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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
Data corrente: |
25/01/2022 |
Data da última atualização: |
25/01/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SILVA, N.; IVAMOTO-SUZUKI, S. T.; CAMARGO, P. O.; ROSA, R. S.; PEREIRA, L. F. P.; DOMINGUES, D. S. |
Afiliação: |
NATACHA SILVA, UNESP; SUZANA TIEMI IVAMOTO-SUZUKI, UNESP; PAULA OLIVEIRA CAMARGO, UNESP; RAÍSSA SCALZONI ROSA, UNESP; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, CNPCa; DOUGLAS SILVA DOMINGUES, UNESP. |
Título: |
Low-copy genes in terpenoid metabolism: the evolution and expression of MVK and DXR genes in angiosperms. |
Ano de publicação: |
2020 |
Fonte/Imprenta: |
Plants, v. 9, n. 4, 2020. |
DOI: |
https://doi.org/10.3390/plants9040525 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Terpenoids are a diverse class of metabolites that impact plant metabolism in response to environmental cues. They are synthesized either via a predominantly cytosolic (MVA) pathway or a plastidic pathway (MEP). In Arabidopsis, several enzymes from the MVA and MEP pathways are encoded by gene families, excluding MVK and DXR, which are single-copy genes. In this study, we assess the diversity, evolution and expression of DXR and MVK genes in selected angiosperms and Coffea arabica in particular. Evolutionary analysis revealed that DXR and MVK underwent purifying selection, but the selection effect for DXR was stronger than it was for MVK. Digital gene expression (DGE) profile analysis of six species revealed that expression levels of MVK in flowers and roots were high, whereas for DXR peak values were observed in leaves. In C. arabica, both genes were highly expressed in flowers, and CaDXR was upregulated in response to methyl jasmonate. C. arabica DGE data were validated by assessing gene expression in selected organs, and by plants treated with hexanoic acid (Hx) using RT-qPCR. MVK expression was upregulated in roots treated with Hx. CaDXR was downregulated in leaves by Hx treatment in a genotype-specific manner, indicating a differential response to priming. |
Thesaurus Nal: |
Angiospermae; Coffea arabica var. arabica; Genes; Terpenoids. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/230488/1/Low-Copy-Genes.pdf
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Marc: |
LEADER 01998naa a2200241 a 4500 001 2139300 005 2022-01-25 008 2020 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.3390/plants9040525$2DOI 100 1 $aSILVA, N. 245 $aLow-copy genes in terpenoid metabolism$bthe evolution and expression of MVK and DXR genes in angiosperms.$h[electronic resource] 260 $c2020 520 $aTerpenoids are a diverse class of metabolites that impact plant metabolism in response to environmental cues. They are synthesized either via a predominantly cytosolic (MVA) pathway or a plastidic pathway (MEP). In Arabidopsis, several enzymes from the MVA and MEP pathways are encoded by gene families, excluding MVK and DXR, which are single-copy genes. In this study, we assess the diversity, evolution and expression of DXR and MVK genes in selected angiosperms and Coffea arabica in particular. Evolutionary analysis revealed that DXR and MVK underwent purifying selection, but the selection effect for DXR was stronger than it was for MVK. Digital gene expression (DGE) profile analysis of six species revealed that expression levels of MVK in flowers and roots were high, whereas for DXR peak values were observed in leaves. In C. arabica, both genes were highly expressed in flowers, and CaDXR was upregulated in response to methyl jasmonate. C. arabica DGE data were validated by assessing gene expression in selected organs, and by plants treated with hexanoic acid (Hx) using RT-qPCR. MVK expression was upregulated in roots treated with Hx. CaDXR was downregulated in leaves by Hx treatment in a genotype-specific manner, indicating a differential response to priming. 650 $aAngiospermae 650 $aCoffea arabica var. arabica 650 $aGenes 650 $aTerpenoids 700 1 $aIVAMOTO-SUZUKI, S. T. 700 1 $aCAMARGO, P. O. 700 1 $aROSA, R. S. 700 1 $aPEREIRA, L. F. P. 700 1 $aDOMINGUES, D. S. 773 $tPlants$gv. 9, n. 4, 2020.
