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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café; Embrapa Trigo. |
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Data corrente: |
06/12/2021 |
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Data da última atualização: |
25/01/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SOUZA, S. G. H. de; SANTOS, T. B. dos; DOMINGUES, D. S.; BERNADAC, A.; BOUZAYEN, M.; PEREIRA, L. F. P.; DEGRASSI, G.; CARPENTIERI-PIPOLO, V. |
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Afiliação: |
SILVIA GRACIELE HÜLSE DE SOUZA, UNIVERSIDADE PARANAENSE; TIAGO B. DOS SANTOS, INSTITUTO AGRONÔMICO DO PARANÁ; DOUGLAS S. DOMINGUES, UNESP; ANNE BERNADAC, INRA/INP-ENSAT; MONDHER BOUZAYEN, INRA/INP-ENSAT; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, CNPCa; GIULIANO DEGRASSI, INTERNATIONAL CENTRE FOR GENETIC ENGINEERING AND BIOTECHNOLOGY (ICGEB); VALERIA CARPENTIERI PIPOLO, CNPT. |
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Título: |
Identification, structure analyses and expression pattern of the ERF transcription factor family in coffea arabica. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Botanical Research, v. 3, n.1, Jan. 2021. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Members of the ERF Family of Transcription Factors play an important role in plant development and gene expression that regulates responses to biotic and abiotic stress. This work identified 36 ERF family genes in Coffea arabica within the AP2/ERF full domain, using the EST-based genomic resource of the Brazilian Coffee Genome Project. The ERF family genes were classified into nine of the ten existing groups through phylogenetic analysis of the deduced amino acid sequences and comparison with the sequences of the ERF family genes in Arabidopsis. In addition to the AP2 domain, other conserved domains were identified, typical of members of each group. The in silico analysis and expression profiling showed high levels of expression for libraries derived from tissues of fruits, leaves and flowers as well as for libraries subjected to water stress. These results suggest the participation of the ERF family genes of C. arabica in distinct biological functions, such as control of development, maturation, and responses to water stress. The results of this work imply in the selection of promising genes for further functional characterizations that will provide a better understanding of the complex regulatory networks related to plant development and responses to stress, opening up opportunities for coffee breeding programs. |
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Palavras-Chave: |
AP2/ERF; Coffee. |
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Thesagro: |
Café; Genoma; Melhoramento Genético Vegetal. |
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Thesaurus Nal: |
Coffea; Ethylene; Plant breeding; Transcription factors. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/230485/1/Identification-structure-2021.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/228523/1/2819-12712-1-PB.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Soja. Para informações adicionais entre em contato com valeria.cardoso@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
31/05/2000 |
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Data da última atualização: |
01/04/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
CARVALHO, V. P.; ABDELNOOR, R. V.; ALMEIDA, A. M. R.; ARIAS, C. A. A. |
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Afiliação: |
RICARDO VILELA ABDELNOOR, CNPSO; CARLOS ALBERTO ARRABAL ARIAS, CNPSO. |
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Título: |
Marcadores RAPD e microssatelite ligados a resistencia ao nematoide de cisto da soja, Heterodera glycines Ichinohe, raça 3. |
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Ano de publicação: |
1999 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirao Preto, v. 22, n. 3, p. 325-326, Oct. 1999. Supplement. Trabalho apresentado no 45o. Congresso Nacional de Genética, 1999, Gramado. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O nematoide de cisto da soja (NCS), Heterodera glycines Ichinohe, e uma doenca que atinge atualmente 1,7 milhao de hectares de areas produtoras de soja, em sete estados brasileiros, causando grandes prejuizos. A pratica de rotacao de culturas com cultivares de soja resistentes, suscetiveis e especies cultivadas nao hospedeiras, e a forma mais eficaz de controle. O desenvolvimento de cultivares envolve a avaliacao de progenies derivadas de cruzamentos biparentais. A avaliacao pelo metodo convencional, por inoculacao artificial do NCS, e um processo trabalhoso e demorado. Portanto, marcadores molecular como RAPD e microssatelite, podem ser utilizados em programas de melhoramento para reduzir o tempo de lancamento de cultivares resistentes ao NCS. Neste trabalho, utilizando 60 linhagens de soja em geracao F, foram identificados quatro marcadores de RAPD e um de microssatelite ligados a resistencia a raca 3 do NCS. Por meio de analise de regressao, verificou-se que o marcador de microssatelite Satt 187, localizado no grupo de ligacao A2, e os marcadores de RAPD OPAG-05, OPF-04, OPAQ-01 e OPAG-01 explicaram 28,9%, 13,8%, 11,4%, 9,9% e 1,3%, respectivamente, da