters, maintained while taking fewest subsamples, led to the choice of a model containing 20% of the entire collection as the ideal to form the CC. 650 $aBreeding and Genetic Improvement 650 $aGenetic improvement 650 $aBanco de Germoplasma 650 $aDendê 650 $aMelhoramento Genético Vegetal 650 $aÓleo 653 $aAmerican oil palm 653 $aBrazilian Elaeis oleifera 653 $aDiversidade genética 700 1 $aFERREIRA FILHO, J. A. 700 1 $aLEAO, A. P. 700 1 $aVARGAS, L. H. G. 700 1 $aFARIAS, M. P. de 700 1 $aRIOS, S. de A. 700 1 $aCUNHA, R. N. V. da 700 1 $aFORMIGHIERI, E. F. 700 1 $aALVES, A. A. 700 1 $aSOUZA JUNIOR, M. T. 773 $tCrop Science$gv. 60, p. 3212-3227, Nov./Dec. 2020.
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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Registros recuperados : 24 | |
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Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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3. | | FARIAS, M. P.; NAVIA, D.; ARAUJO, A. C. G. Ultrastructural identification of the eriophyid mite Aceria tosichella Keifer from wheat, Triticium aestrivum, L. In: SIMPÓSIO DE MICROSCOPIA NO CERRADO, 2008, Pirenópolis, GO. [Anais...] Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. 321 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 265) Organizadoras: Ana Claudia Guerra de Araújo e Sônia Nair Báo. p. 226-228.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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5. | | MORAIS, P. B.; CAPDEVILLE, G. de; FARIAS, M. P.; SOUZA JUNIOR, M. T.; FALCÃO, R.; LEAO, A. P. Estudo do desenvolvimento meiótico de cromossomos em microsporócitos coletados de inflorencências de Elaeis oleifera subamostra coari. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 2., 2015, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2015. p. 118-120Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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6. | | SOUSA, P. C. A.; FARIAS, M. P.; ARAUJO, A. C. G.; DIANESE, A. C.; PAZ-LIMA, M. L. Microscopia eletrônica de varredura de Pseudocercospora passiflora-setacea em folhas de Passiflora setacea. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 34, p. s136, ago. 2009. Suplemento. Trabalho apresentado no 42º Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2009. Rio de Janeiro, RJ.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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7. | | MAFFON, H. P.; ARAUJO, A. C. G. de; FARIAS, M. P.; REZENDE, D. V.; MENDES, M. A. S.; URBEN, A. F.; PAZ LIMA, M. L. Fases sexual e assexual Puccinia sp. em folhas de Ipomoea triloba. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 34, p. S175, 2009. Suplemento. Edição dos Resumos do XLII do Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro, RJ, 2009.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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8. | | SANTOS, C. R.; MARTINS, N. F.; ARAÚJO, M. M.; TOGAWA, R. C.; BUZAR, A. G. R.; FARIAS, M. P.; SOUZA JÚNIOR, M. T. Identificação e caracterização de homólogos de genes de resistência a estresses bióticos e abióticos em Musa acuminata. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 11., 2006, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2006. p. 88.Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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9. | | FARIAS, M. P.; VARGAS, L. H. G.; LEAO, A. P.; FORMIGHIERI, E. F.; ALVES, A. A.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Determinação de estádios meióticos em elaeis oleifera (kunth) cortés. In: WORKSHOP AGROENERGIA, 6., 2012, Ribeirão Preto, SP. Anais... Ribeirão Preto: APTA; Campinas: IAC, 2012. Não paginadoTipo: Artigo em Anais de Congresso |
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10. | | VARGAS, L. H. G.; LEAO, A. P.; FARIAS, M. P.; ALVES, A. A.; FORMIGHIERI, E. F.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Estabelecimento de um protocolo eficiente para extração de rna a partir de folhas jovens de elaeis guineensis jacq. In: WORKSHOP AGROENERGIA, 6., 2012, Ribeirão Preto, SP. Anais... Ribeirão Preto: APTA; Campinas: IAC, 2012. Não paginadoTipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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11. | | LEAO, A. P.; VARGAS, L. H. G.; FARIAS, M. P.; FORMIGHIERI, E. F.; ALVES, A. A.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Estabelecimento de curva de melting para elaeis guineenses jacq. e elaeis oleífera (kunth) cortés. In: WORKSHOP AGROENERGIA, 6., 2012, Ribeirão Preto, SP. Anais... Ribeirão Preto: APTA; Campinas: IAC, 2012. Não paginadoTipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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12. | | SOUSA, P. C. A.; LIMA, E. S. S.; FARIAS, M. P.; ARAUJO, A. C. G. de; MENDES, M. A. S.; URBEN, A. F.; PAZ LIMA, M. L. Microscopia eletrônica de varredura de Alburgo ipomoeae-panduratae infectando folhas de Ipomoea triloba. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 34, p. S175, 2009. Suplemento. Edição dos Resumos do XLII do Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro, RJ, 2009.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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13. | | SOUSA, P. C. A.; FARIAS, M. P.; ARAUJO, A. C. G. de; PEGORIN, A. L. A.; DIANESE, A. de C.; PAZ LIMA, M. L. Microscopia eletrônica de varredura de Pseudocercospora passiflora-setacea em folhas de Passiflora setacea. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 34, p. S181, 2009. Suplemento. Edição dos Resumos do XLII do Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro, RJ, 2009.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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14. | | PEREIRA, V. M.; FERREIRA FILHO, J. A.; LEAO, A. P.; VARGAS, L. H. G.; FARIAS, M. P. de; RIOS, S. de A.; CUNHA, R. N. V. da; FORMIGHIERI, E. F.; ALVES, A. A.; SOUZA JUNIOR, M. T. American oil palm from Brazil: Genetic diversity, population structure, and core collection. Crop Science, v. 60, p. 3212-3227, Nov./Dec. 2020. il.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Milho e Sorgo. |
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15. | | SILVA, A. K.; MARTINS, A. C. Q.; MORGANTE, C. V.; SILVA, S. K. L.; OLIVEIRA, T. N.; FARIAS, M. P.; BERTIOLI, S. C. de M. L.; BERTIOLI, D. J.; GUIMARAES, P. M.; BRASILEIRO, A. C. M. Análise massal do transcritoma de amendoim silvestre (arachis duranensis) submetido a estresse hídrico gradual. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 15., 2010, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. Resumo 012.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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16. | | MARTINS, A. C. Q.; MORGANTE, C. V.; FARIAS, M. P.; SILVA, A. K.; SILVA, S. K. L.; GALHARDO, I. C.; BRASILEIRO, A. C. M.; BERTIOLI, S. C. de M. L.; BERTIOLI, D. J.; MILLER, R. N. G.; GUIMARAES, P. M. Análise massal do transcritoma de amendoim silvestre (Arachis stenosperma) inoculado com Passalora personata, o agente c ausal da mancha preta. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICOLOGIA, 6., 2010, Brasília, DF. Anais. São Paulo: Sociedade Brasileira de Micologia, 2010. Resumo R493.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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17. | | MARTINS, A. C. Q.; MORGANTE, C. V.; FARIAS, M. P.; SILVA, A. K.; SILVA, S. K. L.; GALHARDO, I. C.; BRASILEIRO, A. C. M.; BERTIOLI, S. C. de M. L.; BERTIOLI, D. J.; MILLER, R. N. G.; GUIMARAES, P. M. Análise massal do transcritoma de amendoim silvestre (Arachis stenosperma) inoculado com Passalora personata: mancha preta. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 15., 2010, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. Resumo 013.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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18. | | SILVA, P. I. T.; FARIAS, M. P. de; GUIMARAES, P. M.; BRASILEIRO, A. C. M.; BERTIOLI, S. C. de M. L.; BERTIOLI, D. J.; ARAUJO, A. C. G. de. Análise ultraestrutural da interação entre Puccinia arachidis e espécies silvestre e cultivada de Arachis. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 14., 2009, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2009. Resumo 008. p. 42Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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19. | | PEREIRA, V. M.; LEAO, A. P.; VARGAS, L. H.; FARIAS, M. P. de; FORMIGHERI, E. F.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T.; RIOS, S. de A.; ALVES, A. A. Extensão e organização da diversidade genética da coleção brasileira de germoplasma de Elaeis oleifera. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DE BIOENERGIA, 8., 2013, São Paulo, SP. Anais... São Paulo: CIPA, 2013.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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20. | | PEREIRA, V. M.; LEAO, A. P.; VARGAS, L. H.; FARIAS, M. P. de; FORMIGHIERI, E. F.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T.; RIOS, S. de A.; ALVES, A. A. Extensão e organização da diversidade genética da coleção brasileira de germoplasma de Elaeis oleifera. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DE BIOENERGIA, 8., 2013, São Paulo, SP. Anais... São Paulo: CIPA, 2013.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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