|
|
| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agricultura Digital. Para informações adicionais entre em contato com cnptia.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
Data corrente: |
26/03/2009 |
Data da última atualização: |
15/01/2020 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
FALCAO, P. R. K.; TEIXEIRA, K. R. dos. |
Afiliação: |
PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA; KATIA REGINA DOS SANTOS TEIXEIRA, CNPAB. |
Título: |
Evaluation of point mutation in genes related to ketogluconic acid production by Gluconacetobacter diazotrophicus. |
Ano de publicação: |
2008 |
Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 4., 2008, Salvador. Proceedings... Salvador: AB³C, 2008. |
Páginas: |
Não paginado. |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
X-Meeting 2008. |
Conteúdo: |
Here, bioinformatic approach based on protein modeling was applied to two ORFs related to ketogluconates production, gluconate 5-dehydrogenase and 2-ketoglucone reductase. The ORFs were analyzed and identification of regions that play an important role in substrate binding/recognition presents an opportunity for stability prediction and design of mutagenesis strategy. Gluconate-5-dehydrogenase was modelled using as a 3D model the crystal structure of Gluconate 5-dehydrogenase from Thermotoga maritima (PDB ID: vl8) whereas crystal structure of a NDA-dependent p-glycerate dehydrogenase (PDB ID:1gdh) was used to model 2-ketogluconate reductase. The sequence identities for these proteins are 36% and 34%, respectively. Based on this in silico model and with the prediction performed with CUPSAT [4], it was proposed to construct the mutants His289Asn and Glu271Ser of 2-ketoglucone reductase. |
Palavras-Chave: |
Bioinformática; Gluconacetobacter diazotrophics; Oxidação da glicose; Produção de ácido. |
Thesagro: |
Fixação de Nitrogênio. |
Thesaurus Nal: |
Bioinformatics; genes. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
Marc: |
LEADER 01744nam a2200229 a 4500 001 1031806 005 2020-01-15 008 2008 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aFALCAO, P. R. K. 245 $aEvaluation of point mutation in genes related to ketogluconic acid production by Gluconacetobacter diazotrophicus.$h[electronic resource] 260 $aIn: INTERNATIONAL CONFERENCE OF BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 4., 2008, Salvador. Proceedings... Salvador: AB³C$c2008 300 $aNão paginado. 500 $aX-Meeting 2008. 520 $aHere, bioinformatic approach based on protein modeling was applied to two ORFs related to ketogluconates production, gluconate 5-dehydrogenase and 2-ketoglucone reductase. The ORFs were analyzed and identification of regions that play an important role in substrate binding/recognition presents an opportunity for stability prediction and design of mutagenesis strategy. Gluconate-5-dehydrogenase was modelled using as a 3D model the crystal structure of Gluconate 5-dehydrogenase from Thermotoga maritima (PDB ID: vl8) whereas crystal structure of a NDA-dependent p-glycerate dehydrogenase (PDB ID:1gdh) was used to model 2-ketogluconate reductase. The sequence identities for these proteins are 36% and 34%, respectively. Based on this in silico model and with the prediction performed with CUPSAT [4], it was proposed to construct the mutants His289Asn and Glu271Ser of 2-ketoglucone reductase. 650 $aBioinformatics 650 $agenes 650 $aFixação de Nitrogênio 653 $aBioinformática 653 $aGluconacetobacter diazotrophics 653 $aOxidação da glicose 653 $aProdução de ácido 700 1 $aTEIXEIRA, K. R. dos
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registros recuperados : 119 | |
3. | | FALCÃO, P. T. S.; PARIS, E. C. Avaliação da solubilidade de nanopartículas de ZnO visando a aplicação como fonte de nutriente para o solo In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 8., 2016, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2016. p.73. Editores técnicos: Wilson Tadeu Lopes da Silva, José Manoel Marconcini, Maria Alice Martins, Lucimara Aparecida Forato, Paulino Ribeiro Villas Boas. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 61).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
| |
10. | | RIBEIRO, C.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G.; SANTORO, M. Serine proteases analysis based on phylogenetic trees constructed from the sequence and structure alignments. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-48. Na publicação: Paula Kuser.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
15. | | BRANDÃO, M. M.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. Structural parameters to filter crucial catalytic site aminoacids from fructose 1,6-bisphosphate aldolase. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-21. Na publicação: Paula R. Kuser.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
19. | | KUSER-FALCÃO, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; MARTINS, N. F. Bioinformática como instrumento de apoio aos programas de melhoramento genético. In: FIGUEIREDO, M. do V. B.; BURITY, H. A.; OLIVEIRA, J. de P.; SANTOS, C. E. de R. e S.; STAMFORD, N. P. (Ed.). Biotecnologia aplicada à agricultura: textos de apoio e protocolos experimentais. Brasília, DF: Embrapa Informação Tecnológica; Recife: Instituto Agronômico de Pernambuco, 2010. p. 313-332.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
20. | | NARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER-FALCÃO, P. R.; NESHICH, G. 2D maps of protein surface. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster B-63.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
Registros recuperados : 119 | |
|
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|