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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
17/11/2011 |
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Data da última atualização: |
17/11/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
CAÇÃO, S. M. B.; DINIZ, L. E. C.; SILVA, N. V.; VENIKY, F.; ANDRADE, A. C.; PEREIRA, L. F. P.; VIEIRA, L. G. E. |
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Afiliação: |
SANDRA M. B. CAÇÃO, IAPAR; LEANDRO E. C. DINIZ, IAPAR; NATHALIA V. SILVA, IAPAR; FILIPE VENIKY, CENARGEN; ALAN CARVALHO ANDRADE, CENARGEN; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, SAPC; LUIZ GONZAGA E. VIEIRA, IAPAR. |
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Título: |
Construção de uma biblioteca genômica de cromossomo artificial de bactéria de Coffea arabica. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A produção de mapas físicos em plantas tem grande importância para estudos de genética e melhoramento. O passo inicial para produção destes mapas é a construção de bibliotecas genômicas com largos fragmentos de DNA, em vetores do tipo cromossomo artificial de bactéria (BAC) ou de levedura (YAC). Visando a produção de um mapa físico, o objetivo deste trabalho foi construir uma biblioteca genômica de BAC de café. Fragmentos de DNA de alto peso molecular de C. arabica híbrido de Timor cv. 832/2 foram clonados no vetor pCC1BAC e transformados em E. coli DH10B. Após transformação 57000 clones foram inicialmente obtidos e ordenados manualmente em placas de 96 poços. A biblioteca foi transferida em triplicata para placas de 384 poços, com equipamento Q-BOT, resultando em 55.778 clones em 148 placas. A verificação do tamanho do inserto de 130 clones revelou tamanho médio de 115-120 Kb. A cobertura do genoma haplóide estimada para C.arabica foi de cinco vezes. A validação da biblioteca presença de DNA de cloroplasto e mitocôndria, assim como a seleção inicial com sondas para iniciar o mapeamento físico, está sendo realizada através de hibridização de colônias em membranas contendo 18.462 clones em duplicata. |
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Palavras-Chave: |
BAC; Mapeamento. |
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Thesagro: |
Clonagem. |
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Thesaurus Nal: |
Coffea. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/46896/1/Construcao-de-uma-biblioteca.pdf
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Marc: |
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520 $aA produção de mapas físicos em plantas tem grande importância para estudos de genética e melhoramento. O passo inicial para produção destes mapas é a construção de bibliotecas genômicas com largos fragmentos de DNA, em vetores do tipo cromossomo artificial de bactéria (BAC) ou de levedura (YAC). Visando a produção de um mapa físico, o objetivo deste trabalho foi construir uma biblioteca genômica de BAC de café. Fragmentos de DNA de alto peso molecular de C. arabica híbrido de Timor cv. 832/2 foram clonados no vetor pCC1BAC e transformados em E. coli DH10B. Após transformação 57000 clones foram inicialmente obtidos e ordenados manualmente em placas de 96 poços. A biblioteca foi transferida em triplicata para placas de 384 poços, com equipamento Q-BOT, resultando em 55.778 clones em 148 placas. A verificação do tamanho do inserto de 130 clones revelou tamanho médio de 115-120 Kb. A cobertura do genoma haplóide estimada para C.arabica foi de cinco vezes. A validação da biblioteca presença de DNA de cloroplasto e mitocôndria, assim como a seleção inicial com sondas para iniciar o mapeamento físico, está sendo realizada através de hibridização de colônias em membranas contendo 18.462 clones em duplicata.
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
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URL |
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| Registros recuperados : 105 | |
| 41. |  | SANTOS, M. S. dos; DINIZ, L. E. C.; FERREIRA, J. M. S.; SANTOS, A. L.; OLIVEIRA, F. A. de; TALAMINI, V. Caracterização da variabilidade genética da coleção de isolados de Thielaviopsis paradoxa. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 2., 2012, Aracaju. Anais... Brasília, DF: Embrapa; Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2012. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 42. | | FRAGA, Y. S. B.; SANTOS, D. R. dos; REGO, R.; BRANDÃO, É. C. T. dos A.; DINIZ, L. E. C.; FERNANDES, M. F. Caracterização de bactérias antagonistas com alto potencial de inibição do crescimento de Thielaviopsis paradoxa quanto à presença de genes para síntese de policetídeos e peptídeos não-ribossomais. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 5., 2015, Aracaju. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2015. p. 280, ref. 255-265. 1 CD-ROM. Editor Técnico: Marcelo Ferreira Fernandes.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 43. | | SILVA, D. C.; DINIZ, L. E. C.; BLANK, A. F.; NIZIO, D. A. C.; PINTO, J. A. O.; PEREIRA, K. L. G.; ARRIGONI BLANK, M. F. Assessment of genetic diversity of a native population of Eplingiella fruticosa: a plant with therapeutic potential. Genetics and Molecular Research, v. 16, n. 3, ago. 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 44. | | CAÇÃO, S. M. B.; DINIZ, L. E. C.; SILVA. N. V.; VENIKY, F.; ANDRADE, A. C.; PEREIRA, L. F. P.; VIEIRA, L. G. E. Construção de uma biblioteca genômica de cromossomo artificial de bactéria de Coffea arabica. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007. Biotecnologia aplicada à cadeia agroindustrial do café.