variacao fenotipica ao NCS. Entretanto, na analise de regressao multipla com metodo de eliminacao "stepwise", a combinacao entre os marcadores Satt 187 e OPAG-05 explicaram 40% dessa variacao. Esses marcadores apresentaram 83,3%, 63,6%, 61,6% 61,6% e 51,6%, respectivamente, de eficiencia de selecao. Entretanto, as combinacoes Satt187 e OPAG-05, e Satt187 e OPAQ-01, apresentaram 96,6%, respectivamente. Os marcadores OPAG-05, OPF-04 e OPAQ-01 estao altamente correlacionados, sugerindo que marcam uma mesma regiao do genoma, enquanto que os marcadores Satt187 e o OPAG-01 estariam localizados em outras regioes distintas. De acordo com a segregacao observada, sugere-se que a caracteristica resistencia a raca 3 do NCS, nessa populacao, e controlada por dois genes. Um desses genes esta localizado no grupo de ligacao A, e o outro ainda nao foi localizado. MenosO nematoide de cisto da soja (NCS), Heterodera glycines Ichinohe, e uma doenca que atinge atualmente 1,7 milhao de hectares de areas produtoras de soja, em sete estados brasileiros, causando grandes prejuizos. A pratica de rotacao de culturas com cultivares de soja resistentes, suscetiveis e especies cultivadas nao hospedeiras, e a forma mais eficaz de controle. O desenvolvimento de cultivares envolve a avaliacao de progenies derivadas de cruzamentos biparentais. A avaliacao pelo metodo convencional, por inoculacao artificial do NCS, e um processo trabalhoso e demorado. Portanto, marcadores molecular como RAPD e microssatelite, podem ser utilizados em programas de melhoramento para reduzir o tempo de lancamento de cultivares resistentes ao NCS. Neste trabalho, utilizando 60 linhagens de soja em geracao F, foram identificados quatro marcadores de RAPD e um de microssatelite ligados a resistencia a raca 3 do NCS. Por meio de analise de regressao, verificou-se que o marcador de microssatelite Satt 187, localizado no grupo de ligacao A2, e os marcadores de RAPD OPAG-05, OPF-04, OPAQ-01 e OPAG-01 explicaram 28,9%, 13,8%, 11,4%, 9,9% e 1,3%, respectivamente, da variacao fenotipica ao NCS. Entretanto, na analise de regressao multipla com metodo de eliminacao "stepwise", a combinacao entre os marcadores Satt 187 e OPAG-05 explicaram 40% dessa variacao. Esses marcadores apresentaram 83,3%, 63,6%, 61,6% 61,6% e 51,6%, respectivamente, de eficiencia de selecao. Entretanto, as combinaco... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Brasil; Nematoide de cisto; Parana. |
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Thesagro: |
Heterodera Glycines; Soja. |
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Thesaurus NAL: |
Brazil; Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
LEADER 02847nam a2200229 a 4500
001 1444798
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008 1999 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aCARVALHO, V. P.
245 $aMarcadores RAPD e microssatelite ligados a resistencia ao nematoide de cisto da soja, Heterodera glycines Ichinohe, raça 3.$h[electronic resource]
260 $aGenetics and Molecular Biology, Ribeirao Preto, v. 22, n. 3, p. 325-326, Oct. 1999. Supplement. Trabalho apresentado no 45o. Congresso Nacional de Genética, 1999, Gramado.$c1999
520 $aO nematoide de cisto da soja (NCS), Heterodera glycines Ichinohe, e uma doenca que atinge atualmente 1,7 milhao de hectares de areas produtoras de soja, em sete estados brasileiros, causando grandes prejuizos. A pratica de rotacao de culturas com cultivares de soja resistentes, suscetiveis e especies cultivadas nao hospedeiras, e a forma mais eficaz de controle. O desenvolvimento de cultivares envolve a avaliacao de progenies derivadas de cruzamentos biparentais. A avaliacao pelo metodo convencional, por inoculacao artificial do NCS, e um processo trabalhoso e demorado. Portanto, marcadores molecular como RAPD e microssatelite, podem ser utilizados em programas de melhoramento para reduzir o tempo de lancamento de cultivares resistentes ao NCS. Neste trabalho, utilizando 60 linhagens de soja em geracao F, foram identificados quatro marcadores de RAPD e um de microssatelite ligados a resistencia a raca 3 do NCS. Por meio de analise de regressao, verificou-se que o marcador de microssatelite Satt 187, localizado no grupo de ligacao A2, e os marcadores de RAPD OPAG-05, OPF-04, OPAQ-01 e OPAG-01 explicaram 28,9%, 13,8%, 11,4%, 9,9% e 1,3%, respectivamente, da variacao fenotipica ao NCS. Entretanto, na analise de regressao multipla com metodo de eliminacao "stepwise", a combinacao entre os marcadores Satt 187 e OPAG-05 explicaram 40% dessa variacao. Esses marcadores apresentaram 83,3%, 63,6%, 61,6% 61,6% e 51,6%, respectivamente, de eficiencia de selecao. Entretanto, as combinacoes Satt187 e OPAG-05, e Satt187 e OPAQ-01, apresentaram 96,6%, respectivamente. Os marcadores OPAG-05, OPF-04 e OPAQ-01 estao altamente correlacionados, sugerindo que marcam uma mesma regiao do genoma, enquanto que os marcadores Satt187 e o OPAG-01 estariam localizados em outras regioes distintas. De acordo com a segregacao observada, sugere-se que a caracteristica resistencia a raca 3 do NCS, nessa populacao, e controlada por dois genes. Um desses genes esta localizado no grupo de ligacao A, e o outro ainda nao foi localizado.
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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