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Registros recuperados : 45 | |
2. | | IVAMOTO, S. T.; REIS JUNIOR, O.; CARAZZOLLE, M. F.; DOMINGUES, D. S.; PEREIRA, L. F. P. Transcriptoma de frutos de Coffea arabica L. ao longo do seu desenvolvimento inicial. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 8., 2013, Salvador. Sustentabilidade e inclusão Social. Brasília, DF: Embrapa Café, 2013.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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4. | | PEREIRA, L. F. P.; YANAGUI, K.; FERREIRA, L. P.; DOMINGUES, D. S.; VIEIRA, L. G. E.; POT, D. Analysis Of Nucleotide Diversity In Coffea spp. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 19, 2011, San Diego, CA.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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5. | | PASCHOAL, A. R.; FERNANDES, E. D. M.; SILVA, J. C.; LOPES, F. M.; PEREIRA, L. F. P.; DOMINGUES, D. S. CoffeebEST: an integrated resource for Coffea spp expressed sequence tags. Genetics and Molecular Research, v. 13, n. 4, p. 10913-10920, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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6. | | IVAMOTO, S. T.; CELEDÓN, J. M.; YUEN, M. M. S.; DOMINGUES, D. S.; PEREIRA, L. F. P.; BOHLMANN, J. Biochemical and molecular analysis of Coffea arabica to identify candidate genes related to diterpenes biosynthesis. In: INTERNATIONAL MEETING ON BIOSYNTHESIS, FUNCTIONS AND SYNTHETIC BIOLOGY OF ISOPRENOIDS, 12., 2015, Vancouver, Canada. Porter... Vancouver, Canada: University of British Columbia, 2015.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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8. | | IVAMOTO, S. T.; POT, D.; LANNES, S. D.; DOMINGUES, D. S.; VIEIRA, L. G. E.; PEREIRA, L. F. P. Diversidade nucleotídica de genes envolvidos na biossíntese de ácidos clorogênicos de cafeeiros. Coffee Science, Lavras, v. 8, n. 2, p. 148-156, abr./jun. 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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10. | | IVAMOTO, S. T.; CELEDÓN, J. M.; YUEN, M. M. S.; DOMINGUES, D. S.; PEREIRA, L. F. P.; BOHLMANN, J. Molecular and metabolite analyses of Coffea arabica L. fruits to identify candidate genes for diterpene biosynthesis. In: INTERNATIONAL CONGRESS OF PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 11., 2015, Iguassu Falls, Brazil. Summaries... Rockville, USA: American Society of Plant Biologists, 2015.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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14. | | ABREU, V. A. C. de; ALVES, R. M.; SILVA, S. R.; FERRO, J. A.; DOMINGUES, D. S.; MIRANDA, V. F. O.; VARANI, A. M. Comparative analyses of Theobroma cacao and T. grandiflorum mitogenomes reveal conserved gene content embedded within complex and plastic structures. Gene, v. 849, 146904, 2023.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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16. | | SANT'ANA, G. C.; POT, D.; IVAMOTO, S. T.; DOMINGUES, D. S.; SCHOLZ, M. B. B.; LEROY, T.; PEREIRA, L. F. P. Genomic regions associated to lipids and diterpenes contents slected during domestication and breeding of Coffea arabica. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz de Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro. Maringá, PR: SBMP, 2017. p. 72Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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17. | | CARVALHO, K. de; PETKOWICZ, C. L. O.; NAGASHIMA, G. T.; BESPALHOK FILHO, J. C.; VIEIRA, L. G. E.; PEREIRA, L. F. P.; DOMINGUES, D. S. Homeologous genes involved in mannitol synthesis reveal unequal contributions in response to abiotic stress in Coffea arábica. Molecular Genetics and Genomics, v. 289, n. 5, p. 951-963, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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18. | | SILVA, B. S. R. da; CAÇÃO, S. B.; IVAMOTO, S. T.; SILVA, J. C.; DOMINGUES, D. S.; PEREIRA, L. F. P. Identificação e caracterização de microssatélites de Coffea arabica a partir de dados de sequenciamento de RNA e de BACS. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 8., 2013, Salvador. Sustentabilidade e inclusão Social. Brasília, DF: Embrapa Café, 2013.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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19. | | SOUZA, S. G. H. de; SANTOS, T. B. dos; DOMINGUES, D. S.; BERNADAC, A.; BOUZAYEN, M.; PEREIRA, L. F. P.; DEGRASSI, G.; CARPENTIERI-PIPOLO, V. Identification, structure analyses and expression pattern of the ERF transcription factor family in coffea arabica. Journal of Botanical Research, v. 3, n.1, Jan. 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
Biblioteca(s): Embrapa Café; Embrapa Trigo. |
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20. | | IVAMOTO, S. T.; POT, D.; CHARMETANT, P.; MARRACCINI, P.; FERREIRA, L. P.; DOMINGUES, D. S.; VIEIRA, L. G. E.; PEREIRA, L. F. P. Diterpenes in Coffea arabica: biochemical aspects and transcriptional analysis of candidate cyps involved in cafestol and kahweol biosynthesis. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 24., 2012, Costa Rica. Programme & abstracts. [S.l.]: Association for Science and Information on Coffee, 2012. p. 216Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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