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 45. | | CAÇÃO, S. M. B.; DINIZ, L. E. C.; SILVA, N. V.; VENIKY, F.; ANDRADE, A. C.; PEREIRA, L. F. P.; VIEIRA, L. G. E. Construção de uma biblioteca genômica de cromossomo artificial de bactéria de Coffea arabica. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 46. | | PEREIRA, L. F. P.; CAÇÃO, S. M. B.; SILVA, N. V.; DINIZ, L. E. C.; ALVES, G. S. C.; VINECKY, F.; ANDRADE, A. C.; VIEIRA, L. G. E. Construction of a Coffea arabica bacterial artificial chromosome library. In: ENCUENTRO LATINO AMERICANO Y DEL CARIBE DE BIOTECNOLOGIA AGROPECUARIA: REDBIO 2007, 6., 2007, Viña del Mar, Chile. Abstracts and posters? Roma: FAO, 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 47. | | CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T.; SZINAY, D.; DINIZ, L. E. C.; WIJNKER, E.; SWENNEN, R.; KEMA, G. H. J.; JONG, H. de. The potential of righ-resolution BAC-FISH in banana breeding. Euphytica, Wageningen, n. 166, p. 431-443, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 48. | | CAPDEVILLE, G. D.; SOUZA JUNIOR, M. T.; SZINAY, D.; DINIZ, L. E. C.; WIJNKER, E.; SWENNEN, R.; KEMA, G. H. J.; DE JONG, H. The potential of high-resolution BAC-FISH in banana breeding. Euphytica, v.166, p. 431-443, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 49. | | FREITAS, N. C.; BARRETO, H. G.; TORRES, L. F.; FREIRE, L. L.; RODRIGUES, L. A. Z.; DINIZ, L. E. C.; BEIJO, L. A.; PAIVA, L. V. In silico and in vivo analysis of ABI3 and VAL2 genes during somatic embryogenesis of Coffea arabica: competence acquisition and developmental marker genes. Plant Cell, Tissue and Organ Culture, March, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 51. | | COSTA, T. S.; SILVA, L. A. S.; AMARAL, A. L. do; SANTOS, J. M. dos; BARBOSA, G. V. de S.; DINIZ, L. E. C. Estimativa de diversidade genética entre espécies de cana com potencial sucroenergético. Revista RG News, Brasília, DF, v. 3, n. 2, 2017. p. 79. Edição Especial dos Anais do 3° Simpósio da Rede de Recursos Genéticos Vegetais do Nordeste, Aracaju, out. 2017.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 52. | | COSTA, T. S.; SANTOS, C. T. J.; CORREIA, Q. C. S.; ARCHIMINIO, R. S.; RAMOS, S. R. R.; DINIZ, L. E. C. Estimativa da estrutura genética em acessos de coqueiro anão por marcadores microssatélites. Revista RG News, v. 4, n. 3, p. 313, 2018. Edição especial dos Anais do 5º Congresso Brasileiro de Recursos Genéticos, Fortaleza, nov. 2018.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 54. | | PINHEIRO, C. R.; AMORIM, J. A. E.; SILVA, A. M. F. da; DINIZ, L. E. C.; TALAMINI, V.; MELO, G.; SOUZA JUNIOR, M. T. Genetic diversity of Ralstonia solanacearum race 2 using REP-PCR. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Fortaleza. [Anais...]. Fortaleza: Sociedade Brasileira de Biotecnologia, 2010. Resumo em anais.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 55. | | CASTRO, D. A. M.; COSTA, T. S.; CARDOS, A. S.; RAMOS, H. C. C.; LÓPEZ, J. A.; DINIZ, L. E. C. Genetic structure analysis of Mauritia flexuosa natural population from the Lençóis Maranhenses region using microsatellite markers. Scientia Agricola, v. 79, n. 1, e20200112, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 56. | | LIVRAMENTO, K. G. do; FREITAS, N. C.; TRINDADE, L. de O. R.; TEIXEIRA, L. G. da S.; PAIVA, L. V.; BORDALLO, P. do N.; DINIZ, L. E. C. Gene expression analysis associated with tissue-specific promoters in Musa spp. Acta Scientiarum. Agronomy, v. 44, e55893, 2022. 9 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Soja; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 57. | | MUNIZ, A. V. C. da S.; PINHEIRO, L. R.; DINIZ, L. E. C.; LEDO, A. da S.; SANTOS, A. R. F. Estudo da diversidade genética em população natural de Cattleya labiata localizada em Uruburetama, Ceará. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FLORICULTURA E PLANTAS ORNAMENTAIS, 18.; CONGRESSO BRASILEIRO DE CULTURA DE TECIDOS DE PLANTAS, 5., 2011, Joinville. Resumos... Joinville: Sociedade Brasileira de Plantas Ornamentais e Associação Brasileira de Cultura de Tecidos de Plantas, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 58. | | RODRIGUES JUNINOR, A. S.; SANTOS, S. G. dos; VITORIA, M. F. da; TEIXEIRA, K. M.; DANTAS, T. V. M.; DINIZ, L. E. C.; OLIVEIRA, A. A. de. Comparação de diferentes protocolos de extração de DNA do S. aureus diretamente do leite contaminado. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFI CA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 4., 2014, Aracaju. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 59. | | SILVA, F. G. da; PASSOS, E. M. dos; FARIAS, A. P.; COELHO, C. R.; TEODORO, A. V.; DINIZ, L. E. C.; DOLLET, M.; FERNANDES, M. F. Monitoramento de cigarrinhas (Hemiptera: Auchenorrhyncha) em acessos de coqueiros-anão e gigante. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 6., Aracaju, 2016. Anais... Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2016. p. 30.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 60. | | SANTOS, J. M. S. M.; TALAMINI, V.; SABATO, E. de O.; OLIVIERA, F. A. de; DINIZ, L. E. C.; SANTOS, C. C. dos. Monitoramento de enfezamentos causados por Molicutes e de ciigarrinhas na cultura do milho nos estados de Sergipe e Bahia na safra 2013. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFI CA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 4., 2014, Aracaju